Shewanella violacea: SVI_3119
Help
Entry
SVI_3119 CDS
T01206
Name
(GenBank) serine/threonine protein kinase, putative
Organism
svo
Shewanella violacea
SSDB
Ortholog
Paralog
GFIT
Motif
Pfam:
LRR_8
PK_Tyr_Ser-Thr
LRR_14
Pkinase
LRR_4
LRR_LRWD1
LRR_1
LRR_9
Kdo
LRR_At5g56370
ABC1
YJL043W_N
RIO1
Motif
Other DBs
NCBI-ProteinID:
BAJ03090
UniProt:
D4ZAP5
LinkDB
All DBs
Position
complement(3526883..3528265)
Genome browser
AA seq
460 aa
AA seq
DB search
MQTLAALKNGQLTSTIRLQLAENLTEFPREIFDLADTLEVLDLSNNGLSSLPDDFGRLTQ
LRILFLSNNQFETLPKVLADCPKLEMIGFKANKIRTVDEDALPVQTRWLILTDNKIEALP
DSMGQLYRLQKLALAGNRLSSLPESMANCKNLELVRLSANQLTHLPDWLLQLPKLAWLAF
AGNPLDNNASISEPSMVKAMLTVKMTDIDLAEQLGEGASGVIYKGQWNHQPVSLHGTPDT
IAVKLFKGEVTSDGYPADELACCLQAGEHTNLIKVISQINEQEHLGLVMELIPPSFFNLG
LPPSLVTCTRDTFESGTQFSVSQIAKILQQMAATMTHLHRQAVSHGDLYAHNTMINSDAE
MLFGDFGASSELSVLPERQREAMQAIEVRAFGCLLDDLLSVNAKHLNDEAEKSGQQALLS
GLVQIRDSCLDDEFALRPRFFEISDKLASVVLQPVTEAQL
NT seq
1383 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
ttgcaaacattagcagcacttaaaaatggacagttaacatcgacgatacgtttacagtta
gccgaaaatctaactgaatttccccgagagatctttgatttagctgatactttagaagtg
ctggatctttctaataatggcttatccagtttacccgatgactttggccggctgacacag
ctcagaattcttttcctgtcaaacaatcaatttgaaaccttacctaaggtgttagccgat
tgtcctaagcttgagatgataggttttaaggcgaataaaattcgcactgtcgacgaagat
gccttgccggttcagactcgctggttaatcttaaccgataataaaatcgaggcattacct
gattctatggggcaactgtatcgcctgcagaagctcgccctggcggggaatcgtctctcg
tcgctgcctgagtctatggctaattgtaaaaatctagaattagtacgtttatcggcaaac
caacttactcatcttcccgattggttattgcaattacctaagctagcttggttagcattc
gctggtaatcctctggataataatgcttcaattagcgagccttcgatggtcaaggctatg
ctcacggttaagatgacagatatcgacttagccgagcaactcggtgagggcgcatccggt
gtcatctataaaggtcagtggaatcaccagcctgttagcttacatggcacgcctgatact
atcgcggtaaaactgtttaagggtgaggtcactagtgatggttatcctgccgatgaacta
gcctgttgtttgcaggctggtgagcatacaaaccttattaaagtcatctctcagataaac
gagcaagagcatctgggtctggtgatggaattgatcccgccgagtttctttaacttaggt
ctgccaccctctctggtaacttgtacacgagataccttcgaatccgggactcagtttagc
gtgtcacaaatcgctaaaattttacagcagatggcggcgactatgacacatctgcaccgt
caagctgtgagtcatggggatctctatgcccacaacaccatgattaatagtgatgctgag
atgctatttggtgattttggtgcctcgtcggaattatctgtgctacctgagcgacaaaga
gaggcgatgcaagccatagaagttagagcctttggctgtctactggacgatctcttgtcc
gttaatgcgaaacacttaaacgatgaagccgagaaatcgggccagcaagcgctcttgtct
gggttagtacaaatcagagacagctgcttagatgatgagtttgcacttcgtcccagattc
ttcgaaattagcgacaagctagcgtcagttgttttgcagccagtgactgaagcccagctg
taa
DBGET
integrated database retrieval system
