Shewanella youngdeokensis: RGE70_04925
Help
Entry
RGE70_04925 CDS
T10660
Name
(GenBank) calcium-binding protein
Organism
syou Shewanella youngdeokensis
SSDB
Ortholog
Paralog
Gene cluster
GFIT
Other DBs
NCBI-ProteinID:
WOT06153
LinkDB
All DBs
Position
1155210..1160513
Genome browser
AA seq
1767 aa
AA seq
DB search
MDDTNQNDTNQNDVLVGTGTDDHIEGLAGNDIIDGRSGDDYLVGGEGDDSISGQEGKDFI
LGDQGLEQQSDTPVVENEETTAWGVEQEVFSGGETIEPVTENTPASQIVNIGGYVGGGGN
NFTLNVAVPDDSPALEDGADLTINILTPDDHGNTVIVASGVATQSGDGTIQIDFELTDDQ
LDDTGDIELQFVASGLNEGAQVNIDSVELIAHNTYDDTLDGGVGDDHLMGQQGEDTLFGG
DGDDILDGGINNDQLHGEAGDDLLMGGQGDDLLTGGEGADTLMGGDDNDDLQGGAGNDTL
MGELGDDTLDGGEGDDTLIGDDGNDTLLGGAGHDSLLGGKGDDDLSGGSGNDYLQSDEGD
DILSGGEGDDTLIAGSGNDQLEGGTGADVLLAGTGDDQLVGGEGDDKLFGEEGSDTLSGG
VGNDELHAGGGDDVLTGGEGDDVLFGYSGENILDGGTGNDTIYGGSDNDQILAGEGDDLV
FAESGDDTIDGGAGNDALFGGDGSNTIDGGSGHDELYAGDGDDTLTGGTGDDKIYSGSGV
NTIDAGEGNDTVYAGVDDDTIDGGSGDDVIFSDAGNDTVIAGAGNDQIYAGAGDDTLSGG
EGDDTIFAEDGDDLVSGGAGNDTLYGGGGADRLDGGEGNDSISGGAGDDELLSGSGDNFL
DGGAGDDTITAEDGDDVLIGGDGADTIVAGAGDDIVDAGLGDDTIAAGDGDDTVYAQDGD
DTLEGGLGNDLLHGGEGIDHLDGGEGDDTLYGGGGTDTLIGGAGNDVLDGGADDDVLTGG
EGDDTLIGGSGADELSGGVGADVLVGDAGNDSLFGEAGDDTIYAGAGSDVLLGGEGDDKL
YGGDGDDELIGGEGYDELYGGAGNDTLYAENEAGLLAGGEGDDTLIGGTADDQLYGDGGD
DTILAAEGDDLVFAGAGDDTVETGIGDDMVFAGEGTDNISTGEGSDSVFGEDGQNTINTG
AGNDEIYGGVGADTVYAGTGDDIVYGGDGHDVLHGEEGDDFIDAGAGNDTASGGLGVDVM
FGGDGNDKLSGDEGDDLLFGGEGRDTLEGGEGSDQLFGEGGNDTLSGGAGADLLFGGAGD
DTLDGGEADDQLFGGDGDDTIAGGVGTDFVDGGSGHDTITGGEGDDVLLGGDGNDNIEGG
VGEDKLFAGAGNDHLEGGEGNDELHGEFGDNTLDGGAGDDVIYGGSGNDTLIGGEGNDHL
ESHLGHNTVAGGVGEDTIITGSGNDNIDGGADNDNIEAGAGDNVVSGGAGDDIITTGGGD
DTIFGDEGTDTIHAGEGHNEVSGGDGNDSITSGSGNDTLSGGDGNDSINAGDGDNRISGD
EGNDTIVAGAGSDIISGGAGDDSIQAGDGHNTVTGGEGDDTIIAGAGNDNLSGGAGNDTI
EASAGDNTLSGGDGDDVLIAGGGHDSLSGGDGADTLNAGNGNNQLYGGEGNDKLTSGSGS
DLLEGGAGNDTLSSGSGNDQLFGGEGNDTLSGGSGDDMLYGEAGNDKLSGGGGNDQLFGG
EGDDRLSGSGGDDQLHGDVGNDQLSGGSGSDLLFGGEGDDKLDGGSQNDELYGGSGDDTL
AGGSGDDVLFGDAGSDTIDGGTGSDKLFGGAGDDTIVFDREDFGSNEDGSMDSGGFSYDG
GDGFDVLQVSSVNSEIIDMTGAGIQNMEAIIVEDGVTDIQLELSLDKIYQQADGDGVVGN
NSDDPLENNFLVVGSDNIDLTGDGNWTHSGETLGSQDMDAELREKYEGEGVDIDELQGHI
FSSDEGEVIIWSDADAGGISLNDETLT
NT seq
5304 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
atggatgatactaatcaaaatgatactaatcaaaacgatgtgttggtcggtactggaacg
gatgaccatattgaagggctagcgggcaatgacatcattgatggtcgctctggcgatgac
tacctcgtaggtggtgaaggcgacgatagtatttctggtcaagaaggtaaagattttatt
cttggtgaccaagggctagaacagcaatcagatacgccagtggtcgaaaatgaagaaacc
acagcgtggggagtcgaacaagaagtgtttagtggtggcgagactattgagcctgttacc
gagaacacacctgcgagtcagattgttaacattggtggctatgttggcggtggtggaaat
aactttactttaaatgttgcagtgcctgatgacagccccgctttagaagatggcgccgat
ctaaccattaatatcctgaccccagatgatcatggtaataccgttattgtggcatcgggg
gtggcaactcagtcaggggatggcaccattcaaattgattttgaactgactgatgatcaa
ctcgatgatacgggtgatattgaactgcaatttgttgcatcaggactcaatgaaggtgcc
caagttaatatcgactcagtcgaactgatagctcacaacacctatgatgacactcttgat
ggtggggttggcgacgatcacttgatgggacaacaaggcgaagacaccttattcgggggc
gatggcgacgatatactcgatggtggtattaataacgaccaactgcatggtgaagcgggt
gacgacctattaatgggcgggcaaggagacgacttactgaccggtggcgagggcgctgac
accttgatgggtggcgatgataacgatgatttacaaggtggggctggtaacgacacatta
atgggtgagttaggcgatgacacgctcgatggcggtgagggcgatgacacccttattggt
gatgatggtaacgacacgttacttggtggtgctgggcatgattcgcttttaggcggtaaa
ggtgacgatgatctcagtggcggatcgggcaatgattaccttcaaagtgatgaaggtgac
gacatactatcgggtggcgaaggtgacgatacgcttatagcaggttcgggtaatgaccaa
ctcgaagggggaactggcgcagatgtgttactggctggcaccggagatgaccaactagtt
ggtggtgaaggcgacgataagctgtttggtgaagagggtagcgataccttaagtggtggc
gttggcaatgatgaactgcatgctggtggtggcgatgacgtgcttaccggtggtgaaggc
gatgacgtcttatttggctactcaggtgaaaatatattagacggcggtaccggaaacgac
actatttatggtggtagtgataatgatcaaatcctcgctggtgaaggtgatgatctcgtt
tttgctgagtcaggtgacgatactattgatggtggagcaggtaatgatgcgctgtttggt
ggtgacggttccaacaccattgatggtggtagcggccatgatgaactttacgctggcgac
ggcgatgacacgctcaccggtggcaccggtgacgataaaatttactctggttctggtgtc
aatactattgatgcgggcgaaggtaacgataccgtttatgccggtgtagatgatgacacc
attgacggtggtagtggcgatgatgtgattttctctgatgccggtaacgatacagttatt
gcaggagccggtaatgaccaaatttacgccggagctggagatgacaccttaagcggtggc
gaaggcgatgacactatttttgctgaagatggcgatgacttagtatctggtggcgcgggt
aacgataccctttatggtggtggcggagccgataggcttgacggtggtgaaggtaacgac
agtatcagcggtggagcaggtgatgacgagctcttgtctggcagcggcgataactttctt
gacggtggcgctggtgatgacaccatcacggcagaagacggcgacgatgtgctcattggt
ggcgatggtgccgataccatagttgctggcgcgggtgacgacattgtcgatgcagggttg
ggtgatgacacgattgctgcaggagacggtgatgataccgtctatgcacaagacggcgac
gacacgcttgaaggcggattaggtaatgacttactacatggtggtgaaggtattgaccac
cttgacggtggtgaaggtgatgacacgctctatggcggtggcggaaccgatacgttaatt
ggtggcgcgggtaacgatgttctcgatggtggggcggatgacgatgtccttactggtgga
gaaggtgacgatacgctaattggtggtagcggggctgatgagctcagtggtggtgttggt
gctgatgttttagtaggtgatgccggtaacgacagcctatttggtgaagcgggtgatgac
accatatatgccggtgctggtagtgatgtgctactcggtggtgaaggtgacgacaagctt
tatggtggtgatggtgatgacgaactcataggcggtgaaggttacgatgagctatatggt
ggcgcgggtaacgacactttatacgccgaaaacgaagctggcttactcgctggtggtgaa
ggcgatgacactctaattggtggtactgccgatgatcaactctatggtgatggcggtgat
gacaccattctcgccgctgaaggtgatgatttagtctttgctggggcgggtgatgacacc
gttgaaactggcattggcgatgacatggtatttgccggtgaggggactgacaatatatcg
accggtgaaggtagcgattccgtgtttggtgaagatggtcagaacaccattaacactggc
gcaggcaatgacgaaatatacgggggtgtgggtgccgataccgtatatgctggcacggga
gatgatattgtttacggtggtgacggtcatgatgtgttgcatggtgaagaaggcgatgac
tttatagatgccggagccggtaatgatacggcttcaggtgggcttggcgtcgatgtcatg
tttggtggtgacggtaacgataaactatcgggtgatgaaggcgatgacctattgtttggt
ggtgaaggtcgcgacactctagaaggtggtgaaggaagcgatcaactctttggtgaaggt
ggtaacgatacactatcaggtggtgcgggagctgacttgctctttggtggcgcaggtgat
gatactttagatggtggcgaagctgacgaccagttatttggtggcgacggtgacgatact
attgctggtggtgttggtaccgattttgttgatggaggcagtggtcacgacacgattact
ggtggcgaaggcgatgacgtactgctaggtggtgacggcaacgataatatcgagggcggc
gtaggagaagacaagctgttcgcaggcgcgggtaatgatcacctcgaaggcggtgaaggc
aatgatgaattacatggtgagtttggtgataacaccttagacggtggcgctggtgacgat
gtgatttatggtggtagtggtaatgacactcttatcggtggcgaaggtaacgatcacctt
gaatcgcacctaggtcataacacggttgcgggtggagtcggtgaagacaccatcatcacc
ggtagcggcaacgataacatcgatggtggtgctgataacgacaacattgaagctggcgct
ggtgataacgttgtcagtggcggcgcaggagacgatataatcaccactggtggtggcgat
gatactatttttggtgatgaaggcaccgataccattcatgctggtgaagggcataatgag
gttagtggcggcgacggtaacgacagtatcacttctggcagtggtaatgacaccctctca
ggtggtgacggcaatgacagcattaatgcgggtgacggtgataaccgcatcagtggtgat
gaaggtaacgacactatcgttgctggcgctgggagtgacattatttcaggtggcgcgggt
gatgatagcattcaagctggtgatggccataatacggtcactggcggtgaaggagacgac
accatcatagcgggtgccggtaacgacaatttatcgggcggagcaggcaacgacacaata
gaggctagcgcaggagataacactcttagcggtggtgatggagacgatgtgcttattgct
ggcggtgggcatgatagcctcagcggtggtgatggtgccgataccctcaatgcggggaat
ggtaacaaccaactttatggtggtgaaggtaacgataagctgacgtcgggttctggttct
gatctactcgaaggtggtgccggcaacgatacactcagttctggcagcggaaatgaccag
ctatttggtggtgagggcaacgatacgctcagtggtggctcaggcgacgatatgctgtat
ggcgaagccggtaatgacaaactctccggtggtggcggtaatgaccagctatttggtggt
gaaggtgacgatagactcagtggcagtggcggtgatgatcagttgcacggtgatgtcggt
aatgaccaactaagtggtggtagtggtagcgacttactctttggtggtgagggtgatgat
aaattagacggcggtagtcaaaacgacgagctttacggtggcagcggtgatgatacgctg
gctggtggcagtggcgatgatgtgttgtttggtgacgcggggagcgacaccattgatggt
ggtactggctctgacaaactgtttggtggcgcaggtgatgacaccattgtgtttgataga
gaagatttcggtagtaacgaagatggcagcatggatagcggcggctttagctacgatggt
ggcgacggctttgatgttctgcaagtctcaagtgtcaacagcgaaattatcgatatgaca
ggtgctggcattcaaaatatggaagcgattattgtcgaagatggtgtcacagacatacaa
cttgaactgtcgctcgataaaatctatcagcaggctgatggcgacggcgtcgttggaaac
aactctgatgacccacttgaaaataacttcctagtggttggcagtgacaacattgattta
accggtgatggaaactggactcattctggagaaacgctaggcagccaagatatggatgct
gaactgcgtgagaaatatgaaggagaaggtgttgatattgacgagttgcaaggtcatata
ttctcaagtgacgaaggagaggtgatcatttggagcgatgctgatgccggtggtatttcg
cttaatgatgaaacattaacttaa
DBGET
integrated database retrieval system
