Shewanella xiamenensis: MKD32_17060
Help
Entry
MKD32_17060 CDS
T08228
Name
(GenBank) PAS domain S-box protein
Organism
sxm
Shewanella xiamenensis
SSDB
Ortholog
Paralog
Gene cluster
GFIT
Motif
Pfam:
Response_reg
PAS_3
PAS_9
PAS
HATPase_c
HisKA
PAS_4
PAS_8
Hpt
dCache_1
FleQ
PAS_7
HAMP
HATPase_c_5
DUF724
Motif
Other DBs
NCBI-ProteinID:
UML93116
LinkDB
All DBs
Position
complement(3879455..3884740)
Genome browser
AA seq
1761 aa
AA seq
DB search
MDKSKLRTFRSKILSHIALPLILIMAAVYGITSWFNYLSLEKRLYDHLAQQSAHSASRLQ
LLLEHAQTNTQGLADFIGFLADKNDINDSDKLQKVLTNRLERNPDFYGSAVAFKPGTFLN
KKLFSPYVYRSGNSFHYLDIGAEGYDYTDGTWDWWTQAINKVEGYWSKAYFDEGAGNTLM
ITYAVPFGVQPNYFGVTTVDLALDRLPEQLGIAPNRLMILDEQGRLIFHGDKEKVLATSV
SEWLDKGNHKNNAFGALLEDGLTGQASFVDDTGTVYLASIAEVAKLKWHVVVMVPQQELF
TSLLDDISSVVLNLSLLTLLLLLTCYIAAKRLTRPLETLESGILAFGQGKTQQLVIPKGA
ISEIVTLSETFNKMADLLAQREQAILDSRGNRFARLIDGMSDKSFYCSLDPDGQLAQVSE
GVTKVLGIPPELLKRKYQRLFSANPLNEKNWEYTDLALKGQNVPSHQVELIDSKGQSRRL
DVFMQPLVSDTGELMSVEMLFTDVTEQFSAAAWSSAVLEAAPEAMLIVDQSGQIVFSNSR
CQQLFGYDAKAMLGLQIEALLPEDLRSPHAKERLQFLREGRDRPMANARHVRALKSDGDE
FVAEIALSILPSDFDGRRQVAASIRDMTQKIAVEQKIRDSEVRFRGLVTNIPGAVYRTRI
GEEWVMEYVSDNIADITGYAASQFIENRQRSFASLILEEDRELCHQHIDRALAQQETFEV
EYRIRHRDGSIRWVHEKGKASYTEEGFPLWFDGSIDDITKSKLAIVELEASRLQLTNITE
SIPCTVYQLRWVSPSDRRFTFLSGAAFHMLGLHREDLLSNFNIIAERIFDEERPEVIRAL
EGTSDDKLSWIREFRYRHPNGGIRWMEAGASGHYADDGAIIWNGYVMDVTERKSIEEELA
VSEAHFKALFDGATIGIVNVDIKGLILDCNDQFCEDMGLSRNELRSTPIFDVLSAQDKEV
AKAQFKELVEGKVDHYRGERSFIRPSGEHLWMTVNVSSLLDSQNQFESAVVSMVDMTELK
LLSEQLLVAKEEADAASKAKGDFLANMSHEIRTPMNAIIGMSQLCLQTDLDKKQKNYLEK
IERASQSLLSIINDILDFSKIEAGKLDIENVPFQLDTMLEDLSDIFSERAAQKQIELLFA
VAPNVPRYLLGDPLRLGQVLINLMNNAIKFTERGEVLLSLSLVEQQNDDVILRCSVRDSG
IGLTHEQQAKLFKSFTQADTSTTRKYGGTGLGLAICKQLVELMGGSIGVESQQGHGSTFF
FTVKLRISSGQKLIVGQELEGMPVLVADDNATARDIMRTTLESMGFQVDTVRSGDEAVMR
CSQQDYAVALIDWKMPHLDGLETAKQILQRAKKAPRILMVSAHANQDFLTQIEQLGLAGY
ISKPISASRLLDGIMNALGRAGFLPVRRHQDSIAPELLLPLKGKRILLVEDNEMNLEVAT
EFLEQVGIILSIATNGQIALDKLAQQSFDLVLMDCQMPVMDGYQATKALRQRPELAQLPV
IAMTANAMAGDKEMCLRAGMNDHIAKPIEVNLLYQTLLKYLGAPLPAQELINDSPKPVNI
DVDSVVKWPEHPELDIDRGLQLVQNSTRLYQRIFDRFVTSQRNVVEQINKAVASNKREDA
VRMAHTLKGLAGNLSSTTLAELARQLELHLSENTEFQAELDQIQTLVASICQAIEKVKPE
FEESSGPTAEHLPPEALIEALTRLRQSLEEADSDAVAQMDALKPQVSAQLWQQLSPALTM
INQYQFDEAVELIDEVLVDLT
NT seq
5286 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
atggataaaagtaaacttcgtactttccgcagcaaaattttatcccatattgcgctgcct
ttgattcttatcatggcggccgtttatgggattacttcatggtttaattatctttccctt
gaaaagcggctttacgatcatttagctcaacagtcggcacattcagcctctcgattgcaa
ttattactcgaacacgctcaaacaaatactcaagggcttgctgattttattggttttttg
gctgacaagaatgatattaacgattctgataagctgcaaaaagtcttaactaatcgcctc
gaacgtaaccccgatttttatggttctgccgttgcttttaaaccgggcacttttctcaat
aaaaaacttttttctccctatgtataccgcagtggtaatagtttccattatttagatatt
ggcgccgaggggtacgattataccgatgggacttgggattggtggacgcaagccatcaat
aaagtcgaaggttattggtcaaaagcctatttcgacgagggtgctggtaatactttaatg
attacttatgcggttccttttggagtgcagccgaattattttggggttacaaccgttgat
ttggctttagatagattacctgagcaactagggatagcccctaatcggctgatgatatta
gatgagcaaggtcggcttatctttcatggggataaagaaaaggttttagccacatcagtc
tcggaatggctagataaaggaaatcacaaaaataatgcctttggcgctttgctggaagat
gggctgactgggcaagccagttttgttgatgatactggtacagtttatcttgccagcatt
gcagaagtggcaaagttaaaatggcacgtggttgttatggtgccacagcaggagttattt
acctcgctactggacgatatttcctcagttgtcctcaacttaagtttattaaccttactg
ctgttattgacctgctatatcgccgctaaacggttaactcgtccactggaaacccttgaa
tccggcattttggctttcggtcaaggtaaaacacagcagttggttatccctaaaggtgcg
attagcgagatagtgaccttaagtgaaacctttaacaaaatggcagatctgcttgctcag
cgtgagcaagctattttagattcccgcggtaaccgcttcgctcgcttgatcgacggtatg
agcgataaatccttttattgctcacttgatcctgacggacaacttgcacaggtcagtgaa
ggggtgaccaaagtattgggcataccgcccgaattacttaagcgcaaatatcaaagattg
ttttcggccaacccccttaatgagaaaaactgggaatacaccgatctggcactcaaaggg
cagaacgtcccttcacatcaagttgaactcatcgattcaaaaggccagtcaaggcggctc
gatgtttttatgcagcctttagtgtcagatactggcgagttaatgtcggtggagatgcta
tttaccgatgtgacagagcaattttccgccgcagcttggtctagcgcggtacttgaggcc
gcacctgaggccatgctgattgtcgatcaaagtggccaaatagtatttagcaatagtcgc
tgtcagcagctgtttggttatgacgcaaaagctatgttgggattacaaattgaagctttg
ctacccgaagatttaaggagtccccatgccaaagaaagattacagtttctacgtgaggga
cgtgataggcctatggcaaatgcacgccatgtgcgggcgcttaagtctgatggagatgag
tttgttgccgaaatcgccttaagtattttaccgagtgatttcgatggtcgtcgccaagtg
gccgcatcgatccgtgatatgacccaaaaaatagcggttgaacaaaaaatccgtgatagt
gaagttcgcttccgtggtttggtgactaatattcctggggctgtctaccgcactcgcatc
ggcgaggagtgggtgatggaatatgtcagtgacaatattgccgatatcaccggttatgcc
gcgagccagtttattgagaatcgtcaacgtagctttgcttcattgattttggaggaagat
cgcgagctgtgtcatcagcatattgatagagccctcgcgcagcaggaaacctttgaggtg
gaatatcgtattcgccaccgtgacggcagcatccgttgggtgcatgaaaagggcaaggcg
agttataccgaagagggttttcccctatggtttgacggcagtattgacgatattaccaag
agtaagttagccatcgtcgagcttgaagcctcaaggctgcaattaaccaatatcactgag
tctattccttgtactgtgtatcaattgcgctgggtttctcctagcgatcgccgttttact
tttctttctggcgcagcatttcacatgttgggcttacaccgcgaagatttactcagtaac
tttaatattattgctgagcggatttttgatgaggaacgaccagaagttatacgcgcgctt
gagggaacgagtgacgataaattaagctggatccgcgagttccgctatcgtcatcctaat
ggtggcattcgctggatggaagccggagccagtggtcattatgccgatgatggtgccatt
atctggaatggctatgtgatggatgtgactgaacgcaagtctattgaagaagaacttgcg
gtcagtgaggcgcactttaaggccttatttgatggggcaaccattggtatcgtgaatgtc
gatatcaaaggacttatcctcgattgtaatgatcaattctgtgaggatatgggactgagc
cgtaatgaattacgtagtacgcctatttttgatgtcttgagtgcacaggataaagaagtt
gcaaaagcgcagtttaaggaacttgtagaaggtaaagttgatcactaccgaggggaaaga
agctttattcgtccctccggtgagcatttatggatgacagtcaacgtttcaagcttattg
gacagccagaaccaatttgagtcagctgtggtaagcatggtcgatatgactgagttaaaa
ctgctttcagaacaattgcttgttgccaaggaagaggctgatgccgccagtaaggcaaaa
ggcgacttcctcgcgaatatgtcccatgaaatccgcacgccaatgaatgccattatcggg
atgtcgcaactttgcttacagactgatctagacaaaaaacagaaaaattatctcgaaaaa
attgagcgcgcatcgcaatctttattatcaatcattaacgatatccttgatttttctaag
attgaagctggcaagcttgatatcgaaaatgtgccttttcaactcgataccatgcttgaa
gatttgagcgatatcttctccgaaagggcggctcaaaagcagattgaattgctgtttgct
gtcgcacccaatgttccacgttatctgcttggcgatccgttgcggttggggcaagtgctg
atcaacctaatgaataatgcgatcaaatttaccgaaagaggagaggtattactgtccctc
agcttggtcgagcagcaaaacgatgatgtcatattacgttgtagtgtgcgtgacagtggc
attgggttaacccatgaacaacaagccaaactgtttaagtcgtttacgcaagcagacacg
tctactacccgtaaatatggtggtacaggattagggctggcgatttgtaaacagctggtt
gaattaatggggggaagtatcggggtcgaaagccagcaaggccatggcagtactttcttt
tttaccgttaaattgcgcatctccagtggacaaaagctcatcgtaggtcaagagcttgaa
ggtatgccagtattagttgccgacgacaatgccaccgcaagggacattatgcgaaccact
ctagagagcatgggctttcaagttgatacagtgcgttctggcgacgaggcggtgatgcgg
tgcagtcagcaggattatgctgtggcattgattgattggaaaatgccacatcttgatggg
ctcgaaaccgcaaaacaaatcctgcaacgggcaaaaaaagcgccgcggatcttgatggta
tcagcccatgcgaatcaagatttcttgacccaaattgagcaacttgggttagcgggctac
atcagcaaacctatcagcgcatcaagattgcttgatggcattatgaacgcacttggtcgc
gcagggttcctacccgtcaggcgccatcaagacagtattgcgcctgagttattattgccc
cttaaaggtaagcgtattctgttagtcgaagataacgaaatgaaccttgaggtggcgacc
gaatttttagagcaagtggggattattttatccattgccaccaacggccaaattgcgttg
gataagttagctcagcagagctttgatttggtattgatggattgtcaaatgccagtgatg
gatggttatcaggcaacaaaagcactgagacaaaggcccgagttagcacaattacctgtg
atagcaatgaccgccaatgccatggctggcgacaaggaaatgtgtttaagagcgggaatg
aatgatcatatcgccaagccgatagaggttaacttactgtatcaaaccctcctaaaatat
ttaggcgcaccgttaccggctcaagagcttattaatgattcacccaagcctgtgaatatt
gatgttgattctgtcgtgaaatggcctgaacaccctgagcttgatattgatagaggcttg
cagctagtgcaaaactccacgcgcctttaccaaaggatctttgatcgttttgtgactagt
caacgtaatgttgtcgagcaaatcaacaaggccgttgccagcaataaacgtgaggatgcg
gtgcgaatggcccatacgcttaagggacttgcgggcaatttaagttccacaacgcttgcg
gaattggctcggcaattggaacttcacttaagtgaaaatactgagttccaagcggagttg
gaccaaatccaaacgttagtggcatcgatttgccaagcaattgaaaaagttaaacctgag
tttgaagagtctagtgggccgacggcggagcatttaccaccagaagccctcattgaggcc
ttaacgcgattacgccaaagtttagaagaagcggattccgatgcagttgcccaaatggat
gcacttaaaccgcaagtgagtgcgcagttatggcagcagttgagtccagcgctaacgatg
attaatcaatatcaattcgatgaggccgtcgagttgattgatgaagtacttgtagactta
acgtaa
DBGET
integrated database retrieval system