Shewanella vesiculosa: KDH10_003963
Help
Entry
KDH10_003963 CDS
T08322
Name
(GenBank) TonB-dependent receptor
KO
K02014
iron complex outermembrane recepter protein
Organism
svm
Shewanella vesiculosa
Brite
KEGG Orthology (KO) [BR:
svm00001
]
09180 Brite Hierarchies
09183 Protein families: signaling and cellular processes
02000 Transporters [BR:
svm02000
]
KDH10_003963
Transporters [BR:
svm02000
]
Other transporters
Pores ion channels [TC:
1
]
KDH10_003963
BRITE hierarchy
SSDB
Ortholog
Paralog
Gene cluster
GFIT
Motif
Pfam:
TonB_dep_Rec_b-barrel
Plug
OMP_b-brl_3
Motif
Other DBs
NCBI-ProteinID:
UJL44733
LinkDB
All DBs
Position
4589125..4591680
Genome browser
AA seq
851 aa
AA seq
DB search
MMQSKKSKFGISSLSLAISFALAGTVISSQAFAEDEEAVNKENVEKIAVVGSRAAPRSIG
DSPVPIDIISSDDLKKNGSTDMIDMLVTSVPSFNSRAQPISDAATLVRPVNLRGLPSDST
LILVNGKRRHRASVIAFQGGGINDGAQGPDISVIPGVALKQVEVLRDGAAAQYGSDAIAG
VMNFVLKDASEGGSITVSQGEYYEGDGAATTIDGNIGLPLTDDGFVNISAQYKTADATSR
SVQRPDAAAIAAAGNTSIQDPAQTWGNPEINDDYTVFINSGFDINDDTHLYAFGNVSSRE
ATGGFYYRNPHNRGNVYSNDGGETLLVGAVNGDQSTCAVVPANVPNVLDTPEYQAMVADP
NCFAMNQIRPGGYTPQFTGKIEDMSFFAGVKGELGEWMYDASAGTGSNKASFGLKNSLNP
SLGLDTPTDFDTGSYEQVETTVNLDFSRFVTLGGIEDISFAAGAEWRKESFEIGQGDEAS
WIAGPYADQGFNIGSHGFKGFGPESAGKNDRSNIGIYTDVEAYLTEDFLLGVALRYEDFS
TFGDTLNYKLTAQYVATDELSFRASHSTGFRAPTVGQENVVNTQTSIVNGDLIQTFIAPP
TNPLAAFYGGEVLEPEESVSYAAGLVYQYENLFLTVDYYNIEVTGRIAQSSQISVKASDY
DALRAAGVEFPELISAVTFYTNDFDTTTQGVDIVGSYTTEMLSGDAKFSLAYGWTDTSVD
KYDPETTDAGKVRRLEDGIPAHRATLTWGQSWDDLSMSVRANYFGEYYATHADDTSDWGS
EVADAAVTIDLEVSYAVLDNLTVSVGANNIFDQEAQKLKDGTLGELGGVYYESGPFDYNG
GFYYGRVNYRF
NT seq
2556 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
atgatgcaatcaaaaaaatctaaatttggtattagctctttaagcttagccatttcattt
gcacttgccggaacggtaattagctctcaagcttttgctgaagatgaagaagctgtaaac
aaagaaaatgttgaaaaaatcgcagtagtcggttcgcgtgctgcaccgcgttcaattggt
gattcaccggttccaattgacatcatcagcagtgatgatttaaagaaaaatggttcaact
gacatgatcgacatgttagtgacatctgtgccttcttttaactctcgtgcgcaacctatt
agtgacgcagcaacgctagttcgtccggttaacttacgtggtttaccgtctgacagtacg
cttattttggttaacggcaaacgccgtcaccgtgcgtcagttattgctttccaaggtggt
ggcattaacgatggtgctcaaggtccagatatttcagttattccaggtgtagcattaaag
caagttgaagtattacgcgatggtgctgcagctcagtatggttctgatgcgattgcgggc
gttatgaactttgtattaaaagacgcctctgaaggtggctctatcaccgtcagtcaaggt
gaatactacgaaggtgacggcgcagcaactactattgatggtaacatcggtttaccgtta
actgatgatggctttgttaacatcagtgcgcaatataaaaccgctgatgcgactagtcgc
agtgtacagcgtccagatgccgctgcgattgccgccgctggcaacacttcaattcaagac
cctgcacaaacatggggtaatccagagattaatgatgactatactgttttcataaactca
ggttttgatattaatgatgacactcatttatatgcttttggtaacgtctcttcacgtgaa
gcaacaggtggtttctactatcgtaacccacataaccgcggtaatgtgtattccaacgat
ggtggtgaaacattactcgtaggtgctgttaatggcgatcaatcaacttgtgcggttgtg
ccagctaatgttcctaacgtgcttgatacccctgagtatcaagctatggtcgccgatcca
aattgttttgcgatgaaccaaattcgcccaggtgggtatacaccacaatttaccggtaaa
attgaagacatgtctttctttgccggtgttaaaggcgagttaggtgaatggatgtacgat
gccagtgcaggtacaggtagtaacaaagccagctttggtttaaaaaactctcttaaccca
tcgttgggcttagatacgccaacagactttgacactggttcttacgagcaagttgaaaca
acggtaaaccttgatttctcgcgttttgtgactttaggtggcattgaagacattagcttt
gctgcgggggctgaatggcgtaaagagtcatttgaaattggtcaaggtgatgaagcctct
tggattgctggcccttacgcagaccaaggtttcaacatcggctcacatggatttaaaggt
tttggtccagaatcagctggtaaaaacgaccgtagcaacattggtatttatactgacgtt
gaagcgtatttaaccgaagacttcttactaggtgtcgcacttcgttacgaagatttctct
acttttggtgacacattaaactacaagttaaccgcgcagtatgttgcaacggatgaatta
tcgttccgtgcttcacacagcaccggtttccgtgcacctacagtcggtcaagaaaacgta
gttaatacgcaaacatcgattgttaatggtgatttgattcagacctttattgcgccacca
acaaatccattagcggctttctatggcggtgaagtgcttgagcctgaagagtctgttagc
tatgcagctggtttggtgtatcaatatgaaaacttgttcttaacagttgattactacaac
attgaagtcaccggtcgtattgctcagtcaagccaaatttcggttaaagcaagtgattat
gatgcattaagagctgctggtgttgaattccctgaactgatttcagcggtaaccttctat
accaatgactttgataccaccactcaaggtgttgatattgtcggttcgtatactactgaa
atgctttctggcgatgccaagtttagcttagcctatggttggactgatactagtgttgat
aagtatgatccagaaacaactgatgcaggtaaagttcgtcgtttagaagatggtattcca
gcacatcgtgccactctaacgtggggccaaagctgggatgatttaagcatgtctgtgcgt
gctaactattttggtgaatattacgcaacacatgctgatgatacttctgattggggttct
gaggttgctgatgctgcagtgactatcgatcttgaagtgagttatgcggtacttgataac
ttaacggtatctgtaggtgctaataacatctttgatcaagaagcgcagaagctaaaagat
ggcacattaggtgagttaggtggagtgtactacgaaagtggtccattcgattacaacggt
ggcttctattacggccgtgttaactatcgcttctaa
DBGET
integrated database retrieval system