Shewanella vesiculosa: KDH10_003560
Help
Entry
KDH10_003560 CDS
T08322
Name
(GenBank) efflux RND transporter permease subunit
KO
K15726
heavy metal efflux system protein
Organism
svm
Shewanella vesiculosa
Brite
KEGG Orthology (KO) [BR:
svm00001
]
09180 Brite Hierarchies
09183 Protein families: signaling and cellular processes
02000 Transporters [BR:
svm02000
]
KDH10_003560
Transporters [BR:
svm02000
]
Other transporters
Electrochemical potential-driven transporters [TC:
2
]
KDH10_003560
BRITE hierarchy
SSDB
Ortholog
Paralog
Gene cluster
GFIT
Motif
Pfam:
ACR_tran
DUF2207_C
Motif
Other DBs
NCBI-ProteinID:
UJL42387
LinkDB
All DBs
Position
4151547..4154759
Genome browser
AA seq
1070 aa
AA seq
DB search
MLYKLIEIAVEKRLLVLLSLLAAVVASIFMLPKLNLDAFPDVTNVQVTINTEAEGLAAEE
VEKLISYPVESAMYALPAVTEVRSLSRTGLSLVTVVFAEGTDIYFARQQVFEQLQAAKES
IPAGVGTPEIGPNTSGLGQIYQYILRAEPETHISASELRSLNDYLVKLILMPVSGVTEVL
SFGGEVLQYQVQVDPNKLRSYGLSLTQVSQALESNNRNAGGWFMDQGQEQLVVRGYGLLP
AGDAGLQAIADIPLTEINGTPIRVADIANVAFGSEIRVGAVTMSRRQAADNNSSSDVQAL
GEVVAGVVLKRMGANTKATIDDINSRISLIEQSLPKGVSFEVFYDQADLVEQAVTTVVEA
LLMAFGFIVIILALFLVNIRATLLVLLSIPVSIGIALLIMSYYGMSANLMSLGGLAVAIG
MLVDGSVVMVENIFKHVSAETGANPNAAVHLDGDHHATRKSGSDAQTQSMAIRVMLAAKE
VCSPIFFATAIIIVVFMPLFALEGVEGKLFQPMAISIILAMMAALVVALFAVPALAVFLF
KRGVVVRQSKVLAPIDAVYRRILTLVLSSPKSVMLAAVVLFISSMLLLPKLGTEFVPELE
EGTINLRVTLAPTASLATSINVAPKIEAMLLEFPEVEYALSRIGAPELGGDPEPVSNIEI
YIGLKPIEQWTSASNRFELQRLMEQRLAIFPGLLLTFSQPIATRVDELLSGVKAQLAIKI
FGPDLSILSEKGQVLTDLVAAIPGAVDVSLEQVSGEAQLVVRPKREVLARYGISVDEVMS
LVTQGIGGASAGQVIDGNARYDINLRLAAQYRNAPDAIEDLLLSGANGAIVRLGDLADVV
IEMAPPNIRRDDVQRRVVVQANVSGRDMGSVVNDIYAIVPQAELPAGYTVVVGGQYENQQ
RAQQKLMLVVPISIALIGLLLYFSFGSVKQVALIMANVPLALIGGVVALYATGTYLSVPS
SIGFITLFGVAVLNGVVLVDSINQRRQSSTESLYDSVYQGTVGRLRPVLMTALTSALGLI
PILLSSGVGSEIQQPLAVVIIGGLFSSTALTLLVLPTVYQWLYRDKLSLS
NT seq
3213 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
atgttatataaattaattgagattgccgttgaaaagcggttattggttttacttagcttg
ctcgcagcggttgtggcttcaatattcatgctgccaaaactaaatttagatgcatttcca
gatgtgactaatgtgcaagtgaccattaacacagaagctgaaggtttggctgccgaagaa
gttgaaaaactgattagttatccggtcgagtcggctatgtatgccttacccgcggtgact
gaagtgcgttcattatcgcgcactggtttgtcgttggtgaccgtagtgtttgccgaggga
accgatatttactttgcccgtcagcaagtgtttgaacaactacaagctgccaaagagtcg
attcctgcgggtgtcggtactcccgaaataggcccaaacacctcgggtttagggcaaatt
tatcaatacattttacgggctgaacctgaaacccatatcagcgcatctgagctgcgtagc
ttaaatgattacttagttaagctgatattaatgccagtaagcggtgtgaccgaagtattg
tcatttggcggcgaggtgctgcaataccaagtgcaagttgaccctaataaactgcgcagt
tatggcttgtcgctgacccaagttagccaagcattggaaagtaataatcgtaacgcaggc
ggttggtttatggaccaaggccaagagcaattagtggtccgtggttatggtttattgccc
gcaggcgatgctggcttacaagccattgccgacattccgttaaccgaaatcaatggcacg
cctattcgagtggccgacattgctaacgtggcatttggtagtgaaataagagtcggcgca
gtgactatgtcgcgtaggcaagctgctgataataactcgtcatccgatgtacaagcactg
ggtgaagttgttgctggcgtcgtgcttaaacgcatgggggccaataccaaagccaccatt
gatgacatcaattcacgtattagtttgattgagcaatccttaccaaaaggagtgtcattt
gaggtgttttatgaccaagccgatttggtcgagcaagcggtaaccacagtcgttgaagcg
ttattgatggcctttgggtttatcgtgattattctggcgttgtttttggtcaacatccgc
gccaccttgttggtattgctgtcgatcccagtgtcgatcgggatcgcgttattgatcatg
tcttattatggtatgtcggctaacttaatgtccttgggtggtctggcggtcgcaataggt
atgctcgttgatggctcggtggtgatggttgagaacatctttaagcatgttagcgctgaa
acgggcgccaacccaaatgctgctgtgcatcttgatggtgatcatcatgctactcgtaaa
agtggctctgatgcccaaacccaaagtatggcgattagggtcatgctggcggccaaagaa
gtgtgcagccctatcttctttgcgacagcgattatcatcgtggtgttcatgccgttattt
gcccttgaaggtgtagaaggtaagttatttcagccgatggcgattagcattattttagcc
atgatggcggcattggtggtggcattatttgcagtacccgcattagcggtattcttgttc
aaacgcggtgttgtggtgcgtcaaagtaaagtgctggcacccattgatgcggtttatcgc
cgtattttgacactggtattatcaagccctaaatcggtgatgttagccgctgtagtgttg
tttatctcaagcatgttgttattgccaaagttaggcactgaatttgtgccagaactcgaa
gaaggcaccattaacttacgcgtcacactggcaccgacagcaagcttggccacttctatt
aacgtcgcgcctaaaattgaagccatgctgctggagtttccagaggtggaatatgcctta
agtcgcattggcgcaccagagcttggcggcgaccccgaacctgtgagtaatattgaaatc
tatattggtcttaagccgatagaacaatggacatcggcaagtaaccgctttgagcttcag
cgcttaatggagcaaagattagcgatattcccgggattattgctgaccttctcacaaccc
attgcgactcgagtggatgagctattatcaggggttaaagcgcagttagcgattaagata
tttggcccagatttgagcatattatcggaaaaaggtcaggtactaacagacttagtcgca
gccattcctggggcggttgatgtatcgttagaacaagtcagcggtgaagctcagttagtg
gttcggcctaaacgtgaagtactggcacgttatgggatcagcgttgatgaagtgatgagt
ttagtcactcaaggtattggtggtgccagcgctggtcaggtgattgacggtaacgctcgt
tatgacattaacctgcgattagccgcgcaatatcgtaatgcgcctgatgcaattgaagat
ttgctcctcagtggcgccaatggtgcgattgttcgcttgggcgatctcgctgatgtggtg
attgaaatggcgccaccgaatattcgtcgtgacgatgtacagcgccgcgtggtggtgcaa
gccaacgtgtcggggcgtgatatgggctcggtggtcaatgatatttatgccatagtgccg
caagctgaattacctgctggctatactgtggtggtgggcggccaatatgaaaaccagcaa
cgagcgcaacaaaagctaatgttagtggtgcccatttctatcgcactgattggcctattg
ctgtatttctcgtttggttcagtcaaacaagtggccttgattatggctaatgtgccattg
gcattaatcggcggcgtagtggctttatatgctactggcacctatttatctgtgcccagc
tccatcggctttatcaccttgtttggtgttgcggtgttaaatggtgtggtgctggtggac
tcaattaaccagcgcagacaatcatcaactgaaagcctatacgacagtgtttatcaaggt
acagtcgggcgtttacgtccggtgttaatgacggcactgacgtctgcattagggctgatc
cctattttgttatcgtctggcgtgggcagtgaaattcaacagccgttagctgtcgtgatc
atcggcggtttgtttagctcaaccgccttgacgttattagtgttgcctacggtttatcaa
tggttgtatcgcgataaactatcattgtcataa
DBGET
integrated database retrieval system