Shewanella piezotolerans: swp_0530
Help
Entry
swp_0530 CDS
T00791
Name
(GenBank) Sodium:alanine symporter
KO
K03310
alanine or glycine:cation symporter, AGCS family
Organism
swp
Shewanella piezotolerans
Brite
KEGG Orthology (KO) [BR:
swp00001
]
09190 Not Included in Pathway or Brite
09193 Unclassified: signaling and cellular processes
99977 Transport
swp_0530
BRITE hierarchy
SSDB
Ortholog
Paralog
Gene cluster
GFIT
Motif
Pfam:
Na_Ala_symp
LrgA
DUF5392
Motif
Other DBs
NCBI-ProteinID:
ACJ27358
UniProt:
B8CI82
LinkDB
All DBs
Position
551572..552942
Genome browser
AA seq
456 aa
AA seq
DB search
MEAITEFVGMINGVVWGTPMLVMILGVGLFLTFGLRLMPILKLGTGFKLLWSGRIPDKDK
KMKGEISPFNALMTSLSATIGTGNIAGVATAIFIGGPGALFWMWCTALVGMATKFAEAVL
AVKYREVDDNGNHVGGPMYYIKNGLGSKWAWLGTAFALFGSLAGFGIGNTVQANSVADAL
SSNFGVPTWVTGLILMVLVGAVLMGGIKRIADVAGKLVPIMTIFYIAAGIAVLVVYAAEI
PAAIELIIHSAFNPVAAQGGFAGAAVWAAIRFGVARGVFSNEAGLGSAPIAHAAAQTNNP
VAQGLVAMLGTFIDTLIVCTITGLAIIVSGAWTSGENGAALTSFAFSHAFPLGNYVVAIA
LSVFAFTTILGWSFYCEKCVQFLFGVKAIKPFRILWVIVVPLGAVSSLEFIWLLADTLNA
MMAIPNLIALALLSPVVFALTREYFLKKRETEAAES
NT seq
1371 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
atggaagctattactgaatttgttggcatgatcaacggcgtagtatggggtactcctatg
ctcgtcatgatcttaggggtggggttattcctcacttttggtttacgcctaatgccaatc
ttaaaactgggcactggctttaaactgctttggtcaggccgtattcctgataaagacaaa
aaaatgaaaggtgagattagcccgtttaacgcgctaatgacgtcattatcagccaccatt
ggtactggtaatattgcaggcgttgcaactgccatttttattggcggaccaggggcgcta
ttttggatgtggtgtacggcattagtcggcatggccaccaagtttgccgaagcggtatta
gcggttaaataccgtgaagttgatgacaatggtaaccacgtgggtggcccaatgtactac
atcaagaatggtctaggttcaaagtgggcttggttaggtacagcgtttgcactatttggt
tctctagcaggtttcggtattggtaatactgtacaggctaattcagtggctgatgcatta
agcagtaactttggcgtacctacttgggtgactggtttgatattaatggtcttagtaggt
gctgtattaatggggggcattaagcgtattgctgatgttgccggtaagcttgtacctatt
atgaccattttttatatcgcagcaggtattgcggtattggtggtttatgctgcagaaatt
ccagcggcaattgaattgattattcacagtgcatttaatcctgtcgctgcgcaaggtggc
tttgctggtgctgcggtatgggcggcaattcgctttggtgtggctcgtggtgtgttttcc
aacgaggcgggccttggtagtgcgccgattgcacacgctgcagctcaaacgaacaatcct
gtggctcagggtttagtcgctatgttaggtaccttcattgatactttgatcgtttgtacc
attacaggtttggcgattatagtgtcaggggcatggacatcaggtgagaacggcgcagca
ctcacttcgtttgctttttcccatgcattcccgttaggtaactatgtggtcgcaattgct
ttgtcagttttcgcatttaccactattttgggctggagtttctattgtgagaagtgtgta
cagttcctgtttggtgttaaagcgattaagccgtttaggatcctttgggtgatcgtggtg
cctttaggtgcagtcagctcattagagtttatctggctacttgcagatacgttaaacgca
atgatggcgataccaaacttaatcgcattggcattactaagccctgtcgtgtttgcgttg
acaagagagtactttcttaagaagcgtgaaacggaagctgctgagtcgtag
DBGET
integrated database retrieval system
