Shewanella woodyi: Swoo_2235
Help
Entry
Swoo_2235 CDS
T00676
Name
(GenBank) transcriptional regulator, LysR family
Organism
swd
Shewanella woodyi
SSDB
Ortholog
Paralog
Gene cluster
GFIT
Motif
Pfam:
LysR_substrate
HTH_1
MarR_2
Motif
Other DBs
NCBI-ProteinID:
ACA86516
UniProt:
B1KED8
LinkDB
All DBs
Position
2742410..2743354
Genome browser
AA seq
314 aa
AA seq
DB search
MNISRVDLNLLVYFDVLLRELNVTRAADQLGISQPAMSNGLKRLRVLFDDPLLIRTSKGM
TPTERASELKPVIRELLVGLEKAVEPKAKFNPRESEQVFRMMASDYAEATLIPLLIARLR
NEAPKVILDIMTPSDVNFPDVEQGRVDMVINRFDSIPLSFHQKVLWKDSFSCLINRNHDV
LKNFNLENYLNAHHVWVSKTGMGIGVGMDPDDVQRLGWVDEALAKIGAKRRITVFTRHYQ
AASSLAERQDLIATVPSKMARLQQDNSRVSIIPPPFDIPPIELTMAWSPLLQHNPAHKWM
RELITETARIIDRF
NT seq
945 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
atgaatatatctagagtcgacctcaatctgttggtgtattttgatgttttgctaagagag
ttaaatgtcacgcgagcagcagatcaattaggaataagtcagcctgcaatgagtaatggc
cttaaaaggctacgtgtcctgtttgatgaccctctgcttattcgtactagtaaagggatg
acgcccacagagcgtgcatctgaactaaaacctgtgatccgtgagctattagtaggttta
gagaaagctgtagagcccaaagccaagtttaatccccgcgaaagtgaacaggtgtttcgt
atgatggcctcagattatgcagaggcaacattaatacctttattaatcgctaggttacgc
aatgaagctcccaaagtgattttagatattatgacgcctagtgatgttaactttcccgat
gtggagcagggacgggtggatatggtgattaaccgttttgatagtattccactctctttt
catcaaaaagtactctggaaagacagttttagctgcttaattaatcgtaatcacgatgta
ttgaaaaactttaacctagaaaactacctaaatgctcaccatgtttgggtgagtaaaacc
ggtatggggattggcgtggggatggatcctgatgatgttcagcgtctcggttgggttgat
gaagcattagctaaaataggggcaaaacgcaggatcactgtatttactcgccactatcag
gctgcaagttcattggctgagagacaagatctgatcgcaacagtgcctagtaaaatggct
agattacaacaagataacagtagagtgtcgattataccgccgccttttgatatcccgccc
attgagcttactatggcttggagtccgctactacaacataaccctgcccataagtggatg
cgtgaactcatcacagaaacagcccgtatcattgaccgtttttaa
DBGET
integrated database retrieval system