Thermosipho africanus: THA_1109
Help
Entry
THA_1109 CDS
T00797
Name
(GenBank) cyclic diguanylate phosphodiesterase (EAL) domain protein
Organism
taf
Thermosipho africanus
SSDB
Ortholog
Paralog
Gene cluster
GFIT
Motif
Pfam:
EAL
GGDEF
PAS_9
PAS
PAS_8
PAS_4
NAPRTase_N
Motif
Other DBs
NCBI-ProteinID:
ACJ75562
UniProt:
B7IHJ8
LinkDB
All DBs
Position
complement(1131800..1134256)
Genome browser
AA seq
818 aa
AA seq
DB search
MEDFLIILSLVSLIYLFERKLYKISSALIHIFFSLLFLSIFEFFKIKYSLSEFFCIMQDL
IGVSLIPAIFSFSEDFYGKKKNYKKRFLISLPLFFLIVINNIIFHKQLVNSKPSNFFLVF
YALIIIILSFKNIFKANVEKKVKINILIIFLSLFGYYAYSTITNNFNIPIILLLTLISFI
IIEFILLRKSWIKVLEDAKENLILNISDGIILVDKNNYVLDLNKPAQKIIGKEFNQIINR
KLEDNFKNGQIIEKNGKYYSIEVIDFEKGSIYYFRDVTKEMKYSKRQEIANILFHNLFNN
IPDPLALVTPSGKIVDCNSAFTKTFGYKKLENIENIVPDYLKEESKILILQILKKGHVSY
ETVRKSKSGKNIFVRIYASKFEIENQTFIYIIYSDISKEKKLSQQISNLIEKDPLTKTFN
KVYIIKRLKNLKPLFYHSLIFIDIKDFQRINSLKGNVFGDKVLKIVANKLKECTNYIISR
AHADEFWILAEELDIDVKKAYSKNKELILHIDNCLKNIKVDDTSLKFHIGTYIFKNDENI
DEVIRKTSLSLSRSKDEDKIITYSKEIEDEIRKELEKEIQIKKAIEKGEFIPFFQPIATH
NMEIVGAEALIRWVKDGKVIPPFEFLDFLEKTGLIEQASKQIFENVCKLLSKTKKLKFVD
VNISPIQLKNTNFSKDYLKILEKYNIQSSQITIEITENLFIDYNDIVRENLNLLKSEGFK
LCLDDFGTGYSSLNYLRNIPFDIIKIDREFISNIDDEKNLNLLKAIYSIAESFKMGAIPE
GVENEKQLEILTVIGFRLFQGYYFGKPMPESEFLSILS
NT seq
2457 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
atggaagattttttaattatcttatccctagtttcattaatttatctatttgaaagaaag
ctatacaagatttcttcagcgctaatacacatatttttttcattactttttctatcaatt
tttgaattttttaaaattaaatactcattaagtgaatttttttgtataatgcaggatttg
attggtgtttctcttattcctgcaattttttctttttcagaggatttttatggaaaaaag
aaaaattacaaaaaaaggtttttaatatcattgccgctatttttcttaatagtaattaac
aacattattttccacaaacagttagttaactcaaaaccttcaaatttcttccttgtattt
tatgcattaattattatcattttatcatttaaaaacatctttaaagcaaacgttgaaaag
aaagtaaaaataaatattttaataatattcctctctctttttggatattacgcttattca
acaataactaataatttcaacataccaatcatcttactcttaactctaatttcatttatt
ataatcgaatttattcttttaagaaagagttggattaaagtacttgaagatgcaaaagaa
aaccttattttaaatattagcgatggaataatacttgtagataagaataattatgttctt
gaccttaataaacctgcccagaaaattataggtaaagaatttaaccaaataattaacaga
aaacttgaagataattttaaaaacggacaaataattgaaaaaaatggcaaatattactct
atagaagtcattgattttgaaaagggatccatatactactttagagatgtaaccaaagaa
atgaaatattcaaaaaggcaagaaatcgcaaatatattattccataacctttttaataac
atacctgatccacttgccttagtaactccttccggaaagattgtagactgcaacagtgca
tttacaaaaacttttggttataaaaaattagaaaacattgaaaatatcgtgccagattat
ttaaaagaagaatcaaaaatcttgattcttcaaatactaaaaaaaggacatgtaagttac
gaaaccgtcagaaagagtaaaagtggtaaaaatatatttgtcagaatttatgcgtcaaaa
tttgaaattgaaaatcaaacatttatctatataatctattctgatatttcaaaagaaaag
aaactatcacaacaaatctctaatcttatagaaaaagatcctttaactaaaacatttaac
aaagtatacattattaaaaggcttaaaaacctcaaacctctcttttatcattcactaata
tttattgacataaaggattttcaaagaatcaactccttaaagggaaatgtttttggagat
aaagttctcaaaattgttgcaaataaactaaaggaatgtacaaattatataatttcaagg
gctcacgcagatgaattttggatattagcagaagaattggacatagatgtaaaaaaagct
tacagtaaaaataaagaacttattttgcatatagataattgtttgaaaaacatcaaagtt
gacgatacttcactgaaatttcacataggaacatatattttcaaaaatgatgaaaatatt
gatgaagttataagaaaaacaagcctttccctttcaagatcaaaagacgaagacaaaata
ataacttattcaaaagaaatagaagatgaaataagaaaagaattagagaaagaaattcaa
ataaagaaggcaattgaaaaaggcgaatttataccattcttccagccaatagcaacacac
aatatggaaattgtgggggccgaagcattaataagatgggttaaagatggaaaagtaata
ccaccgtttgaattccttgattttctagaaaaaactggtcttatagaacaagcatcaaaa
caaatatttgaaaatgtatgtaaattactttctaaaacaaaaaaactgaaatttgttgat
gttaatatcagccctatccaactaaaaaataccaacttttcaaaagattatctaaaaata
cttgaaaaatacaatatacaaagcagtcaaattacaatagaaattacagaaaacctcttc
attgattacaacgatattgttcgtgaaaatcttaatctactaaaaagcgaaggatttaaa
ttatgccttgatgactttggaactggttactcttcattaaattatttaagaaatattcca
tttgatataattaaaatagacagagaattcataagtaatatagacgatgaaaaaaatcta
aatctcttaaaagcaatatatagtatagcagagtcttttaaaatgggggcaatacctgaa
ggtgtcgaaaatgaaaaacaacttgaaattttgactgtgataggttttaggttattccaa
gggtattattttggaaagccaatgcctgaatcagagtttttaagtattttaagttag
DBGET
integrated database retrieval system