Synechococcus elongatus PCC 7942 = FACHB-805: Synpcc7942_1337
Help
Entry
Synpcc7942_1337 CDS
T00300
Name
(GenBank) Integrins alpha chain
Organism
syf
Synechococcus elongatus PCC 7942 = FACHB-805
SSDB
Ortholog
Paralog
Gene cluster
GFIT
Motif
Pfam:
FG-GAP
FG-GAP_2
FG-GAP_3
Motif
Other DBs
NCBI-ProteinID:
ABB57367
UniProt:
Q31NK2
LinkDB
All DBs
Position
1368411..1372715
Genome browser
AA seq
1434 aa
AA seq
DB search
MAKASLNLSTLNGSNGFRINGIAAYDYSGRSVSGAGDVNGDGIDDLIIGANYADPNGGYS
GQSYVVFGSDQGFSADLNLADLDGSNGFRINGIAADDRSGISVSNAGDVNGDGIADLIVG
ANYADPNGNLSGQSYVVFGSDQGFSAALNLSTLNGSNGFRINGIAAYDQSGFSVSSAGDV
NGDGIDDLIIGAYFADPNGNLSGQSYVVFGSDQGFSAALNLADLNGSNGFASNGITASDY
SGRSVSGAGDVNGDGFDDFIIGASGADPNGSASGQSYVVFGSDQGFSAALNLADLNGSNG
FAINGITAYDRSGFSVSGAGDVNGDGIDDLIIGAFGADPNGTNSAGQSYVVFGSDQGFSA
DLNLADLDGSNGFAINGIAAFDLSGFSVNGAGDVNGDGIDDLIIGARNADPNGGASGQSY
VVFGKKGGFSADLNLSALNGNNGFRINGIAAGDNSGTSVSNAGDVNGDGVDDLLIGANYA
DPNGNTNAGQSYVVFGNAAPVLDLDGAASAELNFGAVFTGTSVSVVGSGLTITDLNSPTL
SAATVTLVNRPDGIAESLSATTTGTSITATYDSNTGVLLLSGLASVEDYQQVLRSVTYTN
TSNAADLDVSHRTIEFVLDDGADFANTSAVVTTSVTVLRLPLADKASVSLSSLDGGNGFR
ITGIAANDFSGSSVSNAGDVNGDGIDDLIIGARDADPNGTNSAGQSYVVFGSDQGFSADL
NLSSLDGSNGFAINGIAAYDYSGRSVSGAGDVNGDGVDDLIIGAFGADPNGNLSGQSYVV
FGSDQGFSADLNLSSLDGSNGFAINGIAADDFSGFSVSSAGDVNGDGIDDLIIGASLADP
NGARSGQSYVVFGSDQGFSADLNLADLNGTNGFRINGIAVNDQSGFSVSGAGDVNGDGID
DLIIGAFLADPNGNYSGQSYVVFGKTDDFDTELNLADLDGSNGFRINGIAVNDQSGFSVS
GAGDVNGDGINDLIIGALGASPHSNTNATNAGQTYVVFGSDQGFSADLNLSALNGRNGFA
INGITAGDESGRSVSGAGDVNGDGIDDLIIGASNADPNGNFSGQSYVVFGKKGGFAAELN
LSDLNGVNGFAINGITAGDGFGSSVSGAGDVNGDGIDDLLIGAPTADPNGSQSGQSYVVF
GNAAPVLDLDGTTSPELNFGAVFTGTPVSVVGSGLTITDLNSPTLAAATVTLVNRPDGIA
ESLSAITDGTAIKASYDSNTGVLLLVGLATVADYEKVLRTVTYTNTSNAADLDVSRRTIE
FVLDDGADFANTSAVVTTTLSFKNEVNTITGTPRLDFLRGSKGDDLITGLGGNDFLFGRA
GNDTLIGGLGSDVLSGGAGKDRFVYTAVTEARDLIIDFNAKQDVLDLSGLLDSLGYQGSN
PVADQVLRLNSQSFLGTTVSVNVAGLGGVPDFVSLVTLLGVSSSALVIGENIII
NT seq
4305 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
atggccaaggcttctctaaatctctccactctcaatggcagcaatggcttccgcatcaat
ggcattgcggcgtatgactactctggccgttctgtcagtggtgctggggatgtgaatggc
gatggtattgatgacctcatcattggagctaactatgccgaccccaatggcggctattca
ggtcagagctatgtggtctttggctcagatcagggcttcagtgctgatctgaaccttgcg
gatttggatggcagcaatggcttccgcatcaatggcattgcggcagatgaccgctctggc
atttctgtgagtaatgcgggggatgtgaatggggatggcattgctgacctgattgttggg
gctaattatgccgaccctaatggaaatctgtctggtcagagctatgtagtctttggttca
gatcagggctttagtgctgccctgaatctctccactctcaatggcagcaatggcttccgc
atcaatggcattgcggcgtatgaccaatctggcttttcagtcagtagtgccggggatgtg
aatggggatgggattgatgacctgatcattggggcttattttgctgaccctaatggaaat
ctgtctggtcagagctatgtggtctttggctcagatcagggctttagtgctgccctgaat
cttgcagatttgaatggcagcaatggctttgccagcaatggcattactgcgagtgactac
tccggccgttctgtcagtggtgctggggatgtgaacggggatggctttgatgacttcatc
attggggcaagtggtgccgaccccaatggcagtgcttctggccagagctatgtggtcttt
ggctcagatcagggctttagtgctgccctgaatcttgcagatttgaatggcagcaatggc
tttgccatcaatggcattacagcttatgaccgttccggcttttctgtcagtggtgctggg
gatgtgaatggggacggcattgatgacctgatcattggggcttttggtgctgacccaaat
ggcactaatagtgccggtcagagctatgtggtctttggctcagatcagggcttcagtgct
gatctgaatcttgcggatttggatggcagcaatggctttgccatcaatggcattgcggcg
tttgacctctccggcttttctgtcaatggtgctggggatgtgaacggggatgggattgat
gacctgatcattggagcacgaaatgccgaccccaatggcggggcttctggtcagagctat
gtggtctttggcaagaaggggggctttagtgctgacctaaatctctccgcgctgaatggc
aataatggcttccgcattaatggcattgcggcaggggacaactccggtacctccgtcagc
aatgccggggatgtgaatggggatggggttgatgacctcctcattggagctaactatgcc
gaccccaatggcaataccaatgccggccagagctatgtggtctttggcaacgctgctccg
gtgcttgatttggatggcgctgcatcagcagaactaaactttggcgctgtcttcaccggt
acatcagtctcagtcgtgggttcagggctcaccatcactgatctaaactccccgacactc
tccgcagcgaccgtaaccttggtcaaccgaccggatggcattgctgaaagcttgagtgcc
acaaccacaggtacttcaattacagcgacttatgacagcaataccggggtgctgttgctc
tcaggtctagcctcagtagaggactatcagcaagtcctgcgtagcgtcacctataccaac
acctcgaatgcggctgatctggatgtgagccatcgcacgattgagtttgtcctcgacgat
ggagcagactttgccaacactagtgcagtagtcaccaccagcgtgacggttctaaggctc
cccttggcggataaggcaagcgtcagtctctccagtctggatggcggtaatggcttccgc
atcactggcattgcagcgaatgacttctccggcagttcggtcagtaatgctggggatgtg
aatggggacgggattgatgacctgatcattggggcacgcgatgccgacccaaatggcact
aatagtgctggtcagagctatgtggtctttggctcagatcagggctttagtgctgaccta
aatctctcgagtctggatgggagtaatggctttgccatcaatggtattgctgcgtatgac
tactctgggcgttcagtgagcggtgccggggatgtgaacggtgatggcgttgatgacctg
atcattggagcttttggtgccgaccccaatgggaatctttctggtcagagctatgtcgtc
tttggttcagatcagggctttagtgctgacctaaatctctcgagtctggatgggagtaat
ggctttgccatcaatggcattgctgcggatgacttctccggcttttcggtgagtagtgct
ggagatgtgaacggggatgggattgatgacctgatcattggagcgtctcttgccgaccca
aatggagctcgttctggccagagctatgttgtctttggttcagatcagggctttagtgct
gacctaaatcttgcggatttgaatggcacaaatggcttccgcattaatggcattgctgta
aatgatcaatccggcttttcggtgagtggtgctggggatgtgaatggtgatgggattgat
gacctgatcattggagcgtttcttgccgaccccaatggcaattattctggtcagagctat
gtagtcttcggcaagacagatgactttgatactgagctcaatctcgctgatttagatggc
agcaatggcttccgcattaatggcattgctgtaaatgatcaatccggcttttcggtgagt
ggtgctggggatgtgaacggtgatggaattaatgacctaattattggggctcttggtgcc
tctccccatagcaatactaacgctactaacgctggccagacttatgtggtctttggctca
gatcagggcttcagtgctgacctgaatctttccgcgctcaatggtcgcaatggttttgcc
atcaatggcattactgcaggcgacgaatctggccgttcagtgagtggtgcaggggatgtg
aacggtgatgggattgatgacctgatcattggggcatctaatgcagacccaaatggcaac
ttttctggtcagagctatgtagtctttggcaagaaggggggctttgcagctgagctgaat
ctctctgacttgaatggcgtcaatggttttgccatcaatggcattactgcaggcgacggt
ttcggctcttcggtgagtggtgcgggggatgtgaatggcgatggtatcgatgatctgctc
attggtgctccaactgccgaccccaatggtagtcaatctggtcagagctatgtggtgttt
ggcaacgcagcaccggtgcttgatttggatggcaccacatcaccagagctgaactttggc
gctgtctttactggtacgccagtctcagttgtgggttcaggactcaccattaccgatctc
aactctccaaccctcgccgcagcgaccgtgaccttggtcaaccggcccgatggcattgct
gaaagtttgagtgcaatcacggatggcactgcaattaaggccagctatgacagcaatacc
ggggtgctgctgctcgtgggtctggctactgtggcggattatgagaaagtcctgcgcacc
gtcacctataccaacacctctaatgcagccgatctggatgtaagccgtcgcacgattgag
tttgtcctcgacgatggagcagattttgccaacaccagtgcggtagtcactaccacgctg
agcttcaagaatgaagtcaatacaatcactggaacccccagactcgacttcctccgaggc
agcaagggagatgacttgattacggggctcggggggaatgacttcctgtttggcagggct
ggtaatgacaccttgattggcggactcggctctgacgtcctttctggtggagccggcaag
gaccgctttgtctacaccgctgttactgaggctcgcgacttaatcatcgactttaatgcc
aagcaggatgttctggatctaagcgggttgttggatagtctgggctatcaaggctctaat
cctgttgcggatcaggtcctgcgcttgaacagtcagtctttcttgggcacgacggtctct
gtcaatgtagcgggactcggtggagtgcccgactttgtctccctagtgaccctgcttggt
gtctcttcttctgccctcgtcattggtgaaaacatcatcatttag
DBGET
integrated database retrieval system
