Sediminicola sp. YIK13: SB49_06975
Help
Entry
SB49_06975 CDS
T04145
Name
(GenBank) multidrug transporter
KO
K26939
MATE family, multidrug efflux pump
Organism
syi
Sediminicola sp. YIK13
Brite
KEGG Orthology (KO) [BR:
syi00001
]
09180 Brite Hierarchies
09183 Protein families: signaling and cellular processes
02000 Transporters [BR:
syi02000
]
SB49_06975
Transporters [BR:
syi02000
]
Solute carrier family (SLC)
SLC47: Multidrug and Toxin Extrusion (MATE) family
SB49_06975
BRITE hierarchy
SSDB
Ortholog
Paralog
Gene cluster
GFIT
Motif
Pfam:
MatE
Motif
Other DBs
NCBI-ProteinID:
ALM09209
LinkDB
All DBs
Position
complement(1576332..1577717)
Genome browser
AA seq
461 aa
AA seq
DB search
MFKQYTKEFRYNLQLSFPVILGMLGHTFVAFADNIMVGQLGTAELAAVSLGNSFVFIAMS
LGIGFSTAITPLVAEADGAGNKEVGKSALKHGLVLCTGLGLSLFGLIMLSKPLMYMMKQP
PEVVELAMPYLDLVAFSLVPLIIFQAFKQFSEGLSQTKYPMYATVIANIVNIVLNYLLIF
GSFGFPKMGIVGAAMGTLISRIVMVIYIWVLLKNKKKFHDYVTGFNFRNMEKKVMKKIID
LGFPSALQMFFEVGIFTGAIWLSGVLGKNSQAANQIALNLSSMTFMVGMGLGVAAMIRVG
NQKGLKNFQDLRRIAISIFFLTFLLEIVFATLFLLFKDWLPTIYLDVNDLANSADNTEVI
IMAAELILVAAFFQISDGLQVVILGALRGLQDVKIPTIMTFIAYWLIGFPVSFYLGLYTP
LRSTGIWIGLLAGLTASAIMLYIRFNYLTKKLLVNTLIEIK
NT seq
1386 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
ttgttcaagcagtataccaaagaattccgttataacctacaattgtctttccctgtcatt
ttggggatgctgggccataccttcgtggcatttgcagataatataatggtaggccagttg
ggtactgcagaattggccgcagtctctttgggaaatagctttgtttttattgcgatgtct
cttggtatcggattctctacagctataactcctctagtcgcagaagcggatggtgcagga
aataaagaagttgggaaaagtgccttaaagcacggactggtgctttgcacaggattggga
ttgtccctttttggcttgatcatgttgtccaagccgctgatgtatatgatgaagcagccg
ccagaggttgttgaattggcaatgccctatttagacttggtagctttttctttggttccc
ttgattatctttcaagccttcaaacaattttctgaggggctttcccagaccaaatatccc
atgtatgccacggtaattgccaatatcgtcaatattgttcttaactatttattgattttt
ggttcttttggatttcctaaaatgggaatcgttggtgcagcaatgggaacattgatttct
aggattgtgatggtcatttatatttgggttttgctaaaaaacaaaaagaaattccatgac
tatgttacggggttcaacttccgtaacatggaaaaaaaggtcatgaaaaaaatcatagat
cttggatttccttctgcccttcaaatgttctttgaggtgggcatttttacgggagctatc
tggttgagcggggtattgggtaaaaattcacaggcagcaaatcaaattgcattgaacttg
tccagcatgacctttatggtggggatgggacttggtgtggcggccatgatacgtgtgggc
aaccaaaaagggttgaagaattttcaagatctaagacggatagccatctccatattcttt
ttgacatttttattggaaatcgtttttgctaccttgttccttttgttcaaagattggttg
ccaacaatttatttggatgtcaacgatcttgcgaatagtgcagacaataccgaggtgatc
attatggccgcagagttaatattggttgccgcattttttcagatttcggacggtttacag
gttgtaattctaggtgcattgcgcggactccaggatgtaaagattcccacaatcatgacc
tttatcgcttattggttgataggatttcccgttagtttttatttgggattgtatacccca
ttgcgcagtacgggaatatggattggactattggccggcttaactgcctctgcaataatg
ttgtatattcggttcaattatcttacaaaaaagttacttgtcaatacactaatagaaatt
aaatag
DBGET
integrated database retrieval system