Sediminicola sp. YIK13: SB49_02645
Help
Entry
SB49_02645 CDS
T04145
Name
(GenBank) hypothetical protein
Organism
syi
Sediminicola sp. YIK13
SSDB
Ortholog
Paralog
Gene cluster
GFIT
Motif
Pfam:
MBG_2
Peptidase_S8
Por_Secre_tail
Motif
Other DBs
NCBI-ProteinID:
ALM06821
UniProt:
A0A0S1S9H3
LinkDB
All DBs
Position
complement(598546..603750)
Genome browser
AA seq
1734 aa
AA seq
DB search
MVNPFNQPIMQRIEGTTTKNTGKSTSQRFLLPINILFLLLVTTLSAQDYTTTGLSDDWND
PTAWICSGGPCANNPVPDRKVSNSTIIINHNIFYNSNNPISLENKADLIIGNNAKLSTIS
NLNISAGTSLTVNQGQIEIGPGVLNNLGLITLTNALLIKNGNIVNDAQIVVSNSCVELTN
GNFVNNNNISGNGSVKTLNGNINNFGTWGIDIIYFFSQNGNGLPGSPSTIEEVTKICECI
LTNCDILPGYPPNSKVNEIIGSALTSLVLNYNANEAYNDLIYTINPNNQVLIEIIIFNGE
FSRVSAFLNTFGIGTNDYISDVYAPEDDERVITVFFPIEDLQSLNARSDIINQVYEVSPP
IPNQGLIDSQGDAAQNSNLARLGWNVSGVDVKVGVISDSYDRKSGIQPTISPAVQTDIDN
GDLPGNENPVVVVQDFPYGIASDEGRAMMQIIHDVAPDAELLFRTGFISEGNMAAGISEL
VNLNCDIIVDDLTYMRGPFYRDGIIADAINTATASGVSYFSSAGNFGSRSYESTFNPSLS
NPTRHDFGGNNVLQNITLGVGQYIIALQWDDDFYSLGSSTGALNDMDIYLAGDNGTILYG
FNRNNLGADPVEIMPFTVLNPTTTNILIERAAGNSSPLKFKYVVFRAGNDGNFQAIPAAS
GSTVVGHANAEGAIAVGAVRYDNTESFGGILTAQQSSSLGGTTTTGTLRNKPDLMAPTGG
DTSVNLGAPDFDGNLLPNFFGTSASAPHAAGVAALIMDAKSKFEVDPTNSDINLSVRNIL
LNTAIDMAAPGFDFKTGNGFVSADGALASFSNPSPNLIQFNLDNLDLDLFEPGDVSFELI
LEGNSFNESSVVIFRGEELETTFVSQTTLKATIPEFLGNPPIYVFTEPGPLTNGSDGGTS
ETKTFTDPIITDVIVRANNELRRYGEENPTFSFSTIVGDTELPLSDEELNLLLPSITLNT
EATSSSIVGIYAIDVTIANINVGLSELYNFIIEPGVLNINPMPVTIKPQAIDPITYGDSL
PEVSFDYIFGENGETDVTVDPVVASTFSESHANAISLVNGFSLVNGISLVNEISLVNGEP
TLNGFSLVNKTFFVSQSTVDQSETVSQNGFSLVNGTGNEKVINFGADLFSDQKIESGEFS
TITNGISLVNGFSLVNGFSLVNGFSLVNGISMVNGISLVNGFSLVNGISLVNGFALVNGI
SLVNSESAPILNAFENILVILNGDDALSEIPIDIRPLNVITGIDAGTQYIIPGGILDTNF
EIRYQPTPLEILPATLTVTSQDTDIVYGDDPQEDLTGIIDGLQNTDTAEEVFPEGLIYTV
DCESCGVLDSPYIIKATATNTSPNYDISYIDSGLLTVNKFELTVSVEDATITYGQLEDPS
YTIKSNLEPLPYNETISEVLGDLNFTPSDACTTSSTITVNDFVQPDNYNVTIESGNLTIN
KTELQIEILSTFITEGNPIPTNFNIMVNGLVCDDTTPIINSFIIKDKNGLVQSGNLIGGE
YDVYANVSDLSGYENYNLTQVPGILYVNPSVGCNNRIQASDICKSPYTIAGRPEITTLLR
FEYTNNLNTPIFIPNGSKNILKGKAIFVGSPPEVFLPGKHTFEIYTNGETLQWEVITAGC
KSASKSANGSNANPCISNTSLTAKISDSVEQNTVEQLVVYPNPVTDYVNIVTGITSDLIK
ISVYNEVGQTILKQNIEGNNSPEIYLDVSKFKAGLLYIGVEQNGESTFYKIIKK
NT seq
5205 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
atggttaatccatttaatcaaccaattatgcaacgtattgagggaaccactaccaagaac
actgggaaaagcacaagtcaaagatttctactacccattaacattctttttcttttatta
gtaactactttatcggcacaggactacactaccactggtctatctgacgattggaatgac
cccaccgcttggatttgttctggcggaccttgtgccaataacccggtaccggatagaaaa
gtttccaatagcaccattataatcaatcacaatattttctataactccaacaatcccatt
agtctggagaataaagctgatttaataatcgggaacaacgccaaattatcaactattagt
aatttaaatatttctgcaggtacgtcattaactgttaaccaaggacaaattgagataggt
ccaggagttttaaataatttaggattaattacactaaccaatgccctactaataaaaaac
ggaaatattgtcaatgatgcccaaatagtagtatccaactcttgtgtagaactcaccaat
gggaactttgtaaacaataataacatttccgggaatgggagtgttaaaacactaaacgga
aatatcaataattttggtacctggggaatagatattatatactttttcagtcaaaacggc
aatggccttcctggatcaccaagcactattgaagaggtaactaaaatctgtgagtgcatc
ttaactaattgtgatattcttcctgggtatccccctaattccaaggtaaatgaaatcata
ggatctgcattaacttctttggttttaaactataatgctaacgaagcgtacaacgattta
atttacaccatcaaccctaataatcaggtattgattgaaattataattttcaatggagaa
tttagccgcgtaagtgcctttttaaacacctttggaattggcaccaatgattatatttct
gatgtatatgcacctgaggatgacgagcgagttattacagttttctttccaattgaagat
ttacagtctctcaatgccagatctgatattattaatcaggtgtacgaagtgtcaccccca
attccaaaccagggattaattgacagccagggagatgcggcccaaaattcaaatcttgcc
cgacttggctggaacgtttccggggttgatgttaaggttggcgttatttctgatagttac
gacagaaaaagtggtatacaacctaccataagtcctgctgtacaaacagatattgacaat
ggcgatctaccaggaaatgaaaaccccgtagtggttgttcaagatttcccctatggtatt
gcgagcgatgagggaagggccatgatgcaaattatacatgatgtggccccagatgcagaa
ttactctttagaacaggatttatttctgaaggcaatatggcagcagggatttctgaactg
gtaaaccttaattgcgatattatagttgatgaccttacctatatgagaggcccgttctat
agggatggtattatagcagacgctattaatactgccactgccagtggcgtaagttacttt
agttctgctggtaattttggttctagatcctatgaatctacctttaatccatccctttcg
aatcctacacgccacgattttggcggaaataatgtattacagaacattaccttaggcgta
ggtcaatatattattgccctgcaatgggatgatgatttttactccctaggatcttctaca
ggggcactaaatgacatggacatatacctcgctggtgataacggtaccatcctctatgga
ttcaatagaaataatttaggagcagatcctgtggaaataatgccatttacagtactgaat
ccaaccacaactaatatactgattgaaagagcggcagggaatagttcccctttaaaattt
aaatatgtggtttttcgtgcaggtaatgacggtaattttcaggctattcccgcagcgagc
ggatctactgttgttggacatgccaatgcagaaggagctattgctgtgggagcggtacgc
tatgacaacacagaaagttttggaggaattcttactgcccaacagtcttcgtcccttggt
ggtacaacaacgacaggcacattaagaaataaaccagatctaatggcacctacagggggt
gatacttcggtaaatttaggggcaccggattttgatggtaatttattaccaaatttcttt
ggtacttcagcctcggcgcctcatgccgctggtgtggcagcgcttattatggacgcaaaa
tctaaatttgaggtagatcccacaaattcagacatcaatttaagtgttagaaatatttta
ctcaatactgcgatagatatggcagctcctggttttgactttaaaacaggaaacggattt
gtttccgccgacggtgcactagcttccttttctaatccttcccccaatttaattcagttt
aatctcgataatctagatttggatctatttgagcctggagatgtgtcttttgagcttatc
ttggaaggaaactccttcaatgaatcatctgtggttatttttagaggggaagaactggaa
accacctttgttagccaaacaacattgaaagctacaattcctgaatttctgggcaaccct
cctatctatgtatttacagagccgggaccattaacaaatggatctgatggtggaacttcc
gaaacaaaaacgtttaccgatccaatcataacagatgtaattgtccgagccaataatgaa
ctaaggagatatggggaagagaatccaactttttcctttagtaccattgttggtgataca
gaattaccactttctgacgaagaattaaaccttttattgccatcaataacacttaataca
gaggccacctcctcttctatcgtaggtatttatgccatagatgtgactattgcgaatatc
aatgttggcttatcggaactctataattttataatagagccgggagtattgaatatcaac
cctatgcccgttaccataaagccgcaagccatagatccgataacatacggtgattcctta
cctgaggtttcattcgattatatttttggagaaaacggagaaacagatgtaactgtagat
cctgtggtcgccagcactttctcagaaagccatgcgaacgccatttctttggtcaatggc
ttttccttggtaaatgggatttccctggtcaacgaaatatcccttgtaaatggggaacca
accttaaatggcttttctttagtgaacaaaacatttttcgtttcccaaagtaccgtagat
caatcggaaactgtttctcaaaatggcttctctttagtaaatggaactgggaatgaaaag
gtaatcaactttggggccgaccttttttctgatcaaaaaatagaatcaggtgagttctct
accattaccaacggcatttccttggttaatgggttttctttggtaaatggtttttcattg
gtaaatggcttttcattggtgaacggaatatccatggtaaatggcatatccctggtaaat
ggcttttcattggtgaacgggatatcactggtcaatggttttgcgctggttaacggtatt
tcattagtaaatagtgagagtgctcctatcctaaatgcgtttgaaaatattttagtgatt
ctaaatggtgacgatgccctaagtgaaattccaattgacatacgcccccttaacgtaatc
actgggatagatgcggggacacagtatattattcctggaggtattttagatacaaatttt
gaaattagatatcaaccaacccctcttgaaattttacctgcaacactcactgttacctcg
caggatacagatatcgtttatggcgatgatccacaggaagacctgacaggaattatagat
ggcttacaaaatactgatactgcagaagaggttttccctgaaggtttgatctataccgta
gattgtgaatcttgtggagtcttggatagtccgtatatcattaaggcaactgccaccaac
acctccccgaattatgatatatcctatatagatagtggtttactgacggtgaataaattt
gagctaacggtttcggtagaagatgctaccatcacctatggtcagttagaggacccttct
tatacaattaaatccaatttagaaccattaccctataatgaaactatttctgaagtctta
ggcgatttaaacttcaccccatcggatgcctgtaccaccagcagtaccataactgttaac
gactttgtgcaaccggacaattataatgtaaccattgaaagtggtaatttaaccatcaac
aagacggaacttcagatagagattttatccacttttattacagaaggcaatccaatacca
acaaactttaacatcatggtgaacggattggtatgtgatgatactacgcccattattaat
agttttataatcaaagataaaaatggtcttgttcagtctggcaacctaattgggggggaa
tatgatgtatatgcaaatgtttctgatttatctggatatgagaactacaacctgacccaa
gttccaggcatactgtatgtaaatccatcggttggctgtaataacagaattcaggcatca
gatatttgcaaaagtccgtacacaatagcaggacgtccagaaataacaacactgttgcga
tttgaatatactaacaacctaaataccccaatttttattccgaatgggtcaaaaaacatt
ctaaaaggcaaggctattttcgtagggtcccctccagaagtatttctaccaggaaaacat
acctttgaaatttataccaatggtgaaacattgcaatgggaagtgattacagcagggtgt
aaaagtgcctcaaaatccgctaacggctctaatgctaacccttgtatttctaacacctcc
ttaacagcgaaaatttccgattccgtggagcaaaatacagttgaacaattagtggtatac
cccaatccagttacagattatgtgaacattgtaacgggaataacttctgatctgataaag
ataagtgtatacaacgaagtagggcaaaccatcctaaagcaaaatatagaaggaaataac
tcacctgaaatctaccttgatgtttcaaaatttaaggctggccttttatatataggtgta
gaacaaaacggggaaagcaccttttataaaattataaagaagtaa
DBGET
integrated database retrieval system