Shewanella youngdeokensis: RGE70_10345
Help
Entry
RGE70_10345 CDS
T10660
Name
(GenBank) translocation/assembly module TamB domain-containing protein
KO
K09800
translocation and assembly module TamB
Organism
syou Shewanella youngdeokensis
Brite
Transporters [BR:
syou02000
]
Other transporters
Pores ion channels [TC:
1
]
RGE70_10345
BRITE hierarchy
SSDB
Ortholog
Paralog
Gene cluster
GFIT
Other DBs
NCBI-ProteinID:
WOT03750
LinkDB
All DBs
Position
2416444..2420445
Genome browser
AA seq
1333 aa
AA seq
DB search
MTSSKVAASSAATETSTEAKTKPSKRWQWFRQCSRVVIYLPLSLLVMLAMLIGTQFGAHI
TVKMADWLVPNLNITYQSGRINHQLTLAVGNWSMAGIKVETTDLMLDWNPMCLLQTQLCV
NELSASKVNVEIDTGSKGKDTAKSDSVAANVSTEPKPLPPAADALVEQIKQHQEITLPFG
IKLSVASLSHVTVRVNDMDFNAKQLNLSAEWQSTGIRAKSIYSEELLVSIPLQSHDVANT
KANQKSISNQPNELISQQVTNSGVQPKPISHSPQVHTSGSTHWAMAQLPEVFMPIPVYVD
ALEINQGKLVLGSRTDFFEHISLIGSYQTFLINVEKLSLNHSYGDLTLQGQMSLTDDYPM
DIALDANLNKVTELPGLLDQQLQIKLNQGFKQLKTEINGLGQFEFAFNSTIELAKPSLPY
SLALKASQLHWPLDTPTLIATDIDLATNGDIAQQQVSLKTQFASPYHPLLSVVTEFKHQV
SSLDFSQLQVVSEMGNVDLNGKLTYGDKLEWQTNVVSQQLNIGQLQLNLANALPTSLING
SFKTHGHFLLSDSQWEVGIEQANLNGVIADYPLTVAGGLTLNDQGYISSQGLNINALQSE
LNIQGQVNNRWALNGDLTVPDLSLWHRDARGEITSDIHVSGESKHPDVDISLTAVDLTFA
QLSLAHLDLIGEYKPLDNQAFSAYLTSEDFHFNDMILDSIIINGQGDLNQQTLSLATTGE
LDIATEINSQYDNENSIITAKVEQLTIHSLIGDVSLNKPFESVYDFSQHTGKVAPLCLDH
ISGNLCTTEPIILGLNGNAKVQYTGDIGQLTKPWLPDSIDWQAPAKLASEFEWFAERKPI
GRLELDLPAGMIDFSATNNSQASVGYQSLNISSQLNEQHLSTSVLLQATQTASLQANLAI
NVSPDRAIKGDFKLQQVNLHELAALIPQLEVLEGILSSNLRIGGTLNEPQASGDITLQQG
SILAAANPTLVEDIALNLAFAGKKAQIAGELKMGDGLAYVNGDLDWLQQNLKGNFNIKGD
NLAVIQPPLAILSLGTDVNINFTEDSLTVKGDIDVPTGEITIVQLQEGGVAVSKDVVFRD
KQAVEVTKSTPLAVSAELNINIGDELRVEGMGLNGKLVGRLELKQDPFRPPLLYGEIKVI
DGTYKFMGQTLAISAGELQFIGPMDVPSLNIEAAREIKDEDVTAGVRITGTPTKPVVSLY
SSPTKEQAEILNYILRGTSLNSTDTDQNSGLLLGAALTLGNQVGGGTISNMSNRATGIIE
KIGFSNVQLDANDDGRFAISGFIGDNLMVKYGVGVFNPGYEMTVRYYLLSQLYLETVSGT
LEQSLDIYYNFDL
NT seq
4002 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
atgaccagttcaaaagttgccgcctctagcgctgcaaccgaaactagcactgaggccaaa
accaaaccctctaaacgctggcaatggtttagacaatgcagccgagtggttatatatcta
ccattgagtttgctggtaatgctggcaatgttaataggcactcaatttggcgcacatata
acagtcaaaatggctgattggttagtaccaaacctcaacataacgtatcaatctggtagg
ataaaccaccagctaacattagcggtcggtaattggagcatggctggtataaaagtcgaa
acgaccgatttgatgttagattggaatccaatgtgtttattgcaaacacaactatgtgtc
aatgaactgtctgcttctaaagttaatgttgagattgataccggctcaaaaggcaaagat
acagcaaagtctgactcggttgctgctaacgtaagcaccgagccaaagccgttaccgcca
gcagctgacgcactggtggagcagattaaacaacaccaagagatcactctgccttttggg
ataaaattatccgtagcgtcgctcagccacgttacagttagagtcaatgacatggacttt
aatgccaaacagcttaacttaagtgctgaatggcaaagcactgggataagagctaaatca
atatattcagaagagctattggtgtctattccactacaaagtcatgatgtagccaatacc
aaagcaaaccaaaaaagcataagtaatcaacccaatgagcttattagccaacaagtaact
aatagcggcgtacagccaaagcctatctctcattcaccccaggtacatactagcggttca
actcactgggcaatggcacaactacctgaagtatttatgcctattccagtgtatgttgac
gcacttgagattaatcaaggtaagttggtgctcgggagtcgtaccgatttttttgaacac
attagtttgattggtagttaccaaacatttctcattaatgttgaaaaattatcactcaat
catagttatggtgatttaacgctacaaggacaaatgtcgctgactgatgactacccaatg
gatatcgcccttgatgccaacctgaataaggttaccgagctaccaggcttactagatcaa
caattgcaaatcaaactcaaccaaggctttaagcaacttaaaactgaaattaacggctta
ggccaatttgaatttgcttttaactcaaccattgaacttgctaagccaagcctaccctat
tcgctagcgcttaaggcaagtcaactccattggccgctagacacaccaacattaatagca
accgacatagatttagcaacaaacggtgatattgcgcaacagcaagtatcactcaaaacc
cagtttgcttcaccataccatccgttactatctgtcgttacagagtttaagcatcaagtt
agtagtttagacttcagtcaactgcaagtggtaagtgaaatggggaatgttgatttaaac
ggtaagctcacttatggcgacaaattagagtggcaaaccaatgtagtgagtcaacagctt
aatattggccagctacaacttaatttagcgaacgctttgccgacaagcttgattaacgga
tcatttaaaactcatggccactttttgttgtcggattcacagtgggaagtcggtattgaa
caggcaaaccttaacggcgttattgcagattacccgctaacggtagcaggtggcttaacg
ttaaatgatcaaggttatataagctctcaaggcttaaacatcaacgcccttcaaagtgaa
ctcaatattcaagggcaagtcaacaatcgctgggcgttaaacggcgacttaaccgtaccg
gatctgagcttatggcatcgagacgcccgtggagagatcactagcgacattcatgtttca
ggtgaatcgaagcaccctgatgtcgacattagcctgacggcagttgatttaacttttgct
caattatctttagcccatttagatttaataggggaatataagcccctcgataatcaagcg
ttctcggcctatctaacatcagaagattttcattttaatgacatgatcttagatagcatt
atcatcaacggccagggggacttaaatcagcaaacattgagtctagcgaccactggcgaa
ctcgacattgctactgagatcaacagccaatatgataacgaaaacagcatcattaccgca
aaagtagaacagctaaccattcactctttaatcggtgacgttagcttaaataagcctttt
gaatccgtctatgatttcagccagcacacaggtaaagtggcgcctctttgtcttgaccat
atcagtggtaatttatgcacaacagagccaataatattaggcttaaacggtaatgcaaaa
gttcaatacaccggagatattggtcaattaaccaagccatggttgcctgatagcatagat
tggcaagccccagccaagcttgcctctgaatttgaatggtttgcagaacgtaaacccata
gggcggttagagctcgatctccccgctgggatgattgatttttccgccaccaacaatagc
caagctagtgttggctaccaatcactaaacattagtagtcagttaaacgagcaacacctt
tcgacttctgtattactacaagcgacacaaacagccagtttacaggcaaacttagccatc
aatgtcagccctgacagagctattaagggcgactttaaactccagcaggtcaacctacac
gagttagcagcgcttattccccaacttgaggtgttagaaggcatattgtcgagcaaccta
cgcattggcggaacattgaatgaaccgcaagcctctggtgacataacgctgcaacaaggc
tctattcttgctgcagcaaacccaaccctagttgaagacatagcgttaaacctggctttt
gcaggcaaaaaggcacaaattgccggtgaactaaaaatgggggatggactcgcttatgtt
aatggcgatctggattggttacagcaaaacctgaagggtaacttcaacataaaaggcgat
aacctcgcggttatacagcctcccctcgcaattttgagccttggtaccgatgtcaatatt
aatttcactgaggattcgctcactgtcaaaggtgatattgatgtccctacaggtgaaatc
actattgtgcagttacaagaaggcggtgtagccgtttcaaaagatgtggtatttagggac
aaacaggccgtggaagtaacaaaatccacaccactagcggtatcggccgaattaaatatc
aatattggcgatgaacttcgtgtcgaaggaatgggattgaatggcaaattggttggcaga
ctagagttaaaacaagatcccttccgaccaccattgctctatggagaaataaaagtcatt
gatggcacctacaaatttatgggacaaacgctagcaattagtgcgggggaattgcagttt
attggaccgatggacgtcccgagcttaaacattgaagcagcaagagagatcaaagacgaa
gatgttacggctggcgtacggattactggtacaccaacgaaacctgtcgttagcctctat
tccagcccaacaaaagaacaagctgaaattttaaactacattctccgaggaacaagctta
aacagcacagatacagaccaaaacagtggtttactgctaggtgcagctctaacattaggt
aatcaggttggcggcggtacaattagcaatatgagtaatcgagcaactggaataatcgaa
aaaattggcttttccaatgtgcagctagatgccaatgacgacggccgctttgccattagc
ggatttattggcgataacttgatggtgaaatatggagtcggcgtttttaaccctggttat
gaaatgaccgtgcgctactatttgttatcacaactctatttagagacggtatcagggact
ttagagcagtctttagatatttattacaattttgacttatag
DBGET
integrated database retrieval system