Synechocystis sp. PCC 6714: D082_07900
Help
Entry
D082_07900 CDS
T03386
Symbol
dnaB
Name
(GenBank) Replicative DNA helicase / intein-containing
KO
K02314
replicative DNA helicase [EC:
5.6.2.3
]
Organism
syj
Synechocystis sp. PCC 6714
Pathway
syj03030
DNA replication
Brite
KEGG Orthology (KO) [BR:
syj00001
]
09120 Genetic Information Processing
09124 Replication and repair
03030 DNA replication
D082_07900 (dnaB)
09180 Brite Hierarchies
09182 Protein families: genetic information processing
03032 DNA replication proteins [BR:
syj03032
]
D082_07900 (dnaB)
Enzymes [BR:
syj01000
]
5. Isomerases
5.6 Isomerases altering macromolecular conformation
5.6.2 Enzymes altering nucleic acid conformation
5.6.2.3 DNA 5'-3' helicase
D082_07900 (dnaB)
DNA replication proteins [BR:
syj03032
]
Prokaryotic type
DNA Replication Initiation Factors
Initiation factors (bacterial)
D082_07900 (dnaB)
BRITE hierarchy
SSDB
Ortholog
Paralog
Gene cluster
GFIT
Motif
Pfam:
DnaB_C
Intein_splicing
DnaB
LAGLIDADG_3
AAA_25
HTH_19
HTH_26
Motif
Other DBs
NCBI-ProteinID:
AIE73319
LinkDB
All DBs
Position
complement(774754..778134)
Genome browser
AA seq
1126 aa
AA seq
DB search
MVANPALPPQNIEAEECILGGILLDPEAIGRIIDLLVVDAFYVKAHRLIYEAMLSLHGQS
QPTDLMSVSSWLQDHHHFEAIGGMIKLTQLLDRTISAANIDRFAVLVMDKYLRRQLIAAG
YDIVDLGYETSKELEVIFDESEQKIFRLTQSRPQAGLVPLSETLVNTFIELDKLHEKLSS
PGVETQFYDLDAMTGGLQRADLIILAGRPSMGKCCAANAEIVLANGRICTIAEIYKQKKA
ELLTLNQDWKLDWTKPSDFIDDGIKPVFRVTTRLGRSLETTLTHPYLTIMGWQTLANLKV
GDKIAVPRHIPCFGNKILNSGKVKLLAYLIGDGDVTGSCPRFTNINPRIRADFEEATRDF
PGIKLTVETSNNTRTPTLRISKNVKVIARKREIFSENLNNIIKTRSLKTKELASKVKVSI
ASIDNWKKGYCFPEKNKFKLLCQALGVEPSLLLPPEAQETELIKNGASSIKIWLEELGVD
GKTAHTKTIPDLVFQLEKSLLALFLNRLFATDGWASILKSQQIQLGYCSVSEKLARQVQH
LLLRFSIIAKLKRKAVKYNDQLRNAWQLDITDAYSIKNFIEQIGIFGKEEQLIAIQSLLI
NRNYQTNCDLIPIELWEQLKLSKENESWSSLAKRSGIINCSNLHVGKRALTRARLLKLSN
SLANVPFQQLATSDIYWDEIVSIESVGLKQVYDLTVPETHNFIANDICVHNTAFGLGIAA
NIAKNQNLPVAIFSLEMSKEQLALRLLASESLIDSNRLRTGHFSQAEFEPLTAAMGTLSS
LPIYIDDTASISVTQMRSQVRRLQSEQKGPLGMVLIDYLQLMEGGSDNRVQELSKITRSL
KGLAREINAPVIALSQLSRAVESRTNKRPMMSDLRESGCISGDSLVNLVTSKRASIRDLV
DQKDFEVWAINEQTMKLESAKVSRVFCTGKKLVYILKTRLGRTIKATANHKFLTIDGWKR
LDELSLQEYIALPRKLESHALQLMSDEELGLLGHLIGDGCTLPRHAIQYTSNKIELAEVN
KLSQSDIYWDTITSVTEAGIEEVFDLTVPSLHNFVANDIIVHNSIEQDADLIMMIYRDEY
YNPDTPDPGVAELLIVKHRNGPTGVVKLLFKPEFTQFLNLQRTNDY
NT seq
3381 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
atggttgctaaccccgccctaccgccccaaaacattgaagctgaagagtgcatcctgggg
ggtattctcctcgatccagaggccataggtcgcatcattgacctcttagtggtggacgct
ttttacgtcaaagcccatcgtttgatctatgaggccatgctcagtctccatggccaaagt
cagcccacagatttgatgtccgtcagcagttggctccaagatcaccatcatttcgaggcg
atcgggggcatgatcaaattaacccaattgttagatcgcaccatttcagcggcgaacatt
gaccgttttgctgtcctagtaatggataaatatttgcgccgccaattgattgcagcgggg
tatgacatcgttgatttaggttatgaaaccagcaaagaattagaagtaatttttgacgaa
tcggaacagaaaatctttcgcttgacccaatcccgtccccaggcaggactagtcccccta
tcggaaaccttagttaacactttcattgaactagataaattacacgaaaaactttccagt
ccaggggtagaaactcagttctatgacctcgatgcgatgacagggggattacagcgggca
gatttaattatcttggctggtcggccatcaatgggtaagtgctgtgcggccaatgcagaa
attgttttagcaaatggacgtatttgtacaatcgccgaaatttataagcaaaagaaagca
gagttattaacccttaaccaagattggaaactcgattggaccaagccttcagacttcatt
gacgatggcattaaaccagtttttcgtgtcaccacaagattggggcgttctctggaaact
acattgacccatccctatctcacaataatgggttggcagacccttgccaatttaaaagta
ggggataaaattgctgtgccccgtcacataccttgttttggcaacaaaattttaaattct
ggtaaggtcaaattattggcatatttgattggtgatggagatgttaccggatcctgtcct
cgatttactaatattaaccctagaattagggcagattttgaggaggcaactagggatttt
ccaggtattaaacttactgttgaaacttctaacaacacccgcactccgaccttaagaatt
tctaagaatgtaaaagtaatcgctcggaaaagagaaatttttagtgagaatcttaataac
ataattaaaactagatctttaaaaaccaaagaattagctagtaaagtaaaagtcagcatt
gccagcattgataattggaaaaaaggttattgttttccagagaaaaataagttcaaatta
ctttgccaggctttaggagttgagcccagtctattgttgcctccagaagcccaggaaacg
gaactgataaaaaatggagctagtagtataaaaatttggctagaagaactgggggtagat
ggtaaaaccgcccataccaaaactattcctgatctagtttttcaattggagaaatcttta
ctggctctctttctaaatcgcttgtttgccacggacggttgggctagcattcttaaaagt
cagcaaattcagctaggttattgcagtgtcagtgaaaaattagctcgacaagttcagcat
cttcttttgagatttagtattattgcaaaactcaaaagaaaagcagttaaatataatgat
caattaagaaatgcttggcaattggatattactgatgcttattcaattaaaaattttatt
gagcaaattggcatttttggtaaggaagagcaacttatcgctattcaatctttactaatc
aatagaaactatcagactaactgtgatcttattcctatcgagctttgggaacaattaaaa
ttatctaaagaaaatgaatcttggtcttctttagctaagcgttccggcattattaattgc
agtaatcttcatgtaggcaaaagagctttgacaagagctcgcttactaaagctatcaaac
tccttggcaaatgttccctttcagcaattggcgactagtgatatttattgggatgaaatt
gtttccattgaatccgttggcttaaaacaagtctatgatttgacagtgccagaaacccat
aacttcattgccaatgatatctgtgtgcataatacagcttttggcttaggaattgccgca
aatattgccaaaaatcaaaatttgccagtggctatttttagcctagaaatgtctaaggaa
cagttagcattaagacttttggccagtgaatctttaattgatagtaatcgtctgcggacg
gggcattttagccaagcagaatttgagcctttaacggcagccatgggcaccctttctagt
ttgcctatctacattgatgatacggcaagtatttccgtgacccaaatgcgttcccaagtt
cgacgtctgcaaagtgagcaaaaaggtcccttgggcatggttttaattgattatttacaa
ctaatggagggcggcagtgataatcgggtgcaggagttatcaaaaattacccgttccctc
aaaggtttagctagggaaattaatgcgccggtaattgcgttatctcagctgagtcgagcg
gtggaatcgagaactaataagcgaccaatgatgtcagatttgagagaaagtggttgtatt
agtggagatagtttagttaacttagttacaagtaaaagagcctctattagagatctagta
gatcaaaaagattttgaagtatgggcaattaatgaacagacaatgaaactagaatcagct
aaagttagtcgtgtattttgcactggaaaaaagctggtttacattttgaaaactcggcta
ggtagaactattaaagcaacggcaaatcataaatttttaactattgatggttggaagaga
ttagatgagttatctttacaggagtatattgccctgccccgtaaactagaaagtcatgct
ttacagttaatgagtgatgaggaactgggactactggggcacttgattggtgatggctgt
actttgcctcgccatgcaattcaatatacaagtaataaaatagaattagctgaggtaaac
aaattgtctcagagtgatatttattgggataccattacctctgtcaccgaagctggaatc
gaagaagtttttgatttaactgtgccaagtctacataattttgttgcgaatgacatcatc
gttcataacagcattgagcaagatgcagatttgattatgatgatttatcgagatgaatat
tataatcctgacacgccggatccaggggtagcagaactgttaattgttaaacatagaaat
ggacctacgggcgtagttaaattgctttttaaaccggaatttacccagtttttaaaccta
caacgaactaatgactactag
DBGET
integrated database retrieval system
