Shewanella piezotolerans: swp_1843
Help
Entry
swp_1843 CDS
T00791
Name
(GenBank) Sensor histidine kinase/response regulator
Organism
swp
Shewanella piezotolerans
SSDB
Ortholog
Paralog
Gene cluster
GFIT
Motif
Pfam:
PAS_7
HATPase_c
HisKA
Response_reg
HATPase_c_3
PAS_8
HATPase_c_2
PAS
Motif
Other DBs
NCBI-ProteinID:
ACJ28605
UniProt:
B8CLF4
LinkDB
All DBs
Position
1894247..1897675
Genome browser
AA seq
1142 aa
AA seq
DB search
MNLTVLVGTIAIIYVCILFLIAWGAERWFSRITKRIQTWIYGLSLAVYCSSWSFLGTVGQ
SADDLWSFLPIFIGPILIFTVGFGLLRKMVIVSKAQNITSVADFIAARYGKSQVLAAIVT
LIALFGIMPYIALQLKAMVFSLNLFQPEGALFDGAKVSLVITGLLAIFAILFGTRKLDAT
EHNPGMMLAIAFESLVKLGAFLLVGVVISFGVFDGFTDIWQQASAKDLIKEPNLRIESLM
PELLVGMAAFLCMPRQFHVMMVECTNEQTMVKAKWMFPVYLLLFGLFVAPLALAGKLLLG
DAVAADTYVINLPLALDKPWLAVVALLGTLSAATGMVIVAVVTISVMVSNEWLVPLMLRT
GQIKARNFSQFSHLLLNARRLAIMLILGLGYFSYLSFMDNDSLSSLGMLSFGAFAQLAPA
LIGGMYWKHGNRSGVFLGLAVGFGSWCYILLQGAAEHSGIVSTDIALLESIKPNVRDILI
ALLANCACYMLGSVWFRAGVAERIQASAFVTPGRLKNDTNRKSAPVSQQDLLILASRFVS
PTRAYESFSGFSEDAVKSDSWHKVAPPELIAHTEHMLAGVLGASSASLVMDSVMQGRDLA
LDEVFSLVDEASSKIILSQDMLRGAIEHAYEGMSVVDKDLNLVAWNYKYAELYDYPDNFL
QAGMPISDVVRFNAERGYCGAGDIEEQVEKRVQHMRNGTQHVSERQRRDGKVIKIQGNPM
PGGGFVMTFTDITQYRLQAKALQESNETLEARVKERTYELSMLNSKLLESKAQEEMANAS
KSQFLAAVGHDLMQPLNAARLFTASLSQYPNLDLEAKTTLNHVNSSLKIAGELLTDLLDI
SKLDSGMVDVNRRDFAIADLLDGLTVEFEAMAKDCSINFSAIPCSATINSDPSLLRRVLQ
NFLTNAYRYAKGSRVLLGCRYRGGELEIQVLDTGCGIDENETKEIFKEFKRLDNPESKSA
SGLGLGLAIADRISRVLDHEINVSSILGQGSVFSIKVPLGKKVTAPTPKKVASLLQPLAG
VKVLCIDNEEAILAGLESLLTRWQCEVICASDFADARIKLGLKGVAPDIVLADYHLDNDQ
NGVDAMDGVRNLYGENLPGILITANTRKDLIDDIQLRGYHYMAKMVKPAALRALISSLVR
KG
NT seq
3429 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
atgaatttgactgttctggttggcaccattgccatcatatatgtatgtatcttgttcctc
attgcttggggagctgagcgctggttcagtcgtatcacgaagcggatccaaacttggatc
tatggtttaagccttgctgtgtattgttcatcttggagttttctcggcacggttggtcaa
tctgccgatgacctttggtcatttctccccatttttattggacctatcttaatattcact
gttggttttggcctgctgagaaagatggtgattgtgtcaaaggcacaaaacattacctca
gttgccgattttattgccgcacgatatgggaaatctcaagtacttgcagcaatcgtaact
ttaatagccctgtttggcatcatgccctatatagcactgcaacttaaagcgatggtgttc
agcttgaatctttttcagccagagggggcattgtttgacggcgctaaagtctcgctggtt
attactggtttattagccatttttgctattttatttggtaccagaaagcttgatgcgacc
gagcataaccccggaatgatgttggcgattgcctttgagtcacttgtaaaattaggggca
tttttacttgttggtgtcgtcataagctttggcgttttcgatgggtttaccgatatttgg
cagcaagcaagtgctaaagatttaatcaaggaacctaatcttcgtattgaatcactcatg
cctgaactgctggtgggcatggctgcattcttgtgtatgccaaggcaatttcacgtaatg
atggtggagtgcactaatgaacaaaccatggttaaagccaaatggatgtttccggtttac
ttattactgtttggcctttttgttgcgccacttgcactcgcgggcaagctattgcttggc
gatgctgtcgcggctgacacctatgtgataaacctgccattggcgctggataaaccatgg
ctggccgttgtggcattgctcggaacactttcagcggcgacgggcatggtcattgtggct
gtggtgacaataagtgtaatggttagcaatgaatggctagtcccactgatgttgcgaaca
gggcagataaaggccagaaatttcagtcaattttctcacctgctgctaaatgcacgccgc
ctagccatcatgcttattctgggacttgggtattttagttacctatcgtttatggataac
gattcgttgtcctcattaggcatgctgtcatttggcgcgtttgcacagttggcgccagcg
ttaataggcggtatgtattggaaacatggtaatcgcagtggagtgttcttagggcttgca
gtgggttttggcagttggtgctatatcttgttgcagggggctgcggaacattcggggatt
gtatcgacagatattgcccttttagaatctattaagcccaatgtacgcgacatcttaatt
gcactgcttgccaattgcgcatgttacatgttgggctcagtatggtttagagcgggagtt
gctgaacgtatccaagctagcgcttttgttaccccaggacggttaaaaaatgataccaat
cgtaagagtgcaccagtttcacagcaagatttacttattttagcgagtcgctttgtcagc
cctacaagggcgtacgagagtttttcgggtttttctgaagatgccgttaaaagtgatagc
tggcataaagttgcaccgcctgagctcatcgcgcataccgaacatatgcttgcgggggtg
cttggtgcctcaagtgcatcattggtgatggactccgtcatgcaaggtcgtgatcttgct
cttgatgaagtgtttagtctggttgatgaagcttcctctaaaattattttaagccaagat
atgcttagaggtgccatcgaacatgcctatgaaggcatgagtgtggtcgataaagatctg
aatttggtggcttggaactataaatatgccgagctgtatgactatccagacaatttttta
caagcaggcatgccaattagcgatgtcgttcgttttaatgctgaacgcggctattgtggt
gctggcgatattgaagagcaagtcgaaaagcgtgtgcaacatatgcgcaacggcactcaa
catgtatctgagcggcaacgaagagatggtaaagtcataaaaattcagggcaatcctatg
ccaggtggtggctttgtcatgacttttactgatattactcagtatcgtttacaagcaaaa
gccctgcaagagtcaaacgaaacccttgaggctcgggttaaagagcgtacctacgagtta
tccatgcttaacagcaaactgcttgagtcgaaggcgcaagaggagatggcaaacgcatcg
aaaagccaatttctagcggccgttggtcatgacttgatgcaaccattaaatgcagctcga
ctctttacggcatctttgtcgcagtatccaaacttagatttagaggcaaagacaacctta
aatcacgttaacagctcgctgaaaatagctggagagctattgacggacttactcgatatt
tccaagttggattcaggaatggttgatgtaaatcgacgagactttgctattgcagatcta
cttgatggcttaacagttgagtttgaggcaatggctaaagattgttcaattaactttagc
gccattccttgttcggcgaccattaattcagatccaagcctcttaaggcgcgtgttacaa
aacttcttaactaatgcgtatcgttatgccaagggaagccgtgttttgttaggttgccgt
tatcgcggaggagaacttgaaattcaagtgcttgatacaggctgtggtattgatgagaat
gaaaccaaagagatttttaaagagtttaagcgattagataaccctgaaagtaaaagtgcc
agtggtttggggttagggttagccattgcagacaggattagtcgtgttctagatcatgag
atcaacgtcagttcaatattagggcagggctcagtattttccattaaagtgccacttggt
aaaaaggttactgcacctacgccaaaaaaagtagcctctttattgcaacctttagcaggc
gtgaaagtattgtgtattgataatgaagaggccatcttggcggggttggaaagtttatta
acgcgttggcagtgtgaggttatctgcgccagcgactttgccgatgctagaattaaactt
gggcttaaaggagttgctccagatatcgtacttgcagactatcatctagataacgatcaa
aatggcgttgatgcgatggatggtgtcagaaacctttatggtgaaaaccttccaggtata
ttgattaccgctaatactcgtaaagatttgattgatgacattcagcttcgaggttaccac
tacatggccaaaatggtgaaacctgctgcgcttagagcattgatctcgagcttagttaga
aagggctaa
DBGET
integrated database retrieval system
