KEGG   Shewanella violacea: SVI_3845
Entry
SVI_3845          CDS       T01206                                 
Name
(GenBank) RTX toxin, putative
  KO
K20276  large repetitive protein
Organism
svo  Shewanella violacea
Pathway
svo02024  Quorum sensing
Brite
KEGG Orthology (KO) [BR:svo00001]
 09140 Cellular Processes
  09145 Cellular community - prokaryotes
   02024 Quorum sensing
    SVI_3845
SSDB
Motif
Pfam: Big_9 Cadherin_4 K319L-like_PKD
Other DBs
NCBI-ProteinID: BAJ03816
UniProt: D4ZCS1
LinkDB
Position
4373164..4382586
AA seq 3140 aa
MIMGVSVTEQDAVVTNLVGQLKAKDEQGNIRDVTIGDLIKDGEQLIFAPNSQFILHMADG
TIITETNFSEPIPESSLGAAPELATAPVSADAEIAALQAQILAGDDPTAGLPETAAGTAA
GGGGNQGGSDYITLGRTGDETLAGSGYDTAGFALAPAPTEDPVILTAELPEPPTIDASSV
TLLEANLLQGSNPLAAALEQSNSLQVGAQTGISALTINGIDIFIGGLFVGPITLTTDNGV
LVITSFDAVTGTLNYNFTLDTDVDNSASDTLSQIFTTLVTDLAGITTASTITVNIIDDSP
NAVDDSNTVSENGDIAIVITGNVLANDTQGADSAVVSQISNTDVATQAIAATTNISGDFG
LLQISADGSYTYQLDNSLGNVQALAQGELVTETFTYQLADSDGDTVAATLTITITGTNDI
PVIVVIDPDVPVDPDNPVDPILGAEGLVVEAGNEDDGTVVSGVLNTTGLFEPADVDNGAV
LVWSGDATGSLGSFTIDPVTGEWSYTLDNSLADSLAEGDTVQEIFIVTVTDEFDATATQQ
VTITVQGTNDSPIITSSDAAATGTVVEASTLDDETLDPGIPQTSGLLTATDVDNGAQLSW
SGNSAGTYGSFSIDSASGSWVYNLDNDLADSLAEGEVILEEFLVTVTDEFGATDTQLVTI
TVIGTNDAPQITSTSEDAEGVVIETGNADNGTVLPGVLISTGTLDAGDIDNNAVLIFSGS
TDGSFGSFFIDPVTGEWTYTLDDSLADSFAEGQSTEEVFLVTVTDEFGLTSTQNVTITVQ
GTNDSPIIFLDEGDSASGTVIESGSEDDGVFIPGIDVINGTLSVEDVDTIIADNPIWSFT
PQSNNYGVFNLNSTTGEWTYNLNNNLADPLAEGESAEETFLVTVTDEFGATDTQLVTITV
QGTNDLPILTVDIEGGVTKDANNTTLSDSGILSFTDVDTSNTHSVSEDYNQDIDWSNGDI
TSVLTQGEITSLIDGFSVDSNSWDYSIANSLVQFLGADETITLSFEVTVTDNDDGTDTET
VSITIFGTNSLPELTVEGTGAVLEDFTNPDLNDFGAISFTDADVSDTHEVTEEYKGDIFW
TGGTLSNQLIAQDIDILIDGFTVDDDNWDYTIPNALVQFLAVGETITLSFDVTVTDNRGG
SDTEPVTITITGTNDIPIITSSGGAHLGSVKEEGVVDDFDNDPNNNNTPADAVLQTGGTV
TAEDADHNAILTWSGDESGTYGEFTIDSVSGEWVYALNDSVLVNALASGESHDEIFTVTV
TDEFGATDTQNITVTVNGTNDIPVITSSGAAHLGSVKEEGVVDDFDNDPNNNNAPADAVL
QTGGTVTAEDADNNSSLAWSGDDSGTYGEFTIDSVSGEWVYALNDSVLVNALASGESHDE
IFTVTVTDEFGATDTQNITVTVNGTNDIPVITSSGAAHLGSVKEEGVVDDFDNDPNNNNA
PADAVLQTGGTVTAEDADNNSSLAWSGDDSGTYGEFTIDSVSGEWVYALNDSVLVNALAS
GESHDEIFTVTVTDEFGATDTQNITVTVNGTNDIPVITSSGAAHLGSVKEEGVVDDFDND
PNNNNTPADAVLQTGGTVTAEDADNNSSLAWSGDDSGTYGEFTIDSVSGEWVYALNDSVL
VNALASGESHDEIFTVTVTDEFGATDTQNITVTVNGTNDIPVITSSGAAHLGSVKEEGVV
DDFDNDPNNNNTPADAVLQTGGTVTAEDADNNSSLAWSGDDSGTYGEFTIDSVSGEWVYA
LNDSVLVNALASGESHDEIFTVTVTDEFGATDTQNITVTVNGTNDIPVITSSGAAHLGSV
KEEGVVDDFDNDPNNNNAPADAVLQTGGTVTAEDADNNSSLAWSGDDSGTYGEFTIDSVS
GEWVYALNDSVLVNALASGESHDEIFTVTVTDEFGATDTQNITVTVNGTNDIPVITSSGA
AHLGSVKEEGVVDDFDNDPNNNNTPADAVLQTGGTVTAEDADNNSSLAWSGDDSGTYGEF
TIDSVSGEWVYALNDSVLVNALASGESHDEIFTVTVTDEFGATDTQNITVTVNGTNDIPV
ITSSGAAHLGSVKEEGVVDDFDNDPNNNNAPADAVLQTGGTVTAEDADNNSSLAWSGDDS
GTYGEFTIDSVSGEWVYALNDSVLVNALASGESHDEIFTVTVTDEFGATDTQNITVTVNG
TNDIPVITSSGAAHLGSVKEEGVVDDFDNDPNNNNTPADAVLQTGGTVTAEDADNNSSLA
WSGDDSGTYGEFTIDSVSGEWVYALNDSVLVNALASGESHDEIFTVTVTDEFGATDTQNI
TVTVNGTNDIPVITSSGAAHLGSVKEEGVVDDFDNDPNNNNTPADAVLQTGGTVTAEDAD
NNSSLAWSGDESGTYGEFTIDSVSGEWVYVLNDSVLVNALASGESHDEIFTVTVTDEFGA
TDTQNITVTVNGTNDIPILTIDDLTGGITEDDTDPNLNVVGTLSFTDVDNNDTPSIDTAP
VGDVIWSGGDLTPGQIIDLIAGFSVDTSSWDYTIANSLVQFLAENETITLNFDVTVTDDF
GATDTETVVITITGINDAPIVEGISSLLVSEEGLTGGIIDTDGDPSDDTDAISHMGTLTF
TDAENPADNSFTVSLIAPISSAFSAGEEVIWQWDGSNILTGRTEFSDTLVMTVTLGTVSS
ALSVYSVSYTLDLFAPLDHPVNSTEDLLSIDFGVNIFDGFDNVATTLNAIIEDDSPVDEV
DELLMQAMTNAVSEFVTGDLFDPGADGLGSITFTVETSGLTYNGTPLVYNMSGNILTASA
DGTDVFTVTAILDIDGHYDYKLEILQILDAGVSVEYDLSSAPAGNNAAYYVDVDGQIYSQ
DNQTTMTIATITGTDGGASSSINSNNHGIGVGPQTSISTDEAILFVYGTNGASLAAVSLG
NNNNGNHTGTAEISYLVSYTDNTNSGPILATINGTLDIEIIAENNLNIASIEITYLSGND
FQIIGLSSIDVLLQDPINIELSYTATDADGDSVIFDTPDEGHFFVTLDPIPQPSMHMGSA
LDDVLIDGQGDSYLIGGIGSDSLDGGADTDRDIFVWDLGSDDGSTDTVYNFDSSYDALNL
AEILVGEDNTAISLDDYLDFNFVNGNTEIYVDSDGLVGGVNLDLTIIIDGVDLSTIYAPG
DIAIIDGLLTDNALIIDTIP
NT seq 9423 nt   +upstreamnt  +downstreamnt
atgattatgggtgtttcagtaacagaacaagacgcagtcgtcaccaaccttgtcggtcaa
ttaaaggctaaagatgagcaaggtaatatcagagatgtgacgattggcgatctaattaaa
gatggcgaacaattaattttcgcccctaactctcagtttatcttacacatggctgatgga
acaattattactgaaacaaacttttccgaaccgatacctgaaagctccctaggggcggct
cctgaactcgctactgcaccagtttcagccgatgctgaaattgccgccttacaagcacaa
attttagccggcgatgatcctactgctggcctgcctgaaaccgccgctggtacagccgca
ggtggaggaggtaatcaaggtggttctgactatataactttaggaagaacgggtgatgaa
acattagcaggctctggctacgacaccgcaggatttgccctagctccagcccccaccgaa
gaccccgtgatattaaccgcagaactccccgagccaccgacaatagatgccagtagcgtt
accctactagaagccaatcttttgcagggctcaaatcctttagcggcagcacttgagcaa
tccaatagcctacaggtaggagctcagacagggatcagcgctctaacgattaatggcatt
gatatctttatcggaggattatttgttggtcccattactttgacaacagataatggcgta
ttagttatcactagtttcgatgctgtcacaggtacactcaattataattttaccctcgac
actgatgtggataactcagcatctgataccttatctcaaatatttaccactttagtgacc
gatctcgccggtatcaccacagcctcaacaatcacagtcaacatcatcgatgatagccca
aacgctgtagacgatagcaacacggtctcagaaaatggcgacatagcgatagttattact
ggcaatgtcctagctaacgatactcaaggtgccgattctgcagtcgtatcacaaatttcg
aatacagatgtagccactcaggcaatagctgcaactaccaatatttcaggtgattttggt
ctattacaaatatcagcagatggtagctacacctaccagctagataactcattaggaaac
gtgcaagctttagcacaaggtgaactagttactgaaacatttacctatcagctcgccgat
agtgatggtgacactgtcgcagccactctaaccataacaatcacaggtactaatgatata
cctgtaattgtagttatagatcccgatgtacctgtagaccctgataaccctgtcgaccca
attttaggcgccgaggggcttgtggttgaagcaggtaatgaagatgacggtactgtcgtt
tctggtgtcctaaacacaacaggcttatttgaacctgccgatgtggataacggcgcagtg
ctggtatggagtggagatgctacgggtagtttgggtagcttcaccatagatccggtcaca
ggagaatggagttacaccttagataactccttggccgacagcctggccgaaggagatact
gttcaagagatttttattgtcacagtaacggacgaatttgatgccacagcaacacaacaa
gtcaccataactgtccaaggtactaatgactcaccgataatcacctcaagtgatgcggca
gcgactgggactgtcgttgaagccagtactctagatgacgaaactcttgatcctggtatt
ccacaaacatcaggattgttaactgctacagatgttgataatggcgcacaactaagctgg
agtggtaactcagcgggtacctatggcagctttagtatagattcggcttccggatcatgg
gtctacaatttggataatgacctagccgattcgttagccgaaggagaggttattcttgaa
gagtttctagtcacagtaaccgatgaattcggtgccaccgatactcaactggtcactatt
acggttattggtactaatgatgccccgcagatcacttcgacttctgaagacgctgaaggt
gtggtaattgaaacaggtaatgctgataacggtactgtgttacccggagtgttaattagt
acaggtactctagatgcgggtgatattgataacaatgcagttcttattttcagtggcagt
acagatggcagttttgggagcttctttatcgatccagttacaggtgagtggacctacacc
ttagatgactctctggctgacagctttgcagaagggcaaagcacagaagaagtattcctg
gtcacagtgaccgatgaatttggtctcactagcacacaaaacgtcactataaccgttcaa
ggaaccaatgattcccctatcattttcctcgacgaaggtgatagcgcaagtggcacagtt
atcgaatcgggtagcgaagacgacggtgtcttcattccaggtattgacgtaatcaatggc
actctatcggtagaagacgtagatactatcatcgccgataacccgatatggagtttcact
cctcaatccaataattacggtgtgtttaacctcaatagcacaacaggtgaatggacttat
aacctaaataataatttagcagaccctttagccgaaggtgagtctgccgaagagacattc
ttagtcacagtgaccgatgagtttggcgcaaccgatacccaactcgtcacaattacagta
cagggcaccaatgacctgcctattctcaccgtcgatattgaaggtggggtaactaaagat
gccaacaatacgaccctcagcgacagcggaattctcagtttcaccgacgtcgacaccagt
aatacccatagtgtcagtgaagattacaaccaagatatagactggagcaatggtgatatt
acatctgtactcacccagggggagatcaccagtcttattgatggtttcagtgtcgacagt
aacagctgggactacagtatcgccaactcactggtgcaatttttgggtgctgatgagacc
ataaccttaagctttgaagtcactgtgacagataacgatgatggcacagacacagaaact
gtgagcatcaccatttttggtaccaacagcctaccggaactcaccgttgaaggtaccggg
gctgtactagaagacttcaccaatcccgacctcaacgatttcggtgcaattagctttacg
gacgccgatgtcagcgacactcatgaagtcaccgaagagtataagggtgatattttctgg
actggcggcaccctatctaatcaactcatcgctcaagacattgatattctcattgacggc
ttcactgtcgatgacgacaactgggattacaccatcccaaatgctctggtgcagtttctc
gccgttggtgaaaccatcaccttaagcttcgatgtcacagtcacagataaccgaggcggt
agtgatactgagccagtcacaattaccattaccggcactaacgatatccctattatcacc
tcaagtggtggcgctcatctcggcagcgtcaaagaggaaggtgtggtagatgacttcgat
aacgaccccaacaataacaacaccccagcggacgccgtcctgcaaaccggtggcactgtc
accgcagaagatgccgatcataacgcgatcttaacctggtccggggatgagtcaggcacc
tacggtgagttcaccatcgacagtgtcagtggtgaatgggtctacgccctcaacgacagt
gtgttagtcaacgccctcgcctccggtgagagtcacgatgaaatctttaccgtcactgtc
accgatgaattcggcgccaccgacactcaaaatattaccgtcacagtcaacggtactaac
gatatccctgttatcacctcaagtggcgcagctcatcttggcagcgtcaaagaggaaggt
gtggtagatgacttcgataacgaccccaacaataacaacgccccagcggacgccgtcttg
caaaccggtggcacagttaccgcagaagatgccgataacaactcaagcttagcttggtcc
ggggatgactctggcacctatggtgagttcactatcgacagtgtcagtggtgaatgggtc
tacgccctcaacgacagtgtgttagtcaacgccctcgcctccggtgagagtcacgatgaa
atctttaccgtcactgtcaccgatgagttcggcgccaccgacactcaaaatattaccgtc
acagtcaacggtactaacgatatccctgttatcacctcaagtggcgcagctcatcttggc
agcgtcaaagaggaaggtgtggtagatgacttcgataacgaccccaacaataacaacgcc
ccagcggacgccgtcttgcaaaccggtggcacagttaccgcagaagatgccgataacaac
tcaagcttagcttggtccggggatgactctggcacctatggtgagttcactatcgacagt
gtcagtggtgaatgggtctacgccctcaacgacagtgtgttagtcaacgccctcgcctcc
ggtgagagtcacgatgaaatctttaccgtcactgtcaccgatgagttcggcgccaccgac
actcaaaatattaccgtcacagtcaacggtactaacgatatccctgttatcacctcaagt
ggcgcagctcatcttggcagcgtcaaagaggaaggtgtggtagatgacttcgataacgac
cccaacaataacaacaccccagcggacgccgtcttgcaaaccggtggcacagttaccgca
gaagatgccgataacaactcaagcttagcttggtctggggatgactctggcacctatggt
gagttcactatcgacagtgtcagtggtgaatgggtctacgccctcaacgacagtgtgtta
gtcaacgccctcgcctccggtgagagtcacgatgaaatctttaccgtcactgtcaccgat
gagttcggcgccaccgacactcaaaatattaccgtcacagtcaacggtactaacgatatc
cctgttatcacctcaagtggcgcagctcatcttggcagcgtcaaagaggaaggtgtggta
gatgacttcgataacgaccccaacaataacaacaccccagcggacgccgtcttgcaaacc
ggtggcacagttaccgcagaagatgccgataacaactcaagcttagcttggtccggggat
gactctggcacctatggtgagttcactatcgacagtgtcagtggtgaatgggtctacgcc
ctcaacgacagtgtgttagtcaacgccctcgcctccggtgagagtcacgatgaaatcttt
accgtcactgtcaccgatgagttcggcgccaccgacactcaaaatattaccgtcacagtc
aacggtactaacgatatccctgttatcacctcaagtggcgcagctcatcttggcagcgtc
aaagaggaaggtgtggtagatgacttcgataacgaccccaacaataacaacgccccagcg
gacgccgtcttgcaaaccggtggcacagttaccgcagaagatgccgataacaactcaagc
ttagcttggtctggggatgactctggcacctatggtgagttcactatcgacagtgtcagt
ggtgaatgggtctacgccctcaacgacagtgtgttagtcaacgccctcgcctccggtgag
agtcacgatgaaatctttaccgtcactgtcaccgatgagttcggcgccaccgacactcaa
aatattaccgtcacagtcaacggtactaacgatatccctgttatcacctcaagtggcgca
gctcatcttggcagcgtcaaagaggaaggtgtggtagatgacttcgataacgaccccaac
aataacaacaccccagcggacgccgtcttgcaaaccggtggcacagttaccgccgaagat
gccgataacaactcaagcttagcttggtccggggatgactctggcacctatggtgagttc
accatcgacagtgtcagtggtgaatgggtctacgccctcaacgacagtgtgttagtcaac
gccctcgcctccggtgagagtcacgatgaaatctttaccgtcactgtcaccgatgaattc
ggcgccaccgacactcaaaatattaccgtcacagtcaacggtactaacgatatccctgtt
atcacctcaagtggcgcagctcatctcggcagcgtcaaagaggaaggtgtggtagatgac
ttcgataacgaccccaacaataacaacgccccagcggacgccgtcttgcaaaccggtggc
acagttaccgcagaagatgccgataacaactcaagcttagcttggtccggggatgactct
ggcacctatggtgagttcactatcgacagtgtcagtggtgaatgggtctacgccctcaac
gacagtgtgttagtcaacgccctcgcctccggtgagagtcacgatgaaatctttaccgtc
actgtcaccgatgagttcggcgccaccgacactcaaaatattaccgtcacagtcaacggt
actaacgatatccctgttatcacctcaagtggcgcagctcatcttggcagcgtcaaagag
gaaggtgtggtagatgacttcgataacgaccccaacaataacaacaccccagcggacgcc
gtcttgcaaaccggtggcacagttaccgcagaagatgccgataacaactcaagcttagct
tggtccggggatgactctggcacctatggtgagttcactatcgacagtgtcagtggtgaa
tgggtctacgccctcaacgacagtgtgttagtcaacgccctcgcctccggtgagagtcac
gatgaaatctttaccgtcactgtcaccgatgagttcggcgccaccgacactcaaaatatt
accgtcacagtcaacggtactaacgatatccctgttatcacctcaagtggcgcagctcat
cttggcagcgtcaaagaggaaggtgtggtagatgacttcgataacgaccccaacaataac
aacaccccagcggacgccgtcttgcaaaccggtggcacagttaccgccgaagatgccgat
aacaactcaagcttagcttggtccggggatgagtcaggcacctatggtgagttcaccatc
gacagtgtcagtggtgaatgggtctacgtcctcaacgacagtgtgttagtcaacgccctc
gcctccggtgagagtcacgatgaaatctttaccgtcactgtcaccgatgaattcggcgcc
accgacactcaaaatattaccgttacagtcaacggtactaacgatatcccaatactcact
atcgatgatcttactggaggtatcactgaagacgatacagatccaaatctaaatgttgtt
ggaacattaagttttacagacgtagataataatgacactcctagtatagatacagctcca
gttggagatgttatctggtctgggggagatttaacgcctggtcagatcatagatctaatc
gcaggattcagtgtcgatacaagtagctgggattacactattgcaaactcattagtccaa
tttcttgctgaaaatgaaactatcactctaaattttgatgtgactgtcactgatgacttt
ggcgcaacagatactgaaacggtcgttataacaatcacaggtattaacgatgcccccata
gtcgagggtatatcttccttacttgtttccgaggaaggcttaaccggggggatcatagat
acggacggtgatccctctgatgacactgatgccatatcacacatgggcacattaacattc
accgatgcagagaatcccgccgacaatagctttacagtttcgcttatagccccaatctcc
agtgctttttctgcaggcgaagaggttatctggcaatgggatggcagcaacatactaacg
ggaagaaccgaattttcggataccttagtgatgacagtaaccttgggtacagtcagtagc
gccctgtctgtatatagcgtgagctataccttagacttgttcgctccactggatcatcca
gtcaacagtaccgaagatctgttatccatagatttcggagtcaacatcttcgacggtttt
gataatgtcgctaccactctcaatgccatcatagaagatgacagtccagtcgatgaagta
gatgaattattgatgcaagctatgaccaatgccgtcagcgaattcgtaactggtgatcta
ttcgatccaggtgcagatggcttgggcagcatcacttttaccgttgaaacgagtgggctg
acctataacggcactccattagtttataacatgagtggtaatatcctaaccgccagcgcc
gatggcactgatgtgtttaccgtcaccgccatactcgatatcgacggccactacgactat
aaactagagattctacaaatactcgatgccggagtctctgttgaatacgatctcagtagt
gcaccagcagggaataacgcagcttattatgtcgatgtcgatgggcaaatctactcccaa
gataatcaaacaactatgaccattgccacgattacaggtactgatggaggagcaagctcc
agcatcaactctaataatcacggtataggtgtcggccctcaaacctcgatctccactgat
gaagccattttattcgtctatggtaccaacggcgccagtctagccgcagtatctttgggt
aacaacaacaacggtaatcacaccggaacagcagaaataagctacctagtatcatacaca
gacaacacaaattctggacccattctagccaccataaatggcacattagacatagagatt
atcgccgaaaacaacctgaatatcgcctcaattgagatcacttatctcagtggcaacgac
ttccaaattataggtttatcatcaatagatgtactcttacaagatcctatcaatatagag
ctttcctatactgctaccgatgcagatggcgatagtgtgatattcgataccccagatgaa
ggccactttttcgtaaccttagatcccatcccccaaccaagtatgcacatgggcagtgca
ctggatgatgtgttaatcgacggtcagggggatagctacctaattggaggcataggtagc
gatagcttggatggcggagccgatacagatagagatatatttgtctgggatcttggttct
gatgatggcagcacagacactgtttataactttgattcaagctacgatgcattgaatcta
gcagagatattagttggtgaagataacacagcaataagcttagacgattacttagatttt
aattttgtgaatggaaatactgagatatatgtcgattctgatggcttggtgggtggtgta
aacctagatctcactattattatcgatggtgtagatctatcgaccatctatgcccctgga
gatatagccataatagatggccttctcacagataacgcactgattattgacactatccca
taa

DBGET integrated database retrieval system