Shewanella woodyi: Swoo_3956
Help
Entry
Swoo_3956 CDS
T00676
Name
(GenBank) NADH dehydrogenase (quinone)
KO
K05568
multicomponent Na+:H+ antiporter subunit D
Organism
swd
Shewanella woodyi
Brite
KEGG Orthology (KO) [BR:
swd00001
]
09180 Brite Hierarchies
09183 Protein families: signaling and cellular processes
02000 Transporters [BR:
swd02000
]
Swoo_3956
Transporters [BR:
swd02000
]
Other transporters
Electrochemical potential-driven transporters [TC:
2
]
Swoo_3956
BRITE hierarchy
SSDB
Ortholog
Paralog
Gene cluster
GFIT
Motif
Pfam:
Proton_antipo_M
NADHdeh_related
Motif
Other DBs
NCBI-ProteinID:
ACA88213
UniProt:
B1KG76
LinkDB
All DBs
Position
4820593..4822293
Genome browser
AA seq
566 aa
AA seq
DB search
MWMLELPPFVLFLIGGLIAATTRGKLRGALMIAIPVISGLHLWTVPEGVHLQLMFLDYQL
VPYRADKLSLMFGYIFHIAAFIAIIYSLHVKDTVQQVAAMLYAGSAIGAVFAGDLLTLFV
FWELLAFTSVFLIWARRTPQAYSAGMRYLIMQVLSGVILLVGALFYIADTGSISFDFIGL
EGIAGWLIFIAFGIKCAFPFAHTWLTDAYPEATPTGTVLLSAFTTKVAVYALARGYPGTE
LLVYIGAAMTCFPIFFAVIENDLRRVLAYSLINQVGFMVVGIGIGTALALNGAVSHAFND
VIFKGLLFMSMGAVLHMTGRINGSDLGGLYKTMPKTTILCIVGAASISAFPLFSGFVSKS
MVMTAAIETGHDWVWLMLLFASAGVFHHAGIKIPYFAFFAHDSGIRANDPPNNMVLAMFI
AACLCIGIGIYPAALYSLLPYDTGYNPYDATHVLAQTQLLLFSALAFVWLNLKGMYPPEL
RSTHLDVDWVYRRLVPNALQRMFAVVWKVDGEVRQAVLGKLNQGQQLLTRKSKGAGSFIS
STYPSGNMVLWVAIILAAYLFMVFIG
NT seq
1701 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
atgtggatgcttgagctaccgccctttgtactgtttttaattggcggactaattgctgca
acaacacgcgggaagctgcgtggtgcattgatgattgccattccagttatcagtggatta
catctgtggaccgtacctgaaggcgtccacttacagttgatgtttttagactatcaactg
gtcccctaccgcgccgacaaattaagcctgatgtttggctatattttccatattgccgcc
tttattgccatcatctattcactgcacgttaaagacacagttcagcaggtagcggccatg
ctctatgcgggcagcgccataggtgcggtgtttgcgggtgatctgcttaccctgtttgta
ttctgggaactattggcctttacctcagtatttctaatttgggctcgccgtacccctcaa
gcctacagcgcaggtatgagatatttgatcatgcaggtgctctcaggggtaattctgcta
gttggagccctgttttatattgcagacactggcagtatctccttcgactttatcggccta
gagggtattgctggctggcttatctttatcgcctttggcattaagtgcgcctttcctttt
gcccacacttggcttaccgatgcctaccctgaagcgacaccgaccggtaccgtattactc
agtgcatttaccactaaggtggcggtttatgctctggctcgcggctaccccggcacggaa
ctgctggtttatattggcgcggctatgacctgcttccccatcttctttgcggtgatagaa
aacgatcttcgtcgagtactggcttatagcttgattaaccaagttggctttatggtggtt
gggatcggtattggtacagccttagcacttaatggtgcggtatctcacgcctttaatgat
gtgatctttaaaggcttactgtttatgagcatgggtgcagtgctgcatatgacaggtcga
ataaatggctcagatctcggcggcctctataagaccatgcccaaaaccacgatactgtgt
attgtcggcgcagcctctatctcggcattcccactatttagcggctttgtcagtaaatct
atggtgatgactgccgccattgaaactggtcatgactgggtttggttaatgctgctattt
gcctctgcaggggtattccaccatgcaggtatcaagatcccctactttgcatttttcgcc
catgattcagggattagagccaacgatccgccaaacaacatggtattggccatgttcatt
gcagcttgtttgtgtatcggcattggtatctaccctgcggcgctctactcactgctgcca
tacgatactggttacaacccctatgatgcgacccatgtgctcgcacagacccagttactg
ctgttctcggcactggccttcgtctggttgaacctaaaaggtatgtacccgccagagctg
cgctcgactcatctggatgtggattgggtctacagacgcctagtccctaatgccctgcag
cggatgtttgcggtggtctggaaagtggatggagaagtgcgtcaagcagtccttggtaag
cttaaccaaggtcagcaactgttaacacgcaagagcaaaggagcgggaagctttatctcc
agtacctacccctctggcaatatggtgctttgggttgccatcattctagctgcctacctg
tttatggtctttattggctaa
DBGET
integrated database retrieval system
