Shewanella youngdeokensis: RGE70_11145
Help
Entry
RGE70_11145 CDS
T10660
Name
(GenBank) sensor domain-containing diguanylate cyclase
Organism
syou Shewanella youngdeokensis
SSDB
Ortholog
Paralog
Gene cluster
GFIT
Motif
Pfam:
GGDEF
dCache_1
Cas10-Cmr2_palm2
DUF5592
DUF6773
Motif
Other DBs
NCBI-ProteinID:
WOT03897
LinkDB
All DBs
Position
2611677..2613869
Genome browser
AA seq
730 aa
AA seq
DB search
MDKFKQNKLLLASVLGFIGLVVNLFPIPLFSNILLILGNASYIISAALLGPVYGLYTALI
AVSGLFISMESPHVYVMFSMEAVFLGALRRRGLFTLYASLFFWGLIGMPLFYVYATFFTE
LPSTHLPFIILKQGINGIIYTGIGSLVVILTPGFWYLKNRSKSKKRLTFNAQLTYAFTLI
ISLALLFAALLFNNQFVNRHQELLSQNIKESAHQVGALAQAHIDTHIQAINNAASVFSLH
NISIEKQQLTLSKLHRMYPGFITMLKTNQQGILTAASPASRLTGSNQPTTNISVESRPYF
TESFVNQKNFISPVFLSRSFANDPIIVISAPVYSPQSFHQPIGVLAGSLDLGQFKNIEHK
NSQTKAQSIVLVDRKNRVIFGSRELGLSPLSDFNYTQKKNTSISELPTINIRTLDDMSAE
FIYARYELDNQWTLYVLNPVRPLVQIVENMYITTFAILLISLLITFFITKVISTRLTLPL
EAIASKFSDSNISNNYDDSINEESPKEVYALYLRLKQSKSQLISYQLELEEKVAIRTFEL
EQANSQLKLLAEKDSLTGLYNRRYAESQFTSIQDSCKRSDEAIAIAIMDLDHFKHINDTY
GHLAGDMTLKAVSCLLEQDFKRDADIIVRYGGEEFLVIMPLCNALKIEAHLESFKQKLSQ
LVILKPGSDIEFNVTTSIGAVIANSSYSNSLEDWIKQADLNLYHAKNNGRNKLVFTTLPD
PVRNGETEST
NT seq
2193 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
ttggataagtttaagcaaaataaattattactagcatcagtacttggcttcatcggttta
gtcgtcaacctctttcctatacctttattttcaaatatcctgcttatactgggtaatgct
agttatattatttctgcagctttgctggggcctgtttatggattgtatactgcgttaatc
gcagtttctggcttatttatttcaatggaaagccctcatgtttacgtcatgttttcaatg
gaagcagtttttcttggggctttaaggcggcgggggctatttactctatatgccagtttg
tttttttgggggcttattggcatgccactattttacgtttatgccactttctttactgaa
cttcccagcactcacctcccctttattattttaaaacaaggtatcaacggtattatctat
accggtattggctcgttggttgttattttaacgcctggtttttggtatttaaaaaaccgc
tcaaaatcaaagaaacgtctcacatttaatgctcaattaacctatgcatttaccttaatt
atttcgttggcattactttttgctgcattgttatttaataatcaatttgtcaatcgtcat
caagaactactgagccaaaatattaaagagtcagctcatcaagttggtgccttagctcaa
gcccatattgatacccatattcaagcgatcaataatgccgcaagcgtatttagcttgcat
aacatcagtatcgaaaaacagcaactaacactgtcaaagctacatcgcatgtatcctgga
tttatcaccatgctcaaaaccaatcagcaagggatactcacggccgcaagcccagcatca
cgtttaacaggatctaatcagcctacaaccaatatcagcgtagaaagtagaccatacttt
actgagtcttttgtaaatcagaaaaattttatatctccagtatttttaagtcgcagcttt
gccaatgatcccatcatagtcattagcgcacccgtttattcaccacagagctttcatcaa
cctataggtgttcttgcgggttcattggacttggggcagttcaaaaatattgaacacaaa
aacagtcagacaaaagctcaatcaatcgttcttgttgaccgaaaaaatcgggtgatattt
ggctctcgagaattagggctttcgcctttatctgactttaactatacacagaaaaaaaat
accagcatcagcgaattgccaacgataaatattcgtactttagatgacatgtcagctgag
tttatttatgcccgctatgaattagataatcagtggactctttacgtgctcaacccagta
aggccgctagtacagatagttgaaaatatgtacatcacaacttttgctatattattgatt
tcacttcttattactttttttattacaaaagtaattagtactagactcacactaccgctt
gaagcgatagccagtaaatttagtgactcaaatataagcaacaattacgacgactctatt
aatgaagagtccccaaaagaggtctatgcgctctacttacgactaaaacagagtaaaagt
cagttaattagttatcagttagagcttgaagaaaaagttgctatccgtacttttgagcta
gaacaagcaaatagccagttaaagttacttgcggaaaaagactcgcttacaggcttatat
aaccgtcgttacgctgaaagccagttcacatcaattcaagacagttgtaaaagaagtgat
gaagccattgctattgcaattatggatcttgatcacttcaaacatattaatgatacttat
ggtcacttggctggagacatgactcttaaggctgtgtcatgcctattagagcaagatttt
aaaagagatgctgatattattgtccgttatggcggggaggagtttcttgtcattatgcca
ttgtgtaatgcgctaaaaattgaagctcatctagaaagttttaagcaaaaactgtcccaa
ttagtgatactaaaaccaggtagtgatattgagtttaatgtaacaaccagcattggagcc
gtgatagctaatagctcttatagtaattcattagaggattggataaagcaagcagacctt
aacttgtatcatgcaaaaaataatggccgtaataaattagtgtttacaacattaccagat
ccagtgcgcaatggagaaactgaatcaacatga
DBGET
integrated database retrieval system