Shewanella xiamenensis: MKD32_13615
Help
Entry
MKD32_13615 CDS
T08228
Name
(GenBank) DEAD/DEAH box helicase
Organism
sxm
Shewanella xiamenensis
SSDB
Ortholog
Paralog
Gene cluster
GFIT
Motif
Pfam:
SNF2-rel_dom
Helicase_C
ResIII
SNF2_assoc
SWIM
AAA_14
Motif
Other DBs
NCBI-ProteinID:
UML92475
LinkDB
All DBs
Position
complement(3064327..3067602)
Genome browser
AA seq
1091 aa
AA seq
DB search
MNRFPPQEPIQLTQTAIESLFTPPTLMRARDYVMQGKVLSAKANADFRHIEGSVVGSETS
PYRQDIRLVSVNHKLIMNGFCSCPATGHCKHMAAVLYSLLTDKTVEDQRIAQWLHLLDDA
DDPRLNDVESLYDDRVLYILSKDDNGVFIELRRGKLGKKGGYNKGSKIALSDVQYYMPAW
IGAEDVLIINLIMSTRRHGASRLYLKAQLGAVALEKMLATERCFWEESRLALTAGDAITP
QFIWQDIDSEHKQMRLVLPKRDNWELVPTEPAYYIELDYFQIGLIDTDISIEKLRLLSQM
PPVPRTQVEVVSHKLIKHFSARTVPLPSAINFVELRDKLRVRLSLNMLSAASTQANATLP
NTTQLKTTMSHIQAVDINQPYVTLAFIYGDVVLSGNAAKEALTLVTQGGTTYQINRALDE
EQAVVEVLQTLGFTRFVFDLSSLACHWRLGHLPDAIREWLHFIDEEVPRLQTQGIEVGFA
PEFSLKVVDTPLTVELDDSKEGWFSLSLHADINGQRLPMLPLVATWLKQHGEPADDAELL
LPSPNGDWLKIKASVIKPLMSIILELFEQHRGNSIALPKYRAHLLNELAQSDISLLNGER
VRQLAAKLEQFTGVVAVTAPTQLQAELRPYQQQGLNWLCFLKEYQLGGILADDMGLGKTI
QTLAFLLKQKQLKSAAGPHLPSLIICPTSLVGNWAKEAAKFAPSLTLAVIHGAQRGPLLA
RLSEFDVVVTTYPLMVRDNDFYQAQPFEHIVLDEAQQIKNAQAKVSQMIKALQAPFKLCL
TGTPLENHLGELKSLMDFCLPGLLGTTAYFNKAFRYRIERYGDSEQAKVLSQRITPFVLR
RTKAEVVTELPPKTEIYQTLELEKDQRNLYESIRLSMEKKIRELFASQGVAGSHIEFLDA
LLKLRQACCDPRLVKLEQAQKVKNNAKLNWLSQNLPEMVQEGRKILIFSQFTSMLILIEE
LLQSLEIDYSKLTGQTRLRQVQIDQFQEGDTPVFLISLKAGGTGLNLTAADTVIHYDPWW
NPAAERQATDRAHRIGQENPVFVYKLIAEGTVEEKIQEMQLHKQGLADSILEGKGSGAWQ
GSADELLSLFH
NT seq
3276 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
atgaatcgctttcccccccaagagcccattcaattgactcaaacggcaattgagtcctta
ttcacgccgccgaccttgatgcgtgcccgtgattatgtgatgcaggggaaggtgttaagc
gcaaaagccaatgccgattttcgccatattgaaggctcggtagtgggcagtgaaacctca
ccctatcgtcaggatatacgtttagtcagcgtcaatcataagctcatcatgaacggtttt
tgctcctgtcccgccacgggacattgcaagcatatggctgcggtactgtatagcttgctc
accgataaaacggttgaggatcaacgcatcgcccaatggttacatctactcgatgatgcc
gatgatcctcgtttgaatgatgttgagtccctctacgatgatcgggtgctgtatatcctc
tcaaaggacgataatggggtgtttatcgagcttaggcgcggcaagcttgggaagaagggc
ggttataacaagggttccaaaattgcgctctcggatgtgcaatattatatgcccgcatgg
attggtgccgaggatgtgctgatcatcaatctgataatgtctacgaggcgccatggtgca
tcgcggctctatcttaaggcgcagttaggtgcggttgcgcttgagaaaatgctcgcgacc
gaacgttgtttttgggaggaaagtcgcctcgcattgaccgcgggcgatgccattacgcca
cagtttatttggcaagatattgatagtgaacacaagcaaatgcgccttgttttgcccaag
cgagataattgggagcttgtgccaaccgaacctgcgtattatatcgaactcgattacttt
caaattggtcttatcgacactgatatcagtattgaaaaattgcgcctactcagccaaatg
ccacccgtgcctcgcacgcaggttgaggtggtgagtcataaactgattaaacatttttca
gcgcgcacagtgccgctaccaagtgccatcaattttgtggaactacgggataaacttcgg
gttcggttgagcctgaatatgctttcggcggcatcgactcaggccaatgctactctacct
aatacgacccaactcaagacaacaatgtcacatattcaagctgttgatatcaatcagccc
tatgtgaccttggcatttatctatggtgatgtcgttttgagtggtaatgcagctaaagaa
gccttaacccttgtgacccaaggcggaacgacctatcaaattaaccgtgcgttggacgaa
gaacaagcggtggttgaggttctgcaaacgcttggatttactcgttttgtatttgatctt
agcagtttagcctgccactggcgcttaggtcacttgcctgatgcgattcgggaatggctg
cactttatcgatgaagaagtcccaagattacaaactcaaggcatagaggtgggatttgcc
ccagagtttagccttaaggtagtcgacacgccgttaaccgttgagctggatgatagtaaa
gagggctggttttccctgtctttgcatgcggatatcaatggtcagcggttacccatgttg
ccgctggtagccacttggcttaaacaacatggtgagcccgccgatgatgcagagctattg
ctacctagcccaaacggtgactggcttaaaattaaagccagtgttatcaaacccttgatg
agcattattttagagctgtttgaacagcatcgcggcaacagtatcgccttacctaaatat
cgggcacatttactcaatgagttagcccagagtgatatcagcttgctcaatggtgagcgg
gtgcgccaacttgctgctaaattagaacaatttactggtgttgttgcggttactgcgcca
acccaattacaggcagaactgcgtccctatcagcaacagggcttaaattggctatgtttt
ttaaaggaatatcagctaggtggcattttagcggacgatatgggattgggtaaaaccatt
caaactttggcattcctgttgaagcaaaaacagcttaagtcagcggctggccctcatcta
cccagtttaattatctgccccaccagtttggtcgggaactgggcaaaggaggcggcaaaa
tttgcgccttcgttaacactggcggtgatccatggcgcacagcgcgggccgcttttggca
cggttaagtgagtttgatgtggttgttactacctatccgttaatggtgagggataacgat
ttttaccaggcacaaccttttgagcacatagtgcttgatgaagcacagcagattaaaaat
gctcaagctaaagtcagtcagatgattaaagcgctgcaggcgccttttaaactctgcctt
acggggacgccccttgaaaatcatttaggtgaactcaaatccttaatggatttttgtttg
ccaggactccttgggacaacggcttattttaataaggcatttcgttatcggattgagcgt
tacggcgatagcgagcaggcaaaagtgttgagtcaacgcattacgccctttgtgctcaga
cgaactaaggcggaggtagtgactgaacttccgcctaaaaccgaaatttatcaaactctt
gagcttgagaaagatcaacgcaatctgtacgagagtattcgcttaagtatggagaaaaaa
attcgagaattgtttgcaagccaaggcgtggcgggcagccatatcgagtttttagacgcg
ctactcaaattgcgtcaagcctgctgcgatccgcgattggtcaaactggagcaggcacaa
aaggttaaaaataacgccaagcttaactggcttagccaaaacttgccggaaatggtgcag
gaaggacgcaagattttaatcttcagccaatttactagcatgctgattttgattgaagaa
ttactccaatccttagagatcgactacagcaaactgacagggcaaactcggctgcgtcag
gtgcagattgatcaattccaagaaggcgatacgccagtgtttttaattagcttaaaggcg
ggcggaactgggcttaatttgaccgctgccgatacggttatccattacgatccttggtgg
aatcctgcggctgaaaggcaagccactgatagagcacaccgtattggccaagaaaatccg
gtgtttgtctataagcttatcgccgaggggacggtggaagaaaaaatccaagagatgcag
ctgcataaacaaggtttagccgatagtattcttgaaggtaagggcagtggcgcatggcaa
ggtagtgccgatgaactgctctctttattccactaa
DBGET
integrated database retrieval system