Shewanella woodyi: Swoo_3078
Help
Entry
Swoo_3078 CDS
T00676
Name
(GenBank) MotA/TolQ/ExbB proton channel
KO
K03561
biopolymer transport protein ExbB
Organism
swd
Shewanella woodyi
Brite
KEGG Orthology (KO) [BR:
swd00001
]
09180 Brite Hierarchies
09183 Protein families: signaling and cellular processes
02000 Transporters [BR:
swd02000
]
Swoo_3078
Transporters [BR:
swd02000
]
Other transporters
Pores ion channels [TC:
1
]
Swoo_3078
BRITE hierarchy
SSDB
Ortholog
Paralog
Gene cluster
GFIT
Motif
Pfam:
MotA_ExbB
Fib_alpha
Motif
Other DBs
NCBI-ProteinID:
ACA87349
UniProt:
B1KLQ2
LinkDB
All DBs
Position
complement(3768482..3769837)
Genome browser
AA seq
451 aa
AA seq
DB search
MKKFISTAIVAATLSLTAGMVSAADAPKSIDQLLKQVQSERATAAKTNKNREAEFRAERG
DKAALLKREKAALAAEEQRGKDLTQAFADNERKIAQLEEDRKIAQGDLGEMFGVVKGEAG
DFAGKLASSNVTAQYPGRDKFIAELGARKELPKIEELEKFWEDQLFEMAESGKVVTFDGS
VTGLDGGVHNTTVTRVGAYNLLADGKYVVYNADLGLIQELSQQPGGEQVSSVKNFTSTTS
GYEKLFVDPARGVLLSVFTQKATIEERIEAGGPIGYIIIGLLILGALIFIERLITLYLVG
AKVKSQRKNLEEPGNNPLGRILKTYQENKDVDVETLELKLDEAILKETPALETRISIIKV
LAAIAPMMGLLGTVTGMIATFQTIQLFGTGDPRLMAGGISMALMTTVQGLVAALPLMLMH
AIVIARSKSVVQVLEEQSAGIVAAHAEKRNA
NT seq
1356 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
atgaaaaagtttatctctacagctatcgttgctgcaactctatctctaactgccggtatg
gtaagtgctgccgatgctcctaaaagcattgatcagcttcttaaacaggttcaatctgaa
cgtgctactgcagctaagacaaataaaaatcgtgaagctgagtttcgtgctgagcgtggt
gataaagctgcgttacttaagcgtgaaaaagccgctcttgctgctgaagaacagcgcggt
aaagatctgactcaggcttttgctgataacgagcgtaaaattgctcagttagaagaagat
cgtaaaattgctcaaggtgatttgggtgagatgtttggtgttgttaaaggcgaggctggt
gattttgctggtaagctagcttcatctaacgtgactgctcaataccctggtcgtgataag
tttatcgctgaacttggtgctcgtaaggagcttccaaaaatcgaagagcttgaaaagttc
tgggaagaccaacttttcgagatggctgaatctggaaaagtcgttacttttgatggttca
gttaccggtcttgatggtggtgttcataacactactgtgacacgtgttggtgcttataac
ctacttgctgatggtaagtatgttgtgtataacgcagatcttggtctaattcaggagctt
tcacagcaacctggtggcgagcaagtatctagtgttaagaacttcacttctaccacttct
ggttatgaaaagctttttgttgaccctgcacgtggtgttttattaagtgtattcactcag
aaggcaacgattgaagagcgtatcgaagcaggtggaccaattggttacatcattatcggt
ctacttattctcggtgctctaatctttatcgagcgtctaattacgctttatcttgtaggt
gctaaagttaagtctcagcgtaagaatcttgaagagccaggtaataacccacttggacgt
attcttaagacttatcaagaaaacaaagatgttgatgttgagacattagagttgaaactt
gatgaagctattcttaaagagacgcctgcacttgaaactcgtatctctatcatcaaggtt
cttgcagctatcgcacctatgatgggtctacttggtacagtaacgggtatgattgcaacc
ttccaaacgattcagttattcggtacaggtgatccacgtctaatggctggtggtatctct
atggcactgatgacgactgttcaaggtctagttgcagcgcttccattgatgcttatgcat
gcgattgttattgctcgtagcaagtcagttgttcaggttcttgaagagcagagtgctggt
attgttgctgctcacgctgagaagaggaacgcataa
DBGET
integrated database retrieval system