Synechococcus sp. PCC 6312: Syn6312_1275
Help
Entry
Syn6312_1275 CDS
T02370
Name
(GenBank) 1,4-alpha-glucan branching enzyme
Organism
syne
Synechococcus sp. PCC 6312
SSDB
Ortholog
Paralog
Gene cluster
GFIT
Motif
Pfam:
Alpha-amylase
AMPK1_CBM
CBM_48
Alpha-amylase_C
Malt_amylase_C
GHL6
DUF5696
GlgB_N
Motif
Other DBs
NCBI-ProteinID:
AFY60456
UniProt:
K9RSD8
LinkDB
All DBs
Position
complement(1241292..1242947)
Genome browser
AA seq
551 aa
AA seq
DB search
MTHPIEFQLFAPYNKAVALIGSFSAWEDIPMQQGEDGYFRAQVELEDGTYHYKFRVQSKS
WFVEPDQWLEVVDPYATDIDNSTQNGVVQIKNGKKIVDTYIWKHDDKPLPSDRELVIYEL
HVADFSGGEPDRYVRGKYKHVVEKLDFLADLGINAIELMPLKEYPGDYSWGYNPRYFFAA
ESSYGSTDELKNLIDECHARGIRVIMDGIYNHSESSSPLTQIDHDYWYHHSPRDPDNNWG
PEFNYDFYDENLDVKPAWTFIGDVVRYWIEEYHVDGIRYDAARQIANYDFMHWIVAETKK
TAGVKPFYNIAEHIPETTSITNVDGPMDGCWHDSFRSVITGHICGDMFDIEQLKDVIDCK
RKGFMGTTNVVNYLTNHDHNHILAELGNRNIFNDEAFKRAKLGAAILMTAVGVPLIWMGE
EFGEYKHNTQEQAKVEWALLDNDLNGELFEYYKGLIHLRKNNQALYVENIDFFHEDPNSQ
VLAYTRWNEEGSRVVVVANFSGNFWAGYTVPHFPANGTWHEWTGDYDVESGADNMMIDLA
EYEAKVFVWQG
NT seq
1656 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
atgacacacccgattgaatttcaattatttgccccctacaacaaagcagtcgccttgatt
gggtcattctcggcctgggaagatattccaatgcaacaaggagaagatggctatttccgc
gctcaagttgagctggaggatggcacctatcactataaattccgggttcagtcaaaaagc
tggtttgtcgagccggatcaatggttagaggttgttgacccctatgccacagatattgat
aattcgactcaaaatggggttgtccaaatcaaaaatggcaaaaaaattgttgatacctac
atttggaaacatgacgataaacccttgcccagcgatcgcgagttagtcatttatgaactg
cacgtggctgacttttctgggggcgaaccagaccgctatgtgcgcggtaaatataaacac
gttgtcgaaaagttagattttcttgctgacctgggtattaatgccattgaactgatgccg
ctcaaagaatatccgggggattatagctgggggtataacccgcgttacttttttgctgca
gaatcaagttacggctcaacggacgagttaaaaaatctgattgatgaatgtcacgcccgc
gggattcgggtcatcatggatgggatttacaatcactcagaatcgtctagtcccctgaca
caaattgaccatgattactggtaccatcattctccccgggatcctgataacaactggggg
ccagaatttaattatgacttttatgatgaaaacctagatgttaaaccggcctggacattc
attggtgatgttgttcgctattggattgaagaatatcatgtggatggcattcgctacgat
gcagcccggcaaattgctaattatgactttatgcattggatcgttgccgaaactaaaaaa
acagccggagttaagccattttataacattgccgaacatattccagagacaactagtatc
acaaatgtcgatggcccgatggatgggtgctggcacgatagttttcgttctgtaattacc
ggccacatctgcggcgatatgtttgatatcgaacagcttaaggatgtgattgactgcaag
cgaaaagggtttatggggacaactaatgttgttaattatctaaccaatcacgaccacaat
catatcctggcagaattgggcaatcgaaatatctttaatgatgaagcctttaagcgagcg
aagttgggtgcggcgatcctgatgacggcggtgggtgtgcccttgatttggatgggagaa
gaatttggtgagtataaacataacacccaagagcaagcaaaagttgaatgggcactgtta
gataatgatctaaatggggaattgtttgaatactataaagggctgattcatctgcggaaa
aacaatcaggctttgtatgtggaaaatattgacttttttcacgaagatcctaactcacaa
gtgcttgcttacacgcgctggaatgaggaaggctcacgggttgttgttgttgctaatttt
tcgggtaacttctgggctggctataccgttcctcacttcccagccaatggaacctggcac
gaatggacaggcgattatgatgttgagtctggggccgacaacatgatgattgacttggca
gaatacgaagccaaagtgtttgtctggcagggctaa
DBGET
integrated database retrieval system
