Synechococcus sp. PCC 7502: Syn7502_00897
Help
Entry
Syn7502_00897 CDS
T02371
Name
(GenBank) VCBS repeat-containing protein
Organism
synp
Synechococcus sp. PCC 7502
SSDB
Ortholog
Paralog
Gene cluster
GFIT
Motif
Pfam:
HemolysinCabind
Cadherin
Cadherin_CELSR2_9th
Big_9
Cadherin_4
Peptidase_M48
Motif
Other DBs
NCBI-ProteinID:
AFY73019
UniProt:
K9STA1
LinkDB
All DBs
Position
887850..895190
Genome browser
AA seq
2446 aa
AA seq
DB search
MAGLSDSLDNTFASVQNILQGFAQERDRFYSIFGQAFGSDFNITLAETIRSQWASGDFSQ
IPTIQILDSGMNGALGAYAASTNTIYLSEGFLALATPEQLTAVILEEIGHYVDAQVNTTD
TPGDEGEYFSRLVLGQSLSVAELTRIKTEDDTAIISVNGVSIQVEQASQSIGTKLSWNGS
SSIGYFGEGATPTFGQTFTVPSVSNPTLNNFTIYINDFLNSDVIDFGFYVMAWDGSKATG
PILYQSGVRSTTGFAGMEALVFDTNRLSLNPGQQYIAFVNASNFFDGQTGYGDVGFLGDY
YGGGSFWYQGGNFSSLTSSPWGNYGGDLAFQAEFSSNTASPTLASISPGTLTDTATYNTF
SNITGTLSGNDVDTDTTLTYGISGGTGGVTLVQNLVVDSQKNVASVGQPRVFSAPLTAGV
QYKVVVSGTWRPDYSRPNWEADARYVSNNAWSSAQDFDPNGYGDLGLYSSALGNSDDIWG
AYNSSHIYSTLVTGTGSAIDFFVQDVNYGDNLGVYQVAIYQIQTVTKAGTYGNLTLNPLN
GQYTYTPNNSAINALISNATDDFTLTVSDGRSSASRPFTVNITGANDIASISGISTANLT
EDANDPTLTASSNLSVSDVDSGQNKFNTTVSSSGNLGTLTITDTGTWNYSVANSAVQYLG
ATQTKTETFTVQSFDGTASQNVTITINGVNDTPTDLVLNTSSINENVAANSIVGSFTSTD
PDSSNTFSYSLVTGTGSTDNASFSIVNGNQLSINTSPDYETKSSYSVRVRTTDQGGLTYE
KALTIGVNNLNEAPTDLSLSATTINENVATNIVVGNFSSTDPDTGNTFTYSLVSGTGSTD
NASFSIINGNQLSINASPDYETKSSYSVRIRTTDQGGLSYEKALTINVNNLNEAPTITSG
ASINFAENGTGTVYTVTGTDPDAGNTLSYSISGTDSALFNVNSSTGAVTFKTAPNFEAPT
DNGANNVYDINVIASDGSLSDTKAVAISVTNVNEAPTAAALTNTLTTLAENSAINTGIKV
ADISITDDALGTETLSLTGTDASSFEIRGTQLFYIGASPNFEVKSSYTVNVIVDDTTVGS
TPDFTLPFTLNITDVNEAPTAAALTNTSPTLAENSVISTGIKVADISITDDALGTNSLSL
TGDDASSFEIRGTELFYIGASPNFEVKSSYTVNVVVDDTTVGSTPDFNLPFTLNITDVNE
APTAAALTNTSPTLAENSAINTGIKVADISINDDALGTETLSLTGTDASSFEIRGTQLFY
IGASPNFEVKPSYSVNVVIDDTTVGSTPDFTLPFTLNITDVNEAPTAAALTNTLTTLAEN
SAINTGIKVADISTNDDALGTETLSLTGTDASSFEIRGTELFYIGASPNFEVKPSYSVNV
VIDDTTVGSTPDFTLPFTLNITDVNEAPSVTSGTTSNFAENGTGTVYTVTGTDPDAGTTL
TYSIDGTDSALFDINSSTGAVTFKTSPNFEAPLDIGANNIYNIIVIASDTGSLFDTKAVA
ISVTDINEAPTAVELINNLTLTLAGNSAINTGIKVADISITDDALGTNLLSLTGTDASSF
EIRGTELFYIGTTVKSSYTINVVVDDTTVGNTPDLTLVLSGIVGGAGNDILTGTSGNDII
DGGLGTDTVKESADVNFILTNTSLTGLGTDTLISIESANLTGGIGNNILNASTFTLGSVT
LNGGTGDDTLIGGNSTDTLTGGLDNDSLNGGDGTDTVKESGDVNFTLTNTTLTGLGSDTL
FSIESANLTGGIGDNTLDASAFTLGSVTLNGGAGNDTLTGGTGNNTLIGGSGIDTVKESG
NVNFTLTNTSLTGLGTDTLNTIESANLTGGIGDNTLDASAFTLGSVFLDGGSGDDVLTGG
TKNDTLIGGNGDDTLTGGLGNDVLNGGNNTDTVKESGNVNFTLTNTSLTGLGTDTLISIE
SANLTGGIGNNTLNASTFIGAVILDGGGGNDILTGGTGDDTLIGGIGNDTLTGGLGNDSL
NGGDGTDTVKESGDVNFTLTNTTLTGLGSDTLISIESANLTGGISDNTLDASAFTLGSVI
LNGGAGNDTLTGGTGNDTLIGGSGIDTVKESGNVNFTLTNTTLTGLGTDTLNTIESANLT
GGIGDNTLDASAFTLGSVFLDGGSGDDVLIGGTKNDTLIGGYGDDTLTGGLGNDSLDGGS
GIDTVKESGNVNFTLTNTSLTGLGTDTLNTIESANLTSGIGNNTLNASAFTLGSVTLNGG
AGNDTLTGGTGDDILIGGDGTDTVKESGNVNFTLTNTTLTGLGTDTLNTIESANLTGGIG
DNTLDASAFTLGSVILNGGAGNDTLTGGFLNDSLFGGDGNDILNGVGSNNGVGSIDTLTG
NAGNAGNDTFILGSSTLAFYNDGNDNNAGLGDYALIKDFSSTLDKIQLYGAANLYVLGTS
PIGGVSGTAIYLDTNSNGAFSSTDELIAIVQGSGKLSLGSSYFSYV
NT seq
7341 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
atggcagggctatctgattctctagacaacacatttgcctcagtccaaaatatattacaa
ggctttgctcaagagagagatcgcttttacagcatttttggtcaagcctttggcagtgat
tttaatataacccttgccgaaaccattcgtagccaatgggcaagtggcgactttagccaa
attccgactattcaaatacttgacagtggcatgaatggggctttgggagcctatgcagct
agcaccaatacgatttatctatcggaaggttttttagcactagccactccagaacaatta
acggcggtgattctcgaagagatcgggcattatgttgatgctcaggttaacacaacggat
accccaggagacgagggggaatatttttcccgattagtattggggcaaagtctatcagtc
gcagaattaacgcgaattaaaacggaagatgatactgcgatcatttccgtcaatggagta
tcaatacaagttgaacaagcaagtcagagcattgggacgaaactgtcctggaatggatct
agttcaattggttactttggtgaaggcgcaactcctacctttgggcagactttcactgtt
ccttcagtctcaaatccaaccctaaataattttacaatttatataaatgactttttaaac
tcagatgtcattgatttcggcttttatgttatggcgtgggatggctccaaggcaactggt
ccaattttatatcaaagtggtgtgcgttcaaccacaggctttgcagggatggaagcactt
gtctttgacactaatcggcttagtctaaaccctggacagcaatatattgcttttgtaaat
gcatctaatttttttgatgggcagacagggtatggggatgtgggtttcctcggcgactat
tacggtggaggtagtttttggtatcaaggaggaaattttagttctttaacctcatcacca
tggggaaattatggaggagacttagcatttcaagccgaattctcttctaatactgcctca
ccaacactagcatcaattagccctggcactctcaccgacactgcaacctacaataccttt
agtaacatcacaggcaccctgtctggcaatgatgttgatacagatacaaccctaacctac
ggtatcagtggcggtacgggtggcgttacccttgttcaaaatttagtggttgattcccaa
aaaaatgtggcatcagtaggacagcctcgtgtgttttctgcccctttaactgcaggtgtg
caatataaagttgtagtttcaggaacttggagacccgattactctaggcctaactgggaa
gctgatgctcgttatgtaagcaataacgcatggtcatctgctcaagattttgacccgaat
ggttatggcgatctgggtttatattcttctgctctaggtaatagtgatgatatttgggga
gcatacaacagtagtcatatctattcgactttagtgacaggaacaggatctgctatagat
ttcttcgtccaagatgttaactatggggataatttgggagtctatcaggttgctatctat
caaatccaaactgttacaaaagctggcacctacggtaatctcacccttaatcctctgaat
gggcaatatacctacactcctaataactctgcaattaatgccctgattagtaatgcaacg
gacgacttcactctcacagttagtgatggtcgctctagtgccagccgacccttcaccgtt
aacatcacaggagctaacgatattgccagtattagtggtatatcaactgccaatcttaca
gaagatgctaatgatccaactctcacagcatcgagtaatctcagcgttagtgatgtggat
tctggacaaaacaaattcaacaccaccgtctcttcttcaggaaatctaggtactctgaca
attacggacacaggaacctggaactatagcgtcgccaatagtgcggttcagtatttaggt
gctacacagactaaaacagagacttttactgtgcagtccttcgatggcaccgccagccag
aatgttaccattactatcaatggcgtgaatgatacaccaaccgatttagtcctcaacact
agtagtattaatgaaaatgttgcagccaattcgattgtgggcagctttaccagtaccgat
cccgatagtagcaacaccttcagctattctttagtaactggcacaggcagcaccgataat
gcatcctttagcatcgtcaatggcaaccagttaagcatcaatacttcaccagactacgaa
accaagagtagctatagcgttcgagttcgcaccaccgatcaaggcggattgacttatgag
aaagccctaactattggggtcaacaatcttaatgaagctcccactgacctaagtttaagt
gccactaccatcaacgaaaatgttgctactaacatcgttgttggcaacttcagcagcact
gaccccgacacaggtaatacatttacatacagcctagtttctggcacaggcagcaccgat
aatgcctccttcagcatcatcaacggcaaccagttaagcatcaatgcttcacccgactac
gaaaccaagagtagctacagcgtccgcattcgcaccaccgatcaaggcggattgagctat
gaaaaagcgctgaccatcaatgtcaataatctcaacgaagccccgactatcacttcaggc
gcaagtataaatttcgctgaaaatggtacgggcacagtttataccgtcacaggaaccgac
cccgacgctggaaacacccttagctacagtatcagtggaaccgattcggctctgttcaat
gttaacagcagcacaggagccgtcaccttcaaaaccgcacctaactttgaagctccaacc
gataatggcgcaaacaatgtctacgacatcaacgtcattgccagcgatggttccctcagc
gataccaaagccgtagcgattagcgtcaccaacgtcaacgaagcccccacagccgctgcc
ttaaccaataccttaaccacactggcagagaacagtgcaatcaatacaggcatcaaagtt
gccgatatttccatcactgatgatgctttaggaactgaaaccctatccttaacaggaacc
gatgcatctagctttgagattaggggcacccaactcttctacattggagccagtcctaac
tttgaagtcaaatctagctataccgtcaacgtaatagtagatgacaccaccgtcggcagc
actccagacttcaccctaccatttactctaaatatcaccgatgttaatgaagcccctacc
gccgcagccttaaccaatacctcacccacattagcagaaaatagtgtaattagtactggt
attaaagtcgcagatatttccatcactgacgatgctctaggaacaaactcactatcttta
actggagacgatgcatctagctttgagattagaggtactgaactcttctacatcggagcc
agtcccaactttgaagtgaaatctagctataccgttaacgtagtagtcgatgacaccact
gttggcagcaccccagacttcaacttaccttttactctaaatattaccgatgttaatgaa
gctcccacagccgcagccttaaccaatacctcacccacattggcagagaacagtgcaatc
aatacaggcatcaaagtcgcagatatttctatcaatgacgatgctctaggaactgaaacc
ctatccttaacaggaaccgatgcatctagctttgagattaggggcacccaactcttctac
attggagccagtcccaactttgaagtcaaacctagctatagcgtcaacgtagtaattgat
gacaccaccgtcggcagcaccccagacttcaccctaccattcactctaaatattaccgat
gtcaacgaagctcccacagccgcagcattaaccaataccttaaccacattggcagagaac
agtgcaatcaatacaggcatcaaagtcgcagatatttctaccaatgacgatgctctagga
actgaaaccctatccttaacaggaaccgatgcatctagctttgagattagaggtactgaa
ctcttctacatcggagccagtcccaactttgaagtcaaacctagctatagcgtcaacgta
gtaattgatgacaccaccgtcggcagcaccccagacttcaccctaccattcactctaaat
attaccgatgttaatgaagccccaagcgttaccagtggcacaacatcaaacttcgctgaa
aacggaacaggaaccgtctacaccgtcacaggaaccgatccagatgcaggaactaccctg
acctatagcatcgatggaaccgactcggcactgtttgacatcaatagcagcacaggcgca
gttaccttcaaaacttcacccaactttgaagcacccttagacatcggcgcaaataacatc
tataacatcatcgtaattgctagcgatactggctctcttttcgatactaaagctgtagcg
attagcgtaactgacatcaacgaagctccgacagccgtagaattaatcaataacttaaca
ctaacacttgcagggaatagtgcaataaatacaggcatcaaagttgccgatatttctatc
accgatgatgccctaggaacaaacctcttatccttaacaggaactgatgcatctagcttt
gaaattagaggcactgaactcttctatatcggaacaaccgttaaatctagctataccatc
aacgtagtagttgatgatacaaccgtaggcaacactccagacttaactttagtacttagc
ggtatagttggtggggctggcaatgatattctaacaggtacttctggcaacgatattatt
gatggtggtttaggtacagacacagtaaaagaatctgccgatgtcaactttatattgact
aataccagcttaactgggctagggacagacacattaattagtatcgaatctgcaaattta
acagggggtattggcaacaatatacttaatgcctctacgtttaccctaggctctgtaacc
ctaaatggtggaacaggagatgatacattaatcggtggaaatagtactgatactttaaca
gggggactcgacaatgactcccttaacggtggagatggtacagacacagtaaaagaatct
ggcgatgtcaatttcaccctaaccaataccacattaactggactaggctctgacacctta
ttcagtattgaatctgcaaatttaacaggtggcattggcgacaatacgcttgatgcttct
gcctttaccctaggttctgtaaccctaaatggtggtgcaggaaatgatactcttactggc
ggaacaggaaacaatacattaatcggtggtagtggaatagatacagtaaaagaatctggc
aatgtcaatttcaccctaaccaacacctccttaactggactagggacagatacgttaaat
actattgaatctgcaaatttaacaggtggaattggcgacaatacacttgatgcctctgcc
tttaccctaggttctgtatttctagatggcggatcgggagatgatgttcttactggtgga
acaaaaaacgatacattaatcggtgggaatggtgacgatactctaacaggaggacttggg
aacgatgtcctcaacggaggcaataatacagataccgtcaaagaatctggaaatgtcaat
ttcactttaaccaataccagcttaactgggctggggacagacacattaattagtatcgaa
tctgcaaatttaacaggtggaattggtaacaataccttaaacgcttctacctttatagga
gcagtcattcttgatggcggtggaggaaatgatattcttactggtggaacaggagacgat
acattaatcggtggaataggaaatgatactttaacagggggactcggcaatgactccctt
aacggtggagatggaacagacacagtaaaagaatctggcgatgtcaatttcaccctaacc
aataccacattaactggactaggctctgacactttaatcagtattgaatctgcaaattta
acaggtggcattagcgacaatacgcttgatgcttctgcctttacattaggttctgtaatc
ctaaatggtggtgcaggaaatgatactcttactggcggaacaggaaacgatacattaatc
ggtggtagcgggatagacacagtaaaagaatctggaaatgtcaatttcaccctaaccaac
accacattaactggactagggacagatacgttaaatactattgaatctgcaaatttaaca
ggtggaattggcgacaatacacttgatgcctctgcctttaccctaggttctgtatttctg
gatggcggatcgggagatgatgttcttattggtggaacaaaaaatgatacattaatcggt
ggttatggtgacgatactctcacaggagggcttggcaatgactcccttgatggcggtagt
ggaatagatacagtaaaagaatctggaaatgttaatttcaccctaaccaataccagctta
actggactaggaacagatacgttaaatactattgaatctgcaaacttaacaagtggaatt
ggtaataatacgctgaatgcctctgcctttaccctaggttctgtgaccctaaatggcggt
gcaggaaatgatactcttactggcggaacaggagacgatatattaatcggtggagatggt
acagacacagtaaaagaatctggcaatgtcaatttcaccctaaccaacaccacattaact
ggactagggacagatacgttaaatactattgaatctgcaaatttaacaggtggaattggc
gataatacgcttgatgcttctgcttttaccttaggttctgtaatcctaaatggtggtgca
ggaaatgatactcttactggcggattcctaaatgattctttgttcggtggggatggcaac
gatattctcaatggagtaggtagtaacaatggagtaggttctattgatacccttacagga
aatgcaggaaatgcaggaaatgatacttttattcttggttcaagtacgctcgctttctat
aacgatggaaatgacaataatgcgggattaggagattatgctttgatcaaagatttcagt
tctactttggataaaattcaactatatggtgctgctaatctttatgttttgggtacttcg
ccaataggtggggtgtctggtacagctatctatttagatacaaatagtaatggagctttt
agctctacagatgaattaattgctattgttcaaggctcgggtaaactgagtctaggttct
agctattttagttatgtttag
DBGET
integrated database retrieval system