Sediminicola sp. YIK13: SB49_14215
Help
Entry
SB49_14215 CDS
T04145
Name
(GenBank) hypothetical protein
Organism
syi
Sediminicola sp. YIK13
SSDB
Ortholog
Paralog
Gene cluster
GFIT
Motif
Pfam:
YobI-ATPase
TniB
AAA_22
DUF2683
AAA_18
AAA_16
PRK
AAA_29
DUF7365
INT1_R3
ABC_tran
Motif
Other DBs
NCBI-ProteinID:
ALM08821
LinkDB
All DBs
Position
3188163..3191975
Genome browser
AA seq
1270 aa
AA seq
DB search
MNEPSKKTNQNSSSTSDKDSSIKNFISKLKKLRYSFVQIFFQEKDKAEPISSLAAKVLKS
KKEIEKIQPYLNRLNSALSSEDVTNIALTGTYGSGKSTVIKTFQDIYKAEDPNNDFKYLN
ISLASFKDEILDEEDESKKENKNEESSNGIKNALLSKRHKDFEKLLEVSILQQMIYHVKP
SRIPDSRFKRIVNFTKWKLIITSISFVIWLISAFSMWQFNVFSKINPFAWTFSSKDLDFT
SLIIISIFLSGLSKIIYSLIRTFGNSRISKINIKGELELGEKVDKSILNQHLDEIIYYFQ
RTEFNVVVIEDLDRFKDTEIFTKLREINLLLNNSELIRRKIVFVYAIRDDMFQGNERIKF
FDYIIPVIPFINPSNANDKLTELLKEEDLISVFSQSFIDDVVTFIDDIDMRLLTNILQEY
LVYKESLTHELTQDNLLAIVIYKNIYPRDFAKLHKNEGDLFDFISNKATYVNDMISKLDE
EIATNIPLISGLQNEKIKNEKELKEVYLFNIISQLDNPSDIFIEGKPVPLNKLLEQDNFN
SLINEQNINYNTLIINRSYNMYTKTKKSLDKSFSDIEREINKFHKFNERIEHINNNNDNR
LEELKEQNELLKERKEEIKRWNIKNIFQNQDVSVYLGPFMGSLLMRSLLVNGYINENYLD
YISLFHEVNITKGDYTFIRKVKIGESLDFNYKIEKLENLIKKIDESHFEKVAILNHQVIE
FILKNKNQYKSRYESLKKLLKSENQKVIDFIDRFKRSEQTDNKILFKELPSIWQGFWNFI
TTKGKFSEKKTNEYLQLIVTHANLADIKNFNNIKSFKQHFSILSNLADLVKDKDQTEKLK
SIIESFKIKFDNISELNYNNEFLYDYVLTNDSYEIKYTNLLAITTDEGKSEEDFRSSNYT
TLRHLENKLPLAYIEKNIETYVTNVFLTLENTKETEDALISLLNNSDLIIPTRKLILETT
ATVFQNLSDFDDIEIKEEILKQLAVNTSWVNVMDYFNSYTKENLDSILINYLDNDDVYNE
LGKSNLSSLKDDNEVKKKLALAIIYCDELSLESHTKLRTCKSSGWTGLVLKGLSSDKVKS
MIESKFFTLSVEYYDKVKEEFPGLHINLIEKSFITYIKNYAAYEMNEEDHSSIMQSIVLR
DAQKKEFLNTLDENEIIEDAVIASSATKVYVNEKVSNLSYSLLYGLFKGSSSNEYRIQLF
NLNSNNIDKTQAKNLIGQLGHPYNRLIKSRKQAKIAINPINLEFTNNLMSLGIITSNREV
RGMIKAVASA
NT seq
3813 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
atgaatgaaccatccaaaaaaacaaaccagaattcgagttctacatctgacaaagattca
tccataaaaaactttatttcaaaattaaaaaaacttagatatagttttgttcaaatattt
ttccaggagaaagataaggcagaaccaattagctctttagcagcaaaagtacttaagtct
aaaaaagaaattgaaaaaatccaaccttatctaaatagactaaatagtgcgctttcaagt
gaagatgtaactaatattgctcttactggtacatacggttcagggaaaagcacagtaatt
aaaacctttcaagatatatacaaagcagaggacccaaataatgattttaaatatttaaac
atttctttggcatcttttaaagatgaaatattagatgaagaagatgagtcaaaaaaggaa
aataaaaatgaagaaagctcaaatggaattaaaaatgctcttttatcaaaacggcataaa
gactttgaaaagctattagaagttagtattcttcaacaaatgatttatcatgttaagccc
tcaagaattcctgattctcgctttaaaagaattgtaaactttacaaaatggaaattaatt
attacttctatctcttttgtaatatggcttatttctgcattctctatgtggcagtttaat
gtttttagtaaaataaatccttttgcatggacattttcttctaaagatttagattttact
tcacttattataataagtatctttttaagtgggttgtcaaaaattatttatagtcttatt
agaacttttggcaattcacgtatcagcaagataaatattaaaggagagcttgaactaggt
gaaaaagttgataagtctatactaaatcagcatctcgacgaaatcatttattactttcaa
agaactgaattcaatgtagttgttattgaagacttagacagatttaaggatacagaaatt
ttcacaaagctaagagaaatcaatttgctgttaaataatagtgagctcatacgaagaaaa
attgtatttgtttatgctattagagatgacatgtttcaaggtaatgaaagaatcaaattt
tttgattatataataccagttattccatttataaatccttccaatgcgaacgacaagctg
acagaactacttaaagaagaagatttaattagtgttttttcgcaaagttttattgacgac
gttgttacttttattgatgatattgatatgcgtttgctaacaaatattttacaagaatat
ttggtatataaagaaagtcttactcatgaacttactcaggacaacttacttgcgatagtc
atctacaagaatatttatccaagagattttgctaaactgcataaaaatgaaggagacttg
tttgatttcatatctaataaagccacttatgttaatgatatgatttctaagttggatgaa
gaaattgctactaatattccattaatttcaggtttacaaaatgagaagataaaaaatgaa
aaggagcttaaagaggtttatttattcaacatcattagtcaattagataatccatctgat
attttcatagaaggcaagccagtaccattgaataaacttttggaacaagacaattttaat
tccctaattaatgaacaaaacattaattataatacattaattattaatcgttcctataat
atgtacacaaagactaaaaaatctttagataagtcgttttctgatattgaaagggaaata
aataagtttcacaaatttaatgaaagaattgagcatataaataataacaatgataatagg
cttgaagagttaaaagaacaaaatgaactattaaaggaacgaaaagaagagattaaaagg
tggaatattaaaaatattttccagaaccaagacgtaagtgtttatttaggtccatttatg
ggtagtttactaatgagaagtttattagttaatggatatattaatgaaaattacttagac
tacatatctctttttcatgaggttaatattacaaaaggagattatacttttattagaaaa
gtaaaaattggagaaagcttggatttcaattataagattgaaaaattagaaaatctaata
aagaagatagatgaaagccattttgaaaaggttgctatattaaatcatcaagttatagag
ttcattttaaaaaataaaaatcaatacaaatctagatatgagtctttaaaaaaactactg
aaatctgagaatcaaaaagtaattgatttcattgataggtttaaaagaagtgaacaaacg
gataataaaatcttattcaaagaattgccaagtatatggcaaggtttttggaattttata
actacaaaaggtaagttttccgagaagaaaactaacgaataccttcagcttattgttact
catgcaaatttagcagacataaagaactttaacaatataaagtctttcaagcagcatttt
tctatattatctaaccttgccgatttggtaaaggataaagaccagactgaaaaattaaaa
tcaattatagaaagttttaaaatcaagtttgataatatatctgaattaaattataacaat
gaatttttatatgactatgtattaaccaatgattcttacgaaataaaatatactaacctg
ttagctattacgaccgacgaggggaaaagcgaagaagattttagaagttcaaattatact
accttaaggcacttagagaacaaattacctcttgcttatattgagaaaaatattgaaaca
tatgtaacaaatgtattcttaacattagagaatacaaaggagacagaggatgctttaatt
tcgcttttaaataattctgatttaataattccaacaagaaaattaattctggaaaccact
gcgacagtttttcaaaatctatcagactttgatgatattgaaataaaggaagagatttta
aaacagttagctgttaatactagttgggttaatgtaatggactatttcaatagttacaca
aaagaaaacttggatagtatcttaattaactatcttgataatgatgatgtttacaatgaa
ttaggtaaaagtaatttgtcttcacttaaggatgataatgaggttaagaaaaaacttgcg
ctggcaatcatttattgtgatgagctaagtttggaaagtcacactaaactcagaacttgt
aaaagttcaggctggactggactagtgctcaaagggctctcttctgataaagttaaatcc
atgattgaatccaagttttttacattgtcggtcgaatattatgataaagtaaaagaagaa
tttcctgggcttcatattaatttaattgaaaaaagttttattacgtacattaagaattat
gccgcatatgaaatgaatgaagaagaccattcgtctataatgcaatccatagttttaagg
gatgcacaaaaaaaggaatttttaaatactttagatgaaaacgaaataatagaagatgct
gttatagctagttcagcaactaaggtatatgtgaatgaaaaagttagcaatcttagttat
agtcttttgtatgggctatttaagggaagtagttctaatgaatatagaatacaattgttt
aatttgaattctaataacattgataaaacccaagctaagaacttaattggacaattagga
catccatacaatagactcataaaatcaagaaaacaagctaagattgctattaatcctatt
aacctagagtttaccaataacttaatgagtttaggaataataacttctaatagggaagtt
agaggtatgattaaagctgtcgcatctgcctaa
DBGET
integrated database retrieval system
