Synechococcus elongatus PCC6301: syc0216_c
Help
Entry
syc0216_c CDS
T00163
Name
(GenBank) hypothetical protein
Organism
syc
Synechococcus elongatus PCC6301
SSDB
Ortholog
Paralog
Gene cluster
GFIT
Motif
Pfam:
FG-GAP
FG-GAP_2
FG-GAP_3
CLSTN_C
Motif
Other DBs
NCBI-ProteinID:
BAD78406
UniProt:
A0A0H3K032
LinkDB
All DBs
Position
complement(248085..252395)
Genome browser
AA seq
1436 aa
AA seq
DB search
MVMAKASLNLSTLNGSNGFRINGIAAYDYSGRSVSGAGDVNGDGIDDLIIGANYADPNGG
YSGQSYVVFGSDQGFSADLNLADLDGSNGFRINGIAADDRSGISVSNAGDVNGDGIADLI
VGANYADPNGNLSGQSYVVFGSDQGFSAALNLSTLNGSNGFRINGIAAYDQSGFSVSSAG
DVNGDGIDDLIIGAYFADPNGNLSGQSYVVFGSDQGFSAALNLADLNGSNGFASNGITAS
DYSGRSVSGAGDVNGDGFDDFIIGASGADPNGSASGQSYVVFGSDQGFSAALNLADLNGS
NGFAINGITAYDRSGFSVSGAGDVNGDGIDDLIIGAFGADPNGTNSAGQSYVVFGSDQGF
SADLNLADLDGSNGFAINGIAAFDLSGFSVNGAGDVNGDGIDDLIIGARNADPNGGASGQ
SYVVFGKKGGFSADLNLSALNGNNGFRINGIAAGDNSGTSVSNAGDVNGDGVDDLLIGAN
YADPNGNTNAGQSYVVFGNAAPVLDLDGAASAELNFGAVFTGTSVSVVGSGLTITDLNSP
TLSAATVTLVNRPDGIAESLSATTTGTSITATYDSNTGVLLLSGLASVEDYQQVLRSVTY
TNTSNAADLDVSHRTIGFVLDDGADFANTSAVVTTSVTVLRLPLADKASVSLSSLDGGNG
FRITGIAANDFSGSSVSNAGDVNGDGIDDLIIGARDADPNGTNSAGQSYVVFGSDQGFSA
DLNLSSLDGSNGFAINGIAAYDYSGRSVSGAGDVNGDGVDDLIIGAFGADPNGNLSGQSY
VVFGSDQGFSADLNLSSLDGSNGFAINGIAADDFSGFSVSSAGDVNGDGIDDLIIGASLA
DPNGARSGQSYVVFGSDQGFSADLNLADLNGTNGFRINGIAVNDQSGFSVSGAGDVNGDG
IDDLIIGAFLADPNGNYSGQSYVVFGKTDDFDTELNLADLDGSNGFRINGIAVNDQSGFS
VSGAGDVNGDGINDLIIGALGASPHSNTNATNAGQTYVVFGSDQGFSADLNLSALNGRNG
FAINGITAGDESGRSVSGAGDVNGDGIDDLIIGASNADPNGNFSGQSYVVFGKKGGFAAE
LNLSDLNGVNGFAINGITAGDGFGSSVSGAGDVNGDGIDDLLIGAPTADPNGSQSGQSYV
VFGNAAPVLDLDGTTSPELNFGAVFTGTPVSVVGSGLTITDLNSPTLAAATVTLVNRPDG
IAESLSAITDGTAIKASYDSNTGVLLLVGLATVADYEKVLRTVTYTNTSNAADLDVSRRT
IEFVLDDGADFANTSAVVTTTLSFKNEVNTITGTPRLDFLRGSKGDDLITGLGGNDFLFG
RAGNDTLIGGLGSDVLSGGAGKDRFVYTAVTEARDLIIDFNAKQDVLDLSGLLDSLGYQG
SNPVADQVLRLNSQSFLGTTVSVNVAGLGGVPDFVSLVTLLGVSSSALVIGENIII
NT seq
4311 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
gtggtcatggccaaggcttctctaaatctctccactctcaatggcagcaatggcttccgc
atcaatggcattgcggcgtatgactactctggccgttctgtcagtggtgctggggatgtg
aatggcgatggtattgatgacctcatcattggagctaactatgccgaccccaatggcggc
tattcaggtcagagctatgtggtctttggctcagatcagggcttcagtgctgatctgaac
cttgcggatttggatggcagcaatggcttccgcatcaatggcattgcggcagatgaccgc
tctggcatttctgtgagtaatgcgggggatgtgaatggggatggcattgctgacctgatt
gttggggctaattatgccgaccctaatggaaatctgtctggtcagagctatgtagtcttt
ggttcagatcagggctttagtgctgccctgaatctctccactctcaatggcagcaatggc
ttccgcatcaatggcattgcggcgtatgaccaatctggcttttcagtcagtagtgccggg
gatgtgaatggggatgggattgatgacctgatcattggggcttattttgctgaccctaat
ggaaatctgtctggtcagagctatgtggtctttggctcagatcagggctttagtgctgcc
ctgaatcttgcagatttgaatggcagcaatggctttgccagcaatggcattactgcgagt
gactactccggccgttctgtcagtggtgctggggatgtgaacggggatggctttgatgac
ttcatcattggggcaagtggtgccgaccccaatggcagtgcttctggccagagctatgtg
gtctttggctcagatcagggctttagtgctgccctgaatcttgcagatttgaatggcagc
aatggctttgccatcaatggcattacagcttatgaccgttccggcttttctgtcagtggt
gctggggatgtgaatggggacggcattgatgacctgatcattggggcttttggtgctgac
ccaaatggcactaatagtgccggtcagagctatgtggtctttggctcagatcagggcttc
agtgctgatctgaatcttgcggatttggatggcagcaatggctttgccatcaatggcatt
gcggcgtttgacctctccggcttttctgtcaatggtgctggggatgtgaacggggatggg
attgatgacctgatcattggagcacgaaatgccgaccccaatggcggggcttctggtcag
agctatgtggtctttggcaagaaggggggctttagtgctgacctaaatctctccgcgctg
aatggcaataatggcttccgcattaatggcattgcggcaggggacaactccggtacctcc
gtcagcaatgccggggatgtgaatggggatggggttgatgacctcctcattggagctaac
tatgccgaccccaatggcaataccaatgccggccagagctatgtggtctttggcaacgct
gctccggtgcttgatttggatggcgctgcatcagcagaactaaactttggcgctgtcttc
accggtacatcagtctcagtcgtgggttcagggctcaccatcactgatctaaactccccg
acactctccgcagcgaccgtaaccttggtcaaccgaccggatggcattgctgaaagcttg
agtgccacaaccacaggtacttcaattacagcgacttatgacagcaataccggggtgctg
ttgctctcaggtctagcctcagtagaggactatcagcaagtcctgcgtagcgtcacctat
accaacacctcgaatgcggctgatctggatgtgagccatcgcacgattgggtttgtcctc
gacgatggagcagactttgccaacactagtgcagtagtcaccaccagcgtgacggttcta
aggctccccttggcggataaggcaagcgtcagtctctccagtctggatggcggtaatggc
ttccgcatcactggcattgcagcgaatgacttctccggcagttcggtcagtaatgctggg
gatgtgaatggggacgggattgatgacctgatcattggggcacgcgatgccgacccaaat
ggcactaatagtgctggtcagagctatgtggtctttggctcagatcagggctttagtgct
gacctaaatctctcgagtctggatgggagtaatggctttgccatcaatggtattgctgcg
tatgactactctgggcgttcagtgagcggtgccggggatgtgaacggtgatggcgttgat
gacctgatcattggagcttttggtgccgaccccaatgggaatctttctggtcagagctat
gtcgtctttggttcagatcagggctttagtgctgacctaaatctctcgagtctggatggg
agtaatggctttgccatcaatggcattgctgcggatgacttctccggcttttcggtgagt
agtgctggagatgtgaacggggatgggattgatgacctgatcattggagcgtctcttgcc
gacccaaatggagctcgttctggccagagctatgttgtctttggttcagatcagggcttt
agtgctgacctaaatcttgcggatttgaatggcacaaatggcttccgcattaatggcatt
gctgtaaatgatcaatccggcttttcggtgagtggtgctggggatgtgaatggtgatggg
attgatgacctgatcattggagcgtttcttgccgaccccaatggcaattattctggtcag
agctatgtagtcttcggcaagacagatgactttgatactgagctcaatctcgctgattta
gatggcagcaatggcttccgcattaatggcattgctgtaaatgatcaatccggcttttcg
gtgagtggtgctggggatgtgaacggtgatggaattaatgacctaattattggggctctt
ggtgcctctccccatagcaatactaacgctactaacgctggccagacttatgtggtcttt
ggctcagatcagggcttcagtgctgacctgaatctttccgcgctcaatggtcgcaatggt
tttgccatcaatggcattactgcaggcgacgaatctggccgttcagtgagtggtgcaggg
gatgtgaacggtgatgggattgatgacctgatcattggggcatctaatgcagacccaaat
ggcaacttttctggtcagagctatgtagtctttggcaagaaggggggctttgcagctgag
ctgaatctctctgacttgaatggcgtcaatggttttgccatcaatggcattactgcaggc
gacggtttcggctcttcggtgagtggtgcgggggatgtgaatggcgatggtatcgatgat
ctgctcattggtgctccaactgccgaccccaatggtagtcaatctggtcagagctatgtg
gtgtttggcaacgcagcaccggtgcttgatttggatggcaccacatcaccagagctgaac
tttggcgctgtctttactggtacgccagtctcagttgtgggttcaggactcaccattacc
gatctcaactctccaaccctcgccgcagcgaccgtgaccttggtcaaccggcccgatggc
attgctgaaagtttgagtgcaatcacggatggcactgcaattaaggccagctatgacagc
aataccggggtgctgctgctcgtgggtctggctactgtggcggattatgagaaagtcctg
cgcaccgtcacctataccaacacctctaatgcagccgatctggatgtaagccgtcgcacg
attgagtttgtcctcgacgatggagcagattttgccaacaccagtgcggtagtcactacc
acgctgagcttcaagaatgaagtcaatacaatcactggaacccccagactcgacttcctc
cgaggcagcaagggagatgacttgattacggggctcggggggaatgacttcctgtttggc
agggctggtaatgacaccttgattggcggactcggctctgacgtcctttctggtggagcc
ggcaaggaccgctttgtctacaccgctgttactgaggctcgcgacttaatcatcgacttt
aatgccaagcaggatgttctggatctaagcgggttgttggatagtctgggctatcaaggc
tctaatcctgttgcggatcaggtcctgcgcttgaacagtcagtctttcttgggcacgacg
gtctctgtcaatgtagcgggactcggtggagtgcccgactttgtctccctagtgaccctg
cttggtgtctcttcttctgccctcgtcattggtgaaaacatcatcatttag
DBGET
integrated database retrieval system
