KEGG   Shewanella piezotolerans: swp_0776
Entry
swp_0776          CDS       T00791                                 
Name
(GenBank) MscS Mechanosensitive ion channel
  KO
K22051  miniconductance mechanosensitive channel
Organism
swp  Shewanella piezotolerans
Brite
KEGG Orthology (KO) [BR:swp00001]
 09180 Brite Hierarchies
  09183 Protein families: signaling and cellular processes
   02000 Transporters [BR:swp02000]
    swp_0776
Transporters [BR:swp02000]
 Other transporters
  Pores ion channels [TC:1]
   swp_0776
SSDB
Motif
Pfam: MscS_TM MS_channel_2nd MS_channel_3rd MS_channel_1st
Other DBs
NCBI-ProteinID: ACJ27589
UniProt: B8CIW3
LinkDB
Position
complement(774792..777986)
AA seq 1064 aa
MHRFLLVFLCLFCSTANANQPTSLEKKLGLNPTTSETKTPQQQLFLLQSKIQELALTEKN
AKTLLSNFELHKANLLQQIAEAKKAVTLSTEQDISQQGSMAYLRLSELKEVEISLSNKIN
ELNSALNNLPKTLNGARATLKKHKKIKLSNEQTLANKILLAQRELYQQHVVTLEASLASS
QKEIDLNQLQLQLVREQLLQQELFIERINQQLELQRHKRTEAAIAQSLVPDSTATDPIAQ
ALNEANQQYGETLKALNLKISQALTQQEHAEAQYQDQAKQLTNIQQQISWLKLNSAFGER
FLQMLQALPKPPSQDKVQSEIADARLARYQIEQSQTINEQLLSGVPKPTQLHAKLLISQE
LLLQQLLQSYDQYLSELADLRVSNEQLNQQYITLRDTLNEHLFWVPNANRIGGLWLTELH
QSVQWMIQQAPWKQLQNSFTEQGSLWSWWLILFIVSLVAQDILTPKFKAAMRRELPFVGN
VTQDKFIYTWHVLLNSASYSLLKPLPIILAGTIFYLSSINFVSAIGMGILAVGIFYQLYR
LVFLLALDKGLLINHFKAQRSIVRAGQAKFKQLTFMVTPFLGITAFAEIIDTSLVRNSLG
RGAFIIFCLMLFWFYKDILEISNRENKHHHGDKNRKLIQKLLWAMLIITPIACAVLAFLG
YYYTAVQMFLQLQLSLIFGLGFLLLYQLIKRWMLIERRRIAFERAKTKRAEVLAQREKGE
VNSPEQLDTYEEPEVDLETISGQSLGLVRSLLLLAFLASIVGLWTQTHTALFSLLDGVTL
WSSNTTINGIEQQLPITLKSLLLSLIIVGFSMMIATNLPGLIELTILQRLDLSQGTGFAL
TTVCRYLVIVFGVLSGFSTLGMEWSKLQWLVAALSVGLGFGLQEIFANFISGLIILFEKP
VRIGDTVTIRDLTGTVSKIQIRATTIIDWDRKEIIVPNKAFITEQLINWSLSDPITRVIV
YVSVARDSDPARVEAALYQAVQECDDALLTPEPEVWFAGFGQHTQDFEVRAYAKDMGTRW
PLRHKLHKQISKKLRDNNLELAYPQLEVHLSPGQAKDVQNLIRT
NT seq 3195 nt   +upstreamnt  +downstreamnt
atgcatcgttttttattggtcttcctgtgtctattttgttccactgccaatgcaaaccaa
cccacttctcttgaaaaaaagttggggctaaatcctacaactagtgaaactaagactcca
caacaacagttgtttttactacagtcaaaaattcaagagctagcacttaccgaaaaaaat
gctaaaacactgctaagtaattttgaattacataaagcaaacctattgcagcaaatagca
gaagcaaagaaagcagtcacgctttcaacagagcaagatattagccaacaaggttcaatg
gcctacctgcgactttctgaattgaaagaagttgaaatcagtttgagtaataaaattaat
gagctaaatagcgcattaaataatttgccaaaaaccttaaatggtgcgcgagcaacgctc
aaaaagcacaaaaaaatcaagctatctaatgagcagaccctagcgaataaaatactactg
gctcaaagagagctatatcagcagcatgtcgtcacccttgaagcaagcttagccagtagt
cagaaagaaattgacctcaaccagctgcagttacagctagttcgtgagcagttgttacag
caagaactgtttattgagcgcatcaaccaacagctagaattacaacgccacaagcgtact
gaagctgcaatagcccaaagtttagttcctgattcaaccgctacagatcctattgctcaa
gcccttaatgaagcaaatcaacaatatggcgaaacactaaaagcacttaatctcaaaatt
agccaagcactgacacagcaagagcatgctgaggcacagtaccaagatcaagctaagcag
ctcactaatattcaacagcagataagttggctcaagctcaactcagcattcggtgaacgt
tttctgcagatgctacaggcattacccaaaccaccaagccaagataaggtgcaatcagag
attgccgacgcacgattagcccgataccaaatagagcaatcacaaaccattaatgaacag
ctgcttagtggtgtaccaaagccaacacaactgcatgcaaagctgcttatttctcaagag
ttactactacagcaacttctgcaaagctatgaccaatacttaagtgagttagctgattta
agagtgagcaacgagcaacttaaccagcaatacatcactttaagagacacgctaaatgag
catctattttgggtgcctaacgctaatcgaattggggggctttggctaactgaactgcac
caaagcgtgcagtggatgatccaacaagccccttggaagcaactgcaaaactcattcact
gaacaaggcagtttatggtcttggtggttaattttgtttatcgttagcctcgtggcacaa
gatattctcacaccaaagtttaaagcagcaatgcgacgtgaactgccatttgtaggtaac
gttactcaagacaagtttatttatacttggcacgtactacttaactctgcgagctacagc
ctgctcaaaccgcttccaatcattctcgcggggacaattttttatttatctagtattaac
tttgtttccgccataggtatgggcattttggcagtgggcattttctatcaactatatcgc
ttggtgtttttactcgctttagataaggggttgctgattaatcacttcaaagcgcagcga
agcatagtacgcgccggacaagcgaagtttaagcaacttacctttatggtaaccccattt
ttaggcatcacagcatttgccgaaatcattgatacttcgctcgttagaaatagcttagga
cgtggtgcatttatcattttctgtttaatgcttttttggttctataaggatattttagaa
atatccaaccgagagaataagcatcatcacggcgataaaaacagaaagcttatccaaaaa
ttactgtgggcaatgctaatcataacgccaatagcttgtgctgtattggccttcttaggt
tactactacacagctgtgcaaatgttcctgcagttgcagctatcattgatttttggccta
ggctttttattactttatcagttaataaaacgctggatgttaatagagagacgacgaatt
gcctttgaacgcgctaagacaaagcgtgcagaagtactcgcacaacgtgaaaaaggggaa
gttaattcaccagagcaactcgatacctatgaagagccagaggtcgatttagagacgatt
tcaggacaatctttaggtttggttcgctcactcttactattagcctttttggccagcatt
gtaggcctttggacccaaactcatacagcattattctctttgctcgatggagtaacattg
tggtctagtaataccactatcaacggcattgaacagcaactaccgatcaccttaaaatca
ctcttgctctcgcttatcattgtaggtttttcaatgatgattgccaccaatttaccaggc
ttgattgaactaacgattcttcaacgattagacctcagccaaggcactggttttgcacta
actacagtttgtcgctatttagtgattgtctttggtgtattaagcggattctctacatta
gggatggagtggtcgaagctgcagtggttagtcgcagctctatcagtaggcttaggattt
ggcttgcaagagatttttgctaactttatctcgggcctcatcatcctattcgaaaaacca
gtacgaattggtgatacggtaacgattagagatctcactggtactgtcagtaaaatccag
atccgtgccaccaccataatcgactgggatcgaaaagagatcattgtgcctaataaggcc
tttattactgagcagctgattaactggtcgctttcagatccaataacaagagttatcgta
tatgtctctgtagcgcgagattccgatcccgcacgcgtggaggctgctctttatcaagct
gtgcaagagtgtgatgatgccctactcacaccagaaccagaagtatggtttgcagggttt
ggtcagcatacccaagactttgaggtcagagcttacgccaaagacatgggtacacgttgg
ccgcttaggcataagcttcataaacagatcagtaagaaattacgcgataacaatttagaa
cttgcctaccctcaattagaggttcacttgtctcctggacaggccaaagatgtgcaaaat
ttaatacggacttaa

DBGET integrated database retrieval system