Shewanella xiamenensis: MKD32_11975
Help
Entry
MKD32_11975 CDS
T08228
Name
(GenBank) TonB-dependent receptor
KO
K02014
iron complex outermembrane recepter protein
Organism
sxm
Shewanella xiamenensis
Brite
KEGG Orthology (KO) [BR:
sxm00001
]
09180 Brite Hierarchies
09183 Protein families: signaling and cellular processes
02000 Transporters [BR:
sxm02000
]
MKD32_11975
Transporters [BR:
sxm02000
]
Other transporters
Pores ion channels [TC:
1
]
MKD32_11975
BRITE hierarchy
SSDB
Ortholog
Paralog
Gene cluster
GFIT
Motif
Pfam:
TonB_dep_Rec_b-barrel
Plug
Motif
Other DBs
NCBI-ProteinID:
UML92175
LinkDB
All DBs
Position
complement(2702031..2704688)
Genome browser
AA seq
885 aa
AA seq
DB search
MHHLTLAARAVRASLITMGSASVLLSGITIAAEENTKVERIEVTGSRIKQVDMETVSPVT
VINAADIAMTGEKTVADVLNNSAINSFGSWRGVSGYGSGASSTSSVNLRGLGSSATLVLL
DGRRMPGTSSSSGSVADTSSIPMAIVERIEILRDGASAVYGSDAVAGVINIITKKEFDGL
QLDYSTEQPSVEGGDANRLSIATGYNTDKGNITLTYEYYDTKAVMDRDIWNIDDPSYATY
SGFSSVPNGKYGTGNGSWYSNSDICDQTENTVDTTDGNNKGRCLYDSGRVTKLFGDQTRN
SFLSNFTYEITDGIQFRGRASASLAETETRYAGTPVSTNYPVMSADNKFNPVGEDMTLYM
RSAQIGERDTLTETNNVDILGGFIGTLDLGNGIDWELNAQHSRSTTNSFNYNLINDEIVQ
QGIDSEQYDIFNTTGMSYEQWNQQMTELYRKAAHTGVYQGKFESTQIDGLASTLLVDNGD
VSVAMVGGLEYEMIKFKQTSDPESASGIISGGSGGDDVDATRDRSAAYLEFQVGLPANVE
LSAAVRYERYEQEGSLTGPQGQVVNSSTFDAVVPKFGISWRPVDSLLLRASYGDSFRAPN
MGEMFSSQSLSFEKAVDSLWCNEPGNVDAVYCATSNQHKTWYGGNPDLEAEEGNSLTLGG
VWNATDNWNIELSYFSIAYENKIESISVNDILRDEIKNGSSPYVHRGSDGKIEYIEAGVR
NLATVETSGIDFVTAYNLETVIGDFNFRLDLTHVLDFKKQDNAESEMIDYAGLTDSPDWR
GNFATSWKYDDFSAAWTVVYIGRQSADYYNQLEETDVYVDYSNYFKHNIQFAYNHAYNGS
ITVGVNNVFDADAPNFYTYADYRDVNVGLYDVLGRTYYLRINQKF
NT seq
2658 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
atgcatcatctaacgttagcagctagagctgtgcgcgctagtctaatcactatgggttct
gctagtgttttattatctggaataacgattgcggcagaagaaaataccaaagttgaacgt
attgaagtcactggatcacgtattaaacaggtggatatggaaacagtttctcctgtcact
gtgattaatgcagctgatattgccatgacgggcgaaaaaaccgttgctgatgttttgaat
aactcggcaatcaatagttttggttcatggcggggcgtttctggttatggttcaggtgct
agctcaacaagcagcgttaatcttcgcgggctaggctcgtctgcaaccttggtgttgctc
gatggccgccgtatgcctggtacgagctcaagctccggctctgttgctgacacatcctca
attccaatggcgatagtcgagcgcattgaaatcctacgtgatggcgcctctgctgtttat
ggttcagatgctgttgcgggtgtgatcaacattattaccaaaaaagaatttgatggtctg
caattagattacagtacagagcagcctagtgtcgaaggcggtgatgctaaccgtttatcc
attgcgacaggttataatacggataaaggcaatattaccttaacctatgaatattatgat
accaaagccgtcatggatcgtgatatttggaatattgacgatccgagttacgcaacctac
agtggttttagttctgtgccaaatggtaaatatggcacaggtaatggcagttggtatagc
aattcagatatttgtgaccaaactgaaaataccgtcgatacaaccgatggaaataataag
ggccgctgtttatatgattcaggtagagtgactaaattatttggtgatcagacccgtaat
tcctttttatccaattttacctatgaaattaccgacggtattcaatttcgcggtcgtgca
tctgcctcgttagctgaaactgaaacgcgttacgcaggaacacctgtgtcaacaaattat
ccagtaatgagtgctgataataaattcaatcccgttggggaagatatgacactttatatg
cgctctgcccaaattggcgagcgtgataccttaactgagaccaataatgtcgatattctc
ggtggttttattggtacgctggatttaggcaatggcattgattgggaattaaatgcacag
cattcccgctcaaccacgaattcatttaattacaatttaattaatgatgagatagttcag
caaggaatagattctgaacagtacgatatttttaataccacgggcatgagttatgagcag
tggaaccagcagatgactgagctgtatcgtaaggcggctcatacgggcgtgtatcaaggt
aagtttgaaagcactcaaattgatggactggcttcaacgctgcttgttgataatggcgat
gtctctgttgctatggtcggtgggcttgaatatgaaatgattaagtttaagcagaccagt
gatccagagtctgcttcgggcattatctcaggtggctcgggtggcgatgatgtggatgca
acccgtgatcgaagtgcagcttatttagaattccaagttggcttacccgcgaatgttgag
ttatcggccgccgttcgatacgagcgttatgaacaggaaggctcgttaacgggtccacaa
gggcaggtggttaattcatcaacttttgatgccgtagtgcctaaatttggtattagttgg
cgccccgtggatagcttgttactgcgtgccagttacggtgactccttccgagcacccaat
atgggtgaaatgttctcttcacaatctttaagttttgaaaaagccgtcgattcgctttgg
tgtaatgagccaggtaatgtggatgcggtttattgtgcgaccagtaatcaacacaaaact
tggtatggtggtaatcccgaccttgaggctgaggagggtaactcattgacgttaggtggc
gtgtggaatgctactgataattggaatatcgaattatcctacttttcgattgcctacgag
aataaaattgagtcgataagtgtgaacgacatactgcgtgatgaaattaaaaatggttca
tcaccttatgttcaccgtggttccgatggcaagattgaatatattgaagcgggtgtgcgc
aacttagcgacggttgaaacgtcaggtattgattttgtcacagcttataacctagaaacg
gtgatcggtgatttcaacttcagactcgatttaacccatgttttggattttaaaaagcaa
gataatgccgaatcagaaatgattgattatgccgggctaaccgattcgcctgattggcgt
ggtaattttgcaaccagctggaaatatgacgatttttctgcggcctggaccgtagtgtat
attggtcgtcaatcggctgattactacaatcagttagaagaaaccgatgtttacgtcgat
tattcaaactactttaaacacaacatccagtttgcctataaccatgcttataatggttca
atcacggttggggtgaataatgtgtttgatgccgatgcaccaaacttttatacctatgct
gattaccgtgatgtaaacgttggactgtatgatgtgttgggccgcacttactatttgaga
attaatcagaagttttaa
DBGET
integrated database retrieval system
