Shewanella xiamenensis: MKD32_02015
Help
Entry
MKD32_02015 CDS
T08228
Name
(GenBank) SIR2 family protein
Organism
sxm
Shewanella xiamenensis
SSDB
Ortholog
Paralog
Gene cluster
GFIT
Motif
Pfam:
SIR2_2
ANIS5_cation-bd
CH_2
RDD1
Motif
Other DBs
NCBI-ProteinID:
UML94139
LinkDB
All DBs
Position
423824..425335
Genome browser
AA seq
503 aa
AA seq
DB search
MNIREFIGQYRNHPVLFVGAGLSLRYLNNAFTWDGLLKHIAFELKGNNEFYLDIKAGCQD
NGKYDYTQIATKLEQEFNQSLIRERNGKFKLINDIFYHEMENGNCLSRFKIYISNLVSKL
DYKEEKREELAELKKIRKNIGSVITTNYDRLVEDVFSFEPLVGNDILLSNPYGSVYKIHG
CCSNPSKVIITENDYTQFNDKYELIRAQLLSIFIHNPIIFMGYGIGDENIKSLLKTIFTY
VEPNSDDAERIRNNFLLVEYERDNQSSEISEHDIDLQGFSTIRINKLKTDNFNEIYKSLS
NLNLPVSAMDIRKVQSIVKDIYSGVSADGSSIKVNITEDIDALDNSDKILVIGTAKSITY
EHKNASSFMSDYFEIVEESNHHLIRLIDKINIASSQWFPIYAFDQIYPELEKSAVLKLQQ
LRKIEDNVNGLPSTVETSHTCLQDIFDDDSVSRANELNAIMWSTWHGKVLLDEVETFLRQ
MPDKKGTGYRRLLCAYDYKKYCA
NT seq
1512 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
atgaatatacgtgagtttattgggcagtaccgaaatcaccctgttttattcgtaggggca
gggttaagtctacgctatctaaataatgcttttacatgggacggtttattaaaacatata
gcctttgaacttaaaggtaataatgagttctatcttgatattaaagcaggatgccaagat
aacggtaaatacgattatactcaaatcgcaacaaaattagaacaagagtttaatcaaagt
ctgattcgagagcgaaatggaaaatttaaattaattaatgatattttttatcatgagatg
gaaaatgggaattgccttagtcgtttcaaaatctatatttcaaacttggtaagtaagctt
gattataaggaagaaaagcgggaggaacttgccgaactaaaaaagatccgtaaaaatatt
ggttctgtaatcaccacgaactatgacaggcttgtcgaggatgtttttagttttgaacca
ttagtgggtaatgatatattgcttagcaatccttatggttcggtttataaaattcatggt
tgctgctctaacccatcaaaagtaattattacagagaatgactacacccagtttaacgat
aagtatgagctaattcgtgctcagttactctcgatttttattcataatcctataattttt
atgggttatggaatcggtgatgaaaatattaaaagcctgctaaaaactatttttacgtat
gtcgaacctaattcagatgatgcggagagaatccgtaataattttcttttagttgagtat
gaacgtgataatcagtcatctgaaattagcgagcatgatattgatttacaagggttctct
actattaggattaataagctaaaaacagataattttaatgaaatttataagtcactttct
aacttgaatctacctgtgtctgcaatggatattagaaaagttcagagcattgtcaaagat
atctattctggggtaagtgctgacggaagtagtattaaagttaatatcacagaagatatt
gatgcacttgataatagtgataagattctagttataggcacagcaaagtctatcacttat
gagcataaaaatgcatcaagctttatgtctgattattttgagattgtagaagaatctaac
catcatttgattaggttaatagataagataaacatagcgagttcgcaatggttccctatt
tacgcgttcgatcagatttatcctgaactcgaaaagtcagctgttttaaaacttcagcaa
ttaagaaaaattgaagataacgttaatggtttacctagcactgttgaaacgtcacatact
tgtttacaagacatctttgatgatgattctgtctcgagagcaaatgaactgaatgcaatt
atgtggtctacatggcatggaaaggttcttttagatgaggtcgaaacattcctcagacaa
atgccagataaaaaaggaacaggttatagacgattactatgtgcttacgattacaaaaaa
tattgtgcataa
DBGET
integrated database retrieval system