Shewanella piezotolerans: swp_1383
Help
Entry
swp_1383 CDS
T00791
Name
(GenBank) Hemolysin-type calcium-binding region
Organism
swp
Shewanella piezotolerans
SSDB
Ortholog
Paralog
Gene cluster
GFIT
Motif
Pfam:
HemolysinCabind
Motif
Other DBs
NCBI-ProteinID:
ACJ28170
UniProt:
B8CJS3
LinkDB
All DBs
Position
1409038..1413804
Genome browser
AA seq
1588 aa
AA seq
DB search
MDDTNQNDLIVGTDSDDHIEGLTGNDIIDGRSGDDYLVGGEGDDTISGQEGRDFILGDQG
LGEQSDTPVIENAETTAWGVEQQVFNAEDSIEPMAGNCAASQIVNIGGYVGNVGNTFTLN
VALPKDSPVLQDGAELTINILIPDENGNMVIAASGTATQLADGTIQINFEINSDQLDASG
DIELQFVSTGVDAGTEINIDSVELLAHNTYNDVLDGGVGDDHLMGQQGEDKLFGGDGDDQ
LDGGINNDELHGEAGDDLLMGGQGDDLLTGGEGQDTLMGGDDNDTLAGGAGNDTLMGELG
DDTLEGGDGDDLLIGDDGNDTLIGGAGHDSLLGGKGIDELSGGSGNDYLQGDEGDDVLAG
GEGNDTLIAGSGADELDGGSGADVLLAGSGDDTLTGGEGDDKLFGEEGSDTLSGGAGNDE
LHAGGGDDVLTGGAGDDVLFGYAGANVLDGGSGNDTIYGGSDSDQINAGEGDDLVYAESG
DDVIEGGVGNDALFGGDGNNTIDGGTGHDSIYAGDGDDTLIGGSGDDKIYSGAGSNTIDA
GDGNDLVYAGVDADTIDAGSGDDVIFSDAGDDTVIAGAGNDQIYAGAGDDVITGGEGDDT
IYAEDGDDLVIGGVGNDTLYGGAGADRLEGGEGNDALSGGEGNDELLSGSGDNFLDGGSG
DDIITAQDGDDVLIGGDGHDSIIAGAGDDIIDAGLGNDTIDAGDGNDTVYAQDGNDTIEG
GLGNDLLHGGQGIDHLDGGEGDDTLYGGGGADTLIGGAGNDLVDGGEGDDVITGGEGDDT
LIGGSGADQLSGGLGDDVLVGDAGDDTLLGEAGNDTIYAGAGSDSLLGGAGDDKLYGGDG
DDELIGGEGYDELYGGAGNDTLYAENEAGLLAGGEGDDKLIGGTADDQLYGDGGNDTILA
AEGDDLVFAGAGDDTVDTGTGDDVVFAGTGSDNIATGAGDDQVFGEDGDNTINTGEGKDE
IYGGVGADTVYAGTGDDVIYGGDGNDALHGEEGDDFIDGGTGSDTISGGVGADLIFGGDG
SDTIAGDEGNDLLFGGEGHDQIAGGEGDDQLFGEAGDDSLSGGAGADLLFGGAGDDTLDG
GDADDQLFAGDGDDNVIGGLGSDFVDGGSGHDTIAGGEGDDVLLGGDGNDTIEGGAGKDK
LFAGTGNDHLIGGEGDDELHGEFGDNTLDGGAGDDVIYGGSGNDRLIGGEGKDHLESHLG
NNTVEGGSGEDTIITGSGHDTIDGGDDNDSIEAGAGDNIVSGGAGDDTITTGSGHDLIAG
GEGDDIIHAGEGHNQVSGGAGNDSIIAGIGSDTISGGEGHDIIDAGNGDNQISGDAGNDT
LIAGAGSDVISGGAGDDTIRAGDGHNTVTGGEGDDSIIAGEGHDNLSGGAGNDRLEAGAG
NNTVSGGDGDDVLIATGGDDNLSGGAGSDNLNAGNGNNQLFGGDGNDKLTSGSGSDLLEG
GAGNDALSSGSGNDQLFGGEGNDNLSGGSGDDMLYGEAGNDKLTGGGGNDQLFGGDGDDK
LVGSGGNDQLHGDVGNDQLSGGSGNDMLFAGVGDDKLDGGSGSDELYGGDGADTLAGGSG
DDILFGDSGADTLDGGTGVDTLFGGARR
NT seq
4767 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
atggatgatactaatcaaaatgatctaatagttggtactgatagtgatgaccatattgaa
ggacttactggcaacgacataatagatggtcgctcaggtgatgactatttagttggtgga
gagggggacgacaccatctctggtcaggaggggagagactttatcttgggtgaccaaggg
ttaggggaacagtcggatactccggtaatcgaaaatgcggagacgaccgcttggggcgtc
gagcaacaggtgtttaatgctgaagactccattgagcctatggctggaaattgtgcagcc
agccagattgtgaatattggcggctatgtcggtaatgtcggtaatactttcaccctcaac
gtggctctgcctaaggacagcccggtattacaagatggcgcagagctaaccataaatatt
cttattcccgatgagaacggcaatatggtgattgccgcttcaggtactgctacacaactc
gccgatggaaccatacagattaattttgagatcaatagcgaccagctagacgcaagcggc
gatattgagttgcaatttgtcagcactggtgttgacgctggcacagaaatcaatatcgat
tctgtagaactgctagcccacaacacctataacgatgtattggacggtggcgttggtgac
gaccatcttatggggcagcagggtgaagataaattgtttggcggagatggtgatgatcag
ctcgatggtggcattaataacgacgaattgcatggtgaagcgggtgatgatctattaatg
ggcggccagggtgatgacctgcttactggtggcgagggacaagacaccctgatgggcggt
gatgataacgatacacttgctggtggcgcaggcaatgacaccttgatgggggagcttggt
gatgacacgcttgaaggtggtgatggggacgacttactcattggtgatgatggtaacgat
acgctgattggtggtgcgggtcacgattctctattaggtggaaaaggcattgatgagctc
agtggcggcagcggaaatgattacctacaaggtgatgaaggtgacgatgtcttagcgggt
ggagagggaaacgatacgctaattgcaggtagtggtgctgatgagcttgacggtggtagt
ggtgccgatgtcttacttgcggggagtggcgatgatacgttaacgggcggtgaaggcgac
gataagctatttggtgaagagggcagcgatacgctaagcggtggtgctggtaacgatgaa
ctgcacgcaggtggtggtgatgatgtgcttacgggtggggcgggtgatgatgtgctgttt
ggttatgctggcgccaacgtactcgatggtggcagcggaaatgacaccatctatggtggc
agtgatagcgaccaaattaatgctggtgaaggagatgatctcgtttatgccgagtctggt
gatgatgtcattgaaggcggagtgggtaatgatgcgctgtttggtggcgacggtaataat
acgatagatggtggcactggccacgactcgatatatgcaggtgacggtgatgacactctt
attggtggcagtggtgatgacaagatttattctggcgctggcagcaacaccatcgacgct
ggtgatggtaacgacttagtttatgcgggcgttgacgccgataccattgatgctggtagc
ggtgatgatgttattttctctgacgcaggcgatgataccgttatagcaggtgcgggtaat
gatcagatatatgcgggtgctggcgacgacgttataaccgggggcgaaggtgacgacact
atctatgcagaagatggcgatgatttagttattgggggcgttggtaacgataccctctat
ggtggagctggagctgataggttagaaggtggcgaaggtaacgatgctctcagtggtggt
gaaggtaacgatgagctgttatctggcagtggtgataattttctcgatggtggtagcgga
gatgacattattactgcacaagacggtgacgatgtgttgattggtggcgatggtcacgac
agtattatagcgggagctggtgatgacattatcgatgcaggacttggaaatgacaccatt
gatgcgggtgatggcaatgatacggtctatgcccaagatggtaacgataccattgaaggg
gggttaggcaatgacttgcttcacggagggcaaggtattgaccatcttgatggtggtgaa
ggtgatgatactctctatggcggtggtggcgcggataccttaattggtggagctggtaat
gacttagtcgatggtggcgaaggtgatgatgttattaccggtggagagggggatgacacg
cttatcggtggcagtggtgcggaccaactttcaggtggtctaggcgatgacgtactcgtt
ggtgatgctggagatgatacgcttttaggtgaagcgggtaatgacacaatttatgctggg
gcgggcagtgattcattgttaggcggtgcaggggatgacaaattgtatggcggtgacggt
gacgacgagcttattggtggcgagggttacgatgagctttatggtggcgcaggcaatgac
acgctttatgccgagaatgaagcaggcttgctcgcaggtggtgaaggagacgataagctt
attggtggcacggcagacgatcagctctacggcgatggtggtaatgatacgattttagct
gcagaaggtgatgacttagtttttgctggtgcgggtgatgacaccgttgacacaggcact
ggtgatgatgtggtctttgctggtactggtagcgataatattgcaactggtgcaggagat
gaccaagtctttggtgaagacggagataatactatcaacaccggtgagggcaaagatgag
atctacggtggagtcggtgctgatactgtttacgccggaacaggagatgacgtcatttat
ggcggtgatggtaatgacgccttgcatggcgaagagggggatgatttcattgatggtggc
acaggctccgataccatatctggtggtgtcggagctgatctcatatttggtggtgatggc
agtgacactatcgctggagatgaaggtaatgacctgctatttgggggagaagggcatgat
caaatagctggtggtgagggcgatgaccaactatttggcgaagctggtgatgatagctta
tccggaggagctggagccgacttgttatttggtggtgcgggggatgataccttagatggt
ggtgacgcggatgatcaactctttgctggtgacggtgatgataatgttattggcggctta
ggcagtgactttgtcgatggaggcagtggtcatgacactatcgctggcggtgaaggtgat
gatgttctgcttggtggtgatggtaacgatactatcgaaggtggcgctggaaaggacaag
ctatttgctggtactggtaatgatcacttgattggtggtgaaggtgatgatgaattgcat
ggagagtttggtgacaacacccttgatggtggagcgggtgacgatgttatctatggtggt
agcggtaatgatcggttaattggcggcgaaggtaaggatcacctcgaatcgcaccttggt
aataatactgttgaaggcggcagtggtgaggatacgataataactggtagtggtcatgac
actattgatggcggtgatgataatgactccattgaggctggggctggagataatatagtc
tctggcggagcgggcgatgacactataacaactggtagtggtcatgatttgatcgctggt
ggtgaaggagacgatatcattcacgcaggagaagggcacaatcaagtcagtggtggtgcg
ggtaatgacagcattatagcgggcattggcagtgacactatctctggtggtgaaggtcat
gacatcattgatgcaggtaacggcgataatcaaattagtggcgatgctggtaacgatacc
ttgattgcaggggctggtagcgatgtgatctcaggcggagcgggggatgacactattcgt
gctggcgatggtcacaacacggttacaggcggtgaaggtgatgattcgatcatagcaggt
gaaggacatgacaatctctccggtggtgcaggcaacgataggttagaagcgggtgcaggt
aataacacagtaagtggtggtgatggcgatgatgttctgattgcaacaggtggcgatgat
aatctaagcgggggcgcaggctcagataacttaaatgctggcaatggtaataaccaactg
tttggcggagatggtaatgacaaactgacaagtggttcaggctctgatctgctcgaaggc
ggcgcgggtaatgatgcgcttagctcgggtagtggcaatgatcaactgtttggtggcgag
gggaatgataacttaagcggtggttcaggtgacgacatgctttacggtgaagctggcaat
gataagttgaccggtggaggcggtaatgaccaactctttggtggggacggggatgataag
cttgtaggaagcggcggcaatgaccagcttcatggtgatgttggcaacgaccaactcagt
ggcggcagcggtaatgacatgctgtttgcaggtgttggtgatgacaagctcgacggtggt
agcggaagtgatgaactgtatggtggtgatggcgcggatacgttagcaggcggcagcggc
gatgacattcttttcggcgacagcggtgccgatactcttgatggtggtactggggtagat
acactttttggcggagccaggagatga
DBGET
integrated database retrieval system
