Shewanella violacea: SVI_0267
Help
Entry
SVI_0267 CDS
T01206
Name
(GenBank) sensory box protein
Organism
svo
Shewanella violacea
SSDB
Ortholog
Paralog
Gene cluster
GFIT
Motif
Pfam:
EAL
GGDEF
PAS_9
PAS_3
PAS_4
Reg_prop
PAS
PAS_7
PAS_8
Y_Y_Y
Motif
Other DBs
NCBI-ProteinID:
BAJ00238
UniProt:
D4ZEK8
LinkDB
All DBs
Position
316292..320752
Genome browser
AA seq
1486 aa
AA seq
DB search
MLLTKIIKNVCLLILFSTCLTPVTASDFVMRVFGEREGLEAGTINDISFDSHGFVWVATE
QGLYRLSNSKIRRIDKQKFDLRLSSEYINMVEPLSEKHLLVSNYSDTYLYNMLQNKFVRF
GSETLFPDYKGGGIIAQVKQGDHYIFLTLDGELLQYSYEKSLLERIVFLPTNADIPWGNL
AVLDDGRMIVGTEFELELRDSQGQRIAAFPWGEEFGLMKQLFKDSQGRIWLSSSEGVYRV
YADTLEIQAVEALSFYATNIAEDNLGDFWISGRLGLIKWRPGDTEYQTYKQQLKQVADMD
YIYDIEIDDSGLIWVGGAGEGLAIVTSEPDFLVDTYTAASPYSLSDEIIWGIYAEGEHVW
LGTDNGLFSINKLTQTSSRLFPQGLELNDSIYGVDSLDADNLLLSTTNGLFVVHKATFTA
QRFSQWTHGESSLENKIVYASYQDPLIQGRWWFMTSTGLYFWEPGLFDPQAMPVLSDDLS
SRIIDIRTVIRDESGTLWLGGTQVFGYLDNQGEFHSKLAKFSDGSTEVGVNNIEIIDANT
FWLGTSPRGLLEYTLDSGEARALNKDWEIDCTSVYFIQEIADFRLIACPNSLLRYSKSTG
ELKVIGHDDGLLGEELNDGSYFYDPSEGLYVGTPDGAMLLDVDSLSNRLMLDGVFLEAVS
VFYDEGMQIDLIPQDEKIIKPGARMISFQITSLNYLDDTPMTLQYRLRRERDIPEAKYLL
LDGQSQLNITGLQYGKYTLDILSQENGIWSAKPYSFSFTVKQYWWQMSWVKSLLLLSLLC
ICIGVILYRQRQVQAFKRINTALVESEERLRQSLKGSDSELWEWRHDSQMFSLENQREEK
EDDRGNIFLKLEDVPIHREDRDKVVNAWDNMQQGLSDRFDVEYRYRRKDKSWGWTRVLGR
PVEVDAESGSILRVAGIYSDITLQRQLEDDVKLLAQAFGNTSEGVLILDGAERIKVSNKA
AQTIVGASAEMLNGKFFSELILAKEGRSDDIVCLLKQEISWTGEQEFLREQGGSCPVWLN
VSAMLGSKGNITHYVAVFSDITERKRSEADLRRLANYDVLTGLPNRSLFATRLTQSIDGA
EHSGEKLALIFLDLDRFKHVNDSYGHSMGDALLVEAANRLQSCISPEHTLCRFGGDEFVI
LLRDAANLDTINHICTQLLEQIETPFELYGREFFISTSIGVSLWPDDAREAEVLINNADQ
AMYHAKEEGRGNFQYFSSERNSEALYHLRLEAELRKAIERDEFELHYQPQVNILKGDKLC
GMEALLRWHHHEDGLIRTDIFIKVAESCGLIVDIDLWVLRQACIQGKIWSKSYAEPFKLS
VNISAVHFRQPDFIQGVKRILQETELDPRLLGFEITEGVLMKELDTAKEHLLELRALGID
VAIDDFGTGYSSLAYLRHFDVDTLKIDRSFLIDIATNEADQAIASSIIELARNLKLNVVA
EGVETKEQLEQVFSRGCYVIQGYYFSKPLTVVEIEKYMDNSSPIFQ
NT seq
4461 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
atgctattaactaaaattataaaaaatgtgtgtttactcatattgtttagtacttgcctg
actccggtcacggcaagtgattttgttatgcgtgtctttggagaaagagaaggtttagaa
gccggcacaataaacgatatcagcttcgattctcacggatttgtatgggtggctacggag
cagggattatatcgattaagtaactctaagattagacgtatagataagcaaaaattcgac
ctaaggctttccagtgaatacattaatatggttgagcctctgagtgagaagcatctatta
gtcagtaattattcagatacttacctatacaatatgctacaaaataagttcgtgcgtttc
ggtagtgaaacacttttccctgattataagggcggtgggatcatcgctcaggtgaagcaa
ggtgatcactatatttttctgactttagatggtgagttactccaatattcttatgaaaag
tccttgctggaacggattgttttccttccgactaatgccgatatcccttgggggaattta
gccgtcttagatgatggccgtatgatcgtcggcactgagtttgagttagagcttagagat
agccaaggtcagagaattgctgcttttccctggggagaagaattcggcctgatgaagcag
ttgtttaaagattctcaggggcgaatttggctgagttcaagtgaaggggtttatagagtt
tatgccgatactcttgagatccaagctgtcgaagcgctatctttttatgccaccaatata
gccgaagataacctgggtgatttttggatctccgggagactaggcttaatcaaatggagg
ccgggagacactgaatatcaaacgtataaacagcaacttaaacaagttgcagatatggat
tatatctatgacattgaaatcgatgactcaggacttatttgggtaggaggtgccggagag
ggccttgccatagtcacaagcgaaccagattttttagtcgatacctataccgctgcgtca
ccatactccttgagtgatgagattatttgggggatttatgccgagggtgaacatgtttgg
ttgggtaccgataacggcctgttctcgataaataaactaacccagacatctagccgttta
tttccccaaggtttagagctcaatgatagtatttatggtgtagatagtctggatgctgac
aaccttttattatcgaccaccaatggtctgttcgtggtgcacaaagcgacttttacggcc
caaagattttcccagtggactcatggtgagagctcgctggaaaataagatagtttatgcc
agttatcaagatcccctaattcaaggtcgctggtggtttatgacgtccactggcttgtat
ttctgggaaccaggtctgttcgaccctcaggctatgccggttttatccgatgatcttagc
tcgagaataatagatatccgcacggttatcagggatgagtctgggacactctggctcggt
ggtacccaagtctttggttatctggataatcaaggcgagttccattcaaaacttgccaag
tttagtgatggcagcacagaagtgggtgtcaataacatcgagataattgatgctaatacc
ttttggttgggaacatcaccaagaggtttactcgaatacacactggattccggtgaggca
agagcgctaaataaagattgggaaattgattgtacatctgtctatttcatccaggaaatc
gcagatttcaggttaattgcttgtcctaattccctgctcaggtatagcaaatctactggg
gaactcaaggttattggtcatgacgatggcttgctaggggaggaactcaatgatggttca
tatttttatgatcccagtgagggactttatgtgggcacaccggatggagctatgttgctg
gatgtcgacagtttatctaatcgacttatgcttgatggcgtgtttttggaggcggtttca
gttttctatgatgagggaatgcaaatcgaccttatcccccaagatgaaaaaatcataaaa
cccggtgcaaggatgatcagctttcagataaccagtctgaattatctcgatgatacccct
atgaccctacagtatcgcctcaggcgagaaagggacattcccgaagctaaatatttacta
ctagatggccagtctcagctcaacatcacaggcctgcaatacggaaaatataccttagat
atcttgagtcaagagaatggcatttggtctgctaaaccttacagttttagctttaccgtt
aagcaatattggtggcagatgtcctgggttaaaagcctgctgttattaagtctattatgt
atctgtatcggagttatcctgtatcgacagaggcaagttcaggcatttaaacggattaat
accgcattggtcgagagtgaagagaggctgaggcagtctctgaaaggcagtgactctgag
ctgtgggaatggcgccatgactctcagatgttcagcctggagaatcagcgggaagagaaa
gaggatgaccgaggcaatatcttcctcaagttagaggatgttcctattcatagggaagat
agagataaggtggttaatgcctgggataacatgcagcaaggcttgagtgaccgtttcgat
gtcgagtatcgctatcgccgcaaagacaagagctggggatggaccagagtcttggggcgt
ccggtggaggtggatgctgagtcgggtagtatattaagggtcgcggggatttattctgat
atcaccttgcagcgtcagttagaagacgatgtaaagttgctggcccaggcatttggcaac
acctccgaaggcgtgctgattttggacggcgcggagcgaattaaggtgtctaataaagcc
gcccaaaccatagtcggtgcctcggcggagatgctaaacggtaagtttttctctgaatta
attttagctaaagaggggcgttcggatgacattgtttgcctacttaagcaggaaatctcc
tggacaggtgagcaagagtttttacgtgaacaaggtggatcgtgtccggtctggcttaat
gtatcggctatgctggggagtaaaggaaacataactcattatgtggccgtattttccgat
ataactgagagaaaacgcagcgaggccgatcttaggcgtttggcaaattatgatgtgcta
actggccttcctaaccgttctttgtttgctactcgcctgactcagtcgatagatggtgca
gagcatagtggtgaaaaattagcgctgatatttctcgatctcgataggtttaagcacgtc
aatgactcctatggtcatagcatgggggatgccttgttggtggaggctgccaatcgtcta
cagtcttgtatttcaccagagcacaccttatgtcgcttcggcggcgatgaatttgtgatc
ttattaagagatgctgcaaacttagatacgataaatcatatttgtactcaattactcgag
cagatcgagacgcccttcgagctctatggtcgagagttttttatctctaccagcataggg
gtgagtttatggcccgatgatgccagggaggctgaggtgctgatcaataatgccgatcag
gctatgtatcacgccaaagaagaaggtcgtggtaactttcagtacttctcttccgaacgt
aattcagaagccttgtaccacctgagactggaagccgagcttcgtaaggcgatagagaga
gatgagttcgagctgcattaccaacctcaggtaaatatccttaaaggggataagttgtgc
ggtatggaagcactattgagatggcatcaccatgaagacggcttaatccgtaccgatata
tttatcaaggtggcagagtcttgtggcttgattgtcgatatagatctttgggtgttacgc
caggcctgtatacaaggcaagatctggtccaaatcttatgcagagccctttaaattatcg
gtaaatatctcggcggtccattttcgccagcctgattttatccaaggggttaaaagaatt
ttacaagagaccgagctagatcctcgcttattgggtttcgaaatcaccgaaggcgtgttg
atgaaggagttggatacggctaaggagcatcttttagagcttagagcgcttggaattgat
gttgcaatcgatgattttggtactggttactcctcattagcctatttacgccatttcgat
gtggatactttaaaaattgaccgctcattccttatcgatatcgccaccaatgaggcagat
caagctattgccagtagtattattgagcttgccagaaaccttaaactaaacgttgtcgcc
gaaggtgtggagacaaaagagcagcttgagcaggtctttagccgtggttgctatgtgatc
cagggatattatttctccaaacccttaactgtggtcgagatagagaaatatatggataat
tcaagcccaattttccaataa
DBGET
integrated database retrieval system