Shewanella violacea: SVI_2886
Help
Entry
SVI_2886 CDS
T01206
Name
(GenBank) GGDEF domain protein
Organism
svo
Shewanella violacea
SSDB
Ortholog
Paralog
Gene cluster
GFIT
Motif
Pfam:
EAL
GGDEF
Motif
Other DBs
NCBI-ProteinID:
BAJ02857
UniProt:
D4ZMF8
LinkDB
All DBs
Position
complement(3263363..3264976)
Genome browser
AA seq
537 aa
AA seq
DB search
MSFNMTNKKPIPLHRKLFYKMFDSAFSREISFIFILSVILLIICVNIDAFEKLVDFVEYY
EYYELDEIVMLVLISSISFMVIIIRNVKHLNVEIKLRIKSENKLNKLAFFDPLTGLPNRA
LFKNKLEQFVSRDKESMQLGAVLYIDLDDFKNINDSMGHAWGDELLKKFSERLQIQLRTY
DTLFRISGDEFTVIIGSPINIHGISTLAEKLIESLKAPFILDREEVYTSMSVGVAVFPTD
AQTAKGLLKCADTAMYSAKHEGKGHYRYYSIDLDKQAKLKLKISNKLRRAIELEEFTLNY
QPIIDIETQEVKGAEALLRWNNKELGCVGPDIFIPIAEEIGLINEIGNWVLRQACWQNKQ
WHLAGYSYLMMSVNMSSKQLVNDDFINVVNNALVKSQLEGSYLELELTETALLGNLEIAI
EQIYRLKKMGVCIALDDFGTGYSSMSYLVKLKIDRLKIDKSFIDNIPHSEDDRITTHAII
SLANNLNLQVTAEGIETEEQYKYVKSTSCNAAQGYYFSHPLTADNFKFLLDKSPTFS
NT seq
1614 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
atgagttttaatatgaccaataaaaaaccgatccctttacatcgtaaacttttttataaa
atgtttgattctgctttttcaagagaaatttcctttatatttattctttccgtaattttg
ttgattatctgtgtcaatattgatgcgttcgagaagcttgttgattttgttgaatattat
gaatattacgaacttgatgagatagtcatgcttgtgctcatctcatctatttcttttatg
gtcataataattaggaatgttaaacatcttaacgttgaaatcaaattacggattaagagt
gaaaacaaacttaataaactggcattttttgatcctttaacaggtttaccaaatagagcg
ctatttaaaaataaattagaacaatttgtaagtcgtgacaaagaaagtatgcagttggga
gccgtactttatatagacttagatgattttaaaaatattaatgacagtatgggtcatgct
tggggcgacgagcttttaaaaaagttttctgaacggttacaaattcaattgaggacatat
gacaccttgtttcgtatttcaggagatgaatttacggtaataataggatcacctattaac
atacacggtataagtaccttagctgaaaaattaatagaaagtttaaaggctccctttatt
ttagaccgtgaagaagtgtataccagtatgagtgttggcgtggcagtgttcccaacagat
gctcaaacagcgaaaggcttacttaaatgtgcggatactgccatgtatagtgcaaagcat
gaagggaagggacactaccgatattactcaatagaccttgataaacaagcaaaacttaaa
ttgaaaataagtaacaagttacgcagagcaatagagctagaagagtttacacttaattat
caacctattattgacattgaaacacaagaagtaaaaggtgcagaggcactgctgcgttgg
aacaataaggaattgggctgtgttggccctgatatttttattcctattgctgaagaaatt
ggcttgattaatgaaattggtaactgggtccttcgacaggcttgttggcaaaataagcag
tggcatttagccggatactcatatttgatgatgtcagttaatatgtcatcaaaacaatta
gttaatgatgattttatcaatgtagttaacaatgctctagtaaagtcacagcttgagggg
agttatcttgagttagaattgacagaaacagccttactagggaatttggaaatagcaatt
gaacagatatatagattgaaaaaaatgggagtatgtattgccttagatgattttggaact
ggatactcgtccatgagttatttagttaagttaaaaatagatagacttaaaattgataaa
agttttatcgacaacattccccatagtgaagatgatagaataacaactcatgcaatcatt
tcattagcgaataacttaaacctgcaagttaccgcagaaggtattgaaacagaggaacaa
tacaagtatgttaaatcaacaagttgtaatgccgcccaagggtattattttagtcaccct
ctaacggctgataatttcaaatttcttttggataaatcgccaacattctcataa
DBGET
integrated database retrieval system
