Shewanella woodyi: Swoo_2381
Help
Entry
Swoo_2381 CDS
T00676
Name
(GenBank) Peptidase M1 membrane alanine aminopeptidase
Organism
swd
Shewanella woodyi
SSDB
Ortholog
Paralog
Gene cluster
GFIT
Motif
Pfam:
Peptidase_M1
ERAP1_C
Peptidase_M1_N
SprT-like
Motif
Other DBs
NCBI-ProteinID:
ACA86660
UniProt:
B1KFB9
LinkDB
All DBs
Position
2919953..2922532
Genome browser
AA seq
859 aa
AA seq
DB search
MYRVMATSLITAALLSCSQLHAEQFVLNKHAKPISQAVSLVLDPHKDDFSGSTNIQIQVL
KKTKIIQINGVDYTTKNIKLTGDSHCDMSAKMLDTGIVNLICDTDIYPGDYQLRLDFTAP
YNRQSVGLYKTIDAGVPYLFTQFEMSDARRSFPVFDEPEYKIPFQISITAPYDEKVYSNT
PLVSTKINGSQKTHHFAQTKPLSSYLIAYAVGKFESIPVEGMKIPGNVITTQGKVELAKY
AVKEMPAILARLENYFGVDYPYQKLDSVALPEFPFGAMENAGLVTYREDILLLDEAVANQ
NTKRSSISVIAHELAHQWYGNLVTMKWWNDLWLNEAFASWMAAKVTHELHPEFESHLNLS
KNRVMSMDARLSTKPIRKPINTEADIMDGLGLAYSKGSAVLSMVENWIGEEDFKQGIRQY
IKDHAFKNTSADDLWNALSKASGKDVAQVLSTFIEQASYPLIMVKVSGNNLNLSQERFVF
AGSQASSQEWVVPVSIKYGKGDKQITETVLLDSKNKQIKLQFTPDWVYPDADGMGYYRWL
LGDKQLNNLLKNAKNVLTDRERKALISSADALLAGGFITAGELLSILGEFVDDAHPQVVS
SALSYLQIQKATFVDQSNEANWAKFISTKARSAINKYGEVAIEGESIAISKLRPSLISIL
AFEGKNKTIIAAAKKASLDYLDGSKSFDAYLIGTQLQIAVYYGDNELIQKFKTVFETTKN
PQKRTQLMYALGFVAEEKQQKQILDYSLTNKLNSPDLGYIMYGQSYTQARKEIFRTWLYN
NYAAVKNKLPPFSVAKLPNYAGDGCDLVALDKTNLFFQPKLKDSPEFTRSLAKLNEKVKN
CVQLKNREQASVDQYLQKH
NT seq
2580 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
atgtatcgagttatggccacaagcctaatcacagcagcattacttagctgtagccaactg
catgcagagcagtttgtgctcaataaacacgcgaaacctatttctcaggcggtaagttta
gtcctagatccccataaagatgatttttcaggcagtacaaatatacaaatacaagtactt
aaaaaaactaaaataatccagataaacggtgttgattacacgacaaaaaacattaaatta
acaggcgatagccactgtgatatgtccgctaagatgttagataccggcatcgtcaatctt
atttgtgatacagacatttaccctggtgattatcagctacgtctcgattttaccgcacct
tataatcgtcaatcagtgggtctatacaaaaccattgatgccggcgtgccttaccttttt
acgcaatttgagatgagtgatgctcgtagaagttttccggttttcgacgaaccagaatat
aaaatcccattccagattagcataacagcgccatatgatgagaaagtttacagcaatact
cccttggttagcactaagattaatgggagccaaaaaactcatcattttgcgcagactaag
ccattatcttcttatttaatcgcttacgctgtgggtaagtttgagtccattcctgttgaa
gggatgaagatccccggtaatgtgatcaccacacaaggaaaagtagagcttgcaaagtat
gccgttaaagagatgcctgccattttagcgcgtttagagaactactttggtgttgattac
ccttatcagaagctagactctgttgctttacctgaatttcctttcggtgctatggaaaat
gcagggcttgtcacttaccgtgaagatatcctgcttctagacgaagctgtggcaaatcaa
aatactaaacgttcatctatatctgttatcgcccatgagctggcacaccaatggtatggt
aaccttgttaccatgaaatggtggaacgatctttggttaaatgaagcatttgcaagttgg
atggccgctaaagttactcacgagttacaccctgagtttgagtcgcatttaaacctatct
aaaaacagagtcatgagtatggatgcgcgactctctactaaaccgatccgtaagcctatt
aacactgaagccgatattatggacgggttgggcttagcttatagcaaaggatctgcagta
ctatctatggttgagaactggattggtgaggaggattttaaacaagggatccgtcaatat
attaaagatcatgcttttaaaaataccagtgcagatgatctttggaatgccttatctaag
gcttcaggtaaagatgttgctcaagtactaagtacatttatagaacaagcatcatacccg
cttattatggtcaaggtcagtggtaataacttgaatctttctcaggaacgttttgtattt
gctggcagtcaagcatcaagccaggagtgggtagtacctgtctcaatcaaatatgggaaa
ggggataaacagatcactgaaacagtactacttgatagtaaaaacaaacagataaagctt
caatttactccagattgggtatatccagatgcggatggaatgggttactaccgatggtta
ttaggtgataagcaactaaataacttactaaaaaacgcaaaaaatgtgctcaccgacagg
gagcgtaaagcgttaatatcttcagcagacgcactacttgcaggcggattcattacagcc
ggtgagttactctccattcttggtgaatttgttgacgatgcacatccgcaggttgtttca
tcagcattaagttacctgcagatccagaaagctacttttgttgatcaatcaaacgaagct
aattgggctaagtttattagcacaaaagctcgcagtgcgattaataaatatggcgaagtg
gcaattgaaggagagagcatagcaatcagcaagttgcgtcctagtcttatctcaatttta
gcctttgaaggtaagaacaaaacgattatcgcagcagccaaaaaagccagtctagattac
cttgatggtagtaagtcatttgatgcttatctcattggaactcaattacaaatagctgtg
tattatggagataatgaattaatacaaaagtttaaaacagtctttgaaacgactaagaat
ccacaaaagagaacacaattaatgtatgcactgggatttgttgccgaagagaagcagcaa
aaacagatactggattatagtttaacaaacaagttaaactctcctgatcttggctatatt
atgtatggtcagagctatactcaagcaagaaaagagatttttagaacttggttatataac
aactatgctgcagtaaaaaataagttacctccattttccgttgcaaaactgccgaactat
gcaggcgatggttgtgatttagtcgcactcgataaaaccaacctattctttcaaccaaaa
cttaaagattctcccgagtttacacgcagcttggccaagttgaatgagaaggtaaaaaac
tgtgtacagttgaaaaatcgagaacaggcgagtgttgatcagtacttgcagaaacattag
DBGET
integrated database retrieval system