Synechococcus sp. PCC 7502: Syn7502_01074
Help
Entry
Syn7502_01074 CDS
T02371
Name
(GenBank) PAS domain S-box
Organism
synp
Synechococcus sp. PCC 7502
SSDB
Ortholog
Paralog
Gene cluster
GFIT
Motif
Pfam:
Response_reg
HATPase_c
HisKA
GAF
PAS_4
Hpt
PAS_9
PAS
PAS_8
CBS
GAF_2
GAF_3
PDE8A_N
FleQ
Cut8
PAS_3
Motif
Other DBs
NCBI-ProteinID:
AFY73184
LinkDB
All DBs
Position
complement(1087170..1090943)
Genome browser
AA seq
1257 aa
AA seq
DB search
MVIDMTSQQINWLERLPLIVSPNTKLSDAIAQVNSQINFQSNSQIGQGFSYILVANEVIG
IITEREIVSLVTKGTINPELTVGDVCKTTLPLISETELLANSSPDQVLTILRSHQAQYLG
VLGSDQQILGVITLEDILLRSPLSLNSHNPREIDPNNGYFQKLVEISPYAIMIYDSDLRF
HFINSAGVQLLGGNSLEEILQEPISKFIHPSQHQILDDRIKRNFDGESLPQQEYKLVRMD
GAIIDVELNCASLGKLGDKLLGITIATDITNRKITEQALKDSEQRLKSFTSYAPAMIHIK
DREGKYLFANLEFQSALQLAETEVIGRTAYNFFGLEQAEHITDKDQKILKEAVVISDEEV
IDLFDGSHTYITTRFPLIDSHNLPYAVGTIAFDISDRKTTEAILQEKLRQEQLIFQISNR
IRRTLNLEDIFSTTVVELREVLSCDRVIIYRFNPDWSGLLVAESVGSGWISLIEGQSNGI
VIENSAVDSDRCIVKQMEELDQMSSDVVDTYLQNTQGGGYRSGTHLCINDIYKAGFSTCY
VELLETIQARAYLIVPIFQGQQLWGLLAAYQNSAPRTWKENEVAIAIQIGSQLGISVKNA
ELFSQVQKQALELKVAKEAAEAANQAKSEFLAMMSHEIRTPMNAVIGMTGLLLDTQLNNE
QRNFVETIRMGGDALLNVINDILDFSKIEANRMELEIEPFSIQACVEEILDLFAPKITEK
KIELAALIDPKLPSVINGDAGRLRQILINLVSNGIKFTEKGEVTIVVTYIENSAVDCLVQ
FKIKDTGIGIKDEQIGRLFQPFAQADSSITRRYGGTGLGLVISKRLCEMMGGTLTVNSQI
GVGSTFSFTIPVACGHDLPETILEDDLKGKRILIVDDNATNRHILTIQLQGWGMLVQSAG
LGREALDILEIDPNFDLAILDLKMPEINGAELAIALQEKGHTFPIILLTSLDYHRKIEAA
AATLSKPVKSSQLLKTLLRIFSLHGSEVTEISHPQVSGLTKPLQILLVEDNAINQKVAVA
MLERFGYNPAIAGNGKEAIVMTEQQRFDLIFMDIHMPEMDGLTATRIIRSQDLQNIKNGR
GNRPRIVAMTANVFQEAIAECFEAGMDDYISKPVLTEELAKVIERCQPSTTGVNSKRVIN
PNVIKSLLEYLSVESLAKIIDEYITTTPELIQTLESQLQQQDFDKLYFSAHNLKSTSGSL
GAVSMAELARTIEKQAKLANTRQLGNLIAELDHEYEQVKEGFRAELAALKSQTQSLN
NT seq
3774 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
atggtgatagatatgacttctcagcaaattaattggctagaacggctgcctttgatagta
agcccaaacacaaaactatctgatgcgatcgctcaagttaattcccagatcaattttcag
agtaattctcagatcggtcaaggttttagctatattctggttgcaaatgaagtcataggc
attatcacagagagagagatagtttccttagtaacaaaggggacaatcaacccagaacta
accgtaggagatgtatgtaaaaccactttacccttgatttctgaaacagaactactggca
aattccagccccgatcaagttttaacgatcttgcgtagtcatcaagctcagtatttaggg
gtattgggttcagatcaacaaattttgggcgtaattacgttagaggatattttgctgcga
tcgccccttagtcttaattcccataatcctagggagattgatcctaacaatggatatttt
cagaaattagtagaaattagcccctatgcgattatgatctatgattctgatctgaggttt
cactttatcaattcagcaggagtgcagttactaggggggaattccttagaggaaattttg
caagaacccatttctaaatttattcatccttcccaacatcagattttagatgatcgaatc
aagagaaattttgatggagaatctttaccacagcaggagtacaaattagtacggatggat
ggagcaatcattgatgtggaattgaattgtgcttcattgggaaaattgggggacaagttg
cttgggatcacgatcgccacagatataaccaatcgcaaaattacggaacaagctctaaaa
gatagcgaacaaagactaaaatcctttactagttatgctcctgccatgattcatattaag
gatcgtgagggcaaatatctctttgcgaacctagaatttcaatcggctttacaactggct
gaaactgaagtgattggcagaaccgcatacaatttttttggcttagaacaggctgaacac
attactgataaggatcagaagattttaaaggaagcagtcgtgatctcggacgaagaagta
attgatttatttgatggctcccatacctacattactacccgatttccacttatagactcc
cataatttaccctatgctgttggtaccatcgcctttgacattagcgatcgcaaaactacg
gaggcaatattgcaagagaagctacgccaagaacaattaatatttcagattagtaatcgg
attcggcgtaccctgaacctagaagatatattcagtaccaccgttgtggaattgcgtgag
gtgttaagctgcgatcgggtaattatctatcggtttaatcccgattggagtggattattg
gttgctgagtcggtgggatcgggttggatttccctaattgaaggacaaagtaacggcatt
gtgatcgaaaatagtgctgtagatagtgatcgctgcattgtcaaacaaatggaagagttg
gatcaaatgagcagtgatgtggttgatacctatctccaaaatacccaaggtggtggctat
cgttctggtacccatctttgcattaatgatatttataaagcgggattttctacctgctat
gtggagcttttagaaactatccaagcaagggcatacctaatcgtaccaatttttcaagga
caacaactctggggactgttggctgcctatcaaaattctgcacctaggacatggaaggag
aatgaagtagcgatcgccattcaaattgggagtcagttgggaatttccgttaaaaatgcc
gagttatttagccaagtgcaaaaacaagcattggaactaaaagtcgccaaggaagcggca
gaggcagcaaaccaagcaaagagcgaatttttagcaatgatgagtcacgaaattcgtacc
cctatgaatgcggtgatcggtatgactggattacttttagatactcagttaaataatgaa
caaagaaacttcgtagaaactatccgtatgggcggagatgccttacttaacgtgatcaat
gatattttagatttctctaaaattgaagcaaatcgcatggaattggagattgagccgttt
tcgatccaggcatgtgttgaagaaatcctagacctatttgctcctaaaatcaccgagaaa
aagattgaactagcagctttaattgatcccaaactcccatcggttattaatggagatgca
gggcgactgcgccaaattttaattaacctagtcagtaatggcattaaattcacggaaaaa
ggtgaagtcacaattgttgttacttatatcgaaaattccgccgtagactgtttagtccaa
tttaaaattaaagatacaggcattggcattaaggatgagcagataggaagactatttcag
ccctttgcccaagcagatagctctattaccagacgatacggcggcacgggtttaggctta
gtcatcagtaagcgactgtgtgaaatgatgggtggtaccttgacagttaattcgcaaatt
ggcgttggttctacttttagctttacgattccagttgcctgcggtcatgatctcccagaa
actatacttgaagatgacctcaagggcaaacgcatattaatagttgatgataatgccacc
aatcgccatatcctgaccattcagctacagggttgggggatgcttgtccaaagtgctggc
ttagggagagaggcactggatattttagaaattgatcctaattttgatttggcgatcctt
gacttaaaaatgcctgaaatcaatggagcagaattggcaatcgctcttcaggaaaagggg
catacatttccgattatccttctaacttccttggattaccatcgtaaaattgaagctgct
gccgctactctcagcaaaccggttaagagttcccaactgctcaaaactctactgcggatt
ttttccctgcatggttctgaggtgaccgaaatatctcacccacaggtttctggattgact
aaacctctgcaaattctcttggtagaagataatgccattaatcaaaaagtagctgtggca
atgctagaaagatttggttataaccctgcgatcgctggcaatggcaaagaagctatagtc
atgaccgagcagcagagatttgatctgatttttatggatattcacatgcccgaaatggac
ggattaacagccacccgcattattcgtagtcaggatttacaaaatataaaaaatggcaga
ggaaatcgccctcggattgttgccatgactgctaatgttttccaagaggcgatcgctgaa
tgctttgaagcaggaatggatgactacatcagtaagcccgtattaacagaagaactagct
aaagtaattgaacgttgccagccatcaaccactggggtgaactccaaacgggtgattaat
cctaatgtcatcaagtcacttttagaatatttatccgttgaaagtctggctaaaattatt
gatgaatatataaccaccacccccgaactaattcaaacattagaaagccaattacaacag
caggatttcgataaactgtatttttccgcccataacttaaaatctactagtggtagttta
ggcgctgtcagtatggctgaattagcaagaactattgaaaaacaggcaaagctggcgaat
acccgtcaattaggaaatttaattgctgagcttgaccatgagtatgagcaagtcaaagaa
ggttttagagcagaattggcggcactcaaatctcagactcagtccttaaactaa
DBGET
integrated database retrieval system