KEGG   Shewanella piezotolerans: swp_3550
Entry
swp_3550          CDS       T00791                                 
Name
(GenBank) Omega-3 polyunsaturated fatty acid synthase PfaA
Organism
swp  Shewanella piezotolerans
SSDB
Motif
Pfam: PP-binding ketoacyl-synt Ketoacyl-synt_C Acyl_transf_1 KR KAsynt_C_assoc PKS_DH_N adh_short PS-DH IMCp
Other DBs
NCBI-ProteinID: ACJ30242
UniProt: B8CQB2
LinkDB
Position
3755574..3763736
AA seq 2720 aa
MSQTSKPQQSSASEQAQDSQADTRLNKRLKDMPVAIVGMASIFANSRYLNKFWDLISEKI
DAITELPATHWQKEDYFDANKSTPDKSYCKRGGFLPDVDFNPMEFGLPPNILELTDSSQL
LSLIVAKEVLADANLPEVYDRDKIGITLGVGGGQKISHSLTARLQYPVLKKVFANSGISD
EDSEMLIKKFQDQYVHWEENSFPGSLGNVIAGRIANRFDFGGMNCVVDAACAGSLAAMRM
ALSELVEGRSEMMITGGVCTDNSPSMYMSFSKTPAFTTNETIQPFDIDSKGMMIGEGIGM
IALKRLEDAERDGDRIYSVIKGIGSSSDGKFKSIYAPRPEGQAKALNRAYDDAGFAPHTL
GLIEAHGTGTAAGDAAEFAGLCSVFSDGNDTKQHIALGSVKSQIGHTKSTAGTAGLIKAA
LALHHKVLPATINVSQPSPKLDIENSPFYLNTETRPWLPRVDGTPRRAGISSFGFGGTNF
HFVLEEYKAEHSREDSEKAKYRQRQVAQSFLVSATSKDALIKELNTLAAASSAAEFNLKD
AAANYAVRELATDAPRIGLVANSAAELASFIKQALSKLTASDDTQWQLPGGISFRAAAIE
GKVAALFAGQGSQYLNMGRDLACYYPEMRQQLVTADKVFAANDKTPLSQTLYPKPVFNKD
DVKAQEAVLTNTANAQSAIGAISMGQYALFSAAGFNADMVAGHSFGELSALCAAGVISTD
DYYKLAFARGDAMATKAKTKDGHDADCGAMFAVIHKAEDLSTLESTIAKFDGVKVANYNA
PTQSVIAGPTASTTDAAKALSDLGYKAINLPVSGAFHTELVGHAQAPFAKAIDAAKFTKP
SRALYSNASGALYESTAAKVKASFKKHMLQSVRFTAQLEAMFDAGARVFVEFGPKNILQK
LVQGTLASKLDELSVISINPSPKGDSDLQLKQAALQLAVAGVQLDNIDPYQADIAAPAKR
SPMSLTLNAANHISPATRAKMAKSLATGTVKSATIIEEKIVEKVVEKVVEVEKIVEVPTI
IEKEVEKIVEIAVPMSNEHVVPTAPVQNNTAAPSVSVSTDALSQFFAAQQQAAELHQQFL
SIPQQYGETFTTLMTEQTKLAGSGVALPESLQRSMEQFHQLQAQTVQSHTQFLEMQAGNN
NAALNMLNGAATVLTAQPLHSAVQRPQQAVQQVAVSAPAMSAPVITTQAAAPVAPVVNNT
PAPVQQAVATQIEAVTKAAEAAPVVAAPSSAPAVPVSNSAVAVLSAEKVQATMLEVVAEK
TGYPTEMLELEMDMEADLGIDSIKRVEILGTVQDELPGLPELSPEDLAECRTLGEIVSYM
NSKLADGSKLSTTAAVGASSESAAPQVATAKTALSAQKVQGTMMSVVAEKTGYPTEMLEL
EMDMEADLGIDSIKRVEILGTVQDELPGLPELSPEDLAECRTLGEIVSYMNSKLSTNDAA
GASSESAAPQVATAKTALSAQKVQATMMSVVAEKTGYPTEMLELEMDMEADLGIDSIKRV
EILGTVQDELPGLPELNPEDLAECRTLGEIVSYMNSKLADGSKLSTNAAAGASSEDAAPQ
VATAKTALSAQKVQATMMSVVAEKTGYPTEMLELSMDMEADLGIDSIKRVEILGTVQDEL
PGLPELNPEDLAECRTLGEIVSYMNSKLADGSKLSTNDAAGASSEDAAPQVATAKTALSA
QKVQATMMSVVAEKTGYPTEMLELSMDMEADLGIDSIKRVEILGTVQDELPGLPELNPED
LAECRTLGEIVSYMNSKLATFEAAAPAATQVANGLSAEQVQGTMMSVVAEKTGYPTEMLE
LSMDMEADLGIDSIKRVEILGTVQDELPGLPELNPEDLAECRTLGEIVAYMNSKLTSVGS
AATAVIADAVKSVAETVTSSLELPPHSEVALKKLSAADQIVDCFAADAAVVITDDGHNAG
VLAEKLSKKALKVAVVRLPKGAAQSPLNSDVASFQAESLDEAGINAVIAQIEQQLGEISG
FIHLQPEADSNNVNDAINLSSESFTHVSQAFLWAKLLQPKLNVTSDKRRSFISVSRIDGG
FGYLDTKQLQNAELNQAALAGLTKTLSHEWPTVFCRALDIAPNLDATHLADAITGELFDN
VTNLPEVGIASDTNGNIERSTLVAGNARSKHATAQLNSADKILVTGGAKGVTFECALALA
KRTQSHFILAGRSELQAIPAWAADKQISELKPAAISHIVSTGSKPTPKQVEALVWTVKSS
IEINTALAAFSEVGASAEYVSMDVTDTAAITAALNGRSAEITGLIHGAGVLADKHIQDKT
IAELGRVYGTKVNGLKALLAALEPSKVKLLAMFSSAAGFYGNTGQSDYAMSNDILNKAAL
QFTARHPQAKVMSFNWGPWDGGMVTDALKKMFTERGVYVIPLKAGAELFATQLLSETGAQ
LLIGTSMQGGTDTQEAASVKKLNAGEVQNASRPLAPVSLTRVLTPNALVFIQDHRIGGNP
VLPTVCAIQWMREAASEMLGTQVKVIDYKLLKGIVFDSSDAQEMTLELTPSGNEQMTALI
SCHGRPQYKATLARNDNADNTPSREFNSLGKAVTTAAELYSNGTLFHGPRLQGIQQVFKF
DDAGLIAQCQLPQVSDTDCGQFVASQHLGGSQPFAEDLLLQAMLVWARLKYGSASLPSTI
GEFISNKPLAFGDKAVLALEVVKTSARSLEANVALYHENGELSAMMKAAKVTISKNLNSA
FLTETAESDKDKTLSTGEQS
NT seq 8163 nt   +upstreamnt  +downstreamnt
atgagccagacctctaaacctcaacaatcatcagcatcagagcaagcgcaagactcgcaa
gctgatactcgcttaaataaacgtttaaaagatatgcctgtcgctattgtcggcatggca
agcatttttgcgaactcgcgttacctcaacaaattttgggatcttattagcgaaaaaata
gatgccatcactgagctacctgccactcactggcagaaagaagattactttgacgccaac
aaaagcacaccagataaaagctactgtaagcgcggcggctttttaccagatgttgacttc
aacccaatggagtttggtctgccgccaaatatcctagagttgactgactcatcacagctg
ctctctttaatagttgcaaaagaagtactggctgacgctaacctgcctgaagtttatgac
cgtgacaaaattggcataaccttaggtgtcggcggcggacaaaagatcagccacagctta
actgcccgtcttcagtaccctgtgcttaagaaggtctttgccaacagtggtattagcgac
gaagacagcgaaatgctgatcaaaaagttccaagaccaatacgtgcattgggaagaaaac
tcattcccaggttcactgggtaatgtcattgctggccgtatcgccaaccgttttgatttc
ggcggcatgaactgtgtcgttgatgctgcttgtgcaggctcattagccgctatgcgcatg
gcgcttagcgagctggttgaaggtcgttctgagatgatgatcactggcggtgtttgtact
gacaactcaccgtctatgtacatgagcttctctaagacccccgcattcactaccaatgaa
accattcaaccatttgatatcgactcaaagggaatgatgattggtgaaggtatcggcatg
atcgcattgaagcgtcttgaagatgccgagcgtgatggcgacagaatttactcggtcata
aaaggtataggttcatcatctgatggtaagttcaagtcaatctatgctcctcgccctgaa
ggccaagccaaagcgctaaatcgcgcctatgatgatgcaggttttgcaccgcacacttta
ggtctgattgaagcccacggtacaggtactgccgcaggtgatgctgcagaatttgccggt
ctttgctcagtgtttagcgatggtaacgacaccaaacagcacatcgcgctaggttctgtt
aaatcacaaattggccacactaaatctaccgctggtacagcaggtctgattaaagcagct
ttagcgctacaccataaagtattgcctgcaacgattaacgtcagccaaccgagcccaaag
ctggatattgagaactcaccgttctatctcaatacagaaacccgtccttggttacctcgc
gtcgacggcacaccgcgccgcgcaggtatcagctcatttggctttggtggcactaacttc
cactttgtactggaagagtacaaagctgagcacagccgcgaagatagcgaaaaagcgaag
tatcgtcagcgtcaagtagcacaaagcttcctcgttagtgctacaagtaaagatgcactt
attaaagaattaaataccttagcagctgcaagttctgctgcagagttcaaccttaaagat
gccgctgcaaattacgctgtacgcgaattagccactgatgcaccacgtattggtctagtt
gccaatagtgcagcagaattagcaagcttcatcaaacaagcgctatcgaagttaaccgca
agcgacgacactcaatggcaactgcctggtggtataagcttccgcgcagctgcgattgaa
ggcaaagtggcggcattattcgcaggccaaggttcgcagtatcttaatatgggacgagat
cttgcttgttactatccagaaatgcgtcaacaactggtcacagctgataaagtatttgcc
gccaatgacaaaacacctttatcgcaaacactttatccgaaacctgtatttaataaagat
gatgtcaaagcacaagaagcagtgctgaccaacaccgctaatgcacagagtgctatcggt
gccatctctatgggacaatatgcgctatttagtgcagcaggctttaatgccgatatggtt
gcaggtcacagctttggtgagttaagtgcgttatgcgctgcaggtgttatttcaacagat
gactactataaactcgcatttgcccgtggcgatgctatggcaaccaaagcaaaaactaaa
gacggtcacgatgctgattgtggcgccatgtttgcggttatccataaagcagaggatttg
agcacacttgaaagcactatcgctaaatttgatggtgttaaagtggctaactacaacgca
ccgactcagtcggtcattgcaggtccaactgctagcaccactgatgctgctaaagcatta
agcgatctcggttataaagcgatcaatctgccagtgtcaggagcattccacactgagcta
gttggccacgctcaagcgccattcgccaaagcgattgatgctgcgaagtttactaaacct
agccgtgcactctattccaacgctagcggcgcgctatatgaaagtactgcagccaaggtt
aaggcctcgttcaagaaacatatgcttcaatcagttcgcttcaccgctcagctagaagcg
atgtttgacgctggggctcgcgtatttgttgaatttggtcctaaaaatattttgcaaaaa
ttagtgcaaggtaccttagcaagcaaacttgatgagttaagcgttatctctatcaatcca
agccctaaaggcgacagcgacttgcaacttaagcaagcagctctgcagttagccgtagca
ggtgtacagcttgataatatcgacccataccaagccgatatagccgcgccagcgaaacgc
tcaccaatgagcctaacgctaaatgcagccaaccatattagccctgctacacgcgctaaa
atggctaagtcattagcaactggcactgtgaagagcgcgactatcatcgaagaaaaaatc
gttgaaaaggttgttgagaaagtggttgaagtagaaaaaattgttgaagtgccaaccatc
attgaaaaagaagttgaaaaaatcgtggagattgccgtaccaatgtctaatgagcatgta
gtgcctacagccccagttcaaaataatactgccgctccaagtgttagcgttagcactgat
gccttaagccagttctttgctgcacaacaacaagcagcagagttacatcagcagttcctc
agcatcccacagcaatatggtgaaactttcacgaccttgatgacagagcaaacaaaactt
gcaggctctggtgtcgcgttgccagaaagcttgcagcgctcaatggagcagttccaccag
cttcaagcgcaaaccgttcaaagccatactcagtttttagagatgcaagctggcaataac
aatgccgcgctaaacatgctcaatggtgcagcgactgtgctcaccgctcagccattacac
tctgcagtgcaaagacctcagcaagccgttcaacaggtcgcagtttctgcaccggcaatg
tcagcgcctgtaataacgactcaagctgcagcgccagttgctccagttgttaacaatact
ccggcgccagttcaacaagccgttgcaacacagattgaagccgttactaaagcggctgaa
gctgcaccagtagtcgctgcgccgtcatcagcaccagctgtgcccgtgagcaatagcgct
gtggccgttctaagcgccgagaaagttcaagcaaccatgcttgaagtggtcgctgagaaa
accggctacccaacagagatgctagaacttgaaatggacatggaagccgatttaggcatc
gactctatcaaacgagtagaaattctaggtacagtgcaagacgaacttccaggtctacca
gaactcagccctgaagatttagctgagtgtcgtacactaggcgaaatcgttagctacatg
aactctaaactggctgatggctctaaactctctacaactgccgccgtaggcgcttcatct
gaaagcgcagctcctcaagttgcaactgcaaagacagccctgagcgcgcaaaaagtccaa
gggactatgatgtcagtggtcgcagaaaagaccggctacccaacagagatgttagagctt
gaaatggatatggaagccgatttaggcatcgactctatcaaacgagtagaaattctaggt
acagtgcaagacgaacttccaggtctaccagaactcagccctgaagatttagctgagtgt
cgtacactaggcgaaatcgttagctacatgaacagcaagctctctacaaatgacgccgca
ggcgcttcatctgaaagcgcagctcctcaagttgcaactgcaaagacagccctgagcgcg
caaaaagtccaagcgactatgatgtcagtggtcgcagaaaagaccggctacccaacagag
atgttagagcttgaaatggatatggaagccgacttaggtatcgactctatcaagcgtgtc
gaaattcttggtactgtgcaagatgagcttccaggcttgcctgagcttaaccctgaagat
ttggccgagtgtcgtactcttggcgaaatcgttagctacatgaactctaaactggctgat
ggctctaaactctctacaaatgccgccgcaggcgcttcatctgaagacgctgctcctcaa
gttgcgactgcaaagacagccctgagcgcgcaaaaagttcaagccactatgatgtcagtg
gtcgcagaaaagaccggctacccaaccgaaatgcttgagctaagcatggatatggaagcc
gatttaggtatcgactctatcaagcgtgtcgagattttgggcaccgtacaagatgagctt
ccaggcttgccagaacttaaccctgaagatttagccgagtgtcgtacactgggcgaaatc
gttagctatatgaactctaaactggctgatggctctaaactctctacaaatgacgccgca
ggcgcttcatctgaagacgcagctcctcaagttgcgactgcaaagacagccctgagcgcg
caaaaagtacaagccactatgatgtcagtggttgccgaaaagaccggctacccaacagaa
atgcttgaactgagtatggacatggaagccgacttaggtatcgactctatcaaacgagta
gaaattcttggaactgtgcaagatgaacttcctggtctgcctgagcttaaccctgaggat
ttggcagagtgccgtactctgggcgaaatcgttagctatatgaactctaagcttgcgaca
tttgaagctgccgcgccagctgcaacgcaagtggctaatggtcttagcgcggagcaagta
caaggcaccatgatgtctgtggtagcagagaaaaccggctacccaacagagatgcttgaa
ctgagcatggacatggaagccgatcttggtatcgactctatcaaacgagtagaaattcta
gggactgtgcaagatgagctaccgggtttacctgagttaaatccagaagatcttgccgag
tgtcgtacattaggtgaaatcgttgcctacatgaactctaagctgaccagtgttggcagc
gcagcaactgctgtcatcgctgatgcagttaaatctgtagcagagacagtaacatcttct
cttgaactacctcctcacagtgaggtagcgctaaaaaagcttagtgcggcggatcaaatt
gttgattgcttcgccgcagacgcagctgtcgtcattaccgatgatggtcataacgcaggc
gtattagcagagaaactctcaaaaaaagcccttaaagtcgctgttgttcgtctgccaaaa
ggtgcagcgcaatcaccgctaaacagtgacgttgccagcttccaagcagaaagtctcgat
gaagcggggatcaatgctgttatcgctcaaattgagcaacaactaggtgagattagtggc
tttattcacctacaaccagaagctgacagcaataacgttaatgatgccattaacttgagc
agcgaaagcttcactcacgttagccaagcattcctttgggctaagctgttacaaccaaaa
ctaaacgttaccagtgataagcgtcgcagctttatctctgtcagccgaatcgatggtggc
tttggttacttagacactaaacagctgcaaaatgctgagctaaaccaagccgcattagca
gggttaactaaaacactgagccatgaatggccaacggttttttgccgcgcgttagatatt
gcaccgaatttagatgcaactcatttagccgacgccattactggcgagctgttcgataac
gtgaccaatttgccagaggtcggtattgctagcgacacgaatggcaacattgaacgttca
acattggttgcgggcaatgcacgttctaaacatgcaacggcacagctaaatagcgcagat
aaaatactggtgaccggcggcgcaaaaggtgtgacttttgaatgtgccctagcacttgct
aagcgcactcagtcgcatttcatccttgctggacgtagtgaactacaagctattccagct
tgggcggcagataaacagatcagcgaacttaaacctgcagctatttcacatattgtctct
accggtagtaagccgacacctaagcaggtagaagcattagtttggacagtgaaaagctct
atcgagataaacactgctcttgcagcgtttagcgaagtgggcgcaagtgccgagtatgtc
agcatggatgtgaccgataccgccgcaattactgcagcgctaaacggtcgctcagctgag
ataactggccttatccacggcgctggcgttctggctgataaacatattcaagataagacg
atagccgaattaggtcgcgtatacggcactaaagtcaatgggctgaaagcgctccttgcc
gcacttgagccgagtaaagttaagctacttgcgatgttctcttcggctgcaggtttctac
ggtaataccgggcagagcgattacgccatgtctaacgacatccttaacaaagcggcgttg
cagttcactgcccgtcacccacaagctaaagtcatgagctttaactggggcccttgggat
ggtggcatggttaccgatgcactgaagaagatgtttactgaacgtggtgtttacgttatt
ccacttaaagctggagcagaactttttgccactcagctattaagtgaaacgggagcacaa
ctgcttattggaacatctatgcaaggtggaactgacactcaagaggctgcatctgtaaaa
aagcttaatgcgggtgaggtgcaaaacgcatcacgcccgctagcaccagtatctctaact
agagtgttaacccctaatgcgctggtctttattcaagaccaccgtattggtggtaaccca
gtgctaccgacggtatgtgcgattcagtggatgcgtgaggcggcaagtgaaatgcttggc
actcaagttaaagttatcgactataaattactgaaagggatcgtctttgacagcagtgat
gctcaggagatgactcttgaattaacgccgagcggcaacgagcaaatgacggcattaatc
agctgtcatggccgtccgcagtacaaggcgactttagctcgtaacgacaatgctgataat
acgccatcaagggagttcaacagtcttggtaaagcagtgactacagctgcagaactctat
agcaacggcaccctgttccacgggcctcgtttgcaaggcatacagcaggtgttcaagttt
gatgatgcgggtctcatcgctcagtgccaattaccacaggtaagtgatactgactgcggt
caatttgttgcaagccaacatcttggtggtagtcaaccttttgctgaagacttgctactg
caagcgatgctggtatgggcaaggcttaagtatggctcggcaagcttaccatcgactatc
ggtgagtttatctcaaacaagccgctagcatttggtgataaggctgtgctggcgctagag
gtggttaaaacaagtgcccgctcacttgaggctaacgttgcgctttaccatgaaaatggt
gaattgagtgcaatgatgaaagcggcgaaagtcactatcagtaagaaccttaatagtgcc
ttcttaaccgaaacagccgagagtgacaaagataaaacattgagcactggagagcagtca
taa

DBGET integrated database retrieval system