Pseudanabaenococcus habilitatus: Syn7502_03431
Help
Entry
Syn7502_03431 CDS
T02371
Name
(GenBank) TPR repeat-containing protein
Organism
synp
Pseudanabaenococcus habilitatus
SSDB
Ortholog
Paralog
GFIT
Motif
Pfam:
TPR_12
TPR_1
TPR_7
TPR_10
TPR_2
TPR_8
TPR_14
TPR_MalT
TPR_16
CFAP70_TPR_C
TPR_11
TPR_19
Rapsyn_N
TPR_NPHP3
TPR_6
RMD1-3
SNAP
TPR_SusR
MIT
ANAPC3
DUF3856
TRAPPC9-Trs120
DUF2753
ARM_TT21_4th
ARM_TT21_C
Motif
Other DBs
NCBI-ProteinID:
AFY75280
LinkDB
All DBs
Position
complement(3364053..3367820)
Genome browser
AA seq
1255 aa
AA seq
DB search
MANVSEQVQPQNLSPSLEPLPPIDEKFDLEQIASWEALADLVEGSLAQVISSEVVDQDQS
EDEAERLEVAEFEVLPNFINPPSLNVNQNFERILIPASLDLALANQNLTIVTDVIDLSAL
ITWFQAHEGTKFWVDADIYSFTDFARWAIAHLTTSEKLLITPDHHLIATLVDLIQAHPCL
IVITKIDQSSQREFWLDFLQVSQDIASQSTSKITSKIIVTSCHSLKSELALIPELKLSES
LSPSLAADFLSAKGILGDRQDLETFGQLVGGNLLSLTLAASLLKTEEQIPQIRYLARYGK
IFDLSYSQSHGNNKAIAPRQVFERSFKRLLPKLRQLLIYASIYRHPFYIQDMQGIWAFES
NGESIEITELQKLEKLGLLRQLGQNYFYCEPHIREFITIADAKPYHEQIIKYLWTQTKPY
VEWESDQDIQPYVGIFEHCCALGEYYRGFYLIQDGTNQCVDKYLDSEGKYIQRISLLQPL
LSAWQEIKSDRPEFGAVLMGLGNAYTALQKYAQAIPLFQLWLDILGKKNDPASQPDRAQC
LYALASVLAKNNPELWSQVLAYYQESLEIAVKLGDRSLELQNLLGIGNLYARQGEYIHSL
EYYERYLGLARELKDTQSQIHGLPMIADAYKQVKQYAKAIELARIHLNLIANQDKYQNLR
ANSLEHLAHTLQILGQYAEAKTNYQECLALEPDQLEQRGKCLIGLGICSDRLGQYKEAIS
YHQQALEIFTDHDLEPECLINLGNAHNSLGQYKEAVGLYDKALKLSLKTSDRHRQAKSLI
GLGNVQTSLGKFVKAIQFYEQAWEVSLDHSEQKAIALRNLGNAYNTIGQYQEAMELYKQS
LSIAKELGDLNQQAYCLHSLGQVLDQLGYYAQALKFYEQWIDLKKDMGDRSASLSSLNRS
SNLSSLVNTKYAQAIEFHQQWIEIKRKMSDAKGEANSLGNLGNAFFAIGQYPQAIQAYQQ
CLEIARSISDRRSEASSLSGLGSAFFVLGQYTQAIELHARSLEIAQKIDDLMLQAKASSN
LGRTYYTLGQYLPASEQYLRCLVLSQKIGNRQGEANALGDLGNTNYALGKYPQAIHFYQQ
WLHIAQEIGDRSQQGNAFGGLGNSHNALGQYSKAVEFYRQWLEVAQEISDRRSQANALAG
LGNAYNALGDYTRAIEFHQQSLKLQKENSDRPTEIGTWTNFVETLEALEQKSLTANPYKS
IDVQSSQQDDSAIQQLLEAGSTLSIQINPPIQKNKPRPSKNWFDSMLGKLGGKKP
NT seq
3768 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
atggcaaatgtaagtgagcaagtacaaccacaaaacctcagccctagtttggagccatta
ccacccattgatgagaaatttgacctagagcagattgctagttgggaagcattggcggat
ttggttgaggggtctttggctcaagtcattagctctgaagttgtagatcaagatcaatca
gaagatgaggcagaaaggttagaagtagcagaatttgaggttttaccaaattttattaat
ccgccttccctgaatgttaaccagaattttgaacggattttaatccccgcaagtttggat
ttagccctagcaaaccagaatttgactatcgtaactgatgtgatcgatctgtcggcattg
atcacatggtttcaagcccatgaaggtactaagttttgggtggatgcggatatatatagt
tttacggattttgctcggtgggcgatcgctcatttaaccacctccgaaaaattattaatt
actcctgatcatcacctaattgccaccttagttgatctaattcaagcccatccctgtttg
attgttattaccaaaatagaccaaagtagtcaacgggagttttggctagattttctccaa
gtttcgcaggatatagcatctcaatcaactagcaaaataaccagtaagataatagtcacc
agttgtcattctttaaagtcagaattagcattaatacctgaattaaaactttcagaatcc
cttagtccttcactagcagcagattttttaagtgcaaagggcatattaggcgatcgccaa
gatttagaaacctttggacaacttgtgggcgggaaccttctatctctaactttggcggca
agtttactaaaaaccgaagaacaaattccccagattcgctacttggcaagatatggcaag
atttttgatttaagttactctcaatctcacggcaataataaagcgatcgctccccgtcag
gtatttgaacgcagctttaagcggttattaccaaaactacggcagttattaatttatgcc
agtatttatcgccaccccttctatattcaggatatgcaggggatttgggcatttgagagt
aatggcgaatccatagaaattacggagttgcaaaagttagaaaaattaggcttgctgcgg
caattgggacagaattatttttattgtgagccgcacattcgggaatttattaccattgct
gatgctaaaccttaccatgaacaaattattaaatatttatggacacagactaagccctat
gtggagtgggaaagcgatcaggatattcaaccctatgtgggaatttttgagcattgctgc
gccctaggggaatattatcgaggattttatttaattcaagatggtaccaatcaatgtgtg
gataaatatttggattcggagggcaaatatattcagcgcattagcctattgcagccttta
ttaagtgcgtggcaggagattaaatccgatcgccctgagtttggggcagtgttaatggga
ttgggtaatgcctatactgctctgcaaaaatacgctcaggcaattcctttatttcaactg
tggctagatattttagggaagaagaatgatccagcatcccaaccagatcgggcgcagtgc
ctatatgccttggcttctgttcttgctaaaaataatcccgaactatggtcacaggtctta
gcctactatcaagagtccttagaaattgcggttaaattgggcgatcgctcccttgaactc
caaaaccttttagggattggtaatctctatgctaggcagggggaatatatccatagcttg
gaatattatgagcgctacttagggttggcaagggagttaaaggatactcaatcccaaatt
catgggctaccgatgatcgctgatgcttataaacaagtcaaacaatatgccaaggcgatc
gaactggctcggattcatcttaatctcattgccaatcaagataaatatcaaaacctgcgg
gcaaattccttagaacatttagcacataccttacaaattttaggacagtatgctgaggct
aaaacgaattaccaagaatgcttagccctagagccagatcaacttgagcaacggggtaag
tgtctgatcggtttgggaatttgcagcgatcgcctcgggcagtataaagaagcaattagc
tatcatcaacaggcactagaaatatttaccgatcatgatctggagccagaatgtttaatt
aatctcggtaacgcccataattccctaggacaatacaaagaggcggtgggtctctatgac
aaggcattaaaactatccttaaaaactagtgatcgccatcggcaagcaaagtccctgatt
gggttaggaaatgtccaaacctccttgggtaaatttgtgaaagcaattcagttctacgag
caggcttgggaagttagtctagatcattccgaacaaaaggcgatcgcccttagaaatctc
ggtaatgcctataacaccattggacaataccaagaagcaatggagctttataaacagtcc
ctgagtattgccaaagaacttggtgatcttaatcaacaggcgtattgcctccatagttta
ggacaggtgttagatcagttgggatactatgcccaagccttaaagttttacgaacaatgg
attgatctaaaaaaagatatgggcgatcgctctgccagcctatccagcctaaatcgcagt
agtaatctgagttctcttgttaatactaaatacgctcaagcgatcgaatttcatcaacag
tggatcgaaattaaacgcaaaatgagcgatgccaagggagaggcaaactccttaggtaat
ttaggtaatgctttttttgccattggtcaatatccccaagctattcaagcctatcaacaa
tgcttagaaattgcccgatccattagcgatcgccgttccgaagccagttccctaagcggt
ttaggttcagcattttttgtgctcggacaatatacccaagccatcgaactccatgcccgt
tccttggaaattgctcaaaaaattgatgatttaatgttacaggcaaaagcctccagtaat
ttgggacgtacctactacaccctggggcagtacttacccgcctccgagcagtacctgaga
tgtctagtactatctcagaagattggtaaccgccaaggagaagctaatgccttaggcgat
cttggtaatactaactatgcccttggtaaatatccccaagcaattcatttttatcaacaa
tggctgcatattgcccaagaaattggcgatcgctctcagcaaggtaatgccttcggaggt
ttaggtaatagccataacgccctaggacagtatagtaaagccgtagagttttatcgacag
tggttagaagttgcccaagagattagtgatcgccgttcccaagcaaatgcccttgcgggt
ttaggtaatgcttacaatgccctcggagactacacccgtgccattgaatttcatcagcaa
tccttaaagttgcaaaaggaaaatagcgatcgccccacggaaatcggaacatggacaaat
tttgttgaaaccctagaagctttagagcagaaaagtctcaccgccaatccctataaatcc
attgatgtccaatccagccagcaagatgacagtgccattcagcaacttttagaagctggt
tctactttatccatccaaattaatccaccgatccaaaaaaacaaaccccgtccttctaaa
aactggttcgactcaatgttgggaaaactaggcgggaaaaagccttaa
DBGET
integrated database retrieval system
