Candidatus Thiothrix anitrata: J8380_15960
Help
Entry
J8380_15960 CDS
T07878
Name
(GenBank) EAL domain-containing protein
Organism
tani
Candidatus Thiothrix anitrata
SSDB
Ortholog
Paralog
Gene cluster
GFIT
Motif
Pfam:
EAL
GGDEF
PAS
PAS_4
PAS_9
PAS_8
Motif
Other DBs
NCBI-ProteinID:
QTR51871
LinkDB
All DBs
Position
complement(3190680..3192509)
Genome browser
AA seq
609 aa
AA seq
DB search
MAVLQALSLLWSARHQWQTLSVSEQEGFALSNPVAATSAEQVNTEWVLDALAGGVVVVNL
QGKVTYMNASAEKLTLWQRDKVIGEPVDKVLRLDDLQGNPIIQRAFDAHRAHPGHPLQFG
QVKLHPRVGEAKFVELHTTCILDERKAVVFIFRDVTADRKVINRLYRQASRDALTDLMNR
SSFEQYVEQLAHDTSSLLRTHVLASVDLDNFKIINDTCGHLAGDELLKQVAQIFRHSVRT
SDKVARIGGDEFAVFLEGCSQDKGRGIMETILTELRNFRFSWEGRVFSIGASIGLLEFMP
ASHIQIKQLFADADRACYTAKALGRNQVFVHAGEGETEAISNQRVTDWGKLLKDAIREDR
FMLFIQPIAPLSEGRADNIRQYEVLLRLPFRQTLLNPGSFLPMADRLDLMVSIDRWIIRK
SLDVLAKCCVSAAGQVGEQTRLMINLSSHTVQDAECFAYVEQQIKRTGVDPSMICFEISE
SVAISNFVHSKRIMNALHSLGCHLVLDDFGSGFSSLNYLRELPLSYLKIDGNFVHNLVSN
PVDAAMVKAVHEVGQVMNLLTIAELVEDAETLQHLRQIGVDFAQGYYCGRPVPLMQLCQQ
QEQRLQVVA
NT seq
1830 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
atggcagtactgcaagcgttgtcactattgtggtcggcacgccatcagtggcaaacactt
tcggtatctgaacaggaaggttttgctttgtctaaccctgtcgccgcaacatcagcagag
caggtgaatactgagtgggtgttagacgcgcttgcaggcggtgtggtggtcgtgaacttg
caaggtaaagtgacttacatgaacgccagtgcagaaaagctaacattgtggcagcgtgat
aaggtgattggggaacccgtagataaagtgttgcgtttagatgatttgcaaggtaatccc
attattcagcgtgcttttgatgcccatcgagcgcatcctggacatccgctgcaatttgga
caggtgaaattacatccgcgtgtgggcgaggcgaaattcgtggaattacataccacctgt
attttagatgagcgtaaagcggtggtatttattttccgtgatgtgaccgctgaccgtaag
gttattaatcgtttgtaccgtcaggcatcacgcgatgcgttaactgatttaatgaatcgc
tccagttttgaacaatacgtggaacaactggcacacgatacttccagtttgttgcgtact
catgttttagctagtgtggatttggataattttaagattatcaatgatacctgcgggcat
ttggccggtgatgaattgttaaagcaggttgcgcaaatattccgccattcggtacgaact
tcggataaagtggcacggattggtggcgatgaatttgcggtgtttctggagggctgtagc
caagataaggggcgcggtattatggaaactattctgacggaattgcgtaactttcgtttt
agttgggaaggccgagtgttttccattggggcgagcattggtttgttggagtttatgccc
gcatcccatatccagattaaacagttatttgctgatgcggatcgtgcttgttatacggct
aaagctttggggcgtaatcaggtatttgttcatgctggtgagggtgaaaccgaggctatt
tccaaccaacgcgtgaccgactggggtaaattgcttaaggatgcgattcgtgaagatcgc
tttatgttatttattcagccgattgcacccctgagcgaagggcgtgccgataatatacgt
caatacgaggtgttgttgcgtttgccgttccgccagacattgctgaatccgggtagtttt
ctgccaatggctgaccggttagacttgatggtgagtattgatcgttggattatccgtaag
tcattggatgtcttagccaagtgttgcgtatctgcggcaggtcaggtaggtgagcaaacg
cgcttaatgattaatttatcttcgcatacagtacaggatgctgaatgttttgcgtatgtt
gagcaacaaatcaaacgcacgggggttgatcctagcatgatttgttttgagatttccgag
tccgtggcgatcagtaattttgtgcactcgaagcgtattatgaatgcattacacagttta
gggtgtcatttagtactggatgatttcggaagtggtttctcatcccttaattatttgcgg
gaattgccactgagctacctgaaaattgatggcaactttgtgcacaatttagtttccaac
cccgtggatgcggcaatggttaaagcggtacacgaagtcggacaggtgatgaatttgttg
accatcgcggagttggtggaagatgcggaaactttgcagcacttgcgacaaattggtgtg
gatttcgctcaaggctattattgtgggcgacctgtaccgttgatgcagctatgtcagcaa
caggaacaacgtttgcaagtggtggcatga
DBGET
integrated database retrieval system