KEGG   Shewanella violacea: SVI_1172
Entry
SVI_1172          CDS       T01206                                 
Name
(GenBank) type IV pilin biogenesis protein, putative
  KO
K02674  type IV pilus assembly protein PilY1
Organism
svo  Shewanella violacea
Brite
KEGG Orthology (KO) [BR:svo00001]
 09180 Brite Hierarchies
  09183 Protein families: signaling and cellular processes
   02044 Secretion system [BR:svo02044]
    SVI_1172
   02035 Bacterial motility proteins [BR:svo02035]
    SVI_1172
Secretion system [BR:svo02044]
 Type II secretion system
  Pilin secretion/fimbrial assembly protein
   SVI_1172
Bacterial motility proteins [BR:svo02035]
 Pilus system
  Pilus assembly proteins
   SVI_1172
SSDB
Motif
Pfam: T4P_PilY1
Other DBs
NCBI-ProteinID: BAJ01143
UniProt: D4ZHJ4
LinkDB
Position
1366750..1370433
AA seq 1227 aa
MFVLVDLLLPTFKKTTTMINFCFAFIVNAVKSQGQVLPLAKIISLKNHSFGLFFGIVLAI
SAAPFFSFADDTQLYVFESTARTGARPQMLIIFDNSGSMGARVYDVDAPYVKGAGGLKVG
NFAKTGKLYYSRGPTNKANLPNPDNADEKRQFSGAINGCQSSWQYLNKYGVFTGFFREYR
FAGSNGTWKEITGSNANNALAIDCFEDIQDSKWRNAAGADPGLPVDSLGTPSSLINYTVA
SASSNSKTKRNATDKAALTGFGTGRVITVYTEDYLRWEHGVKNKVTKTRLELAKDAIKNV
ILTTPGVDFGLSIFNMNGPGDNQRDGGRIISGIKNMSSKGKIDLLTSVQSITYAQNTPLC
ETLYEAYRYFSGQSVLFGDDDSDYISYDRWGRYRGIYKSNRNSPLDPDILDAGVYSSPLK
KCQDKAYIVYITDGEPTVDSAANHAIQSLTGGVDKHTAYPVSYLSAMSSWMNNHDVNPKE
PGVQHVSTFTIGFSEGAASAASLLKKTAAVGGGSYFDATNAKLLQGSLQQAVNKILEKNA
SFTSPAVASNNFNRTQSFEYAYYSMFLPNKGPRWTGNIKKFKVTGSGDIIDQNGKNAIGG
DGNIKAEACSYWTPKSVCDAGGDGNEVIKGGVLSAMQHARSRTLYSNLSSEMTILTKSEA
ADFAGGRDSLASYMGVEESQLASLFSWTRGLDVDNDKNQKKISTPKSNWRTDIMGDALHS
KPLALNFGDKANPDIRVMVGTNHGFFHMFKDAGAEVSESWAFIPYELLPNLKILRANVPT
GVHSVYGIDASPVAYTKMDDSGIETAWVFFGMRRGGGSYYAIDISDPDSPEFMWKIDSNS
EGMSELGQSWSTPVVTTIQGESGEQPVLIFGAGYSPAGKDSASIGSVDTKGRGVFIVNAQ
DGELIHHFGVGTSSGTQIPGIIDSIPSSVAVLDANDDGKTDRIYATDTGGNVWRMDLATS
DKSTWSAFKFASLGGGSLSSNRRFFSGPVVAQTMFNNISEVEYNVNGATKTTITYQNIPY
DAVVVGSGHRAMPSDLSRADMFFTLQDRNVALTSFKSGNTKVKIPEPLTLANLYDVSAAE
PKSKAEHLSFGKTRGWYYDFSRRGEKNLSSATIINGRVFFTSYVPGSLVNSDQCLISGKG
YLYNFDLHKGQRDFEYRKINDSVPDTPQMIIPPRDADVDGNHPPSNIYLIGIGNAVPNEK
TQAGCEPGDLNCVGGGLRASKIYYFQH
NT seq 3684 nt   +upstreamnt  +downstreamnt
ttgtttgtattagtcgatttgctgttaccaacatttaagaaaacaacaaccatgattaat
ttctgttttgcattcattgttaatgcagttaaatctcaagggcaagttttgcctttagct
aaaattatctcactaaaaaatcatagtttcggcctatttttcggtatcgttttggccata
tctgctgcacctttcttctcttttgcagatgatactcagctctatgtcttcgagtctact
gcacgtacaggtgcgcgtcctcagatgctaattatttttgataattctggcagcatgggg
gcaagagtctatgatgtcgatgcgccttatgtgaaaggagcgggagggctaaaagtgggt
aatttcgctaagactggtaagttgtattacagccgaggtccgaccaataaagctaattta
cctaacccggataatgctgatgaaaaacgccaattttcaggggccataaacggctgccaa
agttcatggcaatatctcaacaaatacggtgtatttaccggtttctttcgtgagtaccgc
ttcgccggttctaatggaacatggaaagaaatcaccggatccaatgctaacaatgccttg
gcaatcgattgttttgaagatatccaggatagtaagtggcgcaatgccgcgggtgcagac
ccaggacttcccgtcgatagtttaggtactccttcttcccttattaattatactgtagca
agtgctagttcaaactctaagactaaacgaaatgcgacagacaaagcggcgttaactgga
tttggtacaggtcgagtcattactgtttacaccgaagattatttgcgttgggagcatggg
gtcaaaaataaggtcactaagacacgactcgaactggccaaagatgcgattaaaaatgtg
atcttgaccacaccgggcgtcgactttggtttgtcgattttcaatatgaacgggcctggg
gataatcaacgcgatggcggacggattatttctggcataaagaacatgtcgtcaaaagga
aaaatagatctgctgacgagtgtacaaagtattacttacgcacaaaacacgccattgtgt
gaaaccttgtacgaagcctatcgatacttctctgggcaatcggtactgtttggtgatgac
gatagcgattatatctcttatgaccgttggggcaggtaccgaggaatttacaaatcaaat
cgaaattcgcctctagacccagatatcctcgatgctggtgtatacagttcaccacttaaa
aaatgtcaagataaagcctatattgtctatatcacagatggtgagccgaccgtggatagc
gctgctaatcatgcgattcaatctttgactggtggggtcgataagcatactgcttaccca
gttagctatctaagtgccatgtccagttggatgaataaccatgatgtaaaccctaaagag
cctggggtccaacatgtatcaacattcaccataggttttagtgaaggagcagctagtgct
gcctcattgttaaagaaaaccgcagcggttggtggggggagttacttcgatgccaccaat
gccaagttgttacaagggtctttgcagcaagcagtaaataaaatcctcgaaaaaaatgcc
agctttacttcacctgcggtggcgagtaataactttaatcgaacccagtcttttgagtat
gcatattattcgatgtttcttcctaataagggtccacgttggacaggtaacataaagaag
ttcaaggtgaccggaagtggcgatattatcgaccagaatggaaaaaatgccataggtggt
gatggcaatattaaggccgaagcctgttcatattggacacctaagtcagtatgcgatgca
ggcggagatggtaatgaagtgattaaaggcggcgtgctttcagctatgcagcatgcacgt
tctcgaaccctttacagtaatttgtcttcggaaatgacaatattaactaagagtgaagcc
gctgattttgcaggaggtagggactcgttagctagctacatgggggtggaagaatctcag
ctagcgtcattgttttcatggactagaggcttagatgtcgataatgataaaaatcaaaaa
aaaatctcgactcctaaatcaaattggcgtaccgatatcatgggggatgcgctgcattcg
aaacctttagcgttaaactttggtgataaggctaatccagatattagggtcatggttggg
actaaccacggtttctttcatatgtttaaagatgcaggcgcagaagtatcagagtcttgg
gcatttattccttatgaactactacctaatcttaaaatcttaagggccaatgttcctacc
ggtgttcattcagtttatggcatagacgctagcccagttgcttatacaaaaatggatgat
tcagggattgagacggcttgggtattctttggcatgcgtcgaggcggaggcagttattac
gccatagatatcagtgatcctgattcacctgaatttatgtggaaaatagattcaaattcc
gaaggcatgtctgagttaggccagtcttggtcaacgccagtagtgacaacgattcaaggc
gaaagtggtgagcagccggtattgatttttggtgcaggatattcccctgcaggaaaagac
agtgccagcattggcagtgtggatactaagggacgtggcgtgtttattgttaatgcacaa
gacggtgagcttattcatcactttggcgtaggcacttctagtggtactcaaatcccaggc
ataattgatagtattccaagttcagtagctgtcttagatgctaatgatgatggtaaaacc
gatcgtatctatgccacagatacgggagggaatgtatggcgtatggatctggccacctca
gataaatcgacttggtcggcatttaaatttgctagcttaggtgggggctcattatcgtca
aatcgccgcttcttctcaggtcccgtagtggcccagactatgtttaataatatctctgag
gttgaatataatgttaatggcgctaccaaaaccactattacctatcagaatatcccctat
gacgctgtagttgtgggcagtggtcatagagccatgccttcggatctgtctcgtgccgat
atgttttttaccctgcaagatagaaatgtcgcattaacgtcttttaagtcgggtaatact
aaggtcaaaatacctgagccattaactttggccaacttatacgatgtcagcgctgcagag
cctaaatcgaaagctgaacacctttcatttggaaaaacccgtggttggtattatgacttt
agtcgccgtggagagaaaaacttatcctcagcgaccatcatcaatggacgggtatttttc
acgtcttatgtacctggcagcttagtaaatagtgatcaatgcttaatttccggtaagggc
tacttatacaatttcgatctacacaagggacagcgtgattttgaatatcgaaagattaac
gattctgtgcccgatactccgcaaatgatcattcctcctagagatgcagatgtcgatgga
aatcatccgccaagcaatatctatctgataggtattggcaatgcggtacctaatgaaaag
acacaagctggctgtgagcctggagatcttaattgcgttggtggtgggttaagagcaagt
aaaatatattactttcagcattaa

DBGET integrated database retrieval system