Shewanella piezotolerans: swp_1778
Help
Entry
swp_1778 CDS
T00791
Name
(GenBank) Multi antimicrobial extrusion protein MatE
KO
K26937
MATE family, multidrug efflux pump
Organism
swp
Shewanella piezotolerans
Brite
KEGG Orthology (KO) [BR:
swp00001
]
09180 Brite Hierarchies
09183 Protein families: signaling and cellular processes
02000 Transporters [BR:
swp02000
]
swp_1778
Transporters [BR:
swp02000
]
Solute carrier family (SLC)
SLC47: Multidrug and Toxin Extrusion (MATE) family
swp_1778
BRITE hierarchy
SSDB
Ortholog
Paralog
Gene cluster
GFIT
Motif
Pfam:
MatE
Motif
Other DBs
NCBI-ProteinID:
ACJ28544
UniProt:
B8CN42
LinkDB
All DBs
Position
1826956..1828500
Genome browser
AA seq
514 aa
AA seq
DB search
MAVAKFVQGSILRHILVMSSTAAVGISALFVVDLLDIFFLSLLGEQELAAAVGYAGTISF
FTTSIGIGLSIALGALVSRSIGAKEIEKAKRLLLNSAVVTLLISIVVAAIVFLFIPELLS
LVGATGKTAELAAGYLYILVPSLPLICLAMALGSALRAVGDAKLSMVSTLIGGGVNAVFD
PIFIFMFAMGIEGAAVASVLARLAVFVVAARGVIVKHKLFGRFNRDHFIADLSPIFAIAG
PAMLTNVATPIGNAVVTRAIADFGDSYVAGWAVLGRLIPVSFGMIFALSGAVGPIVGQNY
GALEFGRVKESLTRAIQFCSVYVFVVSILLFLTRNQIVSVFDMQGDAAELILFFCSYIAV
FFIFSGILFVANASFNNLGKAKYSTLFNVGKATVGTIPFVYFGAQWGGVYGVLIGQAIGS
IIFGVLGVLMAYRLVEQVRGFAAEQMVTEPVQPLPTTTADEMKSEFDEELSLSSQNPMSS
SCANMAMVTEEQDCEASNEIAELIGVKGEKSSTK
NT seq
1545 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
atggcagttgccaagtttgtacaaggatcgatactgcgccatattttggtgatgagctca
acagctgcagtgggaatttcggcgctatttgtggtcgatctgttagatatctttttcctc
agtttattaggtgagcaagagctcgccgccgccgtcggttatgctggcactatttccttt
tttaccacctcgattggcattggtttatcgattgcgcttggtgcgttagtgtctcgctcc
attggtgctaaagagatagaaaaagcaaagcgcttactacttaatagtgctgtggtgaca
ttactgataagtattgtggtcgcggctattgtatttttgtttatacctgagttgctatcg
ctggtgggggcaaccggaaaaacggcggagttagcggccgggtatctttatattttggtg
ccttcattgcctcttatctgtttggcaatggcactggggagtgcgctgcgtgcggtgggt
gatgccaagctgtcaatggtatcaactctgattggtggcggtgttaatgcggtttttgac
ccaatattcatctttatgtttgccatggggattgaaggtgctgctgtagcctcggtgtta
gcccgtttagctgtgtttgttgtggctgccagaggagtgattgttaagcacaaattgttt
ggccgatttaatagagatcattttattgccgacttaagcccaatttttgcgattgcgggc
cctgcaatgttaaccaatgttgcgacccctattggtaatgcggtggtgacacgtgcaatt
gctgattttggtgatagttatgtggcaggttgggcggtgcttggtcgtttgatcccagtc
tcttttggcatgatattcgcgctttctggcgcagtaggtcccattgttggccagaactat
ggcgcactggagtttggtcgagtaaaagagtcgctaactcgtgcgattcaattctgtagt
gtctatgtttttgtggtctcgatattactgtttctaacccgaaaccagattgtgagtgtg
tttgatatgcagggcgatgctgctgagcttatcctgtttttctgtagttatattgctgtg
ttcttcatcttttcggggattctgtttgtcgcaaacgcttcgtttaataatttaggaaaa
gctaagtactcaacgctgtttaatgtaggtaaagcaacggttggtactatcccatttgtg
tattttggcgctcaatggggtggagtatacggcgtgctaattggtcaagctattggttca
atcatctttggtgtactcggtgtacttatggcatatcgcttagtggaacaggtgagaggt
tttgcggctgaacagatggttactgaaccggttcaaccgttgccaacgacaactgctgat
gaaatgaagagtgagtttgatgaagagcttagtctaagtagtcaaaacccgatgtcgtca
tcgtgtgctaatatggcgatggtgactgaggagcaggattgtgaagcaagtaatgaaatt
gctgagcttattggcgttaaaggcgaaaagtcgtcaaccaagtaa
DBGET
integrated database retrieval system