Shewanella piezotolerans: swp_5150
Help
Entry
swp_5150 CDS
T00791
Name
(GenBank) TonB-dependent siderophore receptor
KO
K02014
iron complex outermembrane recepter protein
Organism
swp
Shewanella piezotolerans
Brite
KEGG Orthology (KO) [BR:
swp00001
]
09180 Brite Hierarchies
09183 Protein families: signaling and cellular processes
02000 Transporters [BR:
swp02000
]
swp_5150
Transporters [BR:
swp02000
]
Other transporters
Pores ion channels [TC:
1
]
swp_5150
BRITE hierarchy
SSDB
Ortholog
Paralog
Gene cluster
GFIT
Motif
Pfam:
TonB_dep_Rec_b-barrel
Plug
Motif
Other DBs
NCBI-ProteinID:
ACJ31765
UniProt:
B8CVT9
LinkDB
All DBs
Position
complement(5379806..5381956)
Genome browser
AA seq
716 aa
AA seq
DB search
MSFQASFKFSRIGLAVVAALASSTSFAEEVTADSTAAIDSNIERITVTGRSFNDYKIGSS
SGAMRGDIDILDTPQSVAVIPDFITDEQLATNLGEVLVNDSSVTGGSEKWNRQVFSIRGF
ELSSGSGYLINGQQQWSHYVQPIETLQQVEVLKGPSSMLYGQSGPGGLINMVTKKPTTET
MFDFGFDTDEHGSTRFQIDAGGSLNESETIRYRTVLVKQDTQYWREYQDGSNQERDRWLG
YLNLEFDITDDLMLSVKYDYTQDKTGIDRGGWLDSSGDLIGGSDIIWDQPWAFTDNTISN
MGADLTYHLSDEWKVKAGYNDQQFNRQRLDSSPSLISGSEDPFTDGYYVSPFDRYDDWQH
KTGYVDFTGNLYTGDVEHQLLIGANMLDYYYGQLKDSGPKKQIVMPGQPLPKPDLDYNRD
ETLYESSYKHYGFYVQDLVTITDEWQVLAGVRYDEQKKDGAGNNSYAVSPKFGVIYSPAE
NGSIYVNYSKSFTPQGIVNNDEDASNGMNLDPEYGEQYEIGTKWELFDGSLLLTGAIFDI
TVSNVTVQQELETPDADGNIYMTTQEGEQRHKGFEMGAQGQISDKWFMTGSMMFLDAEYI
TSANDRESLDGMTPVDAPEWSANVWTRYEMTDDLALNFGAIYVGERFANTSNTISKDGYV
RFDMGAAYTMDVMGSDVSVRVNVKNLFDVDYLAGGTNTDVTVGEGRHFSLALEAKF
NT seq
2151 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
atgtcttttcaggcgtcttttaaattttctcgtatcggtcttgccgttgttgcagcttta
gcttcatcaacctcttttgctgaagaagtgactgccgattctactgcagctattgatagt
aatatcgagcgtataaccgttaccggacgtagctttaacgactataaaattggttcatct
tcaggcgcaatgcgaggtgacatcgatattcttgatactcctcaatcagtagcggttatt
ccagactttattactgatgagcaattggcgactaatcttggtgaagttttagttaacgac
tcaagtgtgactggcggtagtgaaaagtggaaccgtcaagtctttagcattcgtggattt
gagttgtcatcaggttcaggctacttgattaatggccagcaacaatggtcgcattacgta
cagccgatcgaaacattacaacaagttgaagtgttaaaaggcccttcaagcatgctttat
ggtcaatcaggtcctggtggactgattaacatggttaccaaaaaaccaacaactgaaact
atgtttgattttggttttgataccgatgaacacggttcgactcgattccaaattgatgcc
ggtggtagcctaaatgaatcagaaacgattcgttaccgtaccgtgcttgttaagcaagac
actcagtactggcgtgaataccaagatggttcaaaccaagagcgtgatcgttggttaggc
taccttaaccttgagtttgatattactgacgacttgatgttgtctgttaaatacgattat
acccaagataaaacaggcattgaccgtggtggttggttagacagcagcggtgatttgatt
ggtggtagcgatattatttgggatcagccttgggcatttactgataatactatctctaat
atgggagcggatttaacttaccacctatctgatgagtggaaagtgaaggcgggttataac
gatcagcagtttaaccgccaacgtttagattcatctccgtcactgatcagtggctcagaa
gatccatttacagacggttattatgttagtccattcgatcgttatgacgattggcagcat
aaaactggttatgttgattttacaggtaacttgtatacgggtgatgttgagcaccagcta
cttattggtgcaaacatgcttgattactactatggtcagttaaaagactctggtccaaag
aaacaaatagtcatgcctggccaaccgctacctaagccggatcttgattacaaccgtgat
gaaactctttatgagagcagctataagcattatggcttctacgttcaagatctcgtgaca
attactgacgagtggcaagtacttgctggcgttcgttacgatgaacagaaaaaagatggt
gctggcaacaatagctatgctgtatcgcctaaatttggtgtgatttactcaccggctgaa
aacggtagcatctatgttaactactctaaaagcttcactccacagggaatagtgaataat
gatgaagatgccagcaatggcatgaatctagatcctgagtatggtgagcaatatgagata
ggtaccaagtgggaattgtttgacggtagcttgctactaacgggtgcaatatttgatatt
acggtatcaaacgttactgttcagcaagagctggaaacacctgatgctgacggtaatatc
tacatgacgactcaagaaggtgagcagcgtcataaaggttttgagatgggtgcccaaggt
cagataagtgacaagtggtttatgacgggctcaatgatgttccttgatgctgaatacatt
actagcgcaaatgatcgagaaagcttagacggaatgacacctgttgatgctcctgagtgg
tcagcaaacgtgtggacgcgttatgaaatgactgacgatttagcacttaactttggtgct
atctatgtgggtgagcgcttcgccaatactagtaacacgatttctaaagatggttatgtc
cgtttcgacatgggtgccgcatacactatggatgtaatgggaagcgatgtaagtgtacgt
gttaacgtgaaaaacctattcgacgttgattatctagctggtggtactaacactgatgtt
actgttggtgaaggtcgtcactttagcttagcgttagaagctaagttctaa
DBGET
integrated database retrieval system