KEGG   Shewanella woodyi: Swoo_0906
Entry
Swoo_0906         CDS       T00676                                 
Name
(GenBank) TonB-dependent receptor
  KO
K02014  iron complex outermembrane recepter protein
Organism
swd  Shewanella woodyi
Brite
KEGG Orthology (KO) [BR:swd00001]
 09180 Brite Hierarchies
  09183 Protein families: signaling and cellular processes
   02000 Transporters [BR:swd02000]
    Swoo_0906
Transporters [BR:swd02000]
 Other transporters
  Pores ion channels [TC:1]
   Swoo_0906
SSDB
Motif
Pfam: TonB_dep_Rec_b-barrel Plug OMP_b-brl_3 OMP_b-brl
Other DBs
NCBI-ProteinID: ACA85200
UniProt: B1KFN4
LinkDB
Position
1207443..1210070
AA seq 875 aa
MKLLQALPSLCAVAVSAVYAPNIMAADEEVERIEVTGSHIKRTDMEGPSPVTSISEEDIS
NSGATDLIGLFSKLPISGQGTFSTQANSSDDTANGGSSVSLRGLGADSTLILVNGRRVSV
SPFAKGIDTAFVDINNIPVSAIKRVDILKDGASATYGSDAIAGVINIILRDDIDGAEITA
RIGDTSAGGGKEESASLVWGSHTEKSSHTFILDYFNREELLYGDRDYSKSANQSALRPND
PFAKSFRSSSGIPGTIELAVRPEDPEKVFRLPDTFGNDVCAPEDIDSVDNICRYDYAPVM
TMVPENKRFSVNYMGKYDITDNVSGFLEFNGQSSKTTVKGAGSPSFNELFMSADNPNHPF
ADMPTHEFYNQDLTMRRRMVDIGNRLKEVESDYYRTVIGLNGQFGEWDWETAFSYINSKS
VERGIDGFPNSRRAQEAIDNGSWNPFEPSTNTQEALDFIETTTNRVGESTNRSLDAKLSG
PLLEMPAGELMVAFGIEYREETISDNPDDQFLRGEVFGTEATQANGERDNTAFYAELGVP
VFESLELQLALRHEDYSDFGTTTDPKVSFLWSPLEDLSFRGSWGTAFRAPSLAQLGLGRT
DESPSLVDTVRCDAVGNINKACEVQEYTAVFEGNPDLGPEESTSYNLGVIYNITDNLNFS
LDYYSYDIENIIDSDTQFVFSNFGDDPNVVERLPSAIPNDPGEVVTIYDSFQNIGDLVTT
GLDLDANFLLETGAGEFKFSYALNYMLKYEDKRPDSDGGQRINIVEGDFEQPEARWTAGV
DWTITDFRSYLGLNYIGEFKQKEAVQKDGMPDIDAMMTVDASVNYYGLPDTVLTLGATNL
LDEEPPFSYHDFMGYVTSVHSGQGRFVYLQASYSF
NT seq 2628 nt   +upstreamnt  +downstreamnt
atgaaattactacaagcattgccaagtctatgcgcagtggctgtgtcagccgtttacgct
ccaaatataatggcagccgatgaagaagttgaacgaatagaggtaacaggttcacatatt
aaacgtacagatatggaggggccatcaccggttacctctatttctgaagaggatattagt
aactctggtgccacggatttaatcgggcttttctctaaacttcctatttcaggccaaggt
actttctcaacacaagcaaatagcagtgatgacaccgccaatggtggctcaagtgtttca
ttacgcggattaggcgctgattccacattgatacttgttaatggaagacgagtatctgtt
agtccatttgcaaaagggatcgataccgcttttgttgatattaataatattccagtctcg
gccattaaacgtgttgatattttaaaagatggcgcttcagcaacttatggttctgatgcc
attgcgggcgtgattaatattattctaagggatgatattgatggcgctgaaataaccgca
agaataggtgatacctctgcaggaggtggtaaagaggagagtgcgagtctagtttgggga
agccatacagaaaagagcagtcacacctttattctagattattttaatcgtgaggagctg
ctttatggagatcgagattactccaaatcggccaatcagtcggcattaaggccaaatgat
ccttttgctaaaagtttccggagttcttctgggatacctggaacaattgaattagctgta
cgtccagaagatccagaaaaagtttttcgtttaccagacacctttgggaatgatgtttgt
gcacctgaagatatagactctgtggataacatatgccgatatgattatgctcctgttatg
accatggttccagagaataagcgttttagcgttaactatatgggtaaatatgatattacc
gataatgttagtggtttccttgagtttaacggacaaagctcaaaaacgacggtaaaaggt
gccggtagcccaagctttaatgagctgtttatgtctgccgataatccaaatcacccattt
gctgatatgccaacccatgagttttataatcaagatttaaccatgcgccgacgtatggta
gatattggcaatcgcttaaaagaggtcgaatctgattattatcgtacggttattggcctt
aatggccagtttggtgagtgggattgggagacagcgtttagttatatcaacagtaaatcg
gtggagcgcggtattgatggcttccctaactctcgtcgcgcccaggaagcgattgataac
ggcagttggaatccgtttgaaccttctacaaatacgcaagaggcgttagattttatcgag
accactaccaatcgtgtaggcgagtcgaccaaccgttcactcgatgcaaaattgtcaggc
cctctgcttgagatgcctgcgggtgagcttatggtggcgtttggtattgagtatcgtgaa
gagactatcagtgacaatcccgatgatcagttcttgcgcggtgaggtatttggaaccgag
gcgacccaagcgaatggagagcgtgataataccgcgttttatgccgagttaggtgtgccg
gtatttgaatcactggagctacagttagcccttcgtcatgaggattacagtgactttggt
acaacaaccgaccctaaggtgtcgtttctttggtcaccactggaagatctctcttttagg
ggctcatggggtacggcatttagggcgccctctttggctcaattaggcttagggaggacg
gatgagtctccatcacttgttgataccgtgcgatgtgatgcagtgggaaacattaataaa
gcctgtgaagttcaagaatatacagcagtgtttgaggggaatccggacttaggaccggaa
gagtccacaagttataacttaggggttatctataacattaccgataatttaaatttctca
ttagattattatagttatgatattgaaaatattatcgattcagatactcagtttgttttc
agtaactttggtgatgatcctaatgttgttgagcgtctgccatcagcgatcccaaatgat
cctggtgaggtggtgaccatctatgattcattccagaatattggcgacttagtgaccact
ggtttagatctggatgccaatttcctgcttgaaaccggtgctggcgaatttaagtttagc
tatgcattgaactatatgctgaaatatgaagataagcgtcctgactcggatggtggacag
aggatcaatattgtagagggagattttgagcagcctgaagcacgttggactgccggtgtc
gattggacaattactgattttagatcttacctaggtctaaattatattggtgagtttaag
cagaaagaagcggtccaaaaagacgggatgcctgatattgatgccatgatgacggttgat
gcatcggttaactactatgggttacccgatactgtgctgacattgggggcgaccaatcta
cttgatgaagagccacctttctcctatcacgactttatggggtatgtgacctcagtacac
agtggtcaagggagatttgtttatctacaggcgagctacagcttttaa

DBGET integrated database retrieval system