KEGG   Shewanella piezotolerans: swp_3185
Entry
swp_3185          CDS       T00791                                 
Name
(GenBank) TonB-dependent receptor
  KO
K02014  iron complex outermembrane recepter protein
Organism
swp  Shewanella piezotolerans
Brite
KEGG Orthology (KO) [BR:swp00001]
 09180 Brite Hierarchies
  09183 Protein families: signaling and cellular processes
   02000 Transporters [BR:swp02000]
    swp_3185
Transporters [BR:swp02000]
 Other transporters
  Pores ion channels [TC:1]
   swp_3185
SSDB
Motif
Pfam: TonB_dep_Rec_b-barrel Plug OMP_b-brl
Other DBs
NCBI-ProteinID: ACJ29893
UniProt: B8CQ30
LinkDB
Position
complement(3341627..3344476)
AA seq 949 aa
MYKNNLLTNSVRLALVSGAMTAAFAAPAVFADEEDSVERIEVTGSRIKRTDMETSSPIHV
MDAEQIKMSGFTNVEDILNQLPQLEAGENSFLSNGATGTSSLDLRGLGSNRTLVLINGRR
MQAGSITSQDADINQIPAALIKRVEVMTGGAAAVYGADAVAGVVNFIMDKSFDGISINVG
ASGYQHDNDNGYIQGLMDEKGYDYPSGNTDIDGKTYNIDLTIGSEFSDGKGHAVAYAVWR
RNDELLQGSRDYASCVLNAKQSECAGSSTTPLAHFDIYPVVNGNVDYDQNYWGYTDPNGN
GFKPDDGYRYNYAPINHFMRPNERISFGSFINYEINDHARPYVELSFMQNRTAGQIAESG
TFYDEEILMDYNNPLMTDLQKQQLQAEFNQTDADQFVAYIGKRNVEGGARANNLEHNSYR
ILTGIEGDINDNWTYDVSFNYSATSSSSVYINDLLSPKIAPRVGAVDTECVEEDGCLYYN
VFEPDGVTAEQAEQLAGVGTQTGLVTQTIYNGYVTGDIGVTVPSASDAIAMVFGFERREQ
NYERISDTIYSEGQLLGQGGPNPSLFGEIDVNEVFTEVQIPVLDNLAFDLGARYSDYSTT
GGDWTYKVGADYTLADNYMFRASFNRAVRAPNVNELFGSPVIQLWDGSDGCTTDDKGNTK
YTAAQCANTGVTASQYGNLNPNDAGQYNEFSGGSPDLEPEEAETLTLGLVANPIDNLSFS
IDYFNIEMENVIDYIGAERILDICAVSGESDFCSNVNRSPSGSLWLGKSGYVTNIIGNVS
SRTWEGVDASASYLFELASGDLSFDLIGSYAMKKEIRPVVGKDEFNYDCAGTVNSDCFAS
PKWRHTLTAKYSADDWVLAAKWRYYGEIDYDGTADERLVEQGGIDAYNYFDLNGSYIFTD
YMSVTAGVNNIFDKEPPMVGNTIASNANTVAGFYDTLGRFMHVSLNFKF
NT seq 2850 nt   +upstreamnt  +downstreamnt
ttgtataagaataacttactcaccaactctgtacgcttagcactcgtcagtggcgctatg
actgccgcattcgcagctcctgctgtattcgcagacgaagaggatagtgttgagcgcatt
gaagtcacaggttcaagaattaaaagaactgatatggagacttcctctcccattcacgtg
atggatgcggagcagataaaaatgagcgggtttactaatgtcgaagacattcttaatcag
ctgccacaacttgaagccggagaaaattcatttctttcaaatggagcaactggtacctcg
tctctagatttacgtggtctaggcagtaaccgcacgttagtactaatcaatggtcgtaga
atgcaagccggcagtattacatctcaagatgcggatattaaccagatcccagcggcttta
attaagcgagttgaagtgatgactggcggagcagcggctgtttatggcgcggatgcagtt
gcaggcgtcgttaactttataatggataagagctttgatggtatctcaatcaatgttggc
gcttcaggttaccaacatgataatgataacggttacattcaagggttaatggatgagaaa
ggttatgactacccatctggcaatacggatattgatggtaaaacctataatatcgacctc
acgattggcagtgagtttagtgatggaaaaggtcacgctgtagcctatgcagtttggcgt
cgaaatgatgagttactgcaaggctcacgtgactatgcttcttgtgtattgaatgcaaaa
caatcggaatgtgctggctcttcgacaacgcctttagcacactttgatatttatcctgta
gtcaacggcaatgttgattatgatcaaaattattggggctataccgatcccaatggcaat
gggtttaagcctgatgatggttatcgatataactatgcaccaataaatcatttcatgcgt
cccaatgaacgaatctcttttggttcatttataaattatgaaataaacgatcatgctcgt
ccgtatgtggaactttcgtttatgcaaaaccggactgctggtcaaattgctgagtctggg
acattctacgatgaagagattttgatggattacaataatccattaatgacagacttacag
aagcagcaattgcaggctgagtttaatcaaactgatgcagatcagttcgttgcctatatc
ggtaagcgtaatgtcgaaggcggtgctcgtgctaataatcttgagcataattcatatcgt
attttgacgggaattgaaggcgatataaatgataactggacttatgatgtgagttttaat
tactccgcaacttcatcatcatctgtttacataaatgatttgctgtcaccgaagatagcg
ccaagagttggtgctgttgatactgaatgcgttgaagaagacggttgcctgtattacaac
gtatttgagcctgatggagtcactgctgagcaagcagaacaactggctggtgtaggaacg
caaacgggattggtaacccaaacgatttataatggttatgttactggcgatatcggggtt
acagttccttctgcttccgatgctatcgcgatggtatttggtttcgagcgtcgtgaacaa
aactatgaacgaatttcggatactatatattcagaaggtcaactattggggcaaggtggc
cctaacccaagcctattcggtgaaatagatgtgaatgaagttttcacggaagttcaaatt
cctgttctagataatttagcatttgatttgggcgctcgttattcagactattcaactaca
ggtggagactggacttataaagtcggtgccgattatacattagctgataattatatgttc
cgtgcaagttttaaccgagctgttagagcaccaaatgtaaatgaattatttggtagtcca
gtgattcaactttgggatggctctgatggttgtactaccgatgataaaggcaatactaag
tacaccgcagcacaatgtgctaacaccggggtgacggcttctcaatatggtaacttaaac
cctaatgatgcaggacaatacaacgagttctcaggtggctcaccagatcttgaaccagaa
gaagctgagacattaacgctagggctggttgctaacccaatagataacctaagtttttct
attgattactttaatattgaaatggaaaatgtgattgactatataggcgctgaaagaatt
ctagatatttgtgccgttagtggtgaatctgatttctgtagcaatgtgaaccgtagcccg
tcaggaagcttgtggttaggaaaaagtggttatgttacaaatattataggaaatgtaagc
agtcgaacatgggaaggagtagatgcttctgccagttatctatttgaattggcaagtggt
gatctttcttttgatctgattggctcatatgcaatgaaaaaggagataaggccagtcgtt
ggtaaagatgaattcaactatgactgtgcaggaactgttaactctgactgttttgcatct
cctaaatggagacatacattgacagctaagtacagtgcagatgattgggtattagctgca
aaatggcgttactatggtgaaattgattatgatggtactgcggatgagcgcctcgtagaa
caaggtggtattgatgcgtataactactttgacttgaatggcagctatatttttactgac
tatatgtcagtaacagcaggtgttaataacattttcgataaagagcctccaatggtaggt
aatactattgcgtcgaatgcaaatactgttgcaggtttttacgacacgcttggtcgcttt
atgcatgtgagtttaaactttaagttctag

DBGET integrated database retrieval system