KEGG   Typha angustifolia (narrow-leaf cattail): 140773468
Entry
140773468         CDS       T11061                                 
Name
(RefSeq) uncharacterized protein
  KO
K12741  heterogeneous nuclear ribonucleoprotein A1/A3
Organism
tang  Typha angustifolia (narrow-leaf cattail)
Pathway
tang03040  Spliceosome
Brite
KEGG Orthology (KO) [BR:tang00001]
 09120 Genetic Information Processing
  09121 Transcription
   03040 Spliceosome
    140773468
 09180 Brite Hierarchies
  09182 Protein families: genetic information processing
   03019 Messenger RNA biogenesis [BR:tang03019]
    140773468
   03041 Spliceosome [BR:tang03041]
    140773468
Messenger RNA biogenesis [BR:tang03019]
 Eukaryotic type
  mRNA surveillance and transport factors
   Transport factors
    Other transport factors
     140773468
   mRNA cycle factors
    Common to processing body (P body) and stress granule
     140773468
Spliceosome [BR:tang03041]
 Common components
  Common spliceosomal components
   hnRNP proteins
    140773468
SSDB
Motif
Pfam: RRM_1 RRM_7
Other DBs
NCBI-GeneID: 140773468
NCBI-ProteinID: XP_072972150
LinkDB
Position
13:complement(join(4334739..4335449,4336164..4336270,4336339..4336407,4336500..4336608))
AA seq 331 aa
MAFLNKVGNFIKQATTSSPSVYQAIRCMSSSKLFVGGLSYGTDDLSLREAFTNYGEVVEA
RVIIDRETGRSRGFGFVTFTSSEEASAAITGMDGKDLHGRMVRVNYANDRSGGFRGGYGG
GGGGGYGGSGGYGSSGGGYGGSGGYGGGGYGGGAGGGYGGRGGYGGGSDGYGASGYSDGG
SGSYGVGSGGYAGSSGGNYSVAGGVGGSDNSFINTSGNNYAGGSTPSGYGAGDFSGSSGG
YGSGRYNRNSGNFVGGTGEYYGVAGGAGGSDNYVDGTTVDTYASGSGAGGYGRTNHHQYG
SSTDQYAQDDLLEDNFKDDEDEPEDYANKKS
NT seq 996 nt   +upstreamnt  +downstreamnt
atggcatttcttaataaagttggaaattttatcaagcaagctacaacttccagtccatca
gtataccaagcaataagatgcatgtcatcctcaaagctctttgttggaggactctcctat
ggtactgatgatctgagtctaagggaagcttttactaactatggtgaagttgttgaagct
agagttatcattgaccgagagactgggaggtcaagggggtttggttttgtaacttttaca
tccagtgaagaggcctcagctgccattactgggatggatggaaaggatcttcatggacga
atggtgagggttaattatgctaatgatcgttccggtggatttcgtggtggttatggcggt
ggtggtggtggtggatacggtggctctggcggctatggcagcagcggtggtggttatggt
ggcagtggcggctatggtggtggtggttatggtggaggtgctggtggtggatatggcgga
agagggggatatggtggcggatctgatggctatggtgctagtggatacagtgatggtgga
agtggaagttatggtgttggaagcggtggttatgctggtagcagtggtggaaactacagt
gttgctggaggtgttggcggcagtgacaactctttcattaatacctctggtaataactat
gctggtggcagcactcctagtggctatggtgctggagacttttctggaagcagtggaggt
tatggcagtggaagatacaatagaaacagtgggaatttcgtcggtggcactggtgagtat
tatggtgttgctggtggtgctggtggcagtgacaactatgtcgacggcacaactgttgat
acctatgctagtggcagcggcgccggtggttatggcagaaccaaccatcatcagtatgga
agcagcactgaccaatatgctcaggatgatttgttggaggacaatttcaaagatgatgag
gacgaacctgaagactatgccaacaagaaaagttaa

DBGET integrated database retrieval system