Synechocystis sp. IPPAS B-1465: C7I86_01975
Help
Entry
C7I86_01975 CDS
T05368
Name
(GenBank) nuclease
KO
K07004
uncharacterized protein
Organism
syo
Synechocystis sp. IPPAS B-1465
Brite
KEGG Orthology (KO) [BR:
syo00001
]
09190 Not Included in Pathway or Brite
09194 Poorly characterized
99997 Function unknown
C7I86_01975
BRITE hierarchy
SSDB
Ortholog
Paralog
Gene cluster
GFIT
Motif
Pfam:
W_rich_C
LTD
SdiA-regulated
Exo_endo_phos
Calx-beta
DUF6454
Motif
Other DBs
NCBI-ProteinID:
AVP88562
LinkDB
All DBs
Position
complement(404545..410184)
Genome browser
AA seq
1879 aa
AA seq
DB search
MSNLIITGIIDGPLPGGLPKAIELYVLADIADLSMYGIEAATNGNASTGPEFTLSGSATA
GDYIYVASETSGFNSFFGFNPNFTDGVANINGDDTIILFENGSIVDVFGEIGIDGTGRPW
EHLDGWAYRNNGALPSSTFNASEWTFSGVDALDDDAANVNATATPSWPIASFSAGGTNGL
DLSTYVRIGRYDLPVPTRTVAPPAGSELALEVSAITYNPDTNTLFVLGDEGTAIVEIDKR
GQLISSMTLTAGDFADPEGLTYVGNGQFVLVEERLRQANLFTYAAGGTLSRADVQAVTLG
TTVGNIGLEGVSKDPVTGGFIFVKEVNPQGIFQTTIDFGAGTASNGSPTTQDSSNLFDPA
LLGMTDIADVFALANSSFVSGAIANNLLVLGQEDGRLVEVDRSGNILSELVINADADNPL
SVTNQGFEGVTLDNDGLLYITSESGGGDGNHPQVWVYAPADYVFNNAAPVTVSVANGVNN
LLENANTTSAIKLGNIIIGDDSLGTNTLSLSGADASNFEIVGNGLFLKAGTVLDFSTQSS
YEVTIAVDDATLGNTPDAITTFTLDITNTAGISDLIISEVAPWSSGNSSVGADWFEVTNT
GANAIDITGWKVDDDSASFANASALAGVTNIAPGQSVVFVDGDANTITAFIDLWFGGTAP
AGLAIGTYGGPGLGTGGDAINLFDATGSLITGVTFGSSPSTSPFSTFDNALGNPSVANLS
TVGSNGAFSVIDAGEGVILNGSPGAIAGSVSSNTTVGIAATGATGSENGPTPGEFTILRT
GDTSTALDVTYSISGDAANGTDYAAIDPTTVTIPAGQSQVKISINPIDDVIIESTESIVI
TLTDTANYDVATSASSATVNIEDNDTPITVSRLQITEFMYSGADGEFIEFTNIDTSSVDM
TGWSFSDSGRVAGSVDLSAFGVVQPGESVILTEADAETFRTAWNLPATAKIIGGLSQNLG
RSDEINLYDATGNLVDRLTYGDQDFSGTIRTQNSSGWISADQLADQEIDADWVLSSVDDA
QNSYASTGGDIGNPSIYITGVDPTIVKIHEIQGTGTASPLVNNVVTIEAIVVGDFQDGDG
DISRNLRGFYVQEEDADVDGNVATSEGIFIFENGNFITDVNVGDKVQITGTVDEFFGETQ
IDTITNITVISSGNTLPTAANITLPTAGTTESQGGTPQPDLEAFEGMLVKFTDTLTITEM
FNLDRFNEIKLSQGGRPQQFTQFNDANVAGYGAYREEIGARTITYDDGLSVQNAEISNLD
GFGSSFSTASDIRMGDTINNLTGVLSYQWAGNASSGATWRVRSAVDGTNQFTKVNDRPVT
PENVGGSLKVTGFNVLNYFKTIDLSGVSTAIGQDPRGADTTAEFDRQTDKLVTALLAIDA
DVLGLAELENDFLPGSSGNAIENLVNELNAVAGAGTYNWVNPGTQFLGTDAIAVGLIYKV
SAVSLVGDAAILNTQAFLDPNNTGENRNRPTVAQTFRDLVTGETFTAVVNHFKSKGASGL
TAGDAGNPDSDQNDGQGFWNDTRTKAAQELVTWLNTNPTGVNDSDYLLLGDYNAYAQEDP
IKALESAGYVNLGAQFSGGTNTSYVFDGQTGTLDYAFASASLAAQVTGATEWGINADEAD
ALDYNLDFGRDVNIFDGTVPYRSSDHDPIIVGLNLASPVEPIANEIGVMAENGFFFVLLP
GGDEVQLKFNNQPFASGTFGNWQILEAETVNGINQVLWQNPNLGQIGVWNADSNWNWISS
QTWPTNSFNTLEAEVTFQIDINNDDLLGDRLTTVENQGSTTLLEGILGNYYVQSGDDLTT
PIKYLGEAFDNNLGNWQALAAETVQGVNQVLWQNLNTNQIGVWNSSADWNWISSSVFEAG
SPQAIAQAGIFGVDLNAVI
NT seq
5640 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
gtgtctaacttaattattaccggtattattgacggaccactgcccggtggactcccgaag
gcgatcgagttatacgtcctagctgacattgccgatctcagtatgtatggcattgaagcc
gccaccaatggcaatgcgagcaccggcccagaatttaccctctccggctctgcaacggca
ggggattacatttacgttgccagtgagacatcaggatttaatagcttttttgggtttaat
cccaactttaccgatggtgtagcgaatataaatggggacgatacaataattctttttgaa
aatggttcaattgttgatgtatttggcgaaattggtatagacggtactggcaggccctgg
gaacaccttgacggttgggcctatcgcaacaatggcgcccttccgagcagcactttcaat
gcgtctgagtggacttttagtggagtagatgccctggatgatgacgcggcaaatgtgaat
gcaactgctacaccatcttggccgatcgccagttttagtgctggtggaactaatggacta
gacttgtctacctatgtccgcattggtcgctatgacctccctgttcccacccggacagtg
gccccccctgctggcagtgagctagccctggaggtttccgccattacctacaatcccgat
accaacaccctttttgtgttgggggatgaaggaacggcgatcgttgagattgataagcga
ggtcaactgataagctccatgaccttgacggcgggggactttgctgaccccgaaggatta
acctacgtgggcaatggtcagtttgtgctggtggaagagcggctacgccaagccaatcta
tttacctatgcggcgggaggaaccctaagccgggccgatgtccaggcggtcaccttgggc
accacggtgggcaacattggtttagaaggagtttccaaagatcccgtaaccggtggtttt
attttcgtcaaggaagttaatccccaaggcattttccaaaccaccattgatttcggtgcc
ggtacagccagcaatggttctcctaccacacaggactccagcaatttatttgatccggct
ctcctcgggatgaccgatattgccgatgtctttgccctggctaattccagctttgtcagt
ggggcgatcgccaacaatttgctggtgctgggtcaggaagatggcaggttggtggaagtt
gatcgctccggtaatatcctgagtgaattggtgattaatgccgatgccgataacccccta
tcggtcacaaaccaaggttttgagggagtaaccctagacaatgatggcctgctctacatc
accagtgaaagcggcggcggcgatgggaatcatccccaagtgtgggtttatgcccctgcg
gactatgtcttcaacaatgcggctccggtgacggtcagtgtggccaatggagtaaataat
ttattggaaaatgctaataccacctcggcgattaaactcggcaatattattattggtgat
gattccctgggaaccaatacgttgagtttatcgggagccgatgctagcaactttgaaatt
gtcgggaatgggttgttccttaaggctggtactgttctagatttttccacccaatccagt
tatgaagtgacgatcgccgtggatgatgcgaccctgggcaatactcccgatgccatcacc
accttcacccttgatattactaatactgccggaatttccgacctaattatctctgaggtt
gcaccctggtccagtggtaatagctctgtgggggcagactggtttgaagtcaccaatact
ggtgccaatgcaattgacatcacaggctggaaggttgatgacgattccgccagctttgcc
aatgcttccgcccttgctggtgtaaccaacattgccccgggtcaatcggtggtctttgtg
gatggtgatgccaacacgatcaccgcctttattgatctttggtttggtgggacagccccc
gctggcttggcgatcggtacctacggtgggcccggtttgggcactggtggagatgcgatt
aatttatttgatgccacgggttcactaatcacaggggtaacctttggctcatctccatcc
acctctccctttagcacattcgataatgccctcggcaaccccagcgtcgctaacctaagt
accgtgggtagcaatggagccttcagtgtgattgatgccggtgaaggcgttattttaaac
ggttccccgggggcgatcgccggctctgtcagctcaaatacaacggtgggaattgcagcc
acaggagctacaggttccgaaaatggccccactccgggggagttcaccattctccgcaca
ggtgatacctcaaccgccttggatgtgacctatagcattagcggcgatgcggctaacggt
acggactacgctgccattgatcccacaacagtaacgattccggcgggtcagtcccaagtc
aagatctcgattaatcccattgatgacgtgattatcgaatccacagagtccatcgtaatc
accctaacggacacagccaattatgatgtggctaccagtgcctccagcgctacggtaaac
atcgaggacaatgacactcccattaccgtctccaggctccaaattactgagtttatgtac
tctggcgctgacggcgaatttatcgagtttaccaacattgatacgtcgtctgtggatatg
acaggttggagtttttccgacagtgggcgagttgcaggttcagttgacctgagtgctttt
ggggtagtgcaaccgggtgagtcggtgattttaacggaggcagacgccgagacattccga
acagcttggaacttgccggcaacagctaaaattattggaggacttagccaaaatttaggt
cgtagtgatgaaattaacctgtacgatgctaccggtaacttagtagatcgtctcacctac
ggagatcaagatttttctggcaccatccgtactcaaaattccagtggctggatatcggct
gaccaattagcagatcaggaaattgatgccgattgggtgctgtcttcagtagatgatgcc
caaaactcctacgcctcaacggggggtgatatcggtaaccccagtatctacatcacaggt
gtcgatcccactatagttaaaatccatgagattcaaggcactggtactgcgagtccctta
gtcaacaatgttgtgacgattgaggcgatcgtggtgggagacttccaagacggagatggg
gatatcagtcgcaatctgcggggcttctacgttcaggaagaagatgcagatgttgatggg
aatgttgctacttcagaagggattttcatctttgagaacggcaacttcattaccgatgtt
aacgttggcgacaaggttcaaattacaggaaccgttgatgaattctttggtgaaactcag
attgatacgatcaccaacatcacggtaattagttccggcaacaccttaccgaccgctgcg
aatattaccctgcccactgccggtaccaccgagagtcaggggggaacgccccagcccgat
ctggaagcttttgaagggatgttggtgaaattcactgataccctgacgattacggaaatg
tttaatctcgatcgctttaatgaaatcaaactcagccaaggcggtcgtccccaacaattc
acccagtttaatgatgctaatgtggcaggctatggggcataccgagaggaaatcggtgct
cgcaccattacctacgatgatggcctgagtgtgcagaacgcagaaattagcaatctggat
ggttttggttccagcttcagcaccgctagtgatattcgcatgggcgacacaatcaataac
ctcactggcgttctcagctaccagtgggcaggtaacgcttccagtggagctacttggcgg
gtgcgctctgctgtagatgggacaaatcagtttactaaggtgaacgatcgccctgtcaca
ccagaaaatgttggcggttccctgaaggtaacgggcttcaatgtcctcaactacttcaag
accatcgacctgtccggtgtaagcacggccattggtcaagatccccgtggggcagacacc
actgcggaatttgatcgccaaacggacaaactggttaccgccttactggcgatcgatgcc
gatgtgttaggcctagcggaactagaaaatgattttctccccggctccagtggcaatgct
attgaaaacttggttaatgagcttaatgcggtggccggcgcaggaacttacaattgggtc
aatcccggtactcagtttcttggcaccgatgcgatcgccgttggtctgatttacaaagtt
agtgcggtcagtctggtcggggatgctgccattttaaatacccaggctttccttgacccc
aataacactggcgaaaaccgcaaccgtccaacggtggcccaaaccttccgggatttagtt
acgggtgaaaccttcaccgcagtggtcaatcactttaaatccaaaggtgcttccggttta
actgctggcgatgccggtaatcccgattctgatcaaaatgatggtcagggcttctggaac
gatacccgcaccaaagctgcccaggagttagtgacatggctcaataccaatcccaccggg
gtaaatgattcggattatctgcttttaggtgactataatgcctacgcccaggaagatccc
attaaagctctggaaagcgctggttatgtcaatctcggggcccagttcagtggcgggacc
aatacgtcctatgtctttgatggtcaaaccggtaccctggactatgcctttgccagtgct
agcttggcagcacaggtaactggcgcaacagaatgggggatcaacgccgatgaagcagat
gccctggactacaacctcgactttgggcgggatgtcaatatttttgatggtacggttccc
tatcgctcctcagaccatgaccccataattgtcggccttaaccttgcttcccccgttgag
ccgatcgccaacgaaattggcgtaatggccgaaaatggcttcttctttgtcctacttcct
gggggtgatgaagtacagcttaaatttaacaatcaaccctttgccagtggcacctttggc
aattggcaaattttggaagcagaaacggtcaatggcatcaatcaagtgctttggcaaaat
cccaaccttggtcagattggtgtttggaatgccgactccaactggaactggatttcttcg
caaacttggcctaccaattccttcaatactctggaagcagaagttaccttccagattgac
atcaacaacgatgacctccttggcgatcgcctgacgaccgtggaaaaccaaggttctaca
actctcctggaaggcatcttgggtaattactacgtccaatctggggatgatttaaccaca
ccaatcaaataccttggggaagcctttgacaacaacctcggtaactggcaagccctagcg
gcggaaactgtacaaggggttaaccaagtgctgtggcaaaacctcaacactaatcaaatt
ggtgtttggaactctagtgctgactggaactggatttcctccagtgtgtttgaagctggt
tctccccaggcgatcgcccaggctggcatttttggtgttgatctgaatgctgtaatttaa
DBGET
integrated database retrieval system
