KEGG   Shewanella piezotolerans: swp_0504
Entry
swp_0504          CDS       T00791                                 
Name
(GenBank) Conserved hypothetical protein
  KO
K12287  MSHA biogenesis protein MshQ
Organism
swp  Shewanella piezotolerans
Brite
KEGG Orthology (KO) [BR:swp00001]
 09180 Brite Hierarchies
  09183 Protein families: signaling and cellular processes
   02044 Secretion system [BR:swp02044]
    swp_0504
Secretion system [BR:swp02044]
 Type II secretion system
  MSHA pilus biogenesis protein
   swp_0504
SSDB
Motif
Pfam: DUF6701 H_lectin DUF7305 Big_3_5
Other DBs
NCBI-ProteinID: ACJ27333
UniProt: B8CI57
LinkDB
Position
519596..524233
AA seq 1545 aa
MSNFKRLIVLFFFSAAFSNVVNAFDDIDESVYFPAVAQGHHGNNNNSCHQISDPQFKQNN
SARINGTEGLGLKFCSYNSGNGLPNDGCDTPSGGDRYCSITGGDIRGLSTNGSNAFKFSN
ENGGELGWCSSGQDYTFGNGSDTQFGKISVYSACTVTFSANHDEYRIKNILAGGGAKIVL
SAGDYFVEELKLASNSHIIAEGDVRIFVKSAIEISGAKINESGTGKVLLFGYDKMTLNGG
TSVKANLYSDDVIYMNSSSAVEGRVTSRYLEMNSTSSINDDASPPQALNFQFGKATSGTV
TFDTAFEAGVTPLVFLMPTITESNPSTSDGPASVFITSISSTGFSWSQRSPDGSDFSANI
MTEIHWLATTAGTHEFSDGTKFEAGIKAVDEVLYKALGSYESVSLSQSFDVVLSQIQSAN
NSCWLSSIADPNGSQLSIGMDVSEVVTAGPGNGFGNKYCRQGSSSTRLNQLGSEDIAYLA
LESGTGTISLNGKQTKYHFGSGYWTIPQSTVQNLDAQCAYESDLTGFDTPPVFVAGKSSR
YGPDGGWLRRCTLTSNKVSIGVDEDQYQDSERSHVAENYAFVALSYEDETPVLQCFYDDF
NRDDLGSDWAIKTLGNSTAPAIESNRMRITPARGNQATSSTYQRLFPAADNFVKVEFDYY
AWSPSSGTGGDGVAIILSDASITPQPGSFGGALGYAQRNNGTPGFAGGWMGVGLDEYGNF
SNPTEGKIGGPGFRTQSVTIRGSANSSYMYLAGTAANLNPAIDKRPTNTASPNHRYRITV
DSRVAGQALVLVERDIKDGNGFQILVPEFDARNIAGQGGVPDDFYLSITGSTGGANNNHE
IDNFEVCSLDSAPVGQLVHHFEFDYSSSPLTCNAEEMTIRACRNANCDLFTDPVTANLIP
ASMTNGGWVGGNVVNLVNGTATVSLRSNTVSPVTIGVSSSFPSTVAGSNTLCRQGSGALN
SASCTLAFAESGFIFDIPDELSNKPSTDILVKAVKQGDAGQACVPAFKSQTKSLNFWSDY
AEPTTGTMKVSVKSGSVEKEVGISLATAESMSLNFDENGEAKIDVNYADAGEMQLNARYT
GTGDEDGLVMNGSNKFVRRPVGICLESDSCTNCSVSSAKYKRAGEEFDIKVKAMAWQSDT
DADICSGNAVTPNFSHDNMLLTHELISPTIAEGGEAGTLGKSEYEQNAGEQVIAQSVSEV
GIFTFSVEPKAGGYFGYSIPGATTESIGRFTPYYLTVTPNKPAPQASCGVFTYMDEPFLF
KTGAEPKLLVLGKNIDGNETKNYQVENWWKYQNQWTHRAFSNIAGSTLPVLEELDPNSRT
VAYLDGTDSEVRSAYLVDGTLRYNRTTALITPFDAVFELSLEVNDLKDTDGICYQQNAAA
DCTGVTFTDIAKDDNFEMRYGRLVMQNAYGPSSEELRLELGTEYVDANSRWVSNGQDSCS
VFDTTTATVVEDTGLVLTPDAGLGAVEGFTNTGGNGKTGSIGLGNSFIYFPAPNAEGEVG
LQLHVDKWLQWYWNFDSAALEDPRASAFFGTYRGHDRIIYWREVN
NT seq 4638 nt   +upstreamnt  +downstreamnt
gtgagtaattttaaacggcttatcgtgctatttttctttagtgcagccttttctaatgtt
gtaaacgcatttgatgatatcgatgagtcagtatattttcccgcggttgctcaagggcat
catggtaacaataacaatagttgccaccagatcagtgatcctcagttcaagcagaataac
tctgcacgaataaatggtactgaagggctaggtttaaaattctgtagttataattccgga
aatggattaccaaatgacggctgtgataccccgtcgggtggagatagatattgctctatc
acaggtggggatattagaggccttagtacaaacggttcaaatgcatttaaatttagtaat
gaaaatggtggggaactcggctggtgctcaagcggccaagattatacgtttggtaatggg
agcgatacccaatttggtaagatttcagtctacagtgcatgtactgttactttttcggct
aaccatgatgaatatagaataaaaaacattctagctggaggtggagctaagatcgtctta
tctgccggagattatttcgttgaagaacttaagttagcatcaaatagccatattattgct
gaaggcgatgttcgaatatttgttaaatcagctattgaaatctcgggagcgaaaattaac
gaatcaggtacgggtaaagtgctgctgtttggctacgataaaatgacattaaatggtggg
acgtcggtaaaagccaatctttatagcgatgatgtcatttatatgaatagttctagtgct
gttgaggggcgagttacatctcgttatttagaaatgaattcgaccagtagtattaatgat
gatgctagcccaccgcaagcattgaacttccaatttggcaaagcaacctctggcacagtt
acattcgataccgcttttgaagctggtgtcacaccgttggtttttttaatgccaactatt
actgagagtaatcctagcactagtgatggtccagcctccgttttcatcactagtatttca
agtactggctttagttggagccaaagatcgccagatggctcagatttttcggctaacatt
atgacggaaattcattggctagcgaccactgcgggaacacacgagttttctgatggcact
aaattcgaggcgggtattaaggcggttgatgaggtgctttataaagcgctcggcagctat
gaaagtgtctctttgagtcaaagctttgatgtggtgctcagtcagattcaatcggccaat
aacagttgttggttatcaagtattgcagatcccaatggtagtcaactctctataggaatg
gatgtctcagaggtggttactgcgggcccaggaaatggctttggcaacaaatattgtcgc
cagggaagtagtagcactagacttaatcaactgggtagtgaggacatcgcgtatttggcg
cttgagagtggcactggcaccatttcattaaatggtaagcagactaaatatcattttggc
agcggttattggacaatccctcaaagtacagtgcagaaccttgatgctcaatgtgcttac
gaaagtgaccttactggatttgatacccctcctgtttttgttgctggtaaaagttcgaga
tatggtccagatggtggttggttaagacgatgtactcttactagtaataaagtgagtatt
ggggttgatgaggatcagtatcaagatagtgagcgcagccatgtcgcagaaaattacgct
tttgtagcgctgtcatatgaagatgaaacacctgtattacagtgtttctacgatgatttt
aatcgtgatgatttaggtagcgactgggcaattaaaacgcttggtaactctactgcacct
gcaattgaatccaaccgaatgcgtattacgccagcaagaggtaatcaagcgacatcgagc
acttatcaacgcctttttcctgctgcagataacttcgttaaggtcgagtttgattactac
gcttggtctccttcgtcaggaactggaggcgatggtgtcgctattattttatccgatgca
tctatcactccacaaccaggcagctttggcggagcattaggttatgctcaacgtaataat
ggtacgccagggtttgcgggaggttggatgggggtcggtttggatgagtatggtaacttc
tccaatccaactgagggtaaaatcggagggcctggatttagaactcaatcagtgacaatc
cgtggctctgctaactctagttacatgtatttagctggcacagcggccaatttaaacccg
gctattgataaaaggccaaccaatacagcttcgcccaatcataggtatagaataaccgta
gactctcgagtcgctggccaagcactagtattagttgagcgtgatattaaagacggcaat
ggattccaaatattagtgcctgaatttgacgccagaaatattgctggtcagggtggtgtc
cctgacgatttttatctatctataacaggctcaacaggtggagctaataacaaccatgaa
atcgataattttgaagtttgttcattagattctgcgccggttgggcaactcgtgcatcac
tttgagtttgattactcaagtagcccactaacctgtaatgcagaagagatgacgattcga
gcctgtcgtaatgctaattgcgatctgtttaccgatcctgttacagccaatctaatacct
gcgtcaatgactaatggtggctgggtgggtggcaatgtggttaatttagttaatggtacg
gcgacagtgagtttgcgttctaatacagtgtcacctgtgactattggtgtttctagttct
ttcccatcaacggttgcaggcagtaacactctttgtaggcaaggtagtggagcgctaaat
agcgccagctgtacgcttgcatttgccgaaagcgggtttatttttgatatccctgatgag
ctttcaaataaaccatcaacggatattctggtaaaggctgttaagcaaggtgatgcaggt
caagcatgtgtgccagcgtttaagagtcaaactaaatcgcttaatttctggagtgattat
gcagagcctacgacaggaaccatgaaagtttcggttaagtctggcagtgttgaaaaagag
gttggcatctctttggcaacagctgagagcatgagcctcaattttgatgagaatggtgag
gctaaaatagacgtcaactatgccgatgccggcgagatgcagctcaatgcacgatataca
ggcactggtgacgaagatggcttggtgatgaatggcagcaataagtttgtccgtcgtcca
gtggggatctgtttagagtctgattcctgtaccaactgcagtgttagcagtgctaagtat
aaaagagcaggcgaggagtttgatatcaaggttaaagctatggcttggcagtcagatact
gacgctgatatctgcagtggcaatgcggtaactccaaatttctctcacgataacatgctg
ctgactcatgaacttatcagtccaaccattgctgaaggtggtgaagcaggaaccttgggc
aaaagtgaatacgaacaaaatgctggtgagcaagtgatcgcacaatcagtttcggaagtg
ggtattttcactttttcagtagaacctaaagctggcggctattttggctatagtatcccg
ggagctacaacggaaagtattggacgctttaccccctattacttgacggtaactcctaat
aagcccgcacctcaagcaagttgtggtgtgtttacttatatggacgagccgtttttattc
aaaacgggtgctgagcctaagctgctggtacttggtaaaaatattgatggcaatgaaact
aaaaactatcaggtagaaaattggtggaagtatcaaaatcaatggactcatcgagcattc
agtaatattgccggctcgacactcccagtgcttgaagagttagaccctaatagtcgtacc
gttgcttatcttgatggtactgacagtgaagttagatcggcctatttagtggatggtacg
cttagatacaaccgcaccactgctttaataacaccttttgatgccgtatttgaactcagt
cttgaagtgaacgacctcaaggatactgacggtatctgttatcaacagaatgctgcagcc
gattgtacaggtgttacttttactgacatagccaaagatgacaactttgaaatgcgctac
ggccgtttagtgatgcaaaatgcctatgggccatcatcagaagagttgcggcttgagctt
ggcactgaatatgttgatgcaaattcacggtgggtgagtaatggccaagatagctgctct
gttttcgataccacaaccgcaaccgttgtcgaggatactggtttagtgctaacgcctgac
gcgggacttggcgccgtcgagggatttactaatactggtggcaacggtaaaacaggttca
attggcttaggcaatagctttatctatttccctgcaccgaatgccgaaggtgaagtggga
ttacagcttcatgttgataagtggctgcagtggtattggaacttcgatagcgccgcactt
gaggacccaagagcgagtgctttctttggtacttatcgcggtcatgatcgcattatatat
tggcgagaagttaattaa

DBGET integrated database retrieval system