Shewanella xiamenensis: MKD32_08900
Help
Entry
MKD32_08900 CDS
T08228
Name
(GenBank) TonB-dependent receptor
KO
K02014
iron complex outermembrane recepter protein
Organism
sxm
Shewanella xiamenensis
Brite
KEGG Orthology (KO) [BR:
sxm00001
]
09180 Brite Hierarchies
09183 Protein families: signaling and cellular processes
02000 Transporters [BR:
sxm02000
]
MKD32_08900
Transporters [BR:
sxm02000
]
Other transporters
Pores ion channels [TC:
1
]
MKD32_08900
BRITE hierarchy
SSDB
Ortholog
Paralog
Gene cluster
GFIT
Motif
Pfam:
Plug
Motif
Other DBs
NCBI-ProteinID:
UML95387
LinkDB
All DBs
Position
complement(2007176..2009998)
Genome browser
AA seq
940 aa
AA seq
DB search
MMRFKPSLLTLALVAAGASMHSYAADAVTDKDVKAKKDAEIEVIQVKGFRTSVIKSLNDK
RFGDTVAESISADDLGALPDQSIADALTRLPGVTAVRTGGQASGLNIRGLDGDFVFATLN
GHEQVTTGGKRAIEFDQYPSELISQAAVYKSPKASLIEGGVAGTVELKTADPLKSDKDQS
FNINTRGSFNDRADEISDAEQYGNRLSLAYQGKFLEDTLGVAVGYAHLYQPYVASQFIGL
RFNDDKKDVNADGIKEAISEGFELQQKGGDDTRDGYMAAIHWQPTDNLSLKGDLFHSKFT
SENFARGFRVKSLKNGTISDAVVENGSMTGGTVSTDGTDNFAVFVINDNDSKYSELTSGS
FNVEWNNGGALTVAADVSYSKADGEFVNGGTRAVLYDDIGNEVRSAESITYQLNGLSPAD
ISFANDYTNTASLGLKEVGMWPYNQQNDLVAYKLDFNYVLDMGVVSSVDFGVRYAEREFN
AQRSQAGYGFEFGKNPSNQPVLSLNGDMAKVVDFGGELSGYPSFLAIDFNKAVELVNAQL
AATGQSPFTPTANWSNNWTMIQSGAVNEDVLAGYVQANLDFDIADIKVTGNLGVRVVNTD
QSSTGLQQVGYGLGEAITDELGVVSTDYIRNKVGKTYTDYLPSLNLTFHLTENDQLRFAA
ASVMSRPPIDKLKSGMGSWYDDSATPGYKKYNAWGNTSPLLDPFYADQYDLSYEHYFEES
EGAVVVALFYKDIKSFINNFTIQPFDFEANGFIVPDTIIDNGVEFPVVKNEGQYQTAINN
DKGGYIRGIELGYTQVFDFLPSPLDGLGFTGSYSYSDSEVEFTTDLSGSNLTIPLPGLSE
DVLNTTLFYTLDGFDTRVSMRYRSGYVSEQVAVESQLAFFDAETVVDYQASYALDNGLKF
LFQINNLTDEPSKTYFGEEHQTGTIQYFGRQYFLGLTYSL
NT seq
2823 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
atgatgcgatttaaacccagcttgctgaccttagcacttgttgctgcaggcgccagtatg
cactcctacgcagcagatgcggtaacagataaagatgtaaaagctaaaaaagatgcagaa
attgaagtaatccaagttaaaggcttcagaaccagtgtaatcaaatcgctcaatgataaa
cgttttggcgataccgtcgctgaatctatctctgccgatgatctcggcgctctgcccgac
caatctatcgccgatgcgttaacccgtttaccaggcgtcaccgccgttcgtactggcggt
caagccagtggtctgaacatccgtggtctcgatggcgatttcgtgtttgctactctaaat
ggtcatgaacaagtcaccactggcggtaaacgcgccattgagtttgaccaatatccatcc
gaattaatcagtcaagcggctgtttataaatccccaaaagcctcgctgatcgaaggcggt
gttgctggtacagttgaattaaaaaccgccgacccgcttaaaagtgacaaagaccaatca
ttcaatatcaacacccgtggcagttttaatgatcgtgctgatgaaatctctgatgcagag
caatacggcaatcggttaagccttgcttatcaaggtaaattcctcgaagacaccttaggg
gttgcagtgggttatgcccacctgtatcagccttacgttgcgagtcagttcattggttta
cgttttaatgatgataaaaaagacgttaacgctgacggtatcaaggaagcaattagcgaa
ggttttgaactacaacaaaaaggcggcgacgatacccgtgatggctatatggctgctatc
cattggcaaccaaccgataatctgagcctgaaaggtgatctgttccactctaaatttacc
tcagaaaactttgcccgtggtttccgtgttaaatcattgaaaaatggcaccatcagtgat
gccgttgtcgaaaatggttctatgacaggtggtaccgtctctaccgacggcacggataac
tttgcggttttcgtgatcaacgataatgactccaaatactcagagctgacctctggctct
tttaatgttgaatggaacaacggcggcgcactgacagttgcagctgatgtgagctattca
aaagccgatggtgaattcgttaacggcggcacccgcgccgtgttgtatgatgacattggt
aatgaagtacgctcagcagaatcgataacataccaacttaatggtttaagtcctgccgat
attagttttgccaacgactataccaatacagcctctttgggcttaaaagaagtgggaatg
tggccttataatcagcaaaacgatctggttgcctacaaactcgactttaactatgtctta
gacatgggcgttgtgtcttctgttgattttggtgtgcgctatgctgagcgtgagtttaac
gctcaacgctcacaagcaggctacggctttgaatttggtaaaaacccaagcaaccaaccg
gtgcttagcctcaacggcgatatggcaaaagtggttgattttggaggagaactctcaggt
tacccaagtttcctcgctattgactttaacaaagctgtcgagctggtcaatgcgcagtta
gccgcaacgggtcaatcaccctttactccaacagctaactggtcaaataactggaccatg
atccaaagcggcgcggtcaatgaagatgtattggcaggctacgtgcaagctaacttggac
tttgatatcgctgatattaaggtaactggtaacctaggtgttcgtgttgttaataccgat
caaagcagtaccggcttacagcaagtaggttatggtttaggtgaggccattaccgatgaa
ctgggtgttgtgagcacagattatatccgtaacaaggtcggcaaaacttatactgattac
ctgccatcattaaacttaaccttccacctgacagaaaacgatcaactgcgttttgctgcg
gcatctgtaatgtcacgtccacctatcgataagttaaagtctggtatgggttcttggtac
gacgattcagcaacaccaggatataaaaagtacaatgcgtggggtaacaccagtccgtta
ttagatcctttctatgcggatcaatatgacttgtcctacgagcactactttgaagaatct
gaaggtgcggtcgttgtagccttgttctataaagatattaaatctttcatcaacaacttc
actattcaaccgtttgattttgaagcgaatggatttatcgtacctgataccattatcgat
aatggtgttgaattcccagttgtaaaaaatgaaggtcaatatcaaacagccatcaacaac
gataaaggcggctatatccgtggtatcgagttaggctatacccaagtgtttgatttccta
ccatcaccattggatggcttaggcttcacgggtagctactcttactccgatagtgaagtg
gaatttaccaccgacttaagtggttcaaacctgaccattccattgccaggactttcagaa
gatgtgttaaacaccacattattctacaccctggatggcttcgatactcgagtcagcatg
agatatcgtagtggctatgtttcagaacaagttgctgttgaatctcaattggcattcttc
gatgcggaaacagttgtggattatcaggcctcttacgcgctggataacggccttaaattc
ctattccaaatcaataaccttactgatgaaccaagcaaaacctattttggtgaagaacat
caaaccgggacgattcaatacttcggtagacaatatttccttggtttaacctactctctg
taa
DBGET
integrated database retrieval system