Shewanella woodyi: Swoo_1500
Help
Entry
Swoo_1500 CDS
T00676
Name
(GenBank) peptidase S8 and S53 subtilisin kexin sedolisin
Organism
swd
Shewanella woodyi
SSDB
Ortholog
Paralog
Gene cluster
GFIT
Motif
Pfam:
Peptidase_S8
PA
K319L-like_PKD
PPC
Big_9
Sde0182_C
Inhibitor_I9
PKD_4
fn3_5
Cadherin_5
DUF6319
RMI1_C
Motif
Other DBs
NCBI-ProteinID:
ACA85788
UniProt:
B1KKE8
LinkDB
All DBs
Position
complement(1868897..1872778)
Genome browser
AA seq
1293 aa
AA seq
DB search
MKTKLAVAISMALLTASIEAQTLETANGETVELNIPSSLIKQQLRNKLDGIQGVKFIPEP
GLGEQEYVYIIRLKAPAVANYQGDIPGLKATSPQFLKHSPGSNKLRSGKLNIAKSEVKAY
RSYLQSKQSHFLMKAQAITGNNIQAITQFSYAFNGMSVRMTQAQAIKLAKLQDVAFIERE
RMEQLETDVSQALIGSPQVWDGSATGTKAMGEGVIVGIIDSGINSDHDSFADIGQDGYDH
TNPWGQGVYVGDCKTDFTDMCNDKLIGIRSYSDITDDYDDVSVFGDNPPAKNGEDYGGHG
SHVASTAAGNILLNVPLVEGEVGKLESDGIETGVEFAQISGVAPHANIVSYQICSPGDNG
DTYSGCSSTAILKAIDDTVKDGVDIINFSISGGGNPWQSSAEQAFLSARNAGIFVAVAAG
NTRAGGPEQVPYSTNKNAPWYTSVANSTHNRDIARSIEFNNKSYDFTPGSGPVQTEVISA
EPLYAGSLDATNVQGCNAFAEKAFENKIALIKRGSCNFSDKVNNAIAADAKAVIVFNKDG
EANARLTMSSLEKTTIPAVFIGNLDGLEMVAALAENPKLEVTIDPKPKILEKEADVLSSG
SLIGPNATNDVIVPFVAAPGSDIYAAYSDQQFGHDKTGTNPADFTVMSGTSMASPHVAGA
GALLKSAHKDWTPDNIRSALMLTATTAQGMKKADGKTIADAFDVGSGRIRVDLAAKTGLI
MDELALNYEIANPATNGDPRKLNIPSMADSKCVNTCSWTRVVTATGDGNWSAQSTSITEN
LNLTVSPATFSLKTGESQSITVTADVTNATQEWGFGQLTLTSESYPDANMPIVAKIAKRN
LPTLLTIDATRDADERNYTQLKAIDLPDLTANVTHLKLSDSFESKVKQDSNVSSALDDLK
DGVQVFKFSVNDNALYFRSSISYTTSPDLDMFVLLDKKDGSDVSIIANSAFAGSNESVLL
TAPQAGDYYVVVQNYQASAVGAEDAFGLKQLTLYDEASDNLSLKLTGDMKDFALNIAWDE
QMLAGDEGLAVVRLMSSDDKVADVTLPIVFERKGDDVVMPLEETLSGDLTAGEPTKVLNK
IEANKTQETRIYMLEAKIPDGHEVANISHDGKLVDNVINWRVEMTSGMASQDVTFDLIPR
KASTKNSLTLSNTVDNPTAKKLEQNYSFDVAELKPTAKVDAPSSILEGTTLVLDASVSSD
PNGDDLSYKWTQLGGASVTFNDTADKISFLTPTVDVNAQTLSFQVEVNDGNGNSDSTLVS
VSVTDTVERKSGGSLGWLTLLLLPLVWRRRKQG
NT seq
3882 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
atgaaaacaaaattagcagtagccatatccatggctttactgactgccagtattgaggct
caaacacttgaaacggcaaacggagaaaccgttgaactgaatattccaagttcattgatt
aagcagcaactcagaaacaaactagatggtattcaaggggtaaaatttattcctgaacca
gggctgggtgagcaggaatatgtgtatattattcgattaaaagctcctgcagtcgccaac
taccaaggagatatcccagggcttaaagccaccagcccacaatttctcaaacatagccca
ggcagtaacaagctacgaagtggcaagcttaatatagctaaatcagaagtcaaagcttac
cgaagttacctgcaatcaaaacagagccattttttaatgaaggctcaagccattacaggc
aacaatattcaggctattacccagtttagctatgcttttaacggcatgtcagttcgcatg
acacaagctcaagcaattaaattagccaaacttcaagatgttgcgtttattgaacgtgaa
cgcatggagcaactagaaacagatgtaagtcaggcgcttatcggctcacctcaggtatgg
gatggttcagcaacaggcaccaaagccatgggtgaaggagttattgttgggatcatcgac
tctgggattaactctgaccatgactcattcgccgacattggccaagacggttacgatcat
accaacccttggggacaaggcgtctatgtcggtgactgcaaaactgatttcaccgatatg
tgtaacgataaactaatcggcatacgcagctattcagatatcaccgatgactatgatgat
gtaagcgtgttcggcgataacccacctgctaaaaacggcgaggattatggtggtcatggc
tcccatgtcgccagcacagccgcgggtaatattctactaaacgttcctcttgttgaaggc
gaggtagggaagcttgaaagtgacggtatagagactggagtagagtttgcgcagatctca
ggtgtcgctccccacgcaaatattgtctcatatcaaatctgtagcccaggagacaatgga
gatacctactcaggttgttcaagcactgcgatattaaaagcaatagacgatacagttaaa
gatggagtagatattattaacttctccatcagtggtggaggaaacccttggcaaagctcg
gctgagcaagcttttcttagcgcaagaaacgctggtatttttgttgctgttgcggcaggg
aatacacgcgcaggcggtccagagcaagtcccctactcaacaaacaaaaatgccccttgg
tacacctctgttgcaaactcaactcataatcgagatattgccagatcaattgagttcaat
aataagagctatgactttacccctggctctggcccagttcaaactgaggtgatctctgca
gagcctctctatgcaggtagcctcgatgcgaccaacgttcaaggctgtaatgcgtttgcc
gaaaaagcgttcgagaacaaaatcgcactcattaagcgtggaagctgtaattttagtgac
aaagtaaataacgctatcgccgcagatgctaaggctgtcatcgttttcaataaagatggt
gaagcgaatgccaggctgaccatgtcaagcttagagaaaaccacaataccagccgttttt
ataggaaaccttgatggattagagatggtcgcagcattggctgaaaaccctaagctagaa
gtcactatcgaccctaaacctaagattttagagaaagaggccgacgtgctctcatccggt
tctcttatcggacccaacgctaccaatgatgtcatcgtcccctttgttgcagcgccaggc
tcagatatctatgcagcctactcagatcaacagtttggccatgataaaacaggcacaaat
ccagcagactttacagtcatgtcaggaacctcaatggcaagccctcatgtagctggtgcc
ggcgcactcctgaaatccgctcataaagattggacaccagataatattcgctctgcatta
atgttaactgcaaccaccgcccaaggaatgaaaaaagccgatgggaaaaccatagctgat
gcatttgatgtgggctctggacgtattcgtgtcgatctcgcggccaaaacggggcttatt
atggatgagttagccctaaattatgagattgccaacccagcaactaatggcgatccccgt
aagttaaatattcccagcatggcggactctaaatgtgttaatacctgcagttggactcgt
gttgtcaccgcaacaggcgatggtaactggagcgcacaaagcaccagtatcacagagaac
ttgaacctaacggtttctccagcaacattcagcctaaaaaccggtgaaagccaaagcatt
accgtaactgcagatgtaacgaatgccacacaagagtgggggtttggtcaactcacactc
acctcagagtcttaccctgacgcaaatatgccgatagtagctaaaattgccaaacgcaac
ttgcctactctgctcaccatagatgcaacccgtgatgctgatgagcgtaactacactcag
cttaaagcgatcgatcttccagatctcaccgctaacgttactcacttaaagttaagcgat
agctttgaatctaaggttaaacaggactcaaatgtcagcagcgcactggatgatcttaaa
gatggggtacaggtatttaaattctcggtgaatgataatgcgctctatttcaggagctca
atcagctacaccacctcacctgatctcgacatgtttgtcctgctagacaagaaagatggc
agcgatgtaagcatcatagcaaactccgctttcgcaggctccaacgagagcgtactgctc
acagcacctcaagccggtgattattatgttgttgttcagaactaccaagcctcggcagtt
ggcgctgaggatgctttcggactcaagcaactcactctgtatgatgaagcatcggataat
ctatcgctaaaattaaccggtgatatgaaagactttgccttaaacatagcttgggatgaa
cagatgctggcaggtgatgaaggcttagctgtcgtcaggcttatgagctctgatgataag
gtggctgacgtgacactaccaatcgtttttgagcgtaaaggcgatgatgtggttatgcct
ttagaggaaacgctatcaggtgatttaaccgcgggagagccaacaaaagtgctcaataaa
attgaagccaacaaaactcaagaaacccgcatttacatgctagaagctaagatcccagat
ggccatgaagtggctaacatctctcatgacggtaaattggtcgacaatgtgatcaattgg
cgtgtcgagatgacatcaggcatggcaagccaagatgtaacatttgacttaattccacgt
aaagccagtacaaaaaacagcttaaccctgtccaatactgtggataatcccaccgcgaag
aaactagaacagaactacagttttgatgtagcagagttgaagcctacagctaaagttgat
gcgccaagctctattcttgaaggtacaaccttggtattggatgccagtgtatcttcagat
cccaatggtgatgatttgagctataagtggactcaattaggtggagcaagtgtgacattt
aatgacactgcagacaaaatcagctttctcaccccaactgttgatgtcaatgcacagaca
ctttctttccaagtggaggtcaatgacggcaatggcaactctgactcaacgctcgtctct
gtatcggtcaccgatacggtagagaggaaaagtggcggctcactaggctggctaacactt
ctcctactccccctagtgtggaggcgccgtaaacaaggttaa
DBGET
integrated database retrieval system
