Candidatus Thiothrix anitrata: J8380_17385
Help
Entry
J8380_17385 CDS
T07878
Name
(GenBank) DUF11 domain-containing protein
Organism
tani
Candidatus Thiothrix anitrata
SSDB
Ortholog
Paralog
Gene cluster
GFIT
Motif
Pfam:
DUF5979
DUF11
He_PIG
FGE-sulfatase
bMG10
StcE_b-sandwich
Chlam_OMP6
Motif
Other DBs
NCBI-ProteinID:
QTR49968
LinkDB
All DBs
Position
complement(3479930..3483421)
Genome browser
AA seq
1163 aa
AA seq
DB search
MTGIKKLLGTIRHSVAIVTGMLCVIAAQHASAESYTPPAGVPAPSYADNFVVVGNPGNAG
DSTGYGGVPYSYMVSATQITVQDWVDFLNDIGATGSNDLGLGPMTTSHPDCDNPWCYSPF
AYSGSSWQVTSFNQNGMSLSASDAAKLPVDWRSLNNVARYLNWMATGSIDSGAFTFTNDG
GPKGNWPIASFNGAYPGPRLPLEDELYKAMYRRAGTTNTYYTYPLGSGTPALATSSVNTG
LHDSNVGGALTGVFSNGGGLYAQVGQETGNPWGIYDFGGNRHETTLNPGATGTTILRGAS
AFGNLSDSSKNTRQTLDAGRRYLSVGYRVWMGVAQLSARISITKQVTGGSDATRNFTINL
NCAGTLYDKTFTLKHGQTAVSDFMPQGTTCTVTETPPSGAPSGYTYGTAIISPANITVPG
DGSTVAVTVTNPLQAACSINSFTIAPVCNNNGTTGSATDDYRTFALNLTGTGVAATYNVS
VNNGGIVTPTSGSYGTATNFRLQNGSAGNGTVYTLTATDATNSSCTRTATISDTGSCSPT
GTLRVRKTVTNPPAGFSSPNFNIAVDCSDDAFDQNFTLAHGATRDITNIPVGTTCSVTET
TPLPTAPAGYEYGTPAIAPSGAQTIVANTTIEVVVTNPLNSVSCPTINVTPNPLPNGTVG
VAYNASPSANASSGGPYTYTWSAAGLPTGMSVNAGTGAVSGTPSATGNATVTASTTVAGQ
TCSGSTPLSVAAAPTGSLSVTKAVTGKPVGFTSPNFSVVVDCSVDSFDQTLTVADGATAT
INSIPTGTTCTVTEPTVPAAPAGYDYGTPVITPSGAQTIGNGTTIAVTVTNPLTLKLGSL
QLGKSVSGQPAGFTSPDYTLRVDCSDDSFDQDVLIKAAENKTISNIPHGTTCTVTEPTQP
TPPAGYSYGTAVITPASVTIAGDSTVSVSVLNPLEGDCAINTPVVTTQCYSNGTSSAADD
TFGFRINTSGVFVAPTYDIQAGTLAVQDVPYGVESGTYGNFLISGGAVTATLADSNKASC
QLNNVALTPPASCSAPPPSCVTVINKANVSAQSSTDQNPGNNEDGAALGANCSTSPQVDL
ELVKTASMTTVKRGDTLVYTLTLVNKGPDDASNVQVQDQLPAGLTYVSSQAERGSYDAAS
GIWTVGKVANGVPVKLMITVRAD
NT seq
3492 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
atgacgggtataaaaaagttactgggaacaatacgccactccgtggctattgtaacgggt
atgttgtgcgtgattgctgcccaacatgcaagcgcggagtcttatacaccacccgctggt
gttccagcgccatcgtatgccgataatttcgtagtcgttggcaatccgggaaatgcgggc
gactcgactggatacggtggagtgccctactcttacatggtgagtgcgacccagattacc
gtacaggactgggtggattttctgaatgacattggggctacgggttctaatgatttgggt
ttaggtccaatgaccacatcccaccctgattgtgacaacccttggtgttattcaccgttt
gcctattctgggagtagttggcaagtaacgtcgtttaatcaaaatggcatgagtttgagt
gcatcggatgcagctaaacttcctgtcgattggcgttctttgaataacgtagctcgttat
ctgaactggatggcaacaggtagtattgattctggggcattcactttcacaaatgatggt
ggaccaaaaggtaactggccaattgcctctttcaatggtgcttatccggggccgcgctta
cctttggaagatgagctttacaaagccatgtatcgtagagcagggacaactaatacttat
tatacttatccattgggtagtggtactcccgctttagcaacgtctagtgtcaatactggc
ttgcatgattctaatgttggcggggcattaacgggtgtctttagtaatgggggagggtta
tatgcacaagttggtcaggaaactggaaatccttgggggatttatgactttgggggaaac
cggcacgaaaccacgttgaatcccggtgctacagggacaaccattctgcgcggtgcatcc
gcatttggtaatctgtctgattcgagtaagaacacccgtcaaactctggatgcggggcga
cgttatttgagtgtcggctaccgggtgtggatgggtgttgcccagctatctgcgcggatc
agcattaccaagcaagttacaggtggcagtgatgctacccgtaacttcacgattaacttg
aattgtgctggcacgctgtatgacaaaacctttactctaaaacacggtcaaactgctgta
tccgactttatgccgcagggaacaacttgtacggttacagaaacgcctccttcaggtgcg
cctagtgggtacacctatggaaccgcaatcattagtcccgcaaatatcacggtgccgggt
gacggctcgactgtagctgtaacagtcaccaaccccctgcaagcagcctgttctattaac
agtttcaccatcgctcctgtatgtaataacaatggtactactggaagtgccacagatgat
taccgcaccttcgcattgaatttgacgggtacgggtgttgcagctacctacaatgtcagc
gtcaataatggtggaatcgtaaccccaacttcgggtagttacggtacggcaaccaatttc
cgcctacaaaacggctcggctggcaatggaacggtgtataccttgaccgccaccgatgca
actaacagcagttgtacccgtacagcgacgatcagtgacacggggagttgttcgccgaca
ggtacgttacgggtgcggaaaacagtgacgaatcctccggcaggatttagcagcccgaat
ttcaatatagcggtagattgttcggatgacgctttcgatcaaaactttacgttggcgcat
ggtgcaacacgcgatattaccaatatccctgtcggtacgacctgtagtgtgacggaaact
acgccactaccaaccgcaccagctggctacgaatacggcacacctgcgattgcgccgagt
ggtgcgcagacgattgtagcgaataccacgatcgaagtggtggtaacgaatccgcttaac
tcggtgagttgcccgacgattaacgttactccgaatccgttaccgaatggcacggtgggt
gtggcttacaatgcgagtccgtcagcgaatgccagtagcggagggccatatacttataca
tggagtgctgctggattgcctacgggtatgagcgttaatgccggaacgggggcggtatct
ggtacgcccagtgcaaccggtaatgcaacggtaacagcgagtaccacggttgcagggcaa
acctgttccgggtcaacgccattgagtgttgctgctgcaccgacaggttcattgagtgtt
acgaaagcagtgacaggcaaaccggtcggttttactagccctaatttctcagtggtggtg
gattgttctgtggatagctttgaccagacattgaccgttgctgatggtgctactgcaacc
attaacagtattccgaccggcacgacctgtaccgtgacagagccgacagtgccagccgca
cccgcaggttatgattacggcacgcccgtcattacgcccagtggtgcgcagacgattggt
aatggcacaaccattgcggtgacggtgactaatccattaaccctaaagctcggtagtttg
cagttgggtaaatcggtaagtgggcagcccgccggatttaccagccctgattacaccttg
agggtggactgttcagatgacagctttgaccaagatgtgctgattaaagcggctgaaaac
aaaaccatcagcaatattcctcacggtacgacctgtacggtgacagagccaacgcagcca
acaccgccagcaggttacagctacggcactgcggtgattactcctgcatcggtcacgatt
gcgggtgatagcaccgtgtctgtgagcgtgttgaatccgctggagggtgattgtgcgatt
aatacgccggttgtcaccacgcaatgttatagcaatggcacgagcagtgcggcggatgat
acgtttggtttccgtatcaatacatcgggggtgtttgttgctccaacctacgatattcag
gccggtacattagcggtgcaagacgtgccttacggcgtggaatcgggtacttacggtaac
tttttgatcagtggcggggcggtgacagcgaccttggccgacagtaacaaggccagttgt
cagttgaacaatgttgctttgactccacctgcgtcgtgttctgcaccgccaccgtcttgt
gtcacggttatcaataaagcgaatgtctcagcacaaagcagtacggatcaaaatccgggt
aataacgaagacggtgctgctttgggggcgaactgttcaacgtcaccacaagtcgatctg
gagttggtgaaaaccgccagtatgacgacggtcaagcgtggtgatacgttggtttatacc
ctgacgctggtgaataaaggccccgatgatgccagcaatgtgcaggtgcaagatcagttg
ccagcaggtttaacctatgtgagcagccaagccgaacgtggcagttatgatgcagccagt
ggcatctggactgtcggtaaggtggcgaatggtgtaccggttaaattaatgatcacagtg
agggctgactaa
DBGET
integrated database retrieval system