KEGG   Shewanella violacea: SVI_0267
Entry
SVI_0267          CDS       T01206                                 
Name
(GenBank) sensory box protein
Organism
svo  Shewanella violacea
SSDB
Motif
Pfam: EAL GGDEF PAS_9 PAS_3 PAS_4 Reg_prop PAS PAS_7 PAS_8 Y_Y_Y
Other DBs
NCBI-ProteinID: BAJ00238
UniProt: D4ZEK8
LinkDB
Position
316292..320752
AA seq 1486 aa
MLLTKIIKNVCLLILFSTCLTPVTASDFVMRVFGEREGLEAGTINDISFDSHGFVWVATE
QGLYRLSNSKIRRIDKQKFDLRLSSEYINMVEPLSEKHLLVSNYSDTYLYNMLQNKFVRF
GSETLFPDYKGGGIIAQVKQGDHYIFLTLDGELLQYSYEKSLLERIVFLPTNADIPWGNL
AVLDDGRMIVGTEFELELRDSQGQRIAAFPWGEEFGLMKQLFKDSQGRIWLSSSEGVYRV
YADTLEIQAVEALSFYATNIAEDNLGDFWISGRLGLIKWRPGDTEYQTYKQQLKQVADMD
YIYDIEIDDSGLIWVGGAGEGLAIVTSEPDFLVDTYTAASPYSLSDEIIWGIYAEGEHVW
LGTDNGLFSINKLTQTSSRLFPQGLELNDSIYGVDSLDADNLLLSTTNGLFVVHKATFTA
QRFSQWTHGESSLENKIVYASYQDPLIQGRWWFMTSTGLYFWEPGLFDPQAMPVLSDDLS
SRIIDIRTVIRDESGTLWLGGTQVFGYLDNQGEFHSKLAKFSDGSTEVGVNNIEIIDANT
FWLGTSPRGLLEYTLDSGEARALNKDWEIDCTSVYFIQEIADFRLIACPNSLLRYSKSTG
ELKVIGHDDGLLGEELNDGSYFYDPSEGLYVGTPDGAMLLDVDSLSNRLMLDGVFLEAVS
VFYDEGMQIDLIPQDEKIIKPGARMISFQITSLNYLDDTPMTLQYRLRRERDIPEAKYLL
LDGQSQLNITGLQYGKYTLDILSQENGIWSAKPYSFSFTVKQYWWQMSWVKSLLLLSLLC
ICIGVILYRQRQVQAFKRINTALVESEERLRQSLKGSDSELWEWRHDSQMFSLENQREEK
EDDRGNIFLKLEDVPIHREDRDKVVNAWDNMQQGLSDRFDVEYRYRRKDKSWGWTRVLGR
PVEVDAESGSILRVAGIYSDITLQRQLEDDVKLLAQAFGNTSEGVLILDGAERIKVSNKA
AQTIVGASAEMLNGKFFSELILAKEGRSDDIVCLLKQEISWTGEQEFLREQGGSCPVWLN
VSAMLGSKGNITHYVAVFSDITERKRSEADLRRLANYDVLTGLPNRSLFATRLTQSIDGA
EHSGEKLALIFLDLDRFKHVNDSYGHSMGDALLVEAANRLQSCISPEHTLCRFGGDEFVI
LLRDAANLDTINHICTQLLEQIETPFELYGREFFISTSIGVSLWPDDAREAEVLINNADQ
AMYHAKEEGRGNFQYFSSERNSEALYHLRLEAELRKAIERDEFELHYQPQVNILKGDKLC
GMEALLRWHHHEDGLIRTDIFIKVAESCGLIVDIDLWVLRQACIQGKIWSKSYAEPFKLS
VNISAVHFRQPDFIQGVKRILQETELDPRLLGFEITEGVLMKELDTAKEHLLELRALGID
VAIDDFGTGYSSLAYLRHFDVDTLKIDRSFLIDIATNEADQAIASSIIELARNLKLNVVA
EGVETKEQLEQVFSRGCYVIQGYYFSKPLTVVEIEKYMDNSSPIFQ
NT seq 4461 nt   +upstreamnt  +downstreamnt
atgctattaactaaaattataaaaaatgtgtgtttactcatattgtttagtacttgcctg
actccggtcacggcaagtgattttgttatgcgtgtctttggagaaagagaaggtttagaa
gccggcacaataaacgatatcagcttcgattctcacggatttgtatgggtggctacggag
cagggattatatcgattaagtaactctaagattagacgtatagataagcaaaaattcgac
ctaaggctttccagtgaatacattaatatggttgagcctctgagtgagaagcatctatta
gtcagtaattattcagatacttacctatacaatatgctacaaaataagttcgtgcgtttc
ggtagtgaaacacttttccctgattataagggcggtgggatcatcgctcaggtgaagcaa
ggtgatcactatatttttctgactttagatggtgagttactccaatattcttatgaaaag
tccttgctggaacggattgttttccttccgactaatgccgatatcccttgggggaattta
gccgtcttagatgatggccgtatgatcgtcggcactgagtttgagttagagcttagagat
agccaaggtcagagaattgctgcttttccctggggagaagaattcggcctgatgaagcag
ttgtttaaagattctcaggggcgaatttggctgagttcaagtgaaggggtttatagagtt
tatgccgatactcttgagatccaagctgtcgaagcgctatctttttatgccaccaatata
gccgaagataacctgggtgatttttggatctccgggagactaggcttaatcaaatggagg
ccgggagacactgaatatcaaacgtataaacagcaacttaaacaagttgcagatatggat
tatatctatgacattgaaatcgatgactcaggacttatttgggtaggaggtgccggagag
ggccttgccatagtcacaagcgaaccagattttttagtcgatacctataccgctgcgtca
ccatactccttgagtgatgagattatttgggggatttatgccgagggtgaacatgtttgg
ttgggtaccgataacggcctgttctcgataaataaactaacccagacatctagccgttta
tttccccaaggtttagagctcaatgatagtatttatggtgtagatagtctggatgctgac
aaccttttattatcgaccaccaatggtctgttcgtggtgcacaaagcgacttttacggcc
caaagattttcccagtggactcatggtgagagctcgctggaaaataagatagtttatgcc
agttatcaagatcccctaattcaaggtcgctggtggtttatgacgtccactggcttgtat
ttctgggaaccaggtctgttcgaccctcaggctatgccggttttatccgatgatcttagc
tcgagaataatagatatccgcacggttatcagggatgagtctgggacactctggctcggt
ggtacccaagtctttggttatctggataatcaaggcgagttccattcaaaacttgccaag
tttagtgatggcagcacagaagtgggtgtcaataacatcgagataattgatgctaatacc
ttttggttgggaacatcaccaagaggtttactcgaatacacactggattccggtgaggca
agagcgctaaataaagattgggaaattgattgtacatctgtctatttcatccaggaaatc
gcagatttcaggttaattgcttgtcctaattccctgctcaggtatagcaaatctactggg
gaactcaaggttattggtcatgacgatggcttgctaggggaggaactcaatgatggttca
tatttttatgatcccagtgagggactttatgtgggcacaccggatggagctatgttgctg
gatgtcgacagtttatctaatcgacttatgcttgatggcgtgtttttggaggcggtttca
gttttctatgatgagggaatgcaaatcgaccttatcccccaagatgaaaaaatcataaaa
cccggtgcaaggatgatcagctttcagataaccagtctgaattatctcgatgatacccct
atgaccctacagtatcgcctcaggcgagaaagggacattcccgaagctaaatatttacta
ctagatggccagtctcagctcaacatcacaggcctgcaatacggaaaatataccttagat
atcttgagtcaagagaatggcatttggtctgctaaaccttacagttttagctttaccgtt
aagcaatattggtggcagatgtcctgggttaaaagcctgctgttattaagtctattatgt
atctgtatcggagttatcctgtatcgacagaggcaagttcaggcatttaaacggattaat
accgcattggtcgagagtgaagagaggctgaggcagtctctgaaaggcagtgactctgag
ctgtgggaatggcgccatgactctcagatgttcagcctggagaatcagcgggaagagaaa
gaggatgaccgaggcaatatcttcctcaagttagaggatgttcctattcatagggaagat
agagataaggtggttaatgcctgggataacatgcagcaaggcttgagtgaccgtttcgat
gtcgagtatcgctatcgccgcaaagacaagagctggggatggaccagagtcttggggcgt
ccggtggaggtggatgctgagtcgggtagtatattaagggtcgcggggatttattctgat
atcaccttgcagcgtcagttagaagacgatgtaaagttgctggcccaggcatttggcaac
acctccgaaggcgtgctgattttggacggcgcggagcgaattaaggtgtctaataaagcc
gcccaaaccatagtcggtgcctcggcggagatgctaaacggtaagtttttctctgaatta
attttagctaaagaggggcgttcggatgacattgtttgcctacttaagcaggaaatctcc
tggacaggtgagcaagagtttttacgtgaacaaggtggatcgtgtccggtctggcttaat
gtatcggctatgctggggagtaaaggaaacataactcattatgtggccgtattttccgat
ataactgagagaaaacgcagcgaggccgatcttaggcgtttggcaaattatgatgtgcta
actggccttcctaaccgttctttgtttgctactcgcctgactcagtcgatagatggtgca
gagcatagtggtgaaaaattagcgctgatatttctcgatctcgataggtttaagcacgtc
aatgactcctatggtcatagcatgggggatgccttgttggtggaggctgccaatcgtcta
cagtcttgtatttcaccagagcacaccttatgtcgcttcggcggcgatgaatttgtgatc
ttattaagagatgctgcaaacttagatacgataaatcatatttgtactcaattactcgag
cagatcgagacgcccttcgagctctatggtcgagagttttttatctctaccagcataggg
gtgagtttatggcccgatgatgccagggaggctgaggtgctgatcaataatgccgatcag
gctatgtatcacgccaaagaagaaggtcgtggtaactttcagtacttctcttccgaacgt
aattcagaagccttgtaccacctgagactggaagccgagcttcgtaaggcgatagagaga
gatgagttcgagctgcattaccaacctcaggtaaatatccttaaaggggataagttgtgc
ggtatggaagcactattgagatggcatcaccatgaagacggcttaatccgtaccgatata
tttatcaaggtggcagagtcttgtggcttgattgtcgatatagatctttgggtgttacgc
caggcctgtatacaaggcaagatctggtccaaatcttatgcagagccctttaaattatcg
gtaaatatctcggcggtccattttcgccagcctgattttatccaaggggttaaaagaatt
ttacaagagaccgagctagatcctcgcttattgggtttcgaaatcaccgaaggcgtgttg
atgaaggagttggatacggctaaggagcatcttttagagcttagagcgcttggaattgat
gttgcaatcgatgattttggtactggttactcctcattagcctatttacgccatttcgat
gtggatactttaaaaattgaccgctcattccttatcgatatcgccaccaatgaggcagat
caagctattgccagtagtattattgagcttgccagaaaccttaaactaaacgttgtcgcc
gaaggtgtggagacaaaagagcagcttgagcaggtctttagccgtggttgctatgtgatc
cagggatattatttctccaaacccttaactgtggtcgagatagagaaatatatggataat
tcaagcccaattttccaataa

DBGET integrated database retrieval system