Thermosipho africanus: THA_6
Help
Entry
THA_6 CDS
T00797
Name
(GenBank) helicase
Organism
taf
Thermosipho africanus
SSDB
Ortholog
Paralog
Gene cluster
GFIT
Motif
Pfam:
SNF2-rel_dom
Helicase_C
ResIII
Motif
Other DBs
NCBI-ProteinID:
ACJ74514
UniProt:
B7IEK0
LinkDB
All DBs
Position
complement(6926..9433)
Genome browser
AA seq
835 aa
AA seq
DB search
MKYVIHKDFIEIKLGIGDRRLKKFYYVFFNTRNNKFNLTYDFLNMLYQEDPTILEKLGFK
TDYENLTVKLRFVNKIDSSTIKFKYNEEIDLVINERFLVNSNKGVILFLNSEVYDAFSFI
LYNNSKIVEKINKLNQLKKKYNISYIAPKKIEIINKYNLKVNEESDGEVIDYTIFGIPKK
ESFVLSGSLVTNKKVYYIDESTKKDLLILEKYRDPKSKKIIINENNIEKFHEDYLHSFSD
EFIEKLSDRIKFLTFQPSNILIRKNVSPISKEELFNYNIIHFHDLLNGGVENLELTPELK
EKIENAKKENKNFVFYKGSWIRLDTLPEEVVEEIKTKSFEPHKEPKSKLFDLEIKENIEK
LEYSKFKKEEKKQTQEEKLDLKYFEGKLKKFQEIGVKKVISAYLEGFRGFLLADDMGLGK
TAQAIAFMTWLLEEKELFPVMIVVPNSLLENWRKELERFSPEIYKHFNTKDLVLINYEKL
LRNEKLLIRDWNLIITDEAQRYKNYRSKTTRIIKGYKFKFHLALTGTPVENSIDELWNII
DAITPGLLGKLKDFNNKYNVINSDPTSEEAQEKSLEILNSIDPVFLRRNKEDKEVEINFP
KKEEFFIESYLTQTQEDKYLDTYLKYKKKNANKKDFLGLAIKLLQVCDFGADYFDENFYK
HSGKLNKLKDLMIEIKNKKEKALIFTKFIMTQQIIKAFLRNELGIESEILNGTVPIETRN
YIVKQFNDGKIDVLIINPRVGGVGLNLVAANHVIHYTPEWNPAVTSQATDRAYRIGQDKD
VYVYYFFSKFRNNHNKTIEEYFMKLLERKKQIKNILLDNIITNKEFENLKKEFFE
NT seq
2508 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
atgaagtatgttattcataaagattttattgagataaagttaggaataggagatagaaga
ttaaaaaaattctactatgtgttttttaatacaagaaacaataagtttaatttaacatat
gattttctgaatatgctttatcaagaagatcctacaattttagaaaaactgggctttaaa
accgactatgaaaatttaacagttaaacttcgattcgttaataaaatagactcttcaact
attaaatttaaatataatgaagaaattgatttagtcatcaatgaaagatttttagtaaat
tctaataaaggggttattttatttttaaattccgaagtttatgatgctttttcatttatt
ctttataataattcgaaaattgttgaaaaaataaataaactaaatcaattgaagaaaaaa
tacaatatctcgtatatagcacctaagaaaattgaaattattaataaatataatttaaaa
gttaatgaggaatctgatggagaagttatagattatacaatatttggcattccaaaaaaa
gaaagttttgtattaagtggttcacttgttacaaacaaaaaggtctactacatagatgaa
agcacaaaaaaagatttattaatcttagaaaaatatagagatccaaaaagtaaaaagata
attataaatgaaaataatattgagaagtttcatgaagattatttacattctttttcagac
gaatttattgaaaaactttctgatagaataaaattccttacttttcaaccttctaacatt
ctcatacgtaaaaatgtttcaccaatatctaaggaagaactatttaattataatataatt
cattttcatgatttacttaatggaggagttgaaaatctagaattaactcctgaattaaaa
gaaaaaatagaaaatgctaagaaagaaaataaaaattttgtattttataaaggttcctgg
attaggctagatacactcccagaagaagtagttgaagaaataaaaacaaaaagttttgaa
ccacataaggagcccaagagcaagcttttcgatttagaaataaaagagaatattgagaaa
ttagaatattcaaagtttaaaaaagaagaaaaaaaacaaacacaggaagaaaaattagat
ttgaagtattttgaaggaaagttaaaaaaatttcaagagattggcgttaaaaaagttatt
tccgcttatctagagggctttagaggttttttacttgccgatgatatgggattgggtaaa
acagctcaagcaattgcttttatgacatggcttttggaagaaaaagagttatttccagta
atgattgttgtaccaaactctcttcttgaaaattggagaaaagaattggaaaggtttagt
ccagagatttataaacattttaacacaaaagatttggtacttattaattacgaaaagttg
ttaagaaatgaaaaactattaattagagattggaatttgattataacagatgaagctcaa
agatataagaattatcgttctaagactactagaataattaaaggttataaatttaagttc
catttagctttgacaggaactcctgtagaaaacagtattgatgaactttggaatataatc
gatgcaataactcctggattgctaggaaaattgaaagattttaacaataagtataatgtc
attaattcagatccaacctcagaagaggctcaagaaaagtcattagaaatattgaatagt
attgatcctgtgtttttaagaagaaacaaagaagataaagaagttgaaattaattttccg
aaaaaagaagagttttttattgaaagttatttaactcaaactcaagaggacaaatatctt
gatacttatttaaaatataagaagaaaaatgctaataaaaaagattttttaggattggct
ataaaattactccaagtatgtgattttggtgcagattattttgatgaaaatttctacaaa
cactctgggaaattgaataaattaaaagatttaatgatcgagattaaaaataaaaaagaa
aaagctttaatttttacaaaatttataatgactcaacaaataattaaagcttttttgcgt
aatgaattaggtatagaaagtgaaattttaaatgggactgttccaattgaaactagaaat
tatattgttaaacaattcaatgatggaaagattgatgttcttattattaatccaagagtt
ggtggggtgggtttaaatcttgtagctgctaatcatgtaatccactatacaccagaatgg
aatcctgcagttacttcgcaagcaactgatagagcttatcgtattgggcaagataaagat
gtatatgtctattatttcttttctaagtttaggaataatcataacaaaacaatagaagaa
tattttatgaaattacttgaaagaaaaaaacaaattaagaatattttacttgataatata
ataactaacaaagaatttgaaaatttgaagaaggaattttttgaataa
DBGET
integrated database retrieval system
