Shewanella woodyi: Swoo_4478
Help
Entry
Swoo_4478 CDS
T00676
Name
(GenBank) cytochrome c-type biogenesis protein CcmF
KO
K02198
cytochrome c-type biogenesis protein CcmF
Organism
swd
Shewanella woodyi
Brite
KEGG Orthology (KO) [BR:
swd00001
]
09180 Brite Hierarchies
09183 Protein families: signaling and cellular processes
02000 Transporters [BR:
swd02000
]
Swoo_4478
Transporters [BR:
swd02000
]
Other transporters
Others
Swoo_4478
BRITE hierarchy
SSDB
Ortholog
Paralog
Gene cluster
GFIT
Motif
Pfam:
CcmF_C
Cytochrom_C_asm
Motif
Other DBs
NCBI-ProteinID:
ACA88729
UniProt:
B1KK98
LinkDB
All DBs
Position
5415454..5417430
Genome browser
AA seq
658 aa
AA seq
DB search
MIPELGLIFLIISTVSALLLSFIPLYAAYTKNSYLFSYVKTLTALMTITICASILCLLAS
FLMDDFSVAYVANHSNTQLATLYKVAAVWGSHEGSMLFWMVSIAIWGCIIVFSPRYQDRL
FIGRMIAILAFVIAGFNLFMLFTSNPFARLLPNFPIEGRDLNPILQDIGLIFHPPMLFLG
YVGLTITFAAAIAALLGGKFTQQHASYLRPWVLMAWVFLTGGNAFGSWWAYNELGWGGWW
FWDPVENASFIPWLVATALLHSVVLSQQRSSFRVTTLLLCLLAFSLSLLGTFLVRSGIVQ
SVHAFASDPTRGMSILFLLGVFVCGALTLFALKANLIKSKSEFALLSRDTVILLGNIVLV
VAAISVLLGTFYPLLFELLNLGTLSVGAPYFNSIFVPLTFVAVLLMGAAPLIKWQQQSLN
CLYPLAALFALAATIGVLVAMQTRDGFNPWVWLGATAASWVFFTLGYLVFSLRSQGAAAI
TKKVAMMIAHFGVAITIIGATAVSNFETQELLRMGPGQGKVVAGYTFVYEDTADVDTKSY
TAIQANIRVTDVDDNFVGYITPQRQTFKTNAMEVSKAGIMRNLVRDLYVSSGQQLSDTEY
LVRISHKPLACWIWIGGLMMMLGGTIAAFSALYNLGRQPVTAKSCSSQAIPKFTEELA
NT seq
1977 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
atgatcccagaactaggacttattttcctcattattagcactgtgtctgccttgctactg
tcatttattccgctctatgctgcttatactaaaaatagttacctgtttagctatgtaaaa
accctgaccgcattaatgactatcaccatttgtgcctctattttatgtctattagcatcc
tttctaatggatgacttctcggtggcttatgttgccaaccactcaaatactcaattagcc
actctctataaggtcgccgcagtatggggaagccatgaaggttcgatgctattttggatg
gtctcaatcgctatttggggttgcatcatagtattctctcctcgctaccaagacaggctt
tttattggccgtatgatcgccattttggcctttgtaatagctggctttaatctgtttatg
ctgttcacctctaatccatttgctcgcttactgccaaactttccgatagaggggcgcgac
cttaacccaattttgcaagacataggactcatctttcatccccctatgttgttcttaggc
tatgtgggactcaccatcacctttgcggctgcaattgcggcactacttgggggcaagttt
actcagcaacatgcaagctaccttcgcccttgggtgttaatggcctgggtatttctaacg
ggtggtaatgcttttggttcttggtgggcttataacgagctaggctggggcggttggtgg
ttctgggatcctgttgaaaacgcttcattcattccttggttggttgcaacggcgctgctt
cacagcgtggtattaagtcagcaacgaagtagctttagggtgacaacattactcttgtgt
ctgctcgctttctcgttaagtttgctgggtaccttcttagtgcgatctggcattgtgcaa
tcagtacacgcctttgcttcagacccaacccgtggtatgtccattctgttcctacttggg
gtatttgtatgcggcgcgttaaccctgtttgctctcaaggctaacctgattaaatctaaa
tcagagtttgcgctactgtcgcgcgatactgtgatactgcttggtaatatcgtattggtg
gtggccgctatctcggtattacttggcaccttctacccactgctatttgaactgcttaat
ttaggcaccttgtcggtgggcgcgccctatttcaatagcatttttgtgccactcaccttt
gtagcggtattactgatgggcgccgcaccactgataaaatggcaacaacaatcacttaat
tgtttatacccacttgcagccttattcgcactcgcagccactattggtgtattggtggca
atgcaaacccgtgacggctttaacccttgggtatggcttggcgcaacggcggcgagctgg
gtgttcttcaccttaggctacttggtatttagcttacgctcacaaggcgctgctgccatc
actaaaaaagtagccatgatgattgctcactttggtgtggccattaccattattggtgca
acggcggtgtctaactttgaaacccaggagctgcttagaatggggccagggcaaggcaag
gtagtcgctggctacacctttgtttatgaagatactgccgatgtcgacactaagagctat
accgcgattcaggccaatatccgcgtgactgatgttgatgacaacttcgtgggttatatc
accccgcaaaggcaaacctttaagaccaatgcgatggaggtctctaaggctggcattatg
cgcaacttagtgcgtgacctgtatgtatcgagcggccagcaacttagtgacactgaatat
ctagtacgtattagccataaacctttggcatgctggatctggattggtgggttgatgatg
atgctaggcggcacaattgctgctttttcagccctatacaacctaggtcgccaaccagtc
acagcgaagtcatgctcctcacaggctatacctaaatttaccgaggagttagcgtga
DBGET
integrated database retrieval system