Shewanella woodyi: Swoo_0906
Help
Entry
Swoo_0906 CDS
T00676
Name
(GenBank) TonB-dependent receptor
KO
K02014
iron complex outermembrane recepter protein
Organism
swd
Shewanella woodyi
Brite
KEGG Orthology (KO) [BR:
swd00001
]
09180 Brite Hierarchies
09183 Protein families: signaling and cellular processes
02000 Transporters [BR:
swd02000
]
Swoo_0906
Transporters [BR:
swd02000
]
Other transporters
Pores ion channels [TC:
1
]
Swoo_0906
BRITE hierarchy
SSDB
Ortholog
Paralog
Gene cluster
GFIT
Motif
Pfam:
TonB_dep_Rec_b-barrel
Plug
OMP_b-brl_3
OMP_b-brl
Motif
Other DBs
NCBI-ProteinID:
ACA85200
UniProt:
B1KFN4
LinkDB
All DBs
Position
1207443..1210070
Genome browser
AA seq
875 aa
AA seq
DB search
MKLLQALPSLCAVAVSAVYAPNIMAADEEVERIEVTGSHIKRTDMEGPSPVTSISEEDIS
NSGATDLIGLFSKLPISGQGTFSTQANSSDDTANGGSSVSLRGLGADSTLILVNGRRVSV
SPFAKGIDTAFVDINNIPVSAIKRVDILKDGASATYGSDAIAGVINIILRDDIDGAEITA
RIGDTSAGGGKEESASLVWGSHTEKSSHTFILDYFNREELLYGDRDYSKSANQSALRPND
PFAKSFRSSSGIPGTIELAVRPEDPEKVFRLPDTFGNDVCAPEDIDSVDNICRYDYAPVM
TMVPENKRFSVNYMGKYDITDNVSGFLEFNGQSSKTTVKGAGSPSFNELFMSADNPNHPF
ADMPTHEFYNQDLTMRRRMVDIGNRLKEVESDYYRTVIGLNGQFGEWDWETAFSYINSKS
VERGIDGFPNSRRAQEAIDNGSWNPFEPSTNTQEALDFIETTTNRVGESTNRSLDAKLSG
PLLEMPAGELMVAFGIEYREETISDNPDDQFLRGEVFGTEATQANGERDNTAFYAELGVP
VFESLELQLALRHEDYSDFGTTTDPKVSFLWSPLEDLSFRGSWGTAFRAPSLAQLGLGRT
DESPSLVDTVRCDAVGNINKACEVQEYTAVFEGNPDLGPEESTSYNLGVIYNITDNLNFS
LDYYSYDIENIIDSDTQFVFSNFGDDPNVVERLPSAIPNDPGEVVTIYDSFQNIGDLVTT
GLDLDANFLLETGAGEFKFSYALNYMLKYEDKRPDSDGGQRINIVEGDFEQPEARWTAGV
DWTITDFRSYLGLNYIGEFKQKEAVQKDGMPDIDAMMTVDASVNYYGLPDTVLTLGATNL
LDEEPPFSYHDFMGYVTSVHSGQGRFVYLQASYSF
NT seq
2628 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
atgaaattactacaagcattgccaagtctatgcgcagtggctgtgtcagccgtttacgct
ccaaatataatggcagccgatgaagaagttgaacgaatagaggtaacaggttcacatatt
aaacgtacagatatggaggggccatcaccggttacctctatttctgaagaggatattagt
aactctggtgccacggatttaatcgggcttttctctaaacttcctatttcaggccaaggt
actttctcaacacaagcaaatagcagtgatgacaccgccaatggtggctcaagtgtttca
ttacgcggattaggcgctgattccacattgatacttgttaatggaagacgagtatctgtt
agtccatttgcaaaagggatcgataccgcttttgttgatattaataatattccagtctcg
gccattaaacgtgttgatattttaaaagatggcgcttcagcaacttatggttctgatgcc
attgcgggcgtgattaatattattctaagggatgatattgatggcgctgaaataaccgca
agaataggtgatacctctgcaggaggtggtaaagaggagagtgcgagtctagtttgggga
agccatacagaaaagagcagtcacacctttattctagattattttaatcgtgaggagctg
ctttatggagatcgagattactccaaatcggccaatcagtcggcattaaggccaaatgat
ccttttgctaaaagtttccggagttcttctgggatacctggaacaattgaattagctgta
cgtccagaagatccagaaaaagtttttcgtttaccagacacctttgggaatgatgtttgt
gcacctgaagatatagactctgtggataacatatgccgatatgattatgctcctgttatg
accatggttccagagaataagcgttttagcgttaactatatgggtaaatatgatattacc
gataatgttagtggtttccttgagtttaacggacaaagctcaaaaacgacggtaaaaggt
gccggtagcccaagctttaatgagctgtttatgtctgccgataatccaaatcacccattt
gctgatatgccaacccatgagttttataatcaagatttaaccatgcgccgacgtatggta
gatattggcaatcgcttaaaagaggtcgaatctgattattatcgtacggttattggcctt
aatggccagtttggtgagtgggattgggagacagcgtttagttatatcaacagtaaatcg
gtggagcgcggtattgatggcttccctaactctcgtcgcgcccaggaagcgattgataac
ggcagttggaatccgtttgaaccttctacaaatacgcaagaggcgttagattttatcgag
accactaccaatcgtgtaggcgagtcgaccaaccgttcactcgatgcaaaattgtcaggc
cctctgcttgagatgcctgcgggtgagcttatggtggcgtttggtattgagtatcgtgaa
gagactatcagtgacaatcccgatgatcagttcttgcgcggtgaggtatttggaaccgag
gcgacccaagcgaatggagagcgtgataataccgcgttttatgccgagttaggtgtgccg
gtatttgaatcactggagctacagttagcccttcgtcatgaggattacagtgactttggt
acaacaaccgaccctaaggtgtcgtttctttggtcaccactggaagatctctcttttagg
ggctcatggggtacggcatttagggcgccctctttggctcaattaggcttagggaggacg
gatgagtctccatcacttgttgataccgtgcgatgtgatgcagtgggaaacattaataaa
gcctgtgaagttcaagaatatacagcagtgtttgaggggaatccggacttaggaccggaa
gagtccacaagttataacttaggggttatctataacattaccgataatttaaatttctca
ttagattattatagttatgatattgaaaatattatcgattcagatactcagtttgttttc
agtaactttggtgatgatcctaatgttgttgagcgtctgccatcagcgatcccaaatgat
cctggtgaggtggtgaccatctatgattcattccagaatattggcgacttagtgaccact
ggtttagatctggatgccaatttcctgcttgaaaccggtgctggcgaatttaagtttagc
tatgcattgaactatatgctgaaatatgaagataagcgtcctgactcggatggtggacag
aggatcaatattgtagagggagattttgagcagcctgaagcacgttggactgccggtgtc
gattggacaattactgattttagatcttacctaggtctaaattatattggtgagtttaag
cagaaagaagcggtccaaaaagacgggatgcctgatattgatgccatgatgacggttgat
gcatcggttaactactatgggttacccgatactgtgctgacattgggggcgaccaatcta
cttgatgaagagccacctttctcctatcacgactttatggggtatgtgacctcagtacac
agtggtcaagggagatttgtttatctacaggcgagctacagcttttaa
DBGET
integrated database retrieval system