Synechocystis sp. LKSZ1: OLK001_16770
Help
Entry
OLK001_16770 CDS
T10519
Name
(GenBank) hypothetical protein
Organism
syns Synechocystis sp. LKSZ1
SSDB
Ortholog
Paralog
GFIT
Motif
Pfam:
Cadherin
Calx-beta
GEX2
Beta_helix
Ig_CLSTN
SprT-like
Motif
Other DBs
NCBI-ProteinID:
BFM39751
LinkDB
All DBs
Position
1834395..1843946
Genome browser
AA seq
3183 aa
AA seq
DB search
MNPFPLEFAIVYEQLTAFAGLESFWASFNTAFGSEYDFAKVENLRIQWLNQDFSQLPTIQ
VLGSGLGLIVGAYAQSTNTIYLSQSFLATATPEQIQAVLLEEIGHYVDSLVNSVDSEGDE
GEIFSALVSGVGLNKLELQTIKAQNDHFTIFVDGQSLQVEAATITVTNTNDSGAGSLRNA
IASAASGDTINFSSLFNTAQTIILTSGQLVVNKSLTIQGPGANLLTISGNNASRVFVIDD
NNENNAETVEISGLTISGGLVTTGSGGGIFNLENLSLRNSTLSGNSADSFGGGIFNRIGT
VTVSNSTISGNSTTVFAGGGIFNDMGTVTVSNSTISGNSTRFGGGIFNDMGTVTVSNSTI
NGNSANLTGGGIVNNAGTTSLTTTIVANNIAGNGDGNNLLLSDGTINASNSLIESNADLI
NGTNSNNIFGVDPLLGSLQNNGGTTLTHALLPGSPAIGAGNTTPSTDQRGISRPQGTNGD
IGAFEYVPPIVNITATDNTATEQSGNTGTFQLTRDLPTGATNTALPVQLTLSGTASASDY
NFSASGGTVNASNNTVTVTFNSGSNTVNVTVTPVDDIQAEANETVILTLNGGSLNYDLGA
NTSGTVTISQNDFVVINTNDSGEGSLRQALLNANDISGANTITFAGVFTDATPDTITLTT
GQLSITDSVTIQGPGANLLTISGNNASRIFSFGNTGPQTYNILGLTLTGGTVDRGGAIAM
SDDNDILNIDRVAITGNTATAYGSGIAIAGGSTLNLTDSGIYYNNASGGGGSSVYIENSK
ANLSNVTVSNNTGNVFWGGSILNFSDASDRTSTVTLLNTTIANNQNYGLYNYGQSGGSPT
TNYSNSIFSNNSIENFNGQAISQGNNIESGTNALLGPLQNNGGTTLTRALLPGSPAIGAG
NTSLTTDQRGISRPQGTNDDIGAFEYVSPTVSLTATDNTATEAAGNTGNFQLTRVIPSGG
LSDALPVQLTLSGTASASDYNFSVSPSEGTVSASSNTVTITFNAGSNTVNLTVTPVDDIQ
AEANETVILTLNSGTPNYDLGANTNGTVTISQNDFVVINTNDSGEGSLRQAILNANAISG
ANTITFAIPGGGVKTINLLSALPNITEQVTIDGTSQTGFTGTPLIELNGTSAGSGANGLT
LTTGSSGSVIQGLIINRFSSGAGIFVNSSNNKIQKNYIGTNAGGTSGAGNSFGVSVNSGN
NNIIGSDEDGNNDASEGNLISGNGNVGVLFFGSNNFIRGNYIGTNFDGTSAIGNGIHGIY
IGSSNHNIGGSTATARNIISGNSFSGVAIFANLASNASNNIVQGNYIGTDISGNNPLGNG
SGGGVRITGANNTIGGTGAGEGNIIANSAGNGVYVTDAFNASPSLNNAGNNISGNNIFNN
TGLGIDLATVQGDSEVGITPNDLLDSDAGVNNLQNYPLLIKDNNGTVQGRLNSAPNTIFR
IEFFSNTNVDPSGNGEGQTYLTFQNITTDGNGNASFTFTPPGGSLNITATATDPQGNTSE
FSSPAIVPVVTITAIDATANEAGDPGTFRVSRTGAPIVPLTVSYAVSGTATNGSDYNSLS
GTVTIPVDQTFIDIAINPIDDIQAEANETVILTLSNSVNYIQGANTNGTVTISQNDFVVT
NTNDSGEGSLRQAILNANAISGGNTITFAIPGGGVKTINLLSALPNITEQVTIDGTSQTG
FAGTPLIELNGASAGAVNGLTLGAGSNGSIIQGLVINRFGSGNGILVQSNNNTILGNFLG
TNADGTSAQANLRGVYIDGGSNNVIGSSTIASRNLISGNTQQGIVIDKASAIGNKVKGNY
IGTNLAGTAALANGFHGIQIQGGSKNNIVGIDGDGANDATEGNLISGNAQIGVITENTGT
TGNIIAGNLIGTNAAGTSAISNNTGIYIANGAENTRVGTDSNGVSDSLERNIISGNTSFG
IWNLNNAGNHRISGNYIGTDINGTTDLGNGSDGILVNGSANNTIGGNQVSDRNVISGNNR
YGILLTSATTTGNTIQGNYIGTNASGTGAIGNSNAGIRLESGTANNLIGTNGDSVNDLAE
GNVISSNSVGISIASNTTTNNTIAGNKIGTNAAGTANLGNTTQGILISDSPNNTIGGTVL
NAGNLIVGNTQQGIAITGNTATGNKIQGNSLSSNGTLGVDLGADGITANDLGDGDAGPNG
LQNAPRLSLAPNGIVQGQLNSTPNTTFRIEFFSNTNPDPSGYGEGQTFLNFISVTTDGSG
NASFTFDPSAASNITATAIDPSGNTSEFSNVAAQTSPTFTLLTDNFTAFYNPTITNLDYN
LVGRQGGLLATTRWIPNTTTAQVGNPTPNIDQGNYLLLSSSGRAALDRNFNGINAQGGLK
ISFELAPNATNTNSTWWGGISLGLSEANKNIFINNNVPHFGILFRGNGGIQAFDANSDVS
GVNSGWGGTGNSSTLYPFSLELTDPTDGNPFNGIGQTKVEVFAGNNLIYTYTKGNGGYSD
NYINLGTTGTSGFDNFKLEKLGRVPFAENATGTVYTATAIGDPLRNPSLVYSLDGPDKNL
FNISQTGEISFKVAPNFEAATDAGEDNIYNLTVIASDANLTGSQNVTITVTNVNEAPINS
VPDGQTTNEDTVLVFSASNSNLISISDIDAGSNLVQVALSVTNGVLTLSGTTGLSVTSGS
NGSGSFTIQGTVANINGALNGLTYLGNSNFNGSDSLQIVTNDLGNTGTGGALTDTDTMTI
TVNAVNDAPINTLPSTFSVDEDTNLTLTGLSIADVDAGAEPVTVTLSVNSGTLAATTGGN
VTVTDSGTSSIILTGTVAAINAFLAGGSAPVFSPISNFNGDVLLTLITNDQGNTGSGGAK
SATDTSTITVNSVNDAPSITSGATASIAENSPVSTVIYTGTATDPDTTAPNNTVSFSLNG
PDKDSFTIDSDDGEVRLKNPANFEVQNSYNIEVVVTDGGNPALSDTKAVTIQVLDVTERF
TTPNRDSINTGPGNDFVTTTLDNLRQRDSINGGAGNDTLVLEGPGSTTPLEINLSNSSQV
LVQPNFIGLPIPFLFFPVPWSQSSVKGFENVDASGFTGNLNLTGSNLSQTLKGGSGADRI
FGLGGDDLIDGGLGADELTGGLGNDMVYLGNDSARDKVYYSAGDGTDTVFQFSRANDQIL
FSGIANIDVVSNGSNTEFRVGDGNIGNPGFATGSLLVSLTGVTGFDSTDASNGVISGATF
SFS
NT seq
9552 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
atgaatccatttcccctagaattcgccatagtctacgaacaacttactgcctttgctggc
ctggagagtttctgggcctctttcaatacagcctttggcagtgagtacgatttcgccaag
gtggagaatctgcgaatccagtggttgaaccaggattttagtcaactaccaaccatccag
gtcttgggcagtggactagggctaattgtcggggcctatgcccaatccaccaataccatt
tatctgtcccagtcctttttagcaacggccacaccagaacagatacaagccgtcctgctc
gaagaaattggtcactatgttgatagtcttgttaactctgttgatagtgagggagatgaa
ggggagattttttcagctttagtttctggagttggcttaaataaactagagctacagaca
ataaaagcccaaaacgatcactttacgatttttgtcgatggacaatctttacaagtcgaa
gcggcaactataactgttacaaacacgaatgatagtggtgcaggttctttacggaatgcg
attgcctctgcggcttccggagatacgattaattttagtagtctttttaatactgctcag
acgattattttaacctctgggcaattagtggttaataaatctttaactatccaaggccct
ggcgcgaatttattaacgattagcggcaacaacgccagtcgggtcttcgtaatcgacgat
aacaatgagaataatgccgaaacggtagaaatctccggtctgaccattagcggtggcctg
gtaaccactggcagtggagggggaattttcaacttggagaatctcagtctccgcaacagt
accctcagtggtaactccgctgactccttcggcggcgggattttcaaccgtataggaaca
gtgacggtcagcaacagcaccatcagtggtaattctactaccgtgttcgccggcggcggg
attttcaacgacatggggacagtgacggtcagcaacagtaccatcagtggtaattctact
cgtttcggcggcgggattttcaacgacatggggacagtgacggtcagcaacagtaccatc
aatggtaattctgctaacctcaccggcggcgggattgttaacaacgcggggacaacttct
ctaaccactactatcgtcgccaacaacatcgcaggtaatggcgatggtaataatcttctg
ttgtctgacggaacgatcaatgccagcaatagcctaattgagagtaacgctgacctaatc
aatggaaccaatagcaacaatatcttcggtgtagatcccttgctagggtctttacaaaat
aatggtggtacaaccttaactcatgcgcttctaccgggtagccctgccattggagcaggc
aatacgactccaagtacagatcagcgggggattagtcgcccccaaggaactaatggtgac
atcggggcctttgagtatgttccccccatcgttaacattactgctactgataataccgct
acagaacaatcaggaaatactggaacttttcaattaactcgtgatcttcccaccggtgca
actaacacggcattacctgttcaattaacactttcgggaacggctagtgctagtgattac
aatttctccgcttctgggggtacggttaatgccagcaacaataccgttacggtaactttt
aattcaggttccaacactgtcaatgtgacggttactcctgtggatgatatccaggccgag
gctaatgagacagttattttaacgctcaatggtggaagtctaaattatgacttaggagct
aataccagcggcaccgtcaccattagccaaaatgattttgttgttatcaatacgaatgat
agtggcgaaggcagtctgcgtcaggcccttctcaatgccaatgacatcagcggagccaat
accattacctttgctggagttttcaccgatgcaacgcccgacaccattaccctgaccact
gggcaactcagtattacggatagtgtgaccatccaaggccctggcgctaacttgttaacg
attagtggtaataatgcgtctcggattttctcttttgggaatactggccctcaaacctac
aacattttggggctaacacttacaggcggtactgttgatcgtggtggtgcaattgccatg
agtgatgacaatgacatattaaacatcgatcgagtagctatcactggtaatacagcaacg
gcatacggatcaggaatagccattgcagggggtagtaccctaaacctgactgatagtggc
atttactataacaatgccagtggtggtggcggaagcagtgtatatattgagaatagcaag
gctaatttaagcaatgtaacggtgagtaataatacgggtaatgtgttttggggaggaagt
attctcaatttttctgatgcttctgacagaaccagtacggtgacattactcaataccacg
atcgctaataatcaaaattatggtctatataattatggtcaaagtggaggcagccctacc
accaattacagcaacagtatttttagcaataactctatagaaaattttaatgggcaagcc
atttcccaaggcaataacatcgagagcggtacaaatgctttgttagggcctttacaaaac
aatggtggtacaaccttaactcgtgcccttctacctggtagcccagccattggggccggt
aatacaagcctcaccacggatcaacggggcattagtcggccccagggaaccaatgatgac
atcggggcctttgaatatgtctccccaacagtaagcctaacagcaacagataatacagcg
acggaagcggcaggcaatacaggcaatttccaattaactcgtgtcattccctctggagga
ctgagcgatgctctcccggttcaattaacgctttcgggaacagccagtgctagtgattac
aatttctctgtctctccctctgaaggaacagttagtgctagtagcaatacggtaacgatt
acctttaatgccggttctaacactgtcaatttaacggtaacgcctgttgacgacatccag
gccgaggctaacgagacggttattttaacgctcaatagtggaactccaaattatgactta
ggagcgaataccaacggcaccgtcaccattagccaaaatgattttgttgttatcaatacg
aatgatagtggcgaaggcagtctgcgccaggctattctcaatgccaacgccatcagcggg
gccaataccattacctttgccattccaggtggtggggtgaaaactattaacttactctca
gcgttaccgaatattacggagcaagtcactattgatggcactagtcaaaccggttttacc
ggtactcccctaatagagttgaatggaacgtctgccggaagtggtgcgaatggtttgacc
ttgactaccggttctagcggaagtgttatccaaggcttgatcattaatcgtttcagtagc
ggagcaggcatttttgtcaacagcagcaacaacaaaatacaaaaaaattacattggcact
aatgcaggtggaacttctggagcaggtaactcatttggtgtttctgttaattcaggcaat
aacaatatcattggcagtgacgaagatggcaacaatgatgccagtgagggaaatttaatt
tctggtaatggaaatgtaggtgttcttttcttcggaagtaataattttattcgaggcaac
tatattggtactaattttgatggcacatcggctataggaaatggaatccatggcatttat
attggttcttctaaccataacattggtggatcaacagccacagctcgcaatatcatctct
ggcaatagcttcagtggggttgctatcttcgcaaatcttgcatctaatgctagcaataat
attgtgcaaggtaactatatcggtacagatatcagtggcaataatcctttaggtaatggt
agtggtggtggtgttcgtatcacaggtgccaataatacgattggggggactggtgctgga
gaaggtaacattattgcgaatagtgcgggcaatggtgtgtatgtaacagatgcttttaac
gctagcccaagcctcaacaatgcaggtaataacatctctggaaataatattttcaacaat
acaggtttggggattgatcttgccactgttcaaggtgatagcgaggtgggcataacaccc
aatgatttattggattcagatgctggtgttaataacctgcaaaattaccccttgctaatc
aaagacaataatggcactgttcaaggccgtctcaatagtgccccaaacaccatttttcgg
atcgaattttttagtaacaccaatgtagatcccagtggcaatggtgaaggtcagacttat
ttgacttttcagaatataaccacagatggtaatggaaatgccagttttactttcacgccg
ccaggtgggtcgctcaatataacggctactgcgacagacccccagggaaatacctcagaa
ttttcgagtcccgcaattgttcccgtcgtcacgattacagccattgatgcaacagcaaat
gaagcgggcgatccaggaacctttcgggttagtcgtactggggcccctattgtcccttta
actgtcagttatgccgtttcaggtacagctaccaatggtagtgattacaacagcctttct
ggaacggttactattcccgttgatcaaacttttatcgatatcgcaattaatcccattgat
gatatccaggccgaggctaatgagacggttattttaacgctgagtaatagtgtcaactac
attcaaggagccaacacaaacggcactgtcacgattagccaaaatgattttgttgttacc
aatacgaatgatagtggcgaaggcagtctgcgccaggctattctcaatgccaatgccatc
agcggaggcaataccattacctttgccattccaggtggtggggttaaaaccattaatttg
ctctcggctttaccgaatattacggaacaagtcaccattgatggcactagtcaaactggt
tttgccgggactcccctaatcgagttaaatggggcctccgccggagctgtgaatggcttg
accttgggcgccggttctaacggaagtattatccaaggcctagtcattaatcgttttggt
agcggcaatggcattctcgttcaaagtaataacaacaccattttgggtaacttcctgggg
acaaacgctgatggaacaagtgcccaggccaatctgcgaggcgtttatattgatggtggc
tcaaataatgtcattggtagctctacgatagcaagccgtaacctaatttctggtaatact
caacaaggcattgtgattgataaagccagcgcaatcggtaacaaagttaaaggcaattac
atcggcacaaatctagcaggaaccgcggcccttgctaatggcttccatggcatacaaatt
caaggaggcagtaaaaataatattgtagggattgatggtgatggagctaatgatgccaca
gaggggaacctgatttccggtaatgctcaaattggcgttattacagaaaacacaggaact
acaggcaatatcattgctggcaatctaattggaaccaatgcggcaggaacctctgctatt
tctaacaatacaggaatatatattgcgaatggagctgagaatacccgtgtagggacagac
agtaacggcgtttccgatagtctagagcgcaatatcatttcaggaaatactagttttggt
atctggaatcttaataatgcagggaatcatcgcattagtggcaactacatcggcacggat
attaatggaacaacagacctaggcaatggcagtgatggaattttagttaatggctcagct
aacaacaccatcggtggtaatcaagtcagtgatcgtaatgttatttctggtaataatcga
tatggtattttgcttacttcagcaaccactacaggcaataccattcaaggtaactatatt
ggtacgaatgctagtggtacaggggcaatcggaaatagcaacgccggtattcgactagag
agtggcaccgccaataacttaattggtacaaatggtgatagcgtcaatgatctggctgaa
ggcaacgttatctctagcaatagcgttggtatttctatcgctagtaatacaaccaccaat
aacaccattgctggtaataaaattggaacaaatgccgctggaacggcaaatctggggaat
acgactcaggggattttgattagcgattctcctaacaacaccattggtggaacggtctta
aatgccggtaatttaattgttggtaatactcaacaaggtattgcgattacaggcaacaca
gccaccggcaataaaatccaaggcaattctctttctagtaatggaactttaggcgttgac
ttgggcgctgatggtatcactgcaaacgatctaggtgatggtgatgccgggcccaatggt
ctgcaaaatgcaccgcgtttaagcctagctcccaatggaatcgttcaaggccaactcaat
agcactccgaataccactttccgcattgagttttttagcaatactaatcctgaccctagt
ggctatggagaaggccaaaccttcttaaatttcatctccgtcaccacggatggaagtggt
aatgccagctttacctttgaccccagcgcggccagcaatatcaccgcaacggccatagac
ccatcgggcaatacttcagaattttccaacgttgcggctcagactagcccgacctttacc
ttgctgacggataacttcaccgctttttataatcccacgatcactaaccttgactacaac
cttgtgggacgacaaggcggacttttggcaacgacccgctggatacctaataccactact
gcccaagtcggcaacccgacccccaacattgaccaaggtaattatctgttattgagcagt
tctggacgagcggcccttgaccggaactttaacggtatcaatgcccagggcggcctcaaa
attagctttgagctggccccgaatgctactaatacaaattcaacctggtggggaggcatt
agtcttggcctctcggaagcaaacaaaaatatttttatcaataacaatgttccccacttt
ggtattcttttccggggcaatggcggcattcaggcctttgatgctaacagtgatgtcagc
ggcgtgaatagtggctggggaggtaccggcaatagtagtactctctatccctttagcctt
gaactcactgaccccaccgatggcaatccttttaatggcattggtcaaaccaaagttgag
gtttttgctggcaataatttaatctatacctataccaagggtaacgggggctatagcgac
aactacatcaacctaggaaccactgggacttctggctttgataatttcaagcttgaaaaa
ctgggtcgagtcccctttgcagaaaatgccacgggtacggtctataccgcaaccgctatc
ggggatcccctgcgaaatccgagcttggtctatagcctcgatgggccagataaaaatctg
ttcaatatttctcaaacaggagaaattagctttaaagtggctcctaattttgaggctgcg
acagatgcaggggaagataatatctataacctgacagtgattgccagtgatgccaattta
acgggctctcaaaatgtcaccatcacagtgaccaacgtcaacgaggccccgattaactcc
gtaccagacggtcaaacaacgaatgaagatacagtcttagtcttcagtgccagcaatagc
aatctcattagcattagtgatatagatgccgggtcgaatctggtgcaggtggcattaagt
gtgaccaacggagtactgactttatctgggacaacgggattaagcgttaccagtggtagc
aatggcagtggtagttttaccatccagggtacagtagccaatattaatggggccctgaat
ggactgacttatctggggaatagtaacttcaatggctctgatagtctgcaaattgttacc
aatgatctgggcaatacaggtactggtggtgctttaacagataccgatacaatgaccatt
acggtcaatgccgtcaatgatgcaccaatcaacaccttacctagtaccttcagtgttgat
gaagacacgaacctaactctcacaggtttatccattgccgatgtagatgctggcgcagag
cccgtaaccgtaaccctgtcggtaaattctggtactctagccgccacaacaggaggaaac
gtcactgtaacagattctggaactagctcgattattttaacgggaactgttgctgcgatt
aatgcatttctggcaggaggatcggccccggtcttttcccccattagcaactttaatggc
gatgttctcttaaccctgatcaccaatgatcagggtaatacgggttcggggggagcaaaa
tcggctactgatacctcaactatcactgtcaattccgtcaatgatgcccccagtattacc
agtggggcaacggccagcattgcggagaatagccccgtctcgacggtgatttacacaggg
acggcgaccgaccctgatacaacagcgcctaacaatactgtatcttttagcctcaatggt
cccgataaggactcttttaccatcgactctgatgatggagaagtgcgcctgaaaaatcct
gctaactttgaagtacagaatagttacaacatagaagttgttgtcactgatggcggcaat
ccggccctttcagataccaaggctgtcacgattcaagttctggatgttacggaaaggttt
acgactcccaatcgagactccatcaacaccggccctgggaacgactttgtcaccaccacc
ctcgataacttgcgccaacgagacagcatcaatggcggtgctggcaacgacacgcttgtt
ctagaagggccgggtagtaccactcccctagagattaacctgagcaattcttcccaggta
ctagttcaacctaactttattggactgcctattcccttcctctttttccccgttccttgg
agtcaatcctctgttaagggctttgagaatgtggatgccagtggttttactggcaatctc
aatctgacgggtagtaatctaagtcagactcttaagggagggagtggcgcagacagaatc
tttggcttaggaggagatgacctcattgatggtggcctcggggccgatgagttaactggg
ggcctgggcaatgacatggtttacctcggcaatgatagcgccagggataaagtgtattac
agtgcaggggatggaacggataccgtgttccagttcagtcgagccaatgaccagatcctc
ttcagtggaattgccaatattgatgttgtttccaacggaagtaatacggaatttcgagta
ggagatggtaacataggtaatcctgggtttgccacgggaagtctgttagtgagtctgact
ggagttactggttttgattctacggatgccagtaatggcgttattagtggagctactttt
agttttagctaa
DBGET
integrated database retrieval system