Shewanella violacea: SVI_2888
Help
Entry
SVI_2888 CDS
T01206
Name
(GenBank) peptidase, U32 family
KO
K08303
U32 family peptidase [EC:3.4.-.-]
Organism
svo
Shewanella violacea
Brite
KEGG Orthology (KO) [BR:
svo00001
]
09180 Brite Hierarchies
09181 Protein families: metabolism
01002 Peptidases and inhibitors [BR:
svo01002
]
SVI_2888
Peptidases and inhibitors [BR:
svo01002
]
Peptidases of unknown catalytic type
Family U32
SVI_2888
BRITE hierarchy
SSDB
Ortholog
Paralog
Gene cluster
GFIT
Motif
Pfam:
Peptidase_U32
DUF3656
Radical_SAM
Motif
Other DBs
NCBI-ProteinID:
BAJ02859
UniProt:
D4ZMG0
LinkDB
All DBs
Position
complement(3267423..3269714)
Genome browser
AA seq
763 aa
AA seq
DB search
MDPKIELLAPGGDVDAIKAAIIAGADAVYCGLDTFNARNRAANISFEELVGIIRLAHQYQ
CQIFLTLNIVILENEFKSLAKLLSKLVNTTLDGVIVQDIGMFHLLTKHFPTLDIHASTQL
TTHNIGQIPFLKKLGASRVNLSRELNLREIAALTETGRENDITTEVFVHGSLCIAFSGLC
YSTSASVGNSGNRGRCSQACREEYETTESGHNFPLNIKDNSAFFDLPALIEAGVHSFKVE
GRIKGASYVHTVIDSFRKQIDGFLATGELLEDGERLYKVFNRDLTNSFLKGDLNQSMFID
NPRDNSKNHLKDKLTHNGLKSISVVQIHDAEQELQTEKSQIQASVNDKIKHLSIEKLPLT
LSFSGQLGQPLTITVSTQDFIIGQTQLEDKTFTVQSPSLLTLSDDASIDASSIEKRFKSL
NNAEFDLLQLVTDDLAPGLSIPFKELTGLKKQVLLLLNHETPVLPAVELPKLARYPKPET
HRPKLSILICDEADIALADVTDADIYFKLPDAYKRGCTKYVEFFKQNPRLIPWFSSVLIG
KDFDAALNILEQVRPKLIVTNNTGIANRAYELGIKWIAGPFLNTTNSYALLAMQEQFDCH
GAFISNEINQNQIKHIARPANFKMLYSIYHPILLMASRQCFFQQSVGCEKPRIDNGCMLS
CDKSTSITNLKGDEFAIDKQKAGYPSIYNQDQFLNTEIIEDLAHLFDGFMIDLTNIGAGD
KPSPDKELLIQQFELLLSGQSNLATSLGNIVPKSTVLQYHNGL
NT seq
2292 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
atggatccaaagattgaattattagcaccaggcggagatgttgatgcgattaaagcggca
attattgccggagccgacgccgtttattgtggcttagatacttttaatgctcgtaaccgt
gcagctaatatttcctttgaggaacttgttgggatcatacgtttagcacaccagtatcag
tgtcagatttttcttacattgaatattgttattttagaaaatgagtttaagtcactggca
aagctactaagtaagttggttaataccacattagacggtgtgatcgtgcaagatattggc
atgttccatttactcacaaagcatttccctacattagacattcacgcatcgactcagcta
accacccataatattggtcaaatccctttcttgaagaagttaggcgcctcgcgagttaat
ttatcgagagagcttaatttacgggagatagccgcattaactgagactggtcgtgaaaac
gatatcaccactgaagtgtttgtgcatggatccttatgcatagcgttctcagggttatgt
tattcaacatctgccagtgtgggtaactcaggtaaccgcggacgttgtagtcaagcttgc
cgtgaagagtatgagaccactgagtcaggtcataactttccgctcaatatcaaagataac
tcggcatttttcgatctacctgcattgattgaagccggtgttcactcgtttaaggtggaa
ggtcgcatcaaaggtgcaagttacgtccatacagtaatagacagctttcgtaagcagatt
gatggcttcctagcgactggagagctgcttgaagatggtgagcgcctctataaggtattt
aatcgggatctaaccaactcttttctaaagggggacttaaatcagtcgatgtttatcgat
aatcctcgtgataactcgaaaaatcaccttaaagataagctcactcacaatggtttgaag
tctatttcggtagtgcaaattcatgatgcggagcaagaattacagacagaaaagagccaa
attcaagcgtctgtcaacgataaaattaaacatctgagcatagaaaaactgcccctgaca
ttgtctttctcaggtcaattgggccagccgttaaccattaccgtcagcactcaagacttt
attattggtcaaacccagttagaggataaaacctttacagtgcagtctcctagcttgctg
actctcagtgatgatgccagcattgatgccagttcgattgagaagcgatttaagagttta
aataatgcagagttcgacttgctgcagctagtcactgatgatttagccccaggccttagc
attccttttaaggaactgacaggcttaaagaagcaagtgctattgctacttaaccatgaa
accccagtgttaccagccgttgaattacctaaattggctaggtatcccaagcctgaaaca
cacagacctaaactgtctatcttgatctgtgatgaggctgatatcgcgcttgccgatgtc
accgatgccgacatttactttaagttacccgatgcctataagcgcggctgtactaagtat
gtcgaattcttcaaacaaaacccgcgtctaatcccttggttctcatcagtgctgataggt
aaagattttgatgctgcgctgaatattttagagcaagttcgacctaagcttattgtgacc
aataatacaggtatcgctaatcgcgcctatgagcttgggattaaatggattgcgggtccg
tttttaaacaccaccaactcttatgcattattggccatgcaagagcagtttgattgtcat
ggtgcctttatttctaacgaaatcaatcagaatcaaattaaacatattgcacgacctgca
aacttcaaaatgctatacagcatctatcatcctattttgcttatggcgagcagacagtgt
ttcttccagcagagtgtaggttgtgaaaagccacgtatcgacaatggctgcatgttgtct
tgtgataaatcgaccagcatcaccaaccttaaaggtgatgagtttgctatcgataagcaa
aaagcaggctatcccagtatttataatcaagatcaattcttaaatactgagatcattgaa
gatctggctcatctttttgatggctttatgattgatttaaccaacataggtgccggagat
aagccatctcctgacaaggagctgctaatccaacagtttgagctactcctcagcggccaa
tctaatctggctacaagcttaggcaatatagtgccgaaatctacggtattgcaataccac
aatggcttgtaa
DBGET
integrated database retrieval system
