Entry |
|
Name |
(GenBank) efflux RND transporter permease subunit
|
KO |
K15726 | heavy metal efflux system protein |
|
Organism |
svm Shewanella vesiculosa
|
Brite |
KEGG Orthology (KO) [BR:svm00001]
09180 Brite Hierarchies
09183 Protein families: signaling and cellular processes
02000 Transporters [BR:svm02000]
KDH10_003560
Transporters [BR:svm02000]
Other transporters
Electrochemical potential-driven transporters [TC:2]
KDH10_003560
|
SSDB |
|
Motif |
|
Other DBs |
|
LinkDB |
|
Position |
4151547..4154759
|
AA seq |
1070 aa
MLYKLIEIAVEKRLLVLLSLLAAVVASIFMLPKLNLDAFPDVTNVQVTINTEAEGLAAEE
VEKLISYPVESAMYALPAVTEVRSLSRTGLSLVTVVFAEGTDIYFARQQVFEQLQAAKES
IPAGVGTPEIGPNTSGLGQIYQYILRAEPETHISASELRSLNDYLVKLILMPVSGVTEVL
SFGGEVLQYQVQVDPNKLRSYGLSLTQVSQALESNNRNAGGWFMDQGQEQLVVRGYGLLP
AGDAGLQAIADIPLTEINGTPIRVADIANVAFGSEIRVGAVTMSRRQAADNNSSSDVQAL
GEVVAGVVLKRMGANTKATIDDINSRISLIEQSLPKGVSFEVFYDQADLVEQAVTTVVEA
LLMAFGFIVIILALFLVNIRATLLVLLSIPVSIGIALLIMSYYGMSANLMSLGGLAVAIG
MLVDGSVVMVENIFKHVSAETGANPNAAVHLDGDHHATRKSGSDAQTQSMAIRVMLAAKE
VCSPIFFATAIIIVVFMPLFALEGVEGKLFQPMAISIILAMMAALVVALFAVPALAVFLF
KRGVVVRQSKVLAPIDAVYRRILTLVLSSPKSVMLAAVVLFISSMLLLPKLGTEFVPELE
EGTINLRVTLAPTASLATSINVAPKIEAMLLEFPEVEYALSRIGAPELGGDPEPVSNIEI
YIGLKPIEQWTSASNRFELQRLMEQRLAIFPGLLLTFSQPIATRVDELLSGVKAQLAIKI
FGPDLSILSEKGQVLTDLVAAIPGAVDVSLEQVSGEAQLVVRPKREVLARYGISVDEVMS
LVTQGIGGASAGQVIDGNARYDINLRLAAQYRNAPDAIEDLLLSGANGAIVRLGDLADVV
IEMAPPNIRRDDVQRRVVVQANVSGRDMGSVVNDIYAIVPQAELPAGYTVVVGGQYENQQ
RAQQKLMLVVPISIALIGLLLYFSFGSVKQVALIMANVPLALIGGVVALYATGTYLSVPS
SIGFITLFGVAVLNGVVLVDSINQRRQSSTESLYDSVYQGTVGRLRPVLMTALTSALGLI
PILLSSGVGSEIQQPLAVVIIGGLFSSTALTLLVLPTVYQWLYRDKLSLS |
NT seq |
3213 nt +upstreamnt +downstreamnt
atgttatataaattaattgagattgccgttgaaaagcggttattggttttacttagcttg
ctcgcagcggttgtggcttcaatattcatgctgccaaaactaaatttagatgcatttcca
gatgtgactaatgtgcaagtgaccattaacacagaagctgaaggtttggctgccgaagaa
gttgaaaaactgattagttatccggtcgagtcggctatgtatgccttacccgcggtgact
gaagtgcgttcattatcgcgcactggtttgtcgttggtgaccgtagtgtttgccgaggga
accgatatttactttgcccgtcagcaagtgtttgaacaactacaagctgccaaagagtcg
attcctgcgggtgtcggtactcccgaaataggcccaaacacctcgggtttagggcaaatt
tatcaatacattttacgggctgaacctgaaacccatatcagcgcatctgagctgcgtagc
ttaaatgattacttagttaagctgatattaatgccagtaagcggtgtgaccgaagtattg
tcatttggcggcgaggtgctgcaataccaagtgcaagttgaccctaataaactgcgcagt
tatggcttgtcgctgacccaagttagccaagcattggaaagtaataatcgtaacgcaggc
ggttggtttatggaccaaggccaagagcaattagtggtccgtggttatggtttattgccc
gcaggcgatgctggcttacaagccattgccgacattccgttaaccgaaatcaatggcacg
cctattcgagtggccgacattgctaacgtggcatttggtagtgaaataagagtcggcgca
gtgactatgtcgcgtaggcaagctgctgataataactcgtcatccgatgtacaagcactg
ggtgaagttgttgctggcgtcgtgcttaaacgcatgggggccaataccaaagccaccatt
gatgacatcaattcacgtattagtttgattgagcaatccttaccaaaaggagtgtcattt
gaggtgttttatgaccaagccgatttggtcgagcaagcggtaaccacagtcgttgaagcg
ttattgatggcctttgggtttatcgtgattattctggcgttgtttttggtcaacatccgc
gccaccttgttggtattgctgtcgatcccagtgtcgatcgggatcgcgttattgatcatg
tcttattatggtatgtcggctaacttaatgtccttgggtggtctggcggtcgcaataggt
atgctcgttgatggctcggtggtgatggttgagaacatctttaagcatgttagcgctgaa
acgggcgccaacccaaatgctgctgtgcatcttgatggtgatcatcatgctactcgtaaa
agtggctctgatgcccaaacccaaagtatggcgattagggtcatgctggcggccaaagaa
gtgtgcagccctatcttctttgcgacagcgattatcatcgtggtgttcatgccgttattt
gcccttgaaggtgtagaaggtaagttatttcagccgatggcgattagcattattttagcc
atgatggcggcattggtggtggcattatttgcagtacccgcattagcggtattcttgttc
aaacgcggtgttgtggtgcgtcaaagtaaagtgctggcacccattgatgcggtttatcgc
cgtattttgacactggtattatcaagccctaaatcggtgatgttagccgctgtagtgttg
tttatctcaagcatgttgttattgccaaagttaggcactgaatttgtgccagaactcgaa
gaaggcaccattaacttacgcgtcacactggcaccgacagcaagcttggccacttctatt
aacgtcgcgcctaaaattgaagccatgctgctggagtttccagaggtggaatatgcctta
agtcgcattggcgcaccagagcttggcggcgaccccgaacctgtgagtaatattgaaatc
tatattggtcttaagccgatagaacaatggacatcggcaagtaaccgctttgagcttcag
cgcttaatggagcaaagattagcgatattcccgggattattgctgaccttctcacaaccc
attgcgactcgagtggatgagctattatcaggggttaaagcgcagttagcgattaagata
tttggcccagatttgagcatattatcggaaaaaggtcaggtactaacagacttagtcgca
gccattcctggggcggttgatgtatcgttagaacaagtcagcggtgaagctcagttagtg
gttcggcctaaacgtgaagtactggcacgttatgggatcagcgttgatgaagtgatgagt
ttagtcactcaaggtattggtggtgccagcgctggtcaggtgattgacggtaacgctcgt
tatgacattaacctgcgattagccgcgcaatatcgtaatgcgcctgatgcaattgaagat
ttgctcctcagtggcgccaatggtgcgattgttcgcttgggcgatctcgctgatgtggtg
attgaaatggcgccaccgaatattcgtcgtgacgatgtacagcgccgcgtggtggtgcaa
gccaacgtgtcggggcgtgatatgggctcggtggtcaatgatatttatgccatagtgccg
caagctgaattacctgctggctatactgtggtggtgggcggccaatatgaaaaccagcaa
cgagcgcaacaaaagctaatgttagtggtgcccatttctatcgcactgattggcctattg
ctgtatttctcgtttggttcagtcaaacaagtggccttgattatggctaatgtgccattg
gcattaatcggcggcgtagtggctttatatgctactggcacctatttatctgtgcccagc
tccatcggctttatcaccttgtttggtgttgcggtgttaaatggtgtggtgctggtggac
tcaattaaccagcgcagacaatcatcaactgaaagcctatacgacagtgtttatcaaggt
acagtcgggcgtttacgtccggtgttaatgacggcactgacgtctgcattagggctgatc
cctattttgttatcgtctggcgtgggcagtgaaattcaacagccgttagctgtcgtgatc
atcggcggtttgtttagctcaaccgccttgacgttattagtgttgcctacggtttatcaa
tggttgtatcgcgataaactatcattgtcataa |