Shewanella piezotolerans: swp_1880
Help
Entry
swp_1880 CDS
T00791
Name
(GenBank) Peptidase S9, prolyl oligopeptidase active site region:WD40-like Beta Propeller
Organism
swp
Shewanella piezotolerans
SSDB
Ortholog
Paralog
Gene cluster
GFIT
Motif
Pfam:
Peptidase_S9
Tricorn_N
PD40
Tricorn_2nd
DPPIV_N
Beta-prop_THOC3
BD-FAE
Hydrolase_4
AXE1
Beta-prop_ELP1_1st
Abhydrolase_1
DLH
Peptidase_S15
Abhydrolase_3
eIF2A
Abhydrolase_4
DUF7099
Motif
Other DBs
NCBI-ProteinID:
ACJ28641
UniProt:
B8CLJ0
LinkDB
All DBs
Position
complement(1931733..1933817)
Genome browser
AA seq
694 aa
AA seq
DB search
MKIGIYIALMIAPLSTTMVIAEESNAQSNSSLASQPPKILQLEDVFNLEYASNLEINNKG
DEVYFVRNYMDILTDKKLGNIWKVDKDKNLTPVTNGLHSDFSPVLSPDNTKLAYISTASG
SAQIHMQWLETGASGQMSHLDHAPSNISWSPDGKYLAFTRFVDTQAKSVVTLPGKPKNAK
WAKPAVYVDEMYYRFDGAGFTKPGNSQIFVMSADGGAARQLTYGTTDHRSHLSWSKDGQQ
IIYSANTRNDSELEWTDSNIYTLNIASLQSTPLTSRNGPDNHPIVSPNGKMIAYLGSDQN
YKNYENTELYIMNLDGSDKRSLTANFDRSVNSIQWANNSKAVYMSYHDRGQTYVAYQPLN
GKKRIVAKNLGGLSFGRPYTGSEFDVSQNGTIAFTYSDPQRPADISINRKGRTSQLTTLN
SDALDHKTLATIKELNVKSSFDGRNIQAWVAYPPGYAAEKKAGKKFPLILEIHGGPVTNY
GPHFSAEIQLMAASGYVVVYANPRGSDSYGKEFAQIIYNNYPSQDYDDLMSVVDGVIAEE
SIDQQALFVTGGSGGGVLTAWIVGHTDRFKAAVVAKPVINWFSFALTTDIYPFVIKNWFE
KMPWEDPQHYMALSPISYVGNVTTPTMLLTGEADKRTPIAETEQFYQALKLRNVDTAMVR
IPDAPHGIYKRPSNLMSKVAHILWWFDKYQQPES
NT seq
2085 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
atgaagatcggcatctatatagcactgatgatcgcaccactttctacaacaatggtcatt
gcagaagaatccaatgctcaatcaaattcttcgcttgcgagtcaaccacctaaaattttg
cagttagaagatgtgtttaaccttgagtatgcatctaatcttgaaatcaataataaaggt
gatgaggtctattttgttcgcaattatatggacatactcacagacaaaaaattgggcaac
atttggaaagtcgacaaggataaaaacctaacacccgtaaccaacggcttacactccgac
ttttcccccgtcctttcacctgataataccaagcttgcatatatctctaccgcgagtggc
tcagcgcaaattcatatgcagtggttagagacaggtgcatcaggccaaatgagtcatttg
gatcatgcaccatcaaatatctcttggtcgcccgatggtaaatacctagcatttactcgc
ttcgtcgatacacaagcaaaatcagtggttactctgcccggaaagcctaaaaatgccaaa
tgggctaaacccgcggtatacgttgatgaaatgtactatcgctttgatggagctggtttc
actaagcctggtaatagccaaatatttgttatgtccgccgatggcggtgctgctcggcaa
ctgacatatggcaccactgaccaccgtagccatttgagctggagcaaagatggtcagcaa
ataatctactcagcaaatacccgcaatgacagcgagttagaatggactgacagcaatatc
tatacgcttaatattgcaagtttgcaaagcacaccactaacaagccgcaatggacctgat
aatcaccctatcgtctctcccaatggcaagatgattgcctatttaggctctgatcagaat
tataagaattacgaaaataccgagttatatattatgaaccttgacggttcagataagcgc
tccttaaccgctaactttgatcgttccgtcaatagcattcaatgggctaataacagtaaa
gctgtttacatgagttaccacgatagaggtcaaacttatgtggcttatcaacccctaaat
ggtaaaaaaagaatcgttgcaaaaaatttaggcggtttgtcatttggacggccttatact
ggtagtgaatttgacgtctcccaaaatgggactatcgctttcacttattcagatccgcag
cgtccagcagatatctccattaatcgtaaaggcagaaccagccagttaacgacgcttaat
agtgatgcactcgatcacaaaaccctggcgacaatcaaagagcttaatgtgaagtcatct
tttgatggccgcaatattcaagcatgggtagcttacccgccaggttatgccgcagagaaa
aaagcaggtaaaaagtttccactcattcttgaaatacatggtggccctgtcaccaattat
ggtccacatttttcagccgagattcagttaatggccgctagtggctatgttgttgtttat
gctaacccgaggggcagtgatagctacggaaaagagtttgcccaaatcatctataacaat
tacccaagtcaagactatgatgatcttatgtcagtcgttgacggagtcattgcagaggaa
tcgattgatcaacaagccctatttgtaacgggtggttctggcggcggcgtactaacagct
tggatagtcggacatactgaccgcttcaaagccgctgtggtggcaaaaccagtaattaat
tggtttagctttgcacttaccactgatatctatccgtttgtgataaaaaattggtttgaa
aaaatgccatgggaagacccccagcattatatggcattatcacctataagctatgtaggg
aacgtgacaacgcctaccatgttgttaacgggtgaagctgacaaacgaactcccatcgca
gaaacagagcagttctatcaagcactaaaactgcgtaatgttgatacggcgatggtaagg
atccctgatgcacctcacgggatctataaacgtccgagtaatttgatgtcaaaagtggcg
catattctgtggtggtttgataagtatcaacaaccagaaagctaa
DBGET
integrated database retrieval system